MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_013889	GCCC	2	8	2553499	2553506	0 %	0 %	25 %	75 %	289209591
59003	NC_013889	GCT	2	6	2553552	2553557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209591
59004	NC_013889	AGC	2	6	2553605	2553610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209591
59005	NC_013889	GC	5	10	2553609	2553618	0 %	0 %	50 %	50 %	289209591
59006	NC_013889	GCG	2	6	2553658	2553663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209591
59007	NC_013889	GCC	2	6	2553673	2553678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209591
59008	NC_013889	GCG	2	6	2553723	2553728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209591
59009	NC_013889	AGC	2	6	2553892	2553897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209592
59010	NC_013889	GCC	2	6	2553898	2553903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209592
59011	NC_013889	CCA	2	6	2553993	2553998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209592
59012	NC_013889	CTG	2	6	2554023	2554028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209592
59013	NC_013889	TCG	2	6	2554069	2554074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209592
59014	NC_013889	TGA	2	6	2554111	2554116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209592
59015	NC_013889	AGCC	2	8	2554159	2554166	25 %	0 %	25 %	50 %	289209592
59016	NC_013889	ACCCGC	2	12	2554310	2554321	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289209593
59017	NC_013889	CGT	2	6	2554324	2554329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209593
59018	NC_013889	TAC	2	6	2554373	2554378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209593
59019	NC_013889	GCC	2	6	2554412	2554417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209593
59020	NC_013889	GCC	2	6	2554547	2554552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209593
59021	NC_013889	GCC	2	6	2554786	2554791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59022	NC_013889	TCG	2	6	2554832	2554837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59023	NC_013889	AC	4	8	2554915	2554922	50 %	0 %	0 %	50 %	289209594
59024	NC_013889	CCG	2	6	2554975	2554980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209594
59025	NC_013889	CAG	2	6	2554989	2554994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209594
59026	NC_013889	CG	4	8	2555002	2555009	0 %	0 %	50 %	50 %	289209594
59027	NC_013889	CTA	2	6	2555057	2555062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209594
59028	NC_013889	CGA	2	6	2555156	2555161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209594
59029	NC_013889	TGA	2	6	2555230	2555235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209594
59030	NC_013889	CGA	2	6	2555243	2555248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209594
59031	NC_013889	ACC	2	6	2555280	2555285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209594
59032	NC_013889	CGG	2	6	2555297	2555302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209594
59033	NC_013889	GCC	2	6	2555353	2555358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209594
59034	NC_013889	TCG	2	6	2555377	2555382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209594
59035	NC_013889	CCGC	2	8	2555384	2555391	0 %	0 %	25 %	75 %	289209594
59036	NC_013889	GCTC	2	8	2555453	2555460	0 %	25 %	25 %	50 %	289209594
59037	NC_013889	ACA	2	6	2555506	2555511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209594
59038	NC_013889	GCG	3	9	2555530	2555538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209594
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59040	NC_013889	GAC	2	6	2555562	2555567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209594
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59042	NC_013889	GGA	2	6	2555723	2555728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209594
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59046	NC_013889	GGCC	2	8	2555966	2555973	0 %	0 %	50 %	50 %	289209594
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59049	NC_013889	GC	4	8	2556116	2556123	0 %	0 %	50 %	50 %	289209594
59050	NC_013889	TCG	2	6	2556142	2556147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209594
59051	NC_013889	TGC	2	6	2556184	2556189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209594
59052	NC_013889	GC	3	6	2556208	2556213	0 %	0 %	50 %	50 %	289209594
59053	NC_013889	CGT	2	6	2556243	2556248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59054	NC_013889	CGC	2	6	2556358	2556363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209595
59055	NC_013889	GGC	2	6	2556376	2556381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209595
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59058	NC_013889	CGA	2	6	2556478	2556483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209595
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59060	NC_013889	GCCC	2	8	2556536	2556543	0 %	0 %	25 %	75 %	289209595
59061	NC_013889	GCC	2	6	2556554	2556559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209595
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59085	NC_013889	CTG	2	6	2557555	2557560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209596
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59112	NC_013889	CTGGTC	2	12	2558642	2558653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209597
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59116	NC_013889	GCAA	2	8	2558723	2558730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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59233	NC_013889	TCG	2	6	2563539	2563544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209603
59234	NC_013889	CGC	2	6	2563556	2563561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209603
59235	NC_013889	CAC	2	6	2563592	2563597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209603
59236	NC_013889	TGC	2	6	2563631	2563636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209603
59237	NC_013889	CG	3	6	2563731	2563736	0 %	0 %	50 %	50 %	289209603
59238	NC_013889	CAC	2	6	2563800	2563805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209603
59239	NC_013889	CTG	2	6	2563983	2563988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209604
59240	NC_013889	GGCGC	2	10	2563991	2564000	0 %	0 %	60 %	40 %	289209604
59241	NC_013889	CCG	2	6	2564001	2564006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209604
59242	NC_013889	CG	3	6	2564041	2564046	0 %	0 %	50 %	50 %	289209604
59243	NC_013889	CTG	2	6	2564196	2564201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209604
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59247	NC_013889	CGCATC	2	12	2564325	2564336	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289209604
59248	NC_013889	GCGGG	2	10	2564351	2564360	0 %	0 %	80 %	20 %	289209604
59249	NC_013889	GCC	2	6	2564385	2564390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209604
59250	NC_013889	CGATCG	2	12	2564410	2564421	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289209604
59251	NC_013889	CCGA	2	8	2564574	2564581	25 %	0 %	25 %	50 %	289209604
59252	NC_013889	CGA	2	6	2564600	2564605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209604
59253	NC_013889	CCGGC	2	10	2564650	2564659	0 %	0 %	40 %	60 %	289209604
59254	NC_013889	CGA	2	6	2564711	2564716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209604
59255	NC_013889	CA	3	6	2564979	2564984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59256	NC_013889	CCT	2	6	2565025	2565030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59257	NC_013889	GC	3	6	2565088	2565093	0 %	0 %	50 %	50 %	289209605
59258	NC_013889	TCAT	2	8	2565097	2565104	25 %	50 %	0 %	25 %	289209605
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59262	NC_013889	ACT	2	6	2565327	2565332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209605
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59264	NC_013889	CGCT	2	8	2565389	2565396	0 %	25 %	25 %	50 %	289209605
59265	NC_013889	TGA	2	6	2565444	2565449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209605
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59281	NC_013889	CAA	2	6	2566363	2566368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209606
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59284	NC_013889	CTA	2	6	2566405	2566410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209606
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59298	NC_013889	A	6	6	2566830	2566835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59299	NC_013889	GAC	2	6	2566885	2566890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209607
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59304	NC_013889	CCGA	2	8	2567215	2567222	25 %	0 %	25 %	50 %	289209607
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59323	NC_013889	TGCC	2	8	2568032	2568039	0 %	25 %	25 %	50 %	289209608
59324	NC_013889	CGCGG	2	10	2568108	2568117	0 %	0 %	60 %	40 %	289209608
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59331	NC_013889	CG	3	6	2568266	2568271	0 %	0 %	50 %	50 %	289209608
59332	NC_013889	CGA	3	9	2568341	2568349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209608
59333	NC_013889	GGCT	2	8	2568357	2568364	0 %	25 %	50 %	25 %	289209608
59334	NC_013889	TCT	2	6	2568416	2568421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209608
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59337	NC_013889	GGCT	2	8	2568489	2568496	0 %	25 %	50 %	25 %	289209608
59338	NC_013889	GGT	2	6	2568497	2568502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209608
59339	NC_013889	GCT	2	6	2568521	2568526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209608
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59341	NC_013889	CAT	2	6	2568599	2568604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209608
59342	NC_013889	GAAC	2	8	2568617	2568624	50 %	0 %	25 %	25 %	289209608
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59344	NC_013889	ACC	2	6	2568877	2568882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209608
59345	NC_013889	AGC	2	6	2568997	2569002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209608
59346	NC_013889	GCGT	2	8	2569040	2569047	0 %	25 %	50 %	25 %	289209608
59347	NC_013889	T	6	6	2569124	2569129	0 %	100 %	0 %	0 %	289209608
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59349	NC_013889	GCC	2	6	2569326	2569331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209608
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59454	NC_013889	TG	3	6	2575337	2575342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59455	NC_013889	CTG	2	6	2575526	2575531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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59457	NC_013889	AAT	2	6	2575684	2575689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59458	NC_013889	CGAC	2	8	2575697	2575704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59459	NC_013889	CG	4	8	2575749	2575756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59460	NC_013889	CCA	2	6	2575816	2575821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59461	NC_013889	T	7	7	2575943	2575949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59462	NC_013889	A	6	6	2576163	2576168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59463	NC_013889	CAC	2	6	2576190	2576195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59464	NC_013889	GCT	2	6	2576236	2576241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59465	NC_013889	GGA	2	6	2576726	2576731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59466	NC_013889	GCT	2	6	2576846	2576851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59467	NC_013889	ACT	2	6	2576899	2576904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59468	NC_013889	CCG	2	6	2577013	2577018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59469	NC_013889	ATC	2	6	2577065	2577070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59470	NC_013889	CCG	2	6	2577088	2577093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59471	NC_013889	TGG	2	6	2577144	2577149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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59478	NC_013889	GCA	2	6	2577556	2577561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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59482	NC_013889	CTC	2	6	2577810	2577815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59483	NC_013889	GTG	2	6	2577853	2577858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59484	NC_013889	GC	3	6	2577866	2577871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59485	NC_013889	GTT	2	6	2577875	2577880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59486	NC_013889	CG	3	6	2578046	2578051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59487	NC_013889	CG	3	6	2578100	2578105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59488	NC_013889	CGA	2	6	2578153	2578158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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59490	NC_013889	TCGGCG	2	12	2578282	2578293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59491	NC_013889	T	7	7	2578387	2578393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59492	NC_013889	GGC	2	6	2578463	2578468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59493	NC_013889	TGG	2	6	2578472	2578477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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59497	NC_013889	GCC	2	6	2578666	2578671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59498	NC_013889	ACGCG	2	10	2578827	2578836	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59499	NC_013889	GCA	2	6	2578940	2578945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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