MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_013889	CGG	2	6	516954	516959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207680
12005	NC_013889	TGGC	2	8	517004	517011	0 %	25 %	50 %	25 %	289207680
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12011	NC_013889	TGG	2	6	517220	517225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12014	NC_013889	TGC	2	6	517294	517299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207681
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12056	NC_013889	TCG	2	6	518960	518965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207683
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12121	NC_013889	G	7	7	522286	522292	0 %	0 %	100 %	0 %	289207686
12122	NC_013889	CGA	2	6	522369	522374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207686
12123	NC_013889	CTG	2	6	522394	522399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207686
12124	NC_013889	GCG	2	6	522415	522420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207686
12125	NC_013889	GGC	2	6	522421	522426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207686
12126	NC_013889	CGA	2	6	522443	522448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207686
12127	NC_013889	CTC	2	6	522475	522480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12128	NC_013889	A	6	6	522491	522496	100 %	0 %	0 %	0 %	289207687
12129	NC_013889	TGA	2	6	522503	522508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207687
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12133	NC_013889	TGG	2	6	522610	522615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207687
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12145	NC_013889	GC	3	6	522986	522991	0 %	0 %	50 %	50 %	289207687
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12147	NC_013889	CGAGC	2	10	523056	523065	20 %	0 %	40 %	40 %	289207687
12148	NC_013889	TCC	2	6	523093	523098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207687
12149	NC_013889	CGC	2	6	523099	523104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207687
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12154	NC_013889	GTC	2	6	523239	523244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207687
12155	NC_013889	GCG	2	6	523281	523286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207687
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12158	NC_013889	TCG	2	6	523516	523521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207687
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12161	NC_013889	GTC	2	6	523596	523601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207687
12162	NC_013889	GC	3	6	523608	523613	0 %	0 %	50 %	50 %	289207687
12163	NC_013889	GGT	2	6	523662	523667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207687
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12171	NC_013889	GGC	2	6	523932	523937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207687
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12210	NC_013889	TGA	2	6	525738	525743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207688
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12214	NC_013889	CGGC	2	8	525861	525868	0 %	0 %	50 %	50 %	289207688
12215	NC_013889	CGG	2	6	525969	525974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207688
12216	NC_013889	GC	3	6	525995	526000	0 %	0 %	50 %	50 %	289207688
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12218	NC_013889	GA	3	6	526106	526111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12219	NC_013889	CGT	2	6	526145	526150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207689
12220	NC_013889	CCGGG	2	10	526202	526211	0 %	0 %	60 %	40 %	289207689
12221	NC_013889	TGC	2	6	526321	526326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207689
12222	NC_013889	CCAG	2	8	526387	526394	25 %	0 %	25 %	50 %	289207689
12223	NC_013889	TCG	2	6	526437	526442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207689
12224	NC_013889	GCG	2	6	526449	526454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207689
12225	NC_013889	GGC	2	6	526528	526533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12226	NC_013889	GGT	2	6	526563	526568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12227	NC_013889	GCC	2	6	526618	526623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12228	NC_013889	GC	3	6	526634	526639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12229	NC_013889	AT	3	6	526667	526672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12230	NC_013889	CGG	2	6	526680	526685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12231	NC_013889	CTGTTG	2	12	526751	526762	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	289207690
12232	NC_013889	ATGTCG	2	12	526911	526922	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289207690
12233	NC_013889	TCG	2	6	526929	526934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207690
12234	NC_013889	CGA	2	6	526939	526944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207690
12235	NC_013889	GCT	3	9	526945	526953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207690
12236	NC_013889	AGC	2	6	526971	526976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207690
12237	NC_013889	GC	4	8	527015	527022	0 %	0 %	50 %	50 %	289207690
12238	NC_013889	CGT	2	6	527080	527085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207690
12239	NC_013889	GCCGAG	2	12	527108	527119	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207690
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12241	NC_013889	GAG	2	6	527165	527170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207690
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12262	NC_013889	CGA	2	6	528032	528037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207691
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12276	NC_013889	GGA	2	6	528575	528580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207691
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12302	NC_013889	TGG	2	6	529537	529542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207691
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12310	NC_013889	GC	3	6	530085	530090	0 %	0 %	50 %	50 %	289207691
12311	NC_013889	GCA	2	6	530102	530107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207691
12312	NC_013889	GGT	2	6	530111	530116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207691
12313	NC_013889	GTC	2	6	530292	530297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207691
12314	NC_013889	CTG	2	6	530343	530348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207691
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12321	NC_013889	CTG	2	6	530595	530600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207691
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12336	NC_013889	ATC	2	6	530997	531002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207691
12337	NC_013889	TAC	2	6	531012	531017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207691
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12340	NC_013889	CGC	2	6	531150	531155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12341	NC_013889	GATG	2	8	531178	531185	25 %	25 %	50 %	0 %	289207692
12342	NC_013889	GAC	2	6	531287	531292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207692
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12344	NC_013889	TGC	2	6	531327	531332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207692
12345	NC_013889	GAC	2	6	531347	531352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207692
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12348	NC_013889	CCG	2	6	531445	531450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207693
12349	NC_013889	TTC	2	6	531506	531511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289207693
12350	NC_013889	GTG	2	6	531539	531544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207693
12351	NC_013889	GGC	2	6	531568	531573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207693
12352	NC_013889	AAGGAC	2	12	531596	531607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289207693
12353	NC_013889	TACAGG	2	12	531657	531668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289207694
12354	NC_013889	GCG	2	6	531720	531725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207694
12355	NC_013889	GGT	2	6	531788	531793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207694
12356	NC_013889	ATG	2	6	531876	531881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207694
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12358	NC_013889	GCA	2	6	531910	531915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207694
12359	NC_013889	CGGC	2	8	531934	531941	0 %	0 %	50 %	50 %	289207694
12360	NC_013889	GC	3	6	531991	531996	0 %	0 %	50 %	50 %	289207694
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12362	NC_013889	ATG	2	6	532047	532052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207694
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12389	NC_013889	TCG	2	6	532953	532958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207694
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12472	NC_013889	GC	4	8	536035	536042	0 %	0 %	50 %	50 %	289207699
12473	NC_013889	CGCA	2	8	536061	536068	25 %	0 %	25 %	50 %	289207699
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