MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 32977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013894	CAG	2	6	223411	223416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548003
5002	NC_013894	AGA	2	6	223450	223455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548003
5003	NC_013894	GGA	2	6	223518	223523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548003
5004	NC_013894	TTC	2	6	223525	223530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548003
5005	NC_013894	A	9	9	223633	223641	100 %	0 %	0 %	0 %	289548003
5006	NC_013894	AAC	2	6	223645	223650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548003
5007	NC_013894	ATA	2	6	223651	223656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548003
5008	NC_013894	CTC	2	6	223708	223713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548003
5009	NC_013894	GGA	2	6	223774	223779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548003
5010	NC_013894	AC	3	6	223862	223867	50 %	0 %	0 %	50 %	289548003
5011	NC_013894	TGT	2	6	223909	223914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548003
5012	NC_013894	AGGA	2	8	223961	223968	50 %	0 %	50 %	0 %	289548003
5013	NC_013894	AGAGGA	2	12	224022	224033	50 %	0 %	50 %	0 %	289548003
5014	NC_013894	CCT	2	6	224070	224075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548003
5015	NC_013894	AGA	2	6	224079	224084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548003
5016	NC_013894	TAAAGG	2	12	224099	224110	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	289548003
5017	NC_013894	TG	3	6	224115	224120	0 %	50 %	50 %	0 %	289548003
5018	NC_013894	CCTA	2	8	224182	224189	25 %	25 %	0 %	50 %	289548003
5019	NC_013894	AAG	2	6	224249	224254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548003
5020	NC_013894	AGA	2	6	224280	224285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548003
5021	NC_013894	AG	3	6	224336	224341	50 %	0 %	50 %	0 %	289548003
5022	NC_013894	AG	3	6	224343	224348	50 %	0 %	50 %	0 %	289548003
5023	NC_013894	TGGT	2	8	224360	224367	0 %	50 %	50 %	0 %	289548003
5024	NC_013894	GAA	2	6	224395	224400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548003
5025	NC_013894	AGA	2	6	224438	224443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548003
5026	NC_013894	TGC	2	6	224465	224470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548003
5027	NC_013894	TCA	2	6	224532	224537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548003
5028	NC_013894	CTG	2	6	224569	224574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548003
5029	NC_013894	TACCG	2	10	224590	224599	20 %	20 %	20 %	40 %	289548003
5030	NC_013894	AC	4	8	224625	224632	50 %	0 %	0 %	50 %	289548003
5031	NC_013894	GTT	2	6	224641	224646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548003
5032	NC_013894	TAT	2	6	224716	224721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548003
5033	NC_013894	ACT	2	6	224730	224735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548003
5034	NC_013894	AGG	2	6	224785	224790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548004
5035	NC_013894	GTA	2	6	224848	224853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548004
5036	NC_013894	GCAC	2	8	224855	224862	25 %	0 %	25 %	50 %	289548004
5037	NC_013894	CAA	2	6	224930	224935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548004
5038	NC_013894	GTT	2	6	224960	224965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548004
5039	NC_013894	AAG	2	6	224988	224993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548004
5040	NC_013894	CAA	2	6	224997	225002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548004
5041	NC_013894	TA	3	6	225033	225038	50 %	50 %	0 %	0 %	289548004
5042	NC_013894	GGA	2	6	225076	225081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548004
5043	NC_013894	ATG	2	6	225099	225104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548004
5044	NC_013894	GTTT	2	8	225107	225114	0 %	75 %	25 %	0 %	289548004
5045	NC_013894	AGA	2	6	225157	225162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548004
5046	NC_013894	CAC	2	6	225189	225194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548004
5047	NC_013894	AGA	2	6	225215	225220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548004
5048	NC_013894	ACC	2	6	225238	225243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548004
5049	NC_013894	TAA	2	6	225250	225255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548004
5050	NC_013894	TCT	2	6	225304	225309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548004
5051	NC_013894	GTA	2	6	225327	225332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548004
5052	NC_013894	ACC	2	6	225369	225374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548004
5053	NC_013894	AGA	3	9	225388	225396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548004
5054	NC_013894	GAG	2	6	225480	225485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548004
5055	NC_013894	A	6	6	225555	225560	100 %	0 %	0 %	0 %	289548004
5056	NC_013894	GTT	2	6	225664	225669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548004
5057	NC_013894	AAG	2	6	225690	225695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548004
5058	NC_013894	AG	3	6	225754	225759	50 %	0 %	50 %	0 %	289548004
5059	NC_013894	TCT	2	6	225835	225840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548004
5060	NC_013894	AGA	2	6	225926	225931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548004
5061	NC_013894	AGT	2	6	225940	225945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548004
5062	NC_013894	AAG	2	6	225984	225989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013894	CACC	2	8	226005	226012	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5064	NC_013894	AGC	2	6	226085	226090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548005
5065	NC_013894	A	9	9	226114	226122	100 %	0 %	0 %	0 %	289548005
5066	NC_013894	GGAA	2	8	226155	226162	50 %	0 %	50 %	0 %	289548005
5067	NC_013894	TAA	2	6	226203	226208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548005
5068	NC_013894	AGTG	2	8	226230	226237	25 %	25 %	50 %	0 %	289548005
5069	NC_013894	AGG	2	6	226255	226260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548005
5070	NC_013894	AGG	2	6	226315	226320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548005
5071	NC_013894	AAG	2	6	226356	226361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548005
5072	NC_013894	A	6	6	226375	226380	100 %	0 %	0 %	0 %	289548005
5073	NC_013894	AAG	2	6	226560	226565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548006
5074	NC_013894	AT	3	6	226615	226620	50 %	50 %	0 %	0 %	289548006
5075	NC_013894	ACT	2	6	226629	226634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548006
5076	NC_013894	CTT	2	6	226695	226700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548006
5077	NC_013894	CCT	2	6	226708	226713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548006
5078	NC_013894	AAG	2	6	226856	226861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548006
5079	NC_013894	CCA	2	6	226876	226881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548006
5080	NC_013894	TGG	2	6	226882	226887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289548006
5081	NC_013894	TAACA	2	10	226894	226903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5082	NC_013894	CGT	2	6	226916	226921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548007
5083	NC_013894	GC	3	6	226930	226935	0 %	0 %	50 %	50 %	289548007
5084	NC_013894	TCC	2	6	227026	227031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548007
5085	NC_013894	TAA	2	6	227042	227047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289548007
5086	NC_013894	CCA	2	6	227051	227056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548007
5087	NC_013894	CG	3	6	227095	227100	0 %	0 %	50 %	50 %	289548007
5088	NC_013894	CA	3	6	227137	227142	50 %	0 %	0 %	50 %	289548007
5089	NC_013894	CCA	2	6	227144	227149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548007
5090	NC_013894	ACC	2	6	227302	227307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548007
5091	NC_013894	CCT	2	6	227345	227350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548007
5092	NC_013894	TC	3	6	227362	227367	0 %	50 %	0 %	50 %	289548007
5093	NC_013894	CACCCA	2	12	227370	227381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548007
5094	NC_013894	TC	4	8	227407	227414	0 %	50 %	0 %	50 %	289548007
5095	NC_013894	TTG	2	6	227446	227451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548007
5096	NC_013894	TTG	3	9	227470	227478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289548007
5097	NC_013894	AGT	2	6	227527	227532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548007
5098	NC_013894	CTGT	2	8	227671	227678	0 %	50 %	25 %	25 %	289548007
5099	NC_013894	CAG	2	6	227682	227687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289548007
5100	NC_013894	CTG	2	6	227692	227697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548007
5101	NC_013894	CAC	2	6	227712	227717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548007
5102	NC_013894	TTA	2	6	227747	227752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289548007
5103	NC_013894	ACGC	2	8	227785	227792	25 %	0 %	25 %	50 %	289548007
5104	NC_013894	ACCT	2	8	227835	227842	25 %	25 %	0 %	50 %	289548007
5105	NC_013894	CT	3	6	227849	227854	0 %	50 %	0 %	50 %	289548007
5106	NC_013894	CCTC	2	8	227888	227895	0 %	25 %	0 %	75 %	289548007
5107	NC_013894	TCC	2	6	227956	227961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548007
5108	NC_013894	GCAC	2	8	228016	228023	25 %	0 %	25 %	50 %	289548007
5109	NC_013894	TTC	2	6	228031	228036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289548007
5110	NC_013894	AGA	2	6	228113	228118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289548007
5111	NC_013894	CT	3	6	228149	228154	0 %	50 %	0 %	50 %	289548007
5112	NC_013894	TCC	2	6	228226	228231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548007
5113	NC_013894	AGTG	2	8	228254	228261	25 %	25 %	50 %	0 %	289548007
5114	NC_013894	TCCC	2	8	228353	228360	0 %	25 %	0 %	75 %	289548008
5115	NC_013894	ACC	2	6	228397	228402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548008
5116	NC_013894	CTC	2	6	228417	228422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548008
5117	NC_013894	GA	3	6	228484	228489	50 %	0 %	50 %	0 %	289548008
5118	NC_013894	AC	3	6	228496	228501	50 %	0 %	0 %	50 %	289548008
5119	NC_013894	CGT	2	6	228542	228547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548008
5120	NC_013894	TGA	2	6	228575	228580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289548008
5121	NC_013894	CT	3	6	228631	228636	0 %	50 %	0 %	50 %	289548008
5122	NC_013894	CT	3	6	228649	228654	0 %	50 %	0 %	50 %	289548008
5123	NC_013894	CCT	2	6	228742	228747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548008
5124	NC_013894	CTG	2	6	228772	228777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548008
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5489	NC_013894	AC	3	6	245183	245188	50 %	0 %	0 %	50 %	289548023
5490	NC_013894	C	6	6	245224	245229	0 %	0 %	0 %	100 %	289548023
5491	NC_013894	CCT	2	6	245247	245252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289548023
5492	NC_013894	CAA	2	6	245378	245383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289548023
5493	NC_013894	TACC	2	8	245408	245415	25 %	25 %	0 %	50 %	289548023
5494	NC_013894	CAT	2	6	245457	245462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289548023
5495	NC_013894	CAC	2	6	245463	245468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548023
5496	NC_013894	GGA	2	6	245482	245487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289548023
5497	NC_013894	CAC	2	6	245495	245500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289548023
5498	NC_013894	CTG	2	6	245539	245544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289548023
5499	NC_013894	CCTTT	2	10	245547	245556	0 %	60 %	0 %	40 %	289548023
5500	NC_013894	CCTG	2	8	245596	245603	0 %	25 %	25 %	50 %	289548023

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