MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_013894	TC	4	8	1410487	1410494	0 %	50 %	0 %	50 %	289549278
31002	NC_013894	GAT	2	6	1410526	1410531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549278
31003	NC_013894	CTT	2	6	1410616	1410621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549278
31004	NC_013894	CATC	2	8	1410640	1410647	25 %	25 %	0 %	50 %	289549278
31005	NC_013894	CCA	2	6	1410655	1410660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549278
31006	NC_013894	TTC	2	6	1410726	1410731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549278
31007	NC_013894	CCAT	2	8	1410733	1410740	25 %	25 %	0 %	50 %	289549278
31008	NC_013894	T	6	6	1410827	1410832	0 %	100 %	0 %	0 %	289549278
31009	NC_013894	TAT	2	6	1410845	1410850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549278
31010	NC_013894	TTA	2	6	1410985	1410990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549278
31011	NC_013894	AGGA	2	8	1411014	1411021	50 %	0 %	50 %	0 %	289549278
31012	NC_013894	GGT	4	12	1411160	1411171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549278
31013	NC_013894	CAGC	2	8	1411222	1411229	25 %	0 %	25 %	50 %	289549278
31014	NC_013894	CAC	2	6	1411234	1411239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549278
31015	NC_013894	TGG	2	6	1411246	1411251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549278
31016	NC_013894	AGA	2	6	1411292	1411297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549278
31017	NC_013894	CTG	2	6	1411300	1411305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549278
31018	NC_013894	ACC	3	9	1411314	1411322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549278
31019	NC_013894	TCC	2	6	1411329	1411334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549278
31020	NC_013894	CAT	2	6	1411442	1411447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549278
31021	NC_013894	AAG	2	6	1411448	1411453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549278
31022	NC_013894	CCAC	2	8	1411476	1411483	25 %	0 %	0 %	75 %	289549278
31023	NC_013894	GAAGT	2	10	1411490	1411499	40 %	20 %	40 %	0 %	289549278
31024	NC_013894	AGG	2	6	1411577	1411582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549279
31025	NC_013894	AGT	2	6	1411583	1411588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549279
31026	NC_013894	GT	3	6	1411595	1411600	0 %	50 %	50 %	0 %	289549279
31027	NC_013894	AGG	2	6	1411640	1411645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549279
31028	NC_013894	TCT	2	6	1411681	1411686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549279
31029	NC_013894	CCT	2	6	1411853	1411858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549279
31030	NC_013894	TGGGT	2	10	1411908	1411917	0 %	40 %	60 %	0 %	289549279
31031	NC_013894	GTT	2	6	1411953	1411958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549279
31032	NC_013894	GTG	2	6	1411969	1411974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549279
31033	NC_013894	TCCT	2	8	1412033	1412040	0 %	50 %	0 %	50 %	289549279
31034	NC_013894	TCA	2	6	1412066	1412071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549279
31035	NC_013894	TGG	2	6	1412072	1412077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549279
31036	NC_013894	GA	3	6	1412282	1412287	50 %	0 %	50 %	0 %	289549279
31037	NC_013894	TC	3	6	1412401	1412406	0 %	50 %	0 %	50 %	289549279
31038	NC_013894	TGC	2	6	1412498	1412503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549279
31039	NC_013894	TAT	2	6	1412508	1412513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549279
31040	NC_013894	TCCT	2	8	1412521	1412528	0 %	50 %	0 %	50 %	289549279
31041	NC_013894	TCC	2	6	1412638	1412643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549279
31042	NC_013894	CTC	2	6	1412660	1412665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549279
31043	NC_013894	GTA	2	6	1412693	1412698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549279
31044	NC_013894	GAA	2	6	1412746	1412751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549279
31045	NC_013894	ACC	2	6	1412752	1412757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549279
31046	NC_013894	GGA	2	6	1412764	1412769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549279
31047	NC_013894	TC	3	6	1412784	1412789	0 %	50 %	0 %	50 %	289549279
31048	NC_013894	CTGT	2	8	1412808	1412815	0 %	50 %	25 %	25 %	289549279
31049	NC_013894	CTTT	2	8	1412822	1412829	0 %	75 %	0 %	25 %	289549279
31050	NC_013894	CTCC	2	8	1412879	1412886	0 %	25 %	0 %	75 %	289549279
31051	NC_013894	CTGT	2	8	1412915	1412922	0 %	50 %	25 %	25 %	289549279
31052	NC_013894	TAT	2	6	1412964	1412969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549279
31053	NC_013894	TTC	2	6	1412970	1412975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549279
31054	NC_013894	TGG	2	6	1413038	1413043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549279
31055	NC_013894	ACC	2	6	1413064	1413069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549279
31056	NC_013894	CTT	2	6	1413077	1413082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549279
31057	NC_013894	CCA	2	6	1413083	1413088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549279
31058	NC_013894	AAT	2	6	1413113	1413118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549279
31059	NC_013894	ATG	2	6	1413160	1413165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549279
31060	NC_013894	TTA	2	6	1413242	1413247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549280
31061	NC_013894	CTATGC	2	12	1413306	1413317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289549280
31062	NC_013894	ATG	2	6	1413328	1413333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549280
31063	NC_013894	TTA	2	6	1413357	1413362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549280
31064	NC_013894	GGTGA	2	10	1413367	1413376	20 %	20 %	60 %	0 %	289549280
31065	NC_013894	CAA	2	6	1413381	1413386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549280
31066	NC_013894	CTTT	2	8	1413472	1413479	0 %	75 %	0 %	25 %	289549280
31067	NC_013894	CCG	2	6	1413497	1413502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289549280
31068	NC_013894	CTT	2	6	1413566	1413571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549280
31069	NC_013894	T	6	6	1413577	1413582	0 %	100 %	0 %	0 %	289549280
31070	NC_013894	GGTA	2	8	1413589	1413596	25 %	25 %	50 %	0 %	289549280
31071	NC_013894	CTT	2	6	1413621	1413626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549280
31072	NC_013894	TAC	2	6	1413658	1413663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549280
31073	NC_013894	CTTTT	2	10	1413695	1413704	0 %	80 %	0 %	20 %	289549280
31074	NC_013894	G	6	6	1413711	1413716	0 %	0 %	100 %	0 %	289549280
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31077	NC_013894	A	7	7	1413805	1413811	100 %	0 %	0 %	0 %	289549280
31078	NC_013894	TAC	2	6	1413814	1413819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549280
31079	NC_013894	TCT	3	9	1413830	1413838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549280
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31084	NC_013894	AC	3	6	1413968	1413973	50 %	0 %	0 %	50 %	289549280
31085	NC_013894	TTC	2	6	1413983	1413988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549280
31086	NC_013894	TCCT	2	8	1413994	1414001	0 %	50 %	0 %	50 %	289549280
31087	NC_013894	TGTGG	2	10	1414014	1414023	0 %	40 %	60 %	0 %	289549280
31088	NC_013894	AGA	2	6	1414036	1414041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549280
31089	NC_013894	CAT	2	6	1414095	1414100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549280
31090	NC_013894	AGA	2	6	1414106	1414111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549280
31091	NC_013894	GCC	2	6	1414159	1414164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289549280
31092	NC_013894	CTT	2	6	1414299	1414304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549280
31093	NC_013894	AC	3	6	1414321	1414326	50 %	0 %	0 %	50 %	289549280
31094	NC_013894	CTG	2	6	1414366	1414371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549280
31095	NC_013894	GGT	2	6	1414375	1414380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549280
31096	NC_013894	GT	3	6	1414379	1414384	0 %	50 %	50 %	0 %	289549280
31097	NC_013894	CAC	2	6	1414486	1414491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549280
31098	NC_013894	AG	3	6	1414509	1414514	50 %	0 %	50 %	0 %	289549280
31099	NC_013894	ATA	2	6	1414519	1414524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549280
31100	NC_013894	TA	3	6	1414557	1414562	50 %	50 %	0 %	0 %	289549280
31101	NC_013894	GCT	2	6	1414632	1414637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549280
31102	NC_013894	TG	3	6	1414690	1414695	0 %	50 %	50 %	0 %	289549280
31103	NC_013894	ACG	2	6	1414748	1414753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31104	NC_013894	TCC	2	6	1414771	1414776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31105	NC_013894	AAAG	2	8	1414813	1414820	75 %	0 %	25 %	0 %	289549281
31106	NC_013894	GA	3	6	1414896	1414901	50 %	0 %	50 %	0 %	289549281
31107	NC_013894	GTA	2	6	1414904	1414909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549281
31108	NC_013894	ACT	2	6	1415077	1415082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549281
31109	NC_013894	T	8	8	1415107	1415114	0 %	100 %	0 %	0 %	289549281
31110	NC_013894	CCA	2	6	1415115	1415120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549281
31111	NC_013894	CAG	2	6	1415131	1415136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549281
31112	NC_013894	AG	4	8	1415204	1415211	50 %	0 %	50 %	0 %	289549281
31113	NC_013894	AAAC	2	8	1415215	1415222	75 %	0 %	0 %	25 %	289549281
31114	NC_013894	GAG	2	6	1415238	1415243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549281
31115	NC_013894	CTT	2	6	1415263	1415268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549281
31116	NC_013894	GGA	2	6	1415344	1415349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549281
31117	NC_013894	CA	3	6	1415369	1415374	50 %	0 %	0 %	50 %	289549281
31118	NC_013894	T	6	6	1415478	1415483	0 %	100 %	0 %	0 %	289549281
31119	NC_013894	GCT	2	6	1415504	1415509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549281
31120	NC_013894	TTC	2	6	1415510	1415515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549281
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31122	NC_013894	CTC	2	6	1415552	1415557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549281
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31124	NC_013894	TAC	2	6	1415627	1415632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549281
31125	NC_013894	AG	3	6	1415642	1415647	50 %	0 %	50 %	0 %	289549281
31126	NC_013894	AGG	2	6	1415683	1415688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549281
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31130	NC_013894	GGA	2	6	1415890	1415895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549281
31131	NC_013894	TTC	2	6	1415917	1415922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549281
31132	NC_013894	TG	3	6	1416029	1416034	0 %	50 %	50 %	0 %	289549281
31133	NC_013894	TTC	2	6	1416116	1416121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549282
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31138	NC_013894	GAG	2	6	1416326	1416331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549282
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31141	NC_013894	TA	3	6	1416467	1416472	50 %	50 %	0 %	0 %	289549282
31142	NC_013894	CATCAC	2	12	1416481	1416492	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	289549282
31143	NC_013894	T	6	6	1416542	1416547	0 %	100 %	0 %	0 %	289549282
31144	NC_013894	AG	3	6	1416550	1416555	50 %	0 %	50 %	0 %	289549282
31145	NC_013894	AGT	2	6	1416571	1416576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549282
31146	NC_013894	AGA	2	6	1416606	1416611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549282
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31150	NC_013894	CCA	2	6	1416758	1416763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549283
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31153	NC_013894	CT	3	6	1416836	1416841	0 %	50 %	0 %	50 %	289549283
31154	NC_013894	GAT	2	6	1416869	1416874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549283
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31158	NC_013894	TCC	2	6	1416970	1416975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549283
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31172	NC_013894	CTTC	2	8	1417507	1417514	0 %	50 %	0 %	50 %	289549284
31173	NC_013894	TGG	2	6	1417567	1417572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549284
31174	NC_013894	ACTG	2	8	1417668	1417675	25 %	25 %	25 %	25 %	289549284
31175	NC_013894	ACC	3	9	1417686	1417694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549284
31176	NC_013894	CCA	3	9	1417732	1417740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289549284
31177	NC_013894	TAT	2	6	1417769	1417774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549284
31178	NC_013894	CT	3	6	1417901	1417906	0 %	50 %	0 %	50 %	289549284
31179	NC_013894	TATC	2	8	1417939	1417946	25 %	50 %	0 %	25 %	289549284
31180	NC_013894	CT	3	6	1417989	1417994	0 %	50 %	0 %	50 %	289549284
31181	NC_013894	TTC	2	6	1418048	1418053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549284
31182	NC_013894	TC	3	6	1418066	1418071	0 %	50 %	0 %	50 %	289549284
31183	NC_013894	TGC	2	6	1418179	1418184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31184	NC_013894	CTTC	2	8	1418288	1418295	0 %	50 %	0 %	50 %	289549285
31185	NC_013894	C	6	6	1418311	1418316	0 %	0 %	0 %	100 %	289549285
31186	NC_013894	TC	3	6	1418321	1418326	0 %	50 %	0 %	50 %	289549285
31187	NC_013894	GTAT	2	8	1418385	1418392	25 %	50 %	25 %	0 %	289549285
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31194	NC_013894	GTGG	2	8	1418487	1418494	0 %	25 %	75 %	0 %	289549285
31195	NC_013894	ACA	2	6	1418547	1418552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549285
31196	NC_013894	GGGTG	2	10	1418553	1418562	0 %	20 %	80 %	0 %	289549285
31197	NC_013894	AAG	2	6	1418595	1418600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549285
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31199	NC_013894	CCT	2	6	1418643	1418648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289549285
31200	NC_013894	GAGG	2	8	1418663	1418670	25 %	0 %	75 %	0 %	289549285
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31202	NC_013894	GTA	2	6	1418737	1418742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549285
31203	NC_013894	CA	3	6	1418864	1418869	50 %	0 %	0 %	50 %	289549285
31204	NC_013894	TG	3	6	1418877	1418882	0 %	50 %	50 %	0 %	289549285
31205	NC_013894	CGG	2	6	1418899	1418904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289549285
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31207	NC_013894	AAG	3	9	1418953	1418961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549285
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31210	NC_013894	TC	3	6	1419038	1419043	0 %	50 %	0 %	50 %	289549286
31211	NC_013894	AGAA	2	8	1419088	1419095	75 %	0 %	25 %	0 %	289549286
31212	NC_013894	AAGG	2	8	1419334	1419341	50 %	0 %	50 %	0 %	289549286
31213	NC_013894	G	6	6	1419438	1419443	0 %	0 %	100 %	0 %	289549286
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31217	NC_013894	TGG	2	6	1419599	1419604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549286
31218	NC_013894	ATA	2	6	1419625	1419630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549286
31219	NC_013894	GGAGA	2	10	1419667	1419676	40 %	0 %	60 %	0 %	289549286
31220	NC_013894	TAC	2	6	1419689	1419694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549286
31221	NC_013894	AGG	2	6	1419710	1419715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549286
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31225	NC_013894	GA	3	6	1419925	1419930	50 %	0 %	50 %	0 %	289549286
31226	NC_013894	AGG	2	6	1419931	1419936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549286
31227	NC_013894	GA	3	6	1420045	1420050	50 %	0 %	50 %	0 %	289549286
31228	NC_013894	GT	3	6	1420072	1420077	0 %	50 %	50 %	0 %	289549286
31229	NC_013894	AC	3	6	1420141	1420146	50 %	0 %	0 %	50 %	289549286
31230	NC_013894	CTT	2	6	1420150	1420155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549286
31231	NC_013894	TGA	2	6	1420189	1420194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549286
31232	NC_013894	GAG	2	6	1420268	1420273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289549287
31233	NC_013894	T	6	6	1420298	1420303	0 %	100 %	0 %	0 %	289549287
31234	NC_013894	GGT	3	9	1420304	1420312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549287
31235	NC_013894	CTT	2	6	1420356	1420361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549287
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31474	NC_013894	ACCT	2	8	1430292	1430299	25 %	25 %	0 %	50 %	289549300
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31499	NC_013894	TGA	2	6	1431248	1431253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549302
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