MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013889	AGA	2	6	43923	43928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207224
1002	NC_013889	ACC	2	6	43934	43939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207224
1003	NC_013889	TCC	2	6	43952	43957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207224
1004	NC_013889	CGG	2	6	43972	43977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207224
1005	NC_013889	CAG	2	6	44038	44043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207224
1006	NC_013889	ACG	2	6	44077	44082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207224
1007	NC_013889	GAAGGT	2	12	44140	44151	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	289207225
1008	NC_013889	GAT	2	6	44167	44172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207225
1009	NC_013889	CCA	2	6	44176	44181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207225
1010	NC_013889	GCC	2	6	44290	44295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207225
1011	NC_013889	GCC	2	6	44306	44311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207225
1012	NC_013889	GAA	2	6	44341	44346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207225
1013	NC_013889	CCGG	2	8	44427	44434	0 %	0 %	50 %	50 %	289207225
1014	NC_013889	GCC	2	6	44494	44499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207225
1015	NC_013889	CGA	2	6	44505	44510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207225
1016	NC_013889	CCA	2	6	44536	44541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207225
1017	NC_013889	CAG	2	6	44602	44607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207225
1018	NC_013889	GGC	2	6	44620	44625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207225
1019	NC_013889	GCT	2	6	44670	44675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207225
1020	NC_013889	GTA	2	6	44677	44682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207225
1021	NC_013889	CAG	2	6	44710	44715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207225
1022	NC_013889	GGTC	2	8	44763	44770	0 %	25 %	50 %	25 %	289207225
1023	NC_013889	CAT	2	6	44803	44808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207225
1024	NC_013889	TGC	2	6	44973	44978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207225
1025	NC_013889	GCG	2	6	45026	45031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207225
1026	NC_013889	GAT	2	6	45034	45039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207225
1027	NC_013889	CGG	2	6	45090	45095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207225
1028	NC_013889	GCC	2	6	45106	45111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207225
1029	NC_013889	CTC	2	6	45268	45273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_013889	TTA	2	6	45297	45302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013889	GAT	2	6	45351	45356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207226
1032	NC_013889	GAT	2	6	45462	45467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207226
1033	NC_013889	GAT	2	6	45510	45515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207226
1034	NC_013889	GC	4	8	45556	45563	0 %	0 %	50 %	50 %	289207226
1035	NC_013889	CCAG	2	8	45665	45672	25 %	0 %	25 %	50 %	289207226
1036	NC_013889	GCT	2	6	45674	45679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1037	NC_013889	GCA	2	6	45749	45754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207226
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1039	NC_013889	CGG	2	6	45802	45807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207226
1040	NC_013889	GTC	2	6	45868	45873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1041	NC_013889	TCG	2	6	45898	45903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1042	NC_013889	CG	4	8	45914	45921	0 %	0 %	50 %	50 %	289207226
1043	NC_013889	GCA	2	6	45947	45952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207226
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1045	NC_013889	CCG	2	6	45995	46000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207226
1046	NC_013889	TGCAG	2	10	46072	46081	20 %	20 %	40 %	20 %	289207226
1047	NC_013889	GTA	2	6	46098	46103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207226
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1050	NC_013889	GAT	2	6	46227	46232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207226
1051	NC_013889	AGCG	2	8	46294	46301	25 %	0 %	50 %	25 %	289207226
1052	NC_013889	CGC	2	6	46310	46315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207226
1053	NC_013889	GCC	2	6	46347	46352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207226
1054	NC_013889	GGT	2	6	46400	46405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207226
1055	NC_013889	TCG	2	6	46432	46437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1056	NC_013889	GGA	2	6	46587	46592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207226
1057	NC_013889	TCTCGA	2	12	46685	46696	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289207226
1058	NC_013889	AGC	2	6	46723	46728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1059	NC_013889	GC	3	6	46745	46750	0 %	0 %	50 %	50 %	289207226
1060	NC_013889	CAC	2	6	46761	46766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207226
1061	NC_013889	CAG	2	6	46782	46787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1062	NC_013889	TGC	2	6	46909	46914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1063	NC_013889	ACC	2	6	47044	47049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207226
1064	NC_013889	CAG	2	6	47064	47069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1065	NC_013889	CCA	2	6	47210	47215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207226
1066	NC_013889	GCGG	2	8	47280	47287	0 %	0 %	75 %	25 %	289207226
1067	NC_013889	TGC	2	6	47291	47296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207226
1068	NC_013889	A	6	6	47538	47543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013889	GGC	2	6	47546	47551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_013889	GCC	2	6	47557	47562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_013889	CGC	2	6	47579	47584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_013889	GAC	2	6	47618	47623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1073	NC_013889	TCG	2	6	47660	47665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1074	NC_013889	CAT	2	6	47689	47694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207227
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1080	NC_013889	CGA	2	6	47886	47891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207227
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1082	NC_013889	GGT	2	6	47911	47916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207227
1083	NC_013889	GCC	2	6	47939	47944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207227
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1085	NC_013889	CCTT	2	8	48014	48021	0 %	50 %	0 %	50 %	289207227
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1089	NC_013889	GCC	2	6	48167	48172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207227
1090	NC_013889	AGC	2	6	48182	48187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1091	NC_013889	GCA	2	6	48203	48208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207227
1092	NC_013889	AG	3	6	48210	48215	50 %	0 %	50 %	0 %	289207227
1093	NC_013889	CG	3	6	48424	48429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_013889	GCG	2	6	48531	48536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_013889	GCG	2	6	48600	48605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013889	AGC	2	6	48734	48739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207228
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1099	NC_013889	GGC	2	6	48905	48910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207228
1100	NC_013889	TGG	2	6	48911	48916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207228
1101	NC_013889	CCG	2	6	48947	48952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207228
1102	NC_013889	GCCAGC	2	12	48953	48964	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207228
1103	NC_013889	GCT	2	6	48975	48980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207228
1104	NC_013889	CG	3	6	48998	49003	0 %	0 %	50 %	50 %	289207228
1105	NC_013889	CGT	2	6	49039	49044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207228
1106	NC_013889	GCT	2	6	49068	49073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207228
1107	NC_013889	CTGC	2	8	49107	49114	0 %	25 %	25 %	50 %	289207228
1108	NC_013889	GGC	2	6	49143	49148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207228
1109	NC_013889	TTC	2	6	49218	49223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207228
1110	NC_013889	A	7	7	49321	49327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013889	G	6	6	49372	49377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013889	GA	3	6	49399	49404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013889	GTCA	2	8	49536	49543	25 %	25 %	25 %	25 %	289207229
1114	NC_013889	GAT	2	6	49669	49674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207229
1115	NC_013889	GCG	2	6	49699	49704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207229
1116	NC_013889	AGA	2	6	49710	49715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207229
1117	NC_013889	GCG	2	6	49730	49735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207229
1118	NC_013889	TCT	2	6	49745	49750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207229
1119	NC_013889	AC	3	6	49845	49850	50 %	0 %	0 %	50 %	289207229
1120	NC_013889	GGCA	2	8	49920	49927	25 %	0 %	50 %	25 %	289207229
1121	NC_013889	CGTG	2	8	50001	50008	0 %	25 %	50 %	25 %	289207229
1122	NC_013889	TCG	2	6	50042	50047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207229
1123	NC_013889	CG	3	6	50079	50084	0 %	0 %	50 %	50 %	289207229
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1125	NC_013889	CAG	2	6	50119	50124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207229
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1250	NC_013889	TGC	2	6	54988	54993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207234
1251	NC_013889	AGC	2	6	54994	54999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207234
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1254	NC_013889	CG	3	6	55211	55216	0 %	0 %	50 %	50 %	289207234
1255	NC_013889	CG	3	6	55272	55277	0 %	0 %	50 %	50 %	289207234
1256	NC_013889	TTGC	2	8	55278	55285	0 %	50 %	25 %	25 %	289207234
1257	NC_013889	TGC	2	6	55342	55347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207234
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1262	NC_013889	TGCC	2	8	55549	55556	0 %	25 %	25 %	50 %	289207235
1263	NC_013889	GAC	2	6	55591	55596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207235
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1266	NC_013889	GA	3	6	55697	55702	50 %	0 %	50 %	0 %	289207235
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1272	NC_013889	GGCC	2	8	55857	55864	0 %	0 %	50 %	50 %	289207235
1273	NC_013889	CGT	2	6	55869	55874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207235
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1280	NC_013889	CAG	2	6	56050	56055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207235
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1282	NC_013889	GCA	2	6	56070	56075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207235
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1285	NC_013889	CG	3	6	56123	56128	0 %	0 %	50 %	50 %	289207235
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1289	NC_013889	GCC	2	6	56255	56260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1358	NC_013889	GGCA	2	8	59019	59026	25 %	0 %	50 %	25 %	289207238
1359	NC_013889	CCCACG	2	12	59052	59063	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289207238
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1369	NC_013889	GCG	2	6	59318	59323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207238
1370	NC_013889	CG	3	6	59407	59412	0 %	0 %	50 %	50 %	289207238
1371	NC_013889	ACGCC	2	10	59437	59446	20 %	0 %	20 %	60 %	289207238
1372	NC_013889	CTT	2	6	59449	59454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207238
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1374	NC_013889	GTC	2	6	59501	59506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207238
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1500	NC_013889	GCC	2	6	64906	64911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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