MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013889	TCGGT	2	10	428719	428728	0 %	40 %	40 %	20 %	289207592
10002	NC_013889	TCGAT	2	10	428908	428917	20 %	40 %	20 %	20 %	289207592
10003	NC_013889	TGG	2	6	428923	428928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207592
10004	NC_013889	CGG	2	6	429004	429009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207592
10005	NC_013889	TCGGCG	2	12	429060	429071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289207592
10006	NC_013889	CAG	2	6	429168	429173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10007	NC_013889	GGC	2	6	429178	429183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207592
10008	NC_013889	GC	3	6	429226	429231	0 %	0 %	50 %	50 %	289207592
10009	NC_013889	TGA	2	6	429270	429275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207592
10010	NC_013889	CAG	2	6	429290	429295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10011	NC_013889	CGT	2	6	429328	429333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10012	NC_013889	CAA	2	6	429340	429345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289207592
10013	NC_013889	GAT	2	6	429374	429379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207592
10014	NC_013889	CA	3	6	429386	429391	50 %	0 %	0 %	50 %	289207592
10015	NC_013889	TCG	2	6	429399	429404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10016	NC_013889	TCC	2	6	429405	429410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207592
10017	NC_013889	CCA	2	6	429440	429445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207592
10018	NC_013889	CTG	2	6	429506	429511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10019	NC_013889	GGC	2	6	429517	429522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207592
10020	NC_013889	CAG	2	6	429560	429565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10021	NC_013889	CCT	2	6	429577	429582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207592
10022	NC_013889	GCA	2	6	429622	429627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10023	NC_013889	CTC	2	6	429629	429634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207592
10024	NC_013889	GC	3	6	429641	429646	0 %	0 %	50 %	50 %	289207592
10025	NC_013889	GCA	2	6	429664	429669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10026	NC_013889	CCG	2	6	429693	429698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207592
10027	NC_013889	TCC	2	6	429813	429818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207592
10028	NC_013889	GCA	2	6	429889	429894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207592
10029	NC_013889	CTGG	3	12	429965	429976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10030	NC_013889	TTCCA	2	10	429987	429996	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10031	NC_013889	CGC	2	6	430005	430010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_013889	C	6	6	430021	430026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10033	NC_013889	GCGG	2	8	430078	430085	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10034	NC_013889	TGCGAT	2	12	430139	430150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289207593
10035	NC_013889	TCG	2	6	430152	430157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207593
10036	NC_013889	ATT	2	6	430208	430213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289207593
10037	NC_013889	CGT	2	6	430285	430290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207593
10038	NC_013889	CGT	2	6	430323	430328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207593
10039	NC_013889	AGG	2	6	430389	430394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289207593
10040	NC_013889	TCA	2	6	430450	430455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289207593
10041	NC_013889	GGTT	2	8	430493	430500	0 %	50 %	50 %	0 %	289207593
10042	NC_013889	GAT	2	6	430529	430534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207593
10043	NC_013889	CG	3	6	430600	430605	0 %	0 %	50 %	50 %	289207593
10044	NC_013889	GA	3	6	430656	430661	50 %	0 %	50 %	0 %	289207593
10045	NC_013889	GGT	2	6	430678	430683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207593
10046	NC_013889	GCA	2	6	430725	430730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207593
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10049	NC_013889	GCC	2	6	430826	430831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207593
10050	NC_013889	G	7	7	430927	430933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_013889	TCC	2	6	431096	431101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207594
10052	NC_013889	CGTT	2	8	431117	431124	0 %	50 %	25 %	25 %	289207594
10053	NC_013889	CGG	2	6	431129	431134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207594
10054	NC_013889	CCG	2	6	431138	431143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207594
10055	NC_013889	GAA	2	6	431161	431166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289207594
10056	NC_013889	TCG	2	6	431174	431179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207594
10057	NC_013889	CGGT	2	8	431197	431204	0 %	25 %	50 %	25 %	289207594
10058	NC_013889	CCA	2	6	431244	431249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289207594
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10060	NC_013889	GGCG	2	8	431320	431327	0 %	0 %	75 %	25 %	289207594
10061	NC_013889	CGA	2	6	431367	431372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207594
10062	NC_013889	GGT	2	6	431413	431418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289207594
10063	NC_013889	CAG	2	6	431428	431433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207594
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10066	NC_013889	CGT	2	6	431595	431600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207594
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10069	NC_013889	CTG	2	6	431908	431913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207594
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10072	NC_013889	TCC	2	6	432008	432013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289207594
10073	NC_013889	GC	3	6	432110	432115	0 %	0 %	50 %	50 %	289207594
10074	NC_013889	AGGC	2	8	432231	432238	25 %	0 %	50 %	25 %	289207595
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10078	NC_013889	GCCCT	2	10	432435	432444	0 %	20 %	20 %	60 %	289207595
10079	NC_013889	C	7	7	432501	432507	0 %	0 %	0 %	100 %	289207595
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10083	NC_013889	TTG	2	6	432712	432717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289207595
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10091	NC_013889	GC	3	6	433075	433080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_013889	AAG	2	6	433093	433098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_013889	CG	3	6	433100	433105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_013889	CCA	2	6	433152	433157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_013889	GGT	2	6	433164	433169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10111	NC_013889	GATCC	2	10	433820	433829	20 %	20 %	20 %	40 %	289207596
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10116	NC_013889	CG	3	6	434080	434085	0 %	0 %	50 %	50 %	289207597
10117	NC_013889	CTG	2	6	434139	434144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207597
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10241	NC_013889	GTCG	2	8	439438	439445	0 %	25 %	50 %	25 %	289207602
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10244	NC_013889	CGT	2	6	439521	439526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207602
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10356	NC_013889	CCGA	2	8	445796	445803	25 %	0 %	25 %	50 %	289207608
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10360	NC_013889	GCGTTC	2	12	445870	445881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289207608
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10482	NC_013889	AGC	2	6	449953	449958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289207611
10483	NC_013889	A	6	6	449982	449987	100 %	0 %	0 %	0 %	289207611
10484	NC_013889	GAT	2	6	450011	450016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289207611
10485	NC_013889	GC	3	6	450017	450022	0 %	0 %	50 %	50 %	289207611
10486	NC_013889	GGC	2	6	450039	450044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289207611
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10488	NC_013889	GGC	2	6	450124	450129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10489	NC_013889	CG	3	6	450145	450150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10490	NC_013889	CGC	2	6	450214	450219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289207612
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10500	NC_013889	CGGGC	2	10	450658	450667	0 %	0 %	60 %	40 %	289207613

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