MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_013894	ACC	2	6	338501	338506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548111
7503	NC_013894	TTC	2	6	338507	338512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548111
7504	NC_013894	CT	3	6	338522	338527	0 %	50 %	0 %	50 %	289548111
7505	NC_013894	AGA	2	6	338536	338541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548111
7506	NC_013894	CTC	2	6	338557	338562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548111
7507	NC_013894	TTA	2	6	338571	338576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548112
7508	NC_013894	TCT	2	6	338606	338611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548112
7509	NC_013894	TCT	2	6	338636	338641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548112
7510	NC_013894	GTA	2	6	338649	338654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548112
7511	NC_013894	CTC	2	6	338680	338685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548112
7512	NC_013894	ACT	2	6	338726	338731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548112
7513	NC_013894	TAT	2	6	338803	338808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548112
7514	NC_013894	CCA	2	6	338901	338906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548112
7515	NC_013894	C	6	6	338963	338968	0 %	0 %	0 %	100 %	289548112
7516	NC_013894	TGGC	2	8	339000	339007	0 %	25 %	50 %	25 %	289548112
7517	NC_013894	TTG	2	6	339023	339028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548112
7518	NC_013894	CCT	2	6	339036	339041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548112
7519	NC_013894	GCCATA	2	12	339056	339067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289548112
7520	NC_013894	GTAC	2	8	339135	339142	25 %	25 %	25 %	25 %	289548112
7521	NC_013894	TGGG	2	8	339149	339156	0 %	25 %	75 %	0 %	289548112
7522	NC_013894	CTT	2	6	339201	339206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548112
7523	NC_013894	GTT	2	6	339221	339226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548112
7524	NC_013894	ATG	2	6	339308	339313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548112
7525	NC_013894	TCC	3	9	339347	339355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548112
7526	NC_013894	ATG	2	6	339362	339367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548112
7527	NC_013894	TCG	2	6	339428	339433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548112
7528	NC_013894	CTA	2	6	339441	339446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548112
7529	NC_013894	TCG	2	6	339461	339466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548112
7530	NC_013894	CT	3	6	339485	339490	0 %	50 %	0 %	50 %	289548112
7531	NC_013894	TTC	2	6	339524	339529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548113
7532	NC_013894	TTC	2	6	339560	339565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548113
7533	NC_013894	CCT	2	6	339566	339571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548113
7534	NC_013894	CT	3	6	339578	339583	0 %	50 %	0 %	50 %	289548113
7535	NC_013894	GAA	2	6	339606	339611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548113
7536	NC_013894	AGA	2	6	339612	339617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548113
7537	NC_013894	TC	3	6	339618	339623	0 %	50 %	0 %	50 %	289548113
7538	NC_013894	CTTA	2	8	339661	339668	25 %	50 %	0 %	25 %	289548113
7539	NC_013894	TACC	2	8	339729	339736	25 %	25 %	0 %	50 %	289548113
7540	NC_013894	TCC	2	6	339794	339799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548113
7541	NC_013894	CGT	2	6	339807	339812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548113
7542	NC_013894	CT	3	6	339855	339860	0 %	50 %	0 %	50 %	289548113
7543	NC_013894	TGA	2	6	339861	339866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548113
7544	NC_013894	TCC	2	6	339869	339874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548113
7545	NC_013894	TC	3	6	339946	339951	0 %	50 %	0 %	50 %	289548113
7546	NC_013894	AG	3	6	339957	339962	50 %	0 %	50 %	0 %	289548113
7547	NC_013894	T	6	6	340150	340155	0 %	100 %	0 %	0 %	289548113
7548	NC_013894	TCC	2	6	340172	340177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548113
7549	NC_013894	TGA	2	6	340247	340252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548113
7550	NC_013894	GAA	2	6	340341	340346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_013894	CCTT	2	8	340422	340429	0 %	50 %	0 %	50 %	289548114
7552	NC_013894	TAG	2	6	340443	340448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548114
7553	NC_013894	GAA	2	6	340474	340479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548114
7554	NC_013894	TGA	2	6	340524	340529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548114
7555	NC_013894	TCCT	2	8	340533	340540	0 %	50 %	0 %	50 %	289548114
7556	NC_013894	CTG	2	6	340639	340644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548114
7557	NC_013894	AC	3	6	340688	340693	50 %	0 %	0 %	50 %	289548114
7558	NC_013894	AAG	2	6	340724	340729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548114
7559	NC_013894	TCC	2	6	340737	340742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548114
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7561	NC_013894	TCT	2	6	340825	340830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548114
7562	NC_013894	GTA	2	6	340898	340903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548114
7563	NC_013894	CA	3	6	340921	340926	50 %	0 %	0 %	50 %	289548114
7564	NC_013894	TCC	2	6	340935	340940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548114
7565	NC_013894	TCC	2	6	340971	340976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548114
7566	NC_013894	TAAGG	2	10	340996	341005	40 %	20 %	40 %	0 %	289548114
7567	NC_013894	GAA	2	6	341111	341116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548114
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7570	NC_013894	CTT	2	6	341268	341273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548115
7571	NC_013894	ACC	3	9	341317	341325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548115
7572	NC_013894	TC	3	6	341332	341337	0 %	50 %	0 %	50 %	289548115
7573	NC_013894	AC	3	6	341388	341393	50 %	0 %	0 %	50 %	289548115
7574	NC_013894	TCG	2	6	341396	341401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548115
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7578	NC_013894	AGTT	2	8	341650	341657	25 %	50 %	25 %	0 %	289548115
7579	NC_013894	ATCT	2	8	341755	341762	25 %	50 %	0 %	25 %	289548115
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7581	NC_013894	TAAAC	2	10	341792	341801	60 %	20 %	0 %	20 %	289548115
7582	NC_013894	CTC	2	6	341853	341858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548115
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7588	NC_013894	TCC	2	6	342176	342181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548115
7589	NC_013894	CCT	2	6	342194	342199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548116
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7592	NC_013894	CCTT	2	8	342401	342408	0 %	50 %	0 %	50 %	289548116
7593	NC_013894	TACGGT	2	12	342508	342519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289548116
7594	NC_013894	CAG	2	6	342532	342537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548116
7595	NC_013894	CACC	2	8	342573	342580	25 %	0 %	0 %	75 %	289548116
7596	NC_013894	ACC	3	9	342578	342586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548116
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7601	NC_013894	TA	3	6	342926	342931	50 %	50 %	0 %	0 %	289548116
7602	NC_013894	GGA	2	6	342938	342943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548116
7603	NC_013894	ACC	2	6	342959	342964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548116
7604	NC_013894	TC	4	8	343008	343015	0 %	50 %	0 %	50 %	289548116
7605	NC_013894	TC	3	6	343126	343131	0 %	50 %	0 %	50 %	289548117
7606	NC_013894	AGT	2	6	343201	343206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548117
7607	NC_013894	CCA	2	6	343253	343258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548117
7608	NC_013894	AC	3	6	343272	343277	50 %	0 %	0 %	50 %	289548117
7609	NC_013894	AAG	2	6	343323	343328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548117
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7611	NC_013894	CTT	2	6	343378	343383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548117
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7613	NC_013894	TCAC	2	8	343414	343421	25 %	25 %	0 %	50 %	289548117
7614	NC_013894	GT	3	6	343451	343456	0 %	50 %	50 %	0 %	289548117
7615	NC_013894	GTC	2	6	343461	343466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548117
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7618	NC_013894	TCTTA	2	10	343500	343509	20 %	60 %	0 %	20 %	289548117
7619	NC_013894	AAG	2	6	343512	343517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548117
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7621	NC_013894	TCC	2	6	343537	343542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548117
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