MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013889	T	6	6	662489	662494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_013889	GCG	2	6	662523	662528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_013889	GCG	2	6	662573	662578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_013889	GTG	3	9	662596	662604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_013889	CCGGT	2	10	662619	662628	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15506	NC_013889	GGCA	2	8	662633	662640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15507	NC_013889	CAC	2	6	662700	662705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15508	NC_013889	CGCA	2	8	662714	662721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15509	NC_013889	GTC	2	6	662800	662805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15510	NC_013889	AC	3	6	662817	662822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15511	NC_013889	CTGC	2	8	662827	662834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15512	NC_013889	GTG	2	6	662840	662845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_013889	GA	3	6	662858	662863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_013889	GGGA	2	8	663006	663013	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_013889	GCGAAC	2	12	663030	663041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_013889	TTC	2	6	663166	663171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207807
15517	NC_013889	TGA	2	6	663188	663193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207807
15518	NC_013889	CAC	2	6	663210	663215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207807
15519	NC_013889	GAA	2	6	663271	663276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207807
15520	NC_013889	CG	3	6	663390	663395	0 %	0 %	50 %	50 %	289207807
15521	NC_013889	GGT	2	6	663406	663411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207807
15522	NC_013889	CTG	2	6	663529	663534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207807
15523	NC_013889	GCC	2	6	663646	663651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207807
15524	NC_013889	TGCG	2	8	663749	663756	0 %	25 %	50 %	25 %	289207807
15525	NC_013889	GTC	2	6	663815	663820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207807
15526	NC_013889	CGA	2	6	663829	663834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207807
15527	NC_013889	CCA	2	6	663908	663913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207807
15528	NC_013889	TGGT	2	8	663992	663999	0 %	50 %	50 %	0 %	289207807
15529	NC_013889	GCCC	2	8	664184	664191	0 %	0 %	25 %	75 %	289207807
15530	NC_013889	GTC	2	6	664357	664362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207807
15531	NC_013889	CCA	2	6	664410	664415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207807
15532	NC_013889	GC	3	6	664474	664479	0 %	0 %	50 %	50 %	289207807
15533	NC_013889	GCA	3	9	664560	664568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207807
15534	NC_013889	GCC	2	6	664610	664615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207807
15535	NC_013889	CGC	2	6	664647	664652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207807
15536	NC_013889	CCG	3	9	664658	664666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207807
15537	NC_013889	GTC	2	6	664693	664698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207807
15538	NC_013889	GCG	2	6	664710	664715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207807
15539	NC_013889	CAGCC	2	10	664748	664757	20 %	0 %	20 %	60 %	289207807
15540	NC_013889	GTT	2	6	664774	664779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207807
15541	NC_013889	GCC	2	6	664825	664830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207807
15542	NC_013889	CTC	2	6	664873	664878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207807
15543	NC_013889	TGT	2	6	664914	664919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207807
15544	NC_013889	GTC	2	6	664924	664929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207807
15545	NC_013889	CGG	2	6	664935	664940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207807
15546	NC_013889	TCCA	2	8	664985	664992	25 %	25 %	0 %	50 %	289207807
15547	NC_013889	GCG	2	6	665020	665025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207807
15548	NC_013889	CCG	2	6	665108	665113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207807
15549	NC_013889	CTGGCC	2	12	665122	665133	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289207807
15550	NC_013889	CTC	2	6	665143	665148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207807
15551	NC_013889	CAGGCC	2	12	665164	665175	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207807
15552	NC_013889	GAG	2	6	665176	665181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207807
15553	NC_013889	ACC	2	6	665189	665194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207807
15554	NC_013889	GCG	3	9	665200	665208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207807
15555	NC_013889	C	6	6	665323	665328	0 %	0 %	0 %	100 %	289207808
15556	NC_013889	TCA	2	6	665351	665356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207808
15557	NC_013889	GCG	2	6	665401	665406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207808
15558	NC_013889	GC	3	6	665470	665475	0 %	0 %	50 %	50 %	289207808
15559	NC_013889	CAG	2	6	665487	665492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207808
15560	NC_013889	GGTCG	2	10	665598	665607	0 %	20 %	60 %	20 %	289207808
15561	NC_013889	CCG	2	6	665737	665742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207808
15562	NC_013889	TTC	2	6	665865	665870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207808
15563	NC_013889	GCGA	2	8	665893	665900	25 %	0 %	50 %	25 %	289207808
15564	NC_013889	GTC	2	6	665916	665921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207808
15565	NC_013889	GCCA	2	8	665962	665969	25 %	0 %	25 %	50 %	289207808
15566	NC_013889	CCT	2	6	665998	666003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15567	NC_013889	ACC	2	6	666013	666018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207809
15568	NC_013889	CGT	2	6	666070	666075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207809
15569	NC_013889	G	6	6	666311	666316	0 %	0 %	100 %	0 %	289207809
15570	NC_013889	GT	3	6	666335	666340	0 %	50 %	50 %	0 %	289207809
15571	NC_013889	CAG	2	6	666344	666349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207809
15572	NC_013889	C	6	6	666380	666385	0 %	0 %	0 %	100 %	289207809
15573	NC_013889	GT	3	6	666429	666434	0 %	50 %	50 %	0 %	289207809
15574	NC_013889	CGAG	2	8	666490	666497	25 %	0 %	50 %	25 %	289207809
15575	NC_013889	TCT	2	6	666510	666515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207809
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15577	NC_013889	GCG	2	6	666571	666576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207809
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15580	NC_013889	GAAG	2	8	666664	666671	50 %	0 %	50 %	0 %	289207809
15581	NC_013889	GGT	2	6	666719	666724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207810
15582	NC_013889	GTC	2	6	666738	666743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207810
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15585	NC_013889	GCG	3	9	666819	666827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207810
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15590	NC_013889	AC	3	6	666964	666969	50 %	0 %	0 %	50 %	289207810
15591	NC_013889	CAA	2	6	666973	666978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207810
15592	NC_013889	TCT	2	6	666994	666999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207810
15593	NC_013889	G	6	6	667028	667033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_013889	CGC	2	6	667219	667224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15602	NC_013889	CGG	2	6	667416	667421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207811
15603	NC_013889	ATC	2	6	667444	667449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207811
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15605	NC_013889	CAG	2	6	667516	667521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207811
15606	NC_013889	GAC	2	6	667659	667664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207811
15607	NC_013889	A	6	6	667755	667760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15609	NC_013889	ATC	2	6	667948	667953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207812
15610	NC_013889	CCGC	2	8	667963	667970	0 %	0 %	25 %	75 %	289207812
15611	NC_013889	CTG	2	6	667977	667982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207812
15612	NC_013889	CGA	2	6	668000	668005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207812
15613	NC_013889	CGC	2	6	668033	668038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207812
15614	NC_013889	GATC	2	8	668081	668088	25 %	25 %	25 %	25 %	289207812
15615	NC_013889	GCC	2	6	668100	668105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207812
15616	NC_013889	CTG	2	6	668127	668132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207812
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15620	NC_013889	CAG	2	6	668397	668402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207812
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15622	NC_013889	TGT	2	6	668486	668491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207812
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15985	NC_013889	CCAAGG	2	12	684978	684989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207830
15986	NC_013889	TGGG	2	8	684993	685000	0 %	25 %	75 %	0 %	289207830
15987	NC_013889	CCG	2	6	685047	685052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207830
15988	NC_013889	GCTC	2	8	685083	685090	0 %	25 %	25 %	50 %	289207830
15989	NC_013889	CTT	2	6	685204	685209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207830
15990	NC_013889	CAG	2	6	685232	685237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207830
15991	NC_013889	ATG	2	6	685328	685333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207830
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15993	NC_013889	AGC	2	6	685389	685394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207830
15994	NC_013889	ATG	2	6	685514	685519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207830
15995	NC_013889	GC	3	6	685613	685618	0 %	0 %	50 %	50 %	289207830
15996	NC_013889	CT	3	6	685757	685762	0 %	50 %	0 %	50 %	289207830
15997	NC_013889	AGA	2	6	685773	685778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207830
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15999	NC_013889	GAC	2	6	685865	685870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207830
16000	NC_013889	GATGT	2	10	685967	685976	20 %	40 %	40 %	0 %	289207830

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