MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013889	GGC	2	6	558682	558687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13002	NC_013889	GTT	2	6	558706	558711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207716
13003	NC_013889	GCA	3	9	558720	558728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207716
13004	NC_013889	CAGG	2	8	558786	558793	25 %	0 %	50 %	25 %	289207716
13005	NC_013889	CG	3	6	558822	558827	0 %	0 %	50 %	50 %	289207716
13006	NC_013889	TCA	2	6	558875	558880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207716
13007	NC_013889	GC	3	6	558894	558899	0 %	0 %	50 %	50 %	289207716
13008	NC_013889	CCT	2	6	558927	558932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207716
13009	NC_013889	GCAG	2	8	559008	559015	25 %	0 %	50 %	25 %	289207716
13010	NC_013889	CGG	2	6	559085	559090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13011	NC_013889	CCA	2	6	559125	559130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207716
13012	NC_013889	GCA	2	6	559131	559136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207716
13013	NC_013889	CGC	2	6	559162	559167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207716
13014	NC_013889	GGC	3	9	559201	559209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13015	NC_013889	GT	3	6	559239	559244	0 %	50 %	50 %	0 %	289207716
13016	NC_013889	GCG	2	6	559246	559251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13017	NC_013889	CGC	2	6	559296	559301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207716
13018	NC_013889	GGC	2	6	559309	559314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13019	NC_013889	CGT	2	6	559347	559352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207716
13020	NC_013889	CGC	2	6	559402	559407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207716
13021	NC_013889	CGC	2	6	559414	559419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207716
13022	NC_013889	CAG	2	6	559501	559506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207716
13023	NC_013889	CG	4	8	559545	559552	0 %	0 %	50 %	50 %	289207716
13024	NC_013889	CAG	2	6	559564	559569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207716
13025	NC_013889	GCG	3	9	559594	559602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13026	NC_013889	C	6	6	559640	559645	0 %	0 %	0 %	100 %	289207716
13027	NC_013889	GCA	3	9	559650	559658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207716
13028	NC_013889	GCG	2	6	559696	559701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13029	NC_013889	AGC	2	6	559706	559711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207716
13030	NC_013889	GGC	3	9	559726	559734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13031	NC_013889	GGC	2	6	559744	559749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207716
13032	NC_013889	GAATG	2	10	559803	559812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_013889	CGGGC	2	10	559838	559847	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13034	NC_013889	GCC	2	6	559860	559865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_013889	GGT	2	6	559953	559958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_013889	AAGC	2	8	559967	559974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13037	NC_013889	CG	4	8	560021	560028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13038	NC_013889	GCG	2	6	560114	560119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207717
13039	NC_013889	AGC	2	6	560120	560125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13040	NC_013889	ACT	2	6	560162	560167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207717
13041	NC_013889	CAT	2	6	560235	560240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207717
13042	NC_013889	GAGC	2	8	560250	560257	25 %	0 %	50 %	25 %	289207717
13043	NC_013889	CGGCCA	2	12	560267	560278	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207717
13044	NC_013889	AAG	2	6	560284	560289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207717
13045	NC_013889	CGCA	2	8	560292	560299	25 %	0 %	25 %	50 %	289207717
13046	NC_013889	TCG	2	6	560399	560404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13047	NC_013889	GGGCA	2	10	560407	560416	20 %	0 %	60 %	20 %	289207717
13048	NC_013889	CGC	2	6	560448	560453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207717
13049	NC_013889	GCT	3	9	560493	560501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13050	NC_013889	GGGCA	2	10	560512	560521	20 %	0 %	60 %	20 %	289207717
13051	NC_013889	GC	3	6	560549	560554	0 %	0 %	50 %	50 %	289207717
13052	NC_013889	TGC	2	6	560570	560575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13053	NC_013889	CGG	2	6	560604	560609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207717
13054	NC_013889	CGC	2	6	560645	560650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207717
13055	NC_013889	CTG	2	6	560686	560691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13056	NC_013889	CGCC	2	8	560774	560781	0 %	0 %	25 %	75 %	289207717
13057	NC_013889	CG	4	8	560821	560828	0 %	0 %	50 %	50 %	289207717
13058	NC_013889	CGA	2	6	560850	560855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13059	NC_013889	GCT	2	6	560898	560903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13060	NC_013889	GCCA	2	8	560914	560921	25 %	0 %	25 %	50 %	289207717
13061	NC_013889	CG	3	6	560926	560931	0 %	0 %	50 %	50 %	289207717
13062	NC_013889	AAG	2	6	560932	560937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207717
13063	NC_013889	CGA	2	6	560961	560966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13064	NC_013889	ACCCG	2	10	560981	560990	20 %	0 %	20 %	60 %	289207717
13065	NC_013889	GGC	2	6	561110	561115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207717
13066	NC_013889	CTG	2	6	561139	561144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13067	NC_013889	CTG	2	6	561238	561243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13068	NC_013889	CGA	2	6	561261	561266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13069	NC_013889	ATC	2	6	561277	561282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207717
13070	NC_013889	TGA	2	6	561311	561316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207717
13071	NC_013889	GAG	2	6	561388	561393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207717
13072	NC_013889	CGC	2	6	561507	561512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207717
13073	NC_013889	CGA	2	6	561522	561527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13074	NC_013889	CGC	2	6	561529	561534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207717
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13077	NC_013889	CGC	3	9	561552	561560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207717
13078	NC_013889	CGT	2	6	561606	561611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13079	NC_013889	GC	4	8	561631	561638	0 %	0 %	50 %	50 %	289207717
13080	NC_013889	ACG	2	6	561650	561655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13081	NC_013889	GCA	2	6	561716	561721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207717
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13084	NC_013889	CCG	2	6	561829	561834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207717
13085	NC_013889	GC	4	8	561839	561846	0 %	0 %	50 %	50 %	289207717
13086	NC_013889	GGA	2	6	561870	561875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207717
13087	NC_013889	GCTG	2	8	561881	561888	0 %	25 %	50 %	25 %	289207717
13088	NC_013889	ACGGCT	2	12	561902	561913	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13089	NC_013889	TCG	2	6	561914	561919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13090	NC_013889	CTG	2	6	561934	561939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13091	NC_013889	CGGCG	2	10	561981	561990	0 %	0 %	60 %	40 %	289207717
13092	NC_013889	TGC	2	6	561992	561997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13093	NC_013889	GTC	2	6	562039	562044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13094	NC_013889	CTG	3	9	562060	562068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207717
13095	NC_013889	GC	3	6	562096	562101	0 %	0 %	50 %	50 %	289207717
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13098	NC_013889	GCGG	2	8	562277	562284	0 %	0 %	75 %	25 %	289207717
13099	NC_013889	CG	3	6	562292	562297	0 %	0 %	50 %	50 %	289207717
13100	NC_013889	CAG	2	6	562405	562410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207718
13101	NC_013889	CGTC	2	8	562419	562426	0 %	25 %	25 %	50 %	289207718
13102	NC_013889	GCGG	2	8	562434	562441	0 %	0 %	75 %	25 %	289207718
13103	NC_013889	ATCG	2	8	562687	562694	25 %	25 %	25 %	25 %	289207718
13104	NC_013889	CGAT	2	8	562695	562702	25 %	25 %	25 %	25 %	289207718
13105	NC_013889	TCC	2	6	562730	562735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207718
13106	NC_013889	CGT	2	6	562749	562754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207718
13107	NC_013889	GC	3	6	562818	562823	0 %	0 %	50 %	50 %	289207718
13108	NC_013889	CCA	2	6	562836	562841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207718
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13110	NC_013889	GCG	2	6	562930	562935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207718
13111	NC_013889	GGC	3	9	562936	562944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207718
13112	NC_013889	GCGT	2	8	563176	563183	0 %	25 %	50 %	25 %	289207718
13113	NC_013889	CGG	2	6	563258	563263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207718
13114	NC_013889	TGG	2	6	563391	563396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207718
13115	NC_013889	GGTCT	2	10	563470	563479	0 %	40 %	40 %	20 %	289207718
13116	NC_013889	GCA	2	6	563514	563519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207718
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13118	NC_013889	GCA	2	6	563631	563636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207718
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13120	NC_013889	GTGC	2	8	563714	563721	0 %	25 %	50 %	25 %	289207718
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13353	NC_013889	GC	3	6	573119	573124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13382	NC_013889	GAGC	2	8	574341	574348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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13483	NC_013889	CGA	2	6	578272	578277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207730
13484	NC_013889	GCT	2	6	578278	578283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207730
13485	NC_013889	CCCG	2	8	578291	578298	0 %	0 %	25 %	75 %	289207730
13486	NC_013889	TGC	2	6	578337	578342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207730
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