MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013889	CGT	2	6	450680	450685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207613
10502	NC_013889	CCG	2	6	450703	450708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207613
10503	NC_013889	GGC	2	6	450716	450721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207613
10504	NC_013889	CCCG	2	8	450767	450774	0 %	0 %	25 %	75 %	289207613
10505	NC_013889	TAC	2	6	450789	450794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207613
10506	NC_013889	CTG	2	6	450804	450809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207613
10507	NC_013889	GCG	2	6	450898	450903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207613
10508	NC_013889	CGG	2	6	450966	450971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207613
10509	NC_013889	CGG	2	6	451050	451055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207614
10510	NC_013889	CGGG	2	8	451075	451082	0 %	0 %	75 %	25 %	289207614
10511	NC_013889	GCA	2	6	451087	451092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207614
10512	NC_013889	G	6	6	451131	451136	0 %	0 %	100 %	0 %	289207614
10513	NC_013889	GGT	2	6	451175	451180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207614
10514	NC_013889	GGC	2	6	451225	451230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207614
10515	NC_013889	CGACG	2	10	451237	451246	20 %	0 %	40 %	40 %	289207614
10516	NC_013889	C	6	6	451272	451277	0 %	0 %	0 %	100 %	289207614
10517	NC_013889	GGC	2	6	451281	451286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207614
10518	NC_013889	CGA	2	6	451363	451368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207614
10519	NC_013889	CGA	2	6	451390	451395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207614
10520	NC_013889	TGTCC	2	10	451417	451426	0 %	40 %	20 %	40 %	289207614
10521	NC_013889	GC	3	6	451466	451471	0 %	0 %	50 %	50 %	289207614
10522	NC_013889	CCG	2	6	451503	451508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207614
10523	NC_013889	GC	3	6	451576	451581	0 %	0 %	50 %	50 %	289207614
10524	NC_013889	GGC	3	9	451629	451637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207614
10525	NC_013889	CGG	2	6	451664	451669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207614
10526	NC_013889	GC	3	6	451682	451687	0 %	0 %	50 %	50 %	289207614
10527	NC_013889	GAA	2	6	451688	451693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207614
10528	NC_013889	GAT	2	6	451769	451774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207614
10529	NC_013889	TGG	2	6	451863	451868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207615
10530	NC_013889	GCGAGC	2	12	451890	451901	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289207615
10531	NC_013889	GTG	2	6	451922	451927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207615
10532	NC_013889	CG	3	6	452107	452112	0 %	0 %	50 %	50 %	289207615
10533	NC_013889	TGA	2	6	452150	452155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207615
10534	NC_013889	TG	3	6	452262	452267	0 %	50 %	50 %	0 %	289207616
10535	NC_013889	CTG	2	6	452290	452295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207616
10536	NC_013889	TGGC	2	8	452301	452308	0 %	25 %	50 %	25 %	289207616
10537	NC_013889	CGA	2	6	452316	452321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207616
10538	NC_013889	CCT	2	6	452371	452376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207616
10539	NC_013889	CCG	2	6	452437	452442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207616
10540	NC_013889	GCAC	2	8	452451	452458	25 %	0 %	25 %	50 %	289207616
10541	NC_013889	TCGGC	2	10	452531	452540	0 %	20 %	40 %	40 %	289207616
10542	NC_013889	CG	4	8	452543	452550	0 %	0 %	50 %	50 %	289207616
10543	NC_013889	GTT	2	6	452583	452588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207616
10544	NC_013889	GTG	2	6	452605	452610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207616
10545	NC_013889	CG	3	6	452613	452618	0 %	0 %	50 %	50 %	289207616
10546	NC_013889	CG	3	6	452630	452635	0 %	0 %	50 %	50 %	289207616
10547	NC_013889	TGG	2	6	452640	452645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207616
10548	NC_013889	GCGCG	2	10	452765	452774	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10549	NC_013889	TTC	2	6	452778	452783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_013889	CTGGC	2	10	452813	452822	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10551	NC_013889	CGG	2	6	452862	452867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_013889	TGC	2	6	452883	452888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_013889	A	6	6	453034	453039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_013889	TTGC	2	8	453074	453081	0 %	50 %	25 %	25 %	289207617
10555	NC_013889	ACG	2	6	453150	453155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207617
10556	NC_013889	TGC	2	6	453165	453170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207617
10557	NC_013889	CAT	2	6	453217	453222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207617
10558	NC_013889	GAT	2	6	453223	453228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207617
10559	NC_013889	GCT	2	6	453250	453255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207617
10560	NC_013889	AGGGCG	2	12	453330	453341	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	289207617
10561	NC_013889	CGA	2	6	453379	453384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207617
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10563	NC_013889	CGA	2	6	453454	453459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207617
10564	NC_013889	CAT	2	6	453496	453501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207617
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10566	NC_013889	GTC	2	6	453529	453534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207617
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10570	NC_013889	CCG	2	6	453610	453615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207617
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10574	NC_013889	ACC	2	6	453774	453779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207617
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10578	NC_013889	CATCT	2	10	454079	454088	20 %	40 %	0 %	40 %	289207618
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10580	NC_013889	GAT	2	6	454346	454351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207618
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10584	NC_013889	GTC	2	6	454630	454635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207618
10585	NC_013889	GCT	2	6	454646	454651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10586	NC_013889	GCA	2	6	454671	454676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10588	NC_013889	T	6	6	454757	454762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_013889	CCG	2	6	454773	454778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10590	NC_013889	GACG	2	8	454858	454865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10591	NC_013889	A	7	7	454892	454898	100 %	0 %	0 %	0 %	289207619
10592	NC_013889	CGG	2	6	454929	454934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207619
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10594	NC_013889	CCGG	2	8	455079	455086	0 %	0 %	50 %	50 %	289207619
10595	NC_013889	GCA	2	6	455095	455100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207619
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10597	NC_013889	GTC	2	6	455162	455167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207619
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10599	NC_013889	CAA	2	6	455275	455280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207619
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10601	NC_013889	CGG	2	6	455340	455345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207619
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10604	NC_013889	GTC	2	6	455435	455440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207619
10605	NC_013889	GAG	2	6	455504	455509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207619
10606	NC_013889	CTG	2	6	455534	455539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207619
10607	NC_013889	CGGG	2	8	455583	455590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10608	NC_013889	GGCC	2	8	455599	455606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10609	NC_013889	ACC	2	6	455614	455619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10610	NC_013889	GGT	2	6	455633	455638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_013889	T	7	7	455638	455644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_013889	CG	3	6	455684	455689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10613	NC_013889	GTGC	2	8	455728	455735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10614	NC_013889	GCC	2	6	455801	455806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207620
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10617	NC_013889	TGA	2	6	455862	455867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207620
10618	NC_013889	GCCG	2	8	455983	455990	0 %	0 %	50 %	50 %	289207620
10619	NC_013889	AGG	2	6	456018	456023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207620
10620	NC_013889	CACCGT	2	12	456028	456039	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289207620
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10622	NC_013889	CG	3	6	456097	456102	0 %	0 %	50 %	50 %	289207620
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10851	NC_013889	GCCG	2	8	466295	466302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10852	NC_013889	TG	3	6	466314	466319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10853	NC_013889	G	7	7	466338	466344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10859	NC_013889	CGA	2	6	466555	466560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207633
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10984	NC_013889	GC	3	6	472070	472075	0 %	0 %	50 %	50 %	289207641
10985	NC_013889	GGC	2	6	472077	472082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207641
10986	NC_013889	CCAG	2	8	472145	472152	25 %	0 %	25 %	50 %	289207641
10987	NC_013889	GCA	2	6	472172	472177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207641
10988	NC_013889	CCA	2	6	472208	472213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207641
10989	NC_013889	CGACCG	2	12	472241	472252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	289207641
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10991	NC_013889	CGC	2	6	472300	472305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207641
10992	NC_013889	AGC	2	6	472306	472311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207641
10993	NC_013889	GTC	3	9	472317	472325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207641
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10998	NC_013889	TCCAGC	2	12	472528	472539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289207641
10999	NC_013889	GGT	2	6	472544	472549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207641
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