MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_013894	GAT	2	6	452245	452250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548240
10003	NC_013894	CCT	2	6	452251	452256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548241
10004	NC_013894	T	6	6	452274	452279	0 %	100 %	0 %	0 %	289548241
10005	NC_013894	AG	3	6	452498	452503	50 %	0 %	50 %	0 %	289548241
10006	NC_013894	CGCC	2	8	452509	452516	0 %	0 %	25 %	75 %	289548241
10007	NC_013894	CTT	2	6	452569	452574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548241
10008	NC_013894	AC	3	6	452650	452655	50 %	0 %	0 %	50 %	289548241
10009	NC_013894	GA	3	6	452683	452688	50 %	0 %	50 %	0 %	289548241
10010	NC_013894	GT	3	6	452699	452704	0 %	50 %	50 %	0 %	289548241
10011	NC_013894	TTA	2	6	452722	452727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548241
10012	NC_013894	ACA	2	6	452737	452742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548241
10013	NC_013894	GGA	2	6	452743	452748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548241
10014	NC_013894	GAG	2	6	452828	452833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548241
10015	NC_013894	AG	3	6	452959	452964	50 %	0 %	50 %	0 %	289548241
10016	NC_013894	ACA	2	6	452967	452972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548241
10017	NC_013894	GGT	3	9	453164	453172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548241
10018	NC_013894	GTG	2	6	453182	453187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548241
10019	NC_013894	TAC	2	6	453305	453310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548241
10020	NC_013894	AT	3	6	453434	453439	50 %	50 %	0 %	0 %	289548241
10021	NC_013894	AGG	2	6	453630	453635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548241
10022	NC_013894	GA	3	6	453696	453701	50 %	0 %	50 %	0 %	289548241
10023	NC_013894	GA	3	6	453832	453837	50 %	0 %	50 %	0 %	289548241
10024	NC_013894	TAC	2	6	453863	453868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548241
10025	NC_013894	CTGT	2	8	453901	453908	0 %	50 %	25 %	25 %	289548242
10026	NC_013894	CCT	2	6	453922	453927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548242
10027	NC_013894	GGT	2	6	453981	453986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548242
10028	NC_013894	GAA	2	6	454016	454021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548242
10029	NC_013894	GAA	2	6	454085	454090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548242
10030	NC_013894	TTC	2	6	454184	454189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548242
10031	NC_013894	CA	4	8	454240	454247	50 %	0 %	0 %	50 %	289548242
10032	NC_013894	ACCTT	2	10	454287	454296	20 %	40 %	0 %	40 %	289548242
10033	NC_013894	TCTT	2	8	454320	454327	0 %	75 %	0 %	25 %	289548242
10034	NC_013894	TCC	2	6	454352	454357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548242
10035	NC_013894	GTA	2	6	454400	454405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548242
10036	NC_013894	CAC	2	6	454414	454419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548242
10037	NC_013894	TGCC	2	8	454537	454544	0 %	25 %	25 %	50 %	289548242
10038	NC_013894	CGT	2	6	454720	454725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548242
10039	NC_013894	TGG	2	6	454804	454809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548242
10040	NC_013894	GAG	2	6	454821	454826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548242
10041	NC_013894	GAA	2	6	454857	454862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548242
10042	NC_013894	ACC	2	6	454863	454868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548242
10043	NC_013894	TC	3	6	455049	455054	0 %	50 %	0 %	50 %	289548242
10044	NC_013894	ACC	2	6	455108	455113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548242
10045	NC_013894	T	6	6	455123	455128	0 %	100 %	0 %	0 %	289548242
10046	NC_013894	CTC	2	6	455167	455172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548243
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10051	NC_013894	TCC	2	6	455345	455350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548243
10052	NC_013894	TC	3	6	455489	455494	0 %	50 %	0 %	50 %	289548243
10053	NC_013894	AAG	2	6	455517	455522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548243
10054	NC_013894	AAT	2	6	455614	455619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548243
10055	NC_013894	ACAGT	2	10	455646	455655	40 %	20 %	20 %	20 %	289548243
10056	NC_013894	GAA	2	6	455658	455663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548243
10057	NC_013894	GTG	2	6	455681	455686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548243
10058	NC_013894	TCCATA	2	12	455699	455710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548243
10059	NC_013894	AAG	2	6	455714	455719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548243
10060	NC_013894	CTC	2	6	455726	455731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548243
10061	NC_013894	TCT	2	6	455732	455737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548243
10062	NC_013894	AGC	2	6	455750	455755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548243
10063	NC_013894	ACC	2	6	455856	455861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548244
10064	NC_013894	A	7	7	455876	455882	100 %	0 %	0 %	0 %	289548244
10065	NC_013894	GAA	2	6	456079	456084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548244
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10069	NC_013894	AG	3	6	456210	456215	50 %	0 %	50 %	0 %	289548244
10070	NC_013894	TGT	2	6	456273	456278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548244
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10075	NC_013894	AGG	2	6	456479	456484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548244
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10078	NC_013894	TTC	2	6	456649	456654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548244
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10088	NC_013894	TGA	2	6	457153	457158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548245
10089	NC_013894	CAG	2	6	457168	457173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548245
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10093	NC_013894	TTC	2	6	457225	457230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548245
10094	NC_013894	TCG	2	6	457299	457304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548245
10095	NC_013894	TCG	2	6	457389	457394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548245
10096	NC_013894	TACC	2	8	457446	457453	25 %	25 %	0 %	50 %	289548245
10097	NC_013894	TA	3	6	457467	457472	50 %	50 %	0 %	0 %	289548245
10098	NC_013894	TA	3	6	457541	457546	50 %	50 %	0 %	0 %	289548245
10099	NC_013894	CGT	2	6	457549	457554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548245
10100	NC_013894	TGT	2	6	457561	457566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548245
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10102	NC_013894	CGG	2	6	457735	457740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289548245
10103	NC_013894	A	7	7	457808	457814	100 %	0 %	0 %	0 %	289548245
10104	NC_013894	CAT	2	6	457823	457828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548245
10105	NC_013894	TAT	2	6	457836	457841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_013894	TCT	2	6	457863	457868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_013894	AT	3	6	457891	457896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_013894	A	8	8	457907	457914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_013894	GGT	2	6	457918	457923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_013894	A	6	6	457930	457935	100 %	0 %	0 %	0 %	289548246
10111	NC_013894	TGG	2	6	457955	457960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548246
10112	NC_013894	CTG	2	6	458032	458037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548246
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10114	NC_013894	CAA	2	6	458103	458108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548246
10115	NC_013894	AAG	2	6	458197	458202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548246
10116	NC_013894	GAG	2	6	458203	458208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548246
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10118	NC_013894	TTTGAC	2	12	458257	458268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289548246
10119	NC_013894	AGA	2	6	458282	458287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548246
10120	NC_013894	TCC	2	6	458329	458334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548246
10121	NC_013894	TGG	3	9	458348	458356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548246
10122	NC_013894	AAG	2	6	458440	458445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548246
10123	NC_013894	CAT	2	6	458544	458549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548246
10124	NC_013894	GCG	2	6	458565	458570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289548247
10125	NC_013894	TGT	2	6	458633	458638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548247
10126	NC_013894	TCC	2	6	458748	458753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548247
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10144	NC_013894	CA	3	6	459532	459537	50 %	0 %	0 %	50 %	289548247
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10230	NC_013894	ATG	2	6	463216	463221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548250
10231	NC_013894	TAT	2	6	463278	463283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548250
10232	NC_013894	TGG	2	6	463310	463315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548250
10233	NC_013894	CA	4	8	463427	463434	50 %	0 %	0 %	50 %	289548251
10234	NC_013894	CCT	2	6	463453	463458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548251
10235	NC_013894	T	6	6	463494	463499	0 %	100 %	0 %	0 %	289548251
10236	NC_013894	CAC	3	9	463544	463552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548251
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10238	NC_013894	AGT	2	6	463621	463626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548251
10239	NC_013894	CAC	2	6	463703	463708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548251
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10241	NC_013894	CTT	2	6	463869	463874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548252
10242	NC_013894	C	6	6	463905	463910	0 %	0 %	0 %	100 %	289548252
10243	NC_013894	GAT	2	6	463917	463922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548252
10244	NC_013894	TCC	2	6	463980	463985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548252
10245	NC_013894	CCT	2	6	463994	463999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548252
10246	NC_013894	CCTC	2	8	464027	464034	0 %	25 %	0 %	75 %	289548252
10247	NC_013894	AAGG	2	8	464183	464190	50 %	0 %	50 %	0 %	289548252
10248	NC_013894	CAC	3	9	464193	464201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548252
10249	NC_013894	TAA	2	6	464231	464236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548252
10250	NC_013894	TC	3	6	464247	464252	0 %	50 %	0 %	50 %	289548252
10251	NC_013894	AC	4	8	464303	464310	50 %	0 %	0 %	50 %	289548252
10252	NC_013894	ACC	2	6	464441	464446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548253
10253	NC_013894	AAC	2	6	464448	464453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548253
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10255	NC_013894	CT	3	6	464498	464503	0 %	50 %	0 %	50 %	289548253
10256	NC_013894	AAG	2	6	464518	464523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548253
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10258	NC_013894	CTGTG	2	10	464582	464591	0 %	40 %	40 %	20 %	289548253
10259	NC_013894	GGT	2	6	464602	464607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548253
10260	NC_013894	AGA	2	6	464614	464619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548253
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10262	NC_013894	CAAAG	2	10	464783	464792	60 %	0 %	20 %	20 %	289548254
10263	NC_013894	ACC	2	6	464799	464804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548254
10264	NC_013894	AAAAT	2	10	464839	464848	80 %	20 %	0 %	0 %	289548254
10265	NC_013894	AGG	2	6	464883	464888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548254
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10269	NC_013894	T	7	7	465012	465018	0 %	100 %	0 %	0 %	289548255
10270	NC_013894	TGAGCC	2	12	465020	465031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289548255
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10272	NC_013894	CT	3	6	465054	465059	0 %	50 %	0 %	50 %	289548255
10273	NC_013894	GTA	2	6	465080	465085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548255
10274	NC_013894	CTC	3	9	465087	465095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548255
10275	NC_013894	CTC	2	6	465159	465164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548255
10276	NC_013894	T	6	6	465183	465188	0 %	100 %	0 %	0 %	289548255
10277	NC_013894	GT	3	6	465291	465296	0 %	50 %	50 %	0 %	289548255
10278	NC_013894	AGG	2	6	465304	465309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548255
10279	NC_013894	ATGC	2	8	465312	465319	25 %	25 %	25 %	25 %	289548255
10280	NC_013894	CTC	2	6	465372	465377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548255
10281	NC_013894	TCG	2	6	465418	465423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548255
10282	NC_013894	CTT	2	6	465444	465449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548255
10283	NC_013894	CAC	2	6	465525	465530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548255
10284	NC_013894	CTT	2	6	465539	465544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548255
10285	NC_013894	TCC	2	6	465550	465555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548255
10286	NC_013894	TCCC	2	8	465658	465665	0 %	25 %	0 %	75 %	289548255
10287	NC_013894	AGGA	2	8	465684	465691	50 %	0 %	50 %	0 %	289548255
10288	NC_013894	AGAA	2	8	465729	465736	75 %	0 %	25 %	0 %	289548255
10289	NC_013894	TC	4	8	465748	465755	0 %	50 %	0 %	50 %	289548255
10290	NC_013894	CACC	2	8	465800	465807	25 %	0 %	0 %	75 %	289548255
10291	NC_013894	CCA	2	6	465871	465876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548255
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10295	NC_013894	GA	3	6	465975	465980	50 %	0 %	50 %	0 %	289548255
10296	NC_013894	ATC	2	6	466042	466047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548255
10297	NC_013894	CT	3	6	466048	466053	0 %	50 %	0 %	50 %	289548256
10298	NC_013894	AG	4	8	466089	466096	50 %	0 %	50 %	0 %	289548256
10299	NC_013894	AC	4	8	466097	466104	50 %	0 %	0 %	50 %	289548256
10300	NC_013894	AGA	2	6	466110	466115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548256
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10303	NC_013894	CTA	2	6	466168	466173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548256
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10310	NC_013894	GAT	2	6	466466	466471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548256
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10314	NC_013894	A	7	7	466635	466641	100 %	0 %	0 %	0 %	289548256
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10316	NC_013894	TGA	2	6	466692	466697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548256
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10319	NC_013894	TATC	2	8	466846	466853	25 %	50 %	0 %	25 %	289548256
10320	NC_013894	CCA	2	6	466882	466887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548256
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10322	NC_013894	CCA	2	6	466942	466947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548256
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10327	NC_013894	AG	3	6	467170	467175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10328	NC_013894	GGA	3	9	467298	467306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548257
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10332	NC_013894	TGG	2	6	467450	467455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548257
10333	NC_013894	ACA	2	6	467465	467470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548257
10334	NC_013894	TCT	2	6	467484	467489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548257
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10336	NC_013894	AT	3	6	467582	467587	50 %	50 %	0 %	0 %	289548258
10337	NC_013894	CTG	2	6	467623	467628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548258
10338	NC_013894	GTGGA	2	10	467629	467638	20 %	20 %	60 %	0 %	289548258
10339	NC_013894	AG	3	6	467787	467792	50 %	0 %	50 %	0 %	289548258
10340	NC_013894	GGTA	2	8	467799	467806	25 %	25 %	50 %	0 %	289548258
10341	NC_013894	TCTTT	2	10	467828	467837	0 %	80 %	0 %	20 %	289548258
10342	NC_013894	TCT	2	6	467863	467868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548258
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10347	NC_013894	GA	3	6	467938	467943	50 %	0 %	50 %	0 %	289548258
10348	NC_013894	CGG	2	6	467984	467989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289548258
10349	NC_013894	GAG	2	6	468022	468027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548258
10350	NC_013894	GAA	3	9	468153	468161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548258
10351	NC_013894	CAG	2	6	468169	468174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548258
10352	NC_013894	CTG	2	6	468199	468204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548258
10353	NC_013894	ATA	2	6	468211	468216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548258
10354	NC_013894	TGA	2	6	468235	468240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548258
10355	NC_013894	AGA	2	6	468250	468255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548259
10356	NC_013894	GGT	3	9	468260	468268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548259
10357	NC_013894	TCA	2	6	468301	468306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548259
10358	NC_013894	GGAGA	2	10	468338	468347	40 %	0 %	60 %	0 %	289548259
10359	NC_013894	CAT	2	6	468509	468514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548259
10360	NC_013894	ATA	2	6	468564	468569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548259
10361	NC_013894	CTT	2	6	468572	468577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548259
10362	NC_013894	TGG	3	9	468601	468609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548259
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10364	NC_013894	GAA	2	6	468731	468736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548259
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