MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_013889	GCT	2	6	472602	472607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11003	NC_013889	AGT	2	6	472644	472649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207642
11004	NC_013889	CG	3	6	472653	472658	0 %	0 %	50 %	50 %	289207642
11005	NC_013889	CGG	2	6	472685	472690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207642
11006	NC_013889	GAC	2	6	472807	472812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11007	NC_013889	GGT	2	6	472821	472826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207642
11008	NC_013889	GCC	2	6	472888	472893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207642
11009	NC_013889	GC	3	6	472949	472954	0 %	0 %	50 %	50 %	289207642
11010	NC_013889	GGC	2	6	472956	472961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207642
11011	NC_013889	GAT	2	6	472996	473001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207642
11012	NC_013889	ACG	2	6	473006	473011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11013	NC_013889	GCA	2	6	473022	473027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11014	NC_013889	CGT	2	6	473031	473036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11015	NC_013889	CCA	2	6	473169	473174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207642
11016	NC_013889	CAG	2	6	473245	473250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11017	NC_013889	CGC	2	6	473259	473264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207642
11018	NC_013889	CAG	2	6	473275	473280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11019	NC_013889	AGC	2	6	473312	473317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207642
11020	NC_013889	TCC	3	9	473351	473359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207642
11021	NC_013889	GGC	2	6	473370	473375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207642
11022	NC_013889	CG	3	6	473376	473381	0 %	0 %	50 %	50 %	289207642
11023	NC_013889	CCA	2	6	473406	473411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207642
11024	NC_013889	CCA	2	6	473442	473447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207642
11025	NC_013889	CAT	2	6	473470	473475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207642
11026	NC_013889	GGC	2	6	473476	473481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_013889	GCG	2	6	473597	473602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207643
11028	NC_013889	CTG	2	6	473630	473635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207643
11029	NC_013889	CG	3	6	473692	473697	0 %	0 %	50 %	50 %	289207643
11030	NC_013889	CCG	2	6	473787	473792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207643
11031	NC_013889	TCG	2	6	473826	473831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207643
11032	NC_013889	CTG	2	6	473837	473842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207643
11033	NC_013889	GAG	2	6	473864	473869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207643
11034	NC_013889	CG	3	6	473873	473878	0 %	0 %	50 %	50 %	289207643
11035	NC_013889	ACC	2	6	473906	473911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207643
11036	NC_013889	TGT	2	6	473940	473945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207643
11037	NC_013889	TCAG	2	8	474003	474010	25 %	25 %	25 %	25 %	289207643
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11039	NC_013889	GACCAG	2	12	474110	474121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207643
11040	NC_013889	CTG	2	6	474191	474196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207643
11041	NC_013889	GAT	2	6	474232	474237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207643
11042	NC_013889	GGC	2	6	474241	474246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207643
11043	NC_013889	GAC	2	6	474287	474292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207643
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11047	NC_013889	CG	3	6	474592	474597	0 %	0 %	50 %	50 %	289207643
11048	NC_013889	GCC	2	6	474713	474718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11049	NC_013889	CGG	2	6	474797	474802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207644
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11052	NC_013889	CGC	2	6	474907	474912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207644
11053	NC_013889	GCC	2	6	475057	475062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207644
11054	NC_013889	ATC	2	6	475087	475092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207644
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11056	NC_013889	CCG	2	6	475228	475233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207644
11057	NC_013889	GTG	2	6	475240	475245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207644
11058	NC_013889	CCT	2	6	475266	475271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207644
11059	NC_013889	TGC	2	6	475283	475288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207644
11060	NC_013889	CGA	2	6	475335	475340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207644
11061	NC_013889	CGGG	2	8	475362	475369	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11062	NC_013889	CAA	2	6	475461	475466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_013889	ATC	2	6	475500	475505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207645
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11065	NC_013889	CAC	2	6	475592	475597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207645
11066	NC_013889	TCG	2	6	475606	475611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207645
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11070	NC_013889	CG	3	6	475838	475843	0 %	0 %	50 %	50 %	289207645
11071	NC_013889	TGC	2	6	475846	475851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207645
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11084	NC_013889	GAC	2	6	476418	476423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207645
11085	NC_013889	GAC	2	6	476493	476498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207645
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11088	NC_013889	CGGT	2	8	476605	476612	0 %	25 %	50 %	25 %	289207645
11089	NC_013889	TGC	3	9	476656	476664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207645
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11091	NC_013889	TGA	2	6	476710	476715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207645
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11097	NC_013889	GCCGC	2	10	476880	476889	0 %	0 %	40 %	60 %	289207645
11098	NC_013889	CCT	2	6	476998	477003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207645
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11102	NC_013889	GC	4	8	477091	477098	0 %	0 %	50 %	50 %	289207645
11103	NC_013889	CGA	3	9	477164	477172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207645
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11108	NC_013889	CGT	2	6	477368	477373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207645
11109	NC_013889	CGA	3	9	477395	477403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207645
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11114	NC_013889	CGC	2	6	477644	477649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207646
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11118	NC_013889	CG	3	6	477717	477722	0 %	0 %	50 %	50 %	289207646
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11201	NC_013889	CCGC	2	8	481309	481316	0 %	0 %	25 %	75 %	289207648
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11218	NC_013889	GCC	2	6	482053	482058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207648
11219	NC_013889	GTG	2	6	482205	482210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207648
11220	NC_013889	GCG	2	6	482221	482226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207648
11221	NC_013889	GGC	2	6	482238	482243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207648
11222	NC_013889	CG	4	8	482250	482257	0 %	0 %	50 %	50 %	289207648
11223	NC_013889	CG	4	8	482341	482348	0 %	0 %	50 %	50 %	289207648
11224	NC_013889	TTCCG	2	10	482396	482405	0 %	40 %	20 %	40 %	289207648
11225	NC_013889	GCA	2	6	482408	482413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207648
11226	NC_013889	GCA	2	6	482417	482422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207648
11227	NC_013889	TC	3	6	482488	482493	0 %	50 %	0 %	50 %	289207648
11228	NC_013889	CGG	2	6	482600	482605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207648
11229	NC_013889	TGG	2	6	482665	482670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_013889	G	6	6	482702	482707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_013889	GC	3	6	482843	482848	0 %	0 %	50 %	50 %	289207649
11232	NC_013889	CAAG	2	8	482891	482898	50 %	0 %	25 %	25 %	289207649
11233	NC_013889	CCT	2	6	482936	482941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207649
11234	NC_013889	CAG	2	6	482982	482987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207649
11235	NC_013889	CAG	2	6	483000	483005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207649
11236	NC_013889	GGGCGG	2	12	483035	483046	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	289207649
11237	NC_013889	ATG	2	6	483093	483098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207649
11238	NC_013889	CAGC	2	8	483114	483121	25 %	0 %	25 %	50 %	289207649
11239	NC_013889	GAC	2	6	483153	483158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207649
11240	NC_013889	GGC	2	6	483230	483235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207649
11241	NC_013889	GTC	2	6	483324	483329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207649
11242	NC_013889	CGG	2	6	483364	483369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207649
11243	NC_013889	GTC	2	6	483403	483408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207649
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11247	NC_013889	CTG	3	9	483513	483521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207649
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11250	NC_013889	TGCG	2	8	483569	483576	0 %	25 %	50 %	25 %	289207649
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11253	NC_013889	CTG	2	6	483702	483707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207649
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11297	NC_013889	C	6	6	485687	485692	0 %	0 %	0 %	100 %	289207652
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11316	NC_013889	CGA	2	6	486573	486578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207652
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11341	NC_013889	CGGG	2	8	487701	487708	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11342	NC_013889	GAC	2	6	487759	487764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207654
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11354	NC_013889	CTG	2	6	488335	488340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11355	NC_013889	CG	3	6	488450	488455	0 %	0 %	50 %	50 %	289207655
11356	NC_013889	GTT	2	6	488483	488488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207655
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11479	NC_013889	CG	4	8	493691	493698	0 %	0 %	50 %	50 %	289207661
11480	NC_013889	CGG	2	6	493710	493715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207661
11481	NC_013889	CCT	2	6	493722	493727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207661
11482	NC_013889	CAG	2	6	493873	493878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207661
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