MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013889	GGC	2	6	600860	600865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207756
14002	NC_013889	TCA	2	6	600882	600887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207756
14003	NC_013889	GCT	2	6	600979	600984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14004	NC_013889	GGC	2	6	601012	601017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207756
14005	NC_013889	TTC	2	6	601025	601030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207756
14006	NC_013889	TTCC	2	8	601051	601058	0 %	50 %	0 %	50 %	289207756
14007	NC_013889	TCGGCA	2	12	601116	601127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14008	NC_013889	CGG	3	9	601171	601179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207756
14009	NC_013889	GGTGAT	2	12	601192	601203	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289207756
14010	NC_013889	ATC	3	9	601205	601213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207756
14011	NC_013889	GCT	2	6	601279	601284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14012	NC_013889	TGGA	2	8	601292	601299	25 %	25 %	50 %	0 %	289207756
14013	NC_013889	TCCA	2	8	601307	601314	25 %	25 %	0 %	50 %	289207756
14014	NC_013889	CAT	2	6	601342	601347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207756
14015	NC_013889	TGC	3	9	601401	601409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14016	NC_013889	ACA	2	6	601452	601457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207756
14017	NC_013889	GGT	2	6	601463	601468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207756
14018	NC_013889	TGG	2	6	601499	601504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207756
14019	NC_013889	CGA	2	6	601525	601530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14020	NC_013889	GTG	2	6	601539	601544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207756
14021	NC_013889	TCG	2	6	601581	601586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14022	NC_013889	GAC	2	6	601592	601597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14023	NC_013889	GTTC	2	8	601749	601756	0 %	50 %	25 %	25 %	289207756
14024	NC_013889	CGG	2	6	601831	601836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207756
14025	NC_013889	CGG	2	6	601852	601857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207756
14026	NC_013889	CGCTGG	2	12	601908	601919	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289207756
14027	NC_013889	CTT	2	6	601924	601929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207756
14028	NC_013889	TAC	2	6	601979	601984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207756
14029	NC_013889	TGG	2	6	602037	602042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207756
14030	NC_013889	GCT	2	6	602050	602055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207756
14031	NC_013889	GCCG	2	8	602092	602099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14032	NC_013889	CGG	2	6	602123	602128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_013889	CGCGG	2	10	602140	602149	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14034	NC_013889	TGC	2	6	602159	602164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_013889	CGG	2	6	602181	602186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_013889	ATT	2	6	602296	602301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_013889	GC	3	6	602384	602389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14038	NC_013889	AC	3	6	602409	602414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_013889	TC	3	6	602485	602490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_013889	CAGG	2	8	602518	602525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14041	NC_013889	TGC	2	6	602537	602542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_013889	C	7	7	602643	602649	0 %	0 %	0 %	100 %	289207757
14043	NC_013889	AGG	2	6	602777	602782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207757
14044	NC_013889	TCC	2	6	602795	602800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207757
14045	NC_013889	GCA	2	6	602823	602828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14046	NC_013889	CGAGGT	2	12	602925	602936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289207757
14047	NC_013889	CGA	2	6	602985	602990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14048	NC_013889	ATCG	2	8	602995	603002	25 %	25 %	25 %	25 %	289207757
14049	NC_013889	GAA	2	6	603060	603065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207757
14050	NC_013889	GCA	2	6	603095	603100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14051	NC_013889	GAG	2	6	603109	603114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207757
14052	NC_013889	CGA	2	6	603132	603137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14053	NC_013889	GCCG	2	8	603157	603164	0 %	0 %	50 %	50 %	289207757
14054	NC_013889	AGC	2	6	603185	603190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14055	NC_013889	GAG	2	6	603211	603216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207757
14056	NC_013889	CGA	2	6	603240	603245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14057	NC_013889	AAG	2	6	603298	603303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207757
14058	NC_013889	GAA	2	6	603345	603350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207757
14059	NC_013889	GAG	2	6	603532	603537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207757
14060	NC_013889	GGT	2	6	603553	603558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207757
14061	NC_013889	CAG	2	6	603562	603567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14062	NC_013889	GAA	2	6	603595	603600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207757
14063	NC_013889	CGT	2	6	603610	603615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14064	NC_013889	CAT	2	6	603642	603647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207757
14065	NC_013889	GGC	2	6	603705	603710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207757
14066	NC_013889	TAC	2	6	603742	603747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207757
14067	NC_013889	GGT	2	6	603801	603806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207757
14068	NC_013889	TCG	2	6	603815	603820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207757
14069	NC_013889	GAA	2	6	603840	603845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207757
14070	NC_013889	TGA	2	6	603863	603868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207757
14071	NC_013889	GCA	2	6	603920	603925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207758
14072	NC_013889	TGG	2	6	603952	603957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207758
14073	NC_013889	GC	3	6	603980	603985	0 %	0 %	50 %	50 %	289207758
14074	NC_013889	TCT	2	6	604024	604029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207758
14075	NC_013889	GCT	2	6	604076	604081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207758
14076	NC_013889	CGGG	2	8	604135	604142	0 %	0 %	75 %	25 %	289207758
14077	NC_013889	CCG	2	6	604150	604155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207758
14078	NC_013889	TCA	2	6	604183	604188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207758
14079	NC_013889	GGC	2	6	604220	604225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207758
14080	NC_013889	GGT	2	6	604251	604256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207758
14081	NC_013889	CCA	2	6	604301	604306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207758
14082	NC_013889	GATATC	2	12	604338	604349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289207758
14083	NC_013889	GAG	2	6	604377	604382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207758
14084	NC_013889	CAC	2	6	604401	604406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207758
14085	NC_013889	TGG	2	6	604489	604494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207758
14086	NC_013889	GC	3	6	604516	604521	0 %	0 %	50 %	50 %	289207758
14087	NC_013889	GCC	2	6	604524	604529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207758
14088	NC_013889	AAG	2	6	604548	604553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207758
14089	NC_013889	GC	3	6	604582	604587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14090	NC_013889	CGA	2	6	604686	604691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14091	NC_013889	CCG	2	6	604703	604708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207759
14092	NC_013889	GT	3	6	604800	604805	0 %	50 %	50 %	0 %	289207759
14093	NC_013889	CAT	2	6	604821	604826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207759
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14095	NC_013889	AGG	2	6	604841	604846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207759
14096	NC_013889	CG	3	6	604880	604885	0 %	0 %	50 %	50 %	289207759
14097	NC_013889	CGA	2	6	604902	604907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14098	NC_013889	GTCCAA	2	12	605010	605021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289207759
14099	NC_013889	CAT	2	6	605022	605027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207759
14100	NC_013889	GCT	2	6	605058	605063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14101	NC_013889	CAT	2	6	605160	605165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207759
14102	NC_013889	GCT	2	6	605172	605177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14103	NC_013889	CGA	2	6	605229	605234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14104	NC_013889	CTG	2	6	605311	605316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14105	NC_013889	CAC	2	6	605331	605336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207759
14106	NC_013889	GCC	2	6	605346	605351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207759
14107	NC_013889	GGGC	2	8	605355	605362	0 %	0 %	75 %	25 %	289207759
14108	NC_013889	GCA	2	6	605373	605378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14109	NC_013889	GCG	3	9	605420	605428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207759
14110	NC_013889	ATC	2	6	605449	605454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207759
14111	NC_013889	CAG	2	6	605455	605460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14112	NC_013889	GGC	2	6	605473	605478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207759
14113	NC_013889	CCG	2	6	605489	605494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207759
14114	NC_013889	GGC	2	6	605524	605529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207759
14115	NC_013889	AGC	2	6	605540	605545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14116	NC_013889	TCG	2	6	605588	605593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207759
14117	NC_013889	CGCC	2	8	605688	605695	0 %	0 %	25 %	75 %	289207759
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14119	NC_013889	GGT	2	6	605862	605867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207759
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14243	NC_013889	CGA	2	6	610687	610692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207763
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14246	NC_013889	CGG	2	6	610768	610773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207763
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14253	NC_013889	CAG	2	6	611072	611077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207763
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14260	NC_013889	CG	3	6	611404	611409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14261	NC_013889	GC	3	6	611435	611440	0 %	0 %	50 %	50 %	289207764
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14264	NC_013889	GCA	2	6	611532	611537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207764
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14300	NC_013889	CTCCAC	2	12	612907	612918	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14357	NC_013889	CTTCG	2	10	615396	615405	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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14478	NC_013889	AG	3	6	620107	620112	50 %	0 %	50 %	0 %	289207771
14479	NC_013889	CGG	2	6	620125	620130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207771
14480	NC_013889	CGG	2	6	620137	620142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207771
14481	NC_013889	GCTGG	2	10	620154	620163	0 %	20 %	60 %	20 %	289207771
14482	NC_013889	CGC	2	6	620164	620169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207771
14483	NC_013889	TCT	2	6	620231	620236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207771
14484	NC_013889	ATG	2	6	620239	620244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207771
14485	NC_013889	CAT	3	9	620256	620264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207771
14486	NC_013889	GAG	2	6	620305	620310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207771
14487	NC_013889	CAT	2	6	620352	620357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207771
14488	NC_013889	ATC	2	6	620539	620544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207771
14489	NC_013889	GC	4	8	620580	620587	0 %	0 %	50 %	50 %	289207771
14490	NC_013889	TGG	2	6	620588	620593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207771
14491	NC_013889	ATG	2	6	620596	620601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207771
14492	NC_013889	GCG	3	9	620656	620664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207771
14493	NC_013889	CTG	2	6	620689	620694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207771
14494	NC_013889	CTGG	2	8	620700	620707	0 %	25 %	50 %	25 %	289207771
14495	NC_013889	CCTGTT	2	12	620733	620744	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289207771
14496	NC_013889	CTG	2	6	620755	620760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207771
14497	NC_013889	CG	3	6	620848	620853	0 %	0 %	50 %	50 %	289207772
14498	NC_013889	CG	3	6	620860	620865	0 %	0 %	50 %	50 %	289207772
14499	NC_013889	TCC	2	6	620868	620873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207772
14500	NC_013889	CGC	2	6	620918	620923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207772

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