MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_013889	TCA	2	6	2422151	2422156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209463
56002	NC_013889	GTC	2	6	2422173	2422178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209463
56003	NC_013889	GCG	2	6	2422186	2422191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209463
56004	NC_013889	TGT	2	6	2422283	2422288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209463
56005	NC_013889	TCC	2	6	2422292	2422297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56006	NC_013889	CTTG	2	8	2422321	2422328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56007	NC_013889	CAA	2	6	2422443	2422448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209464
56008	NC_013889	CCT	2	6	2422456	2422461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209464
56009	NC_013889	ACC	2	6	2422479	2422484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209464
56010	NC_013889	CTG	2	6	2422584	2422589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209464
56011	NC_013889	TGT	2	6	2422615	2422620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209464
56012	NC_013889	GGC	2	6	2422670	2422675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209464
56013	NC_013889	GCA	2	6	2422700	2422705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209464
56014	NC_013889	GACC	2	8	2422706	2422713	25 %	0 %	25 %	50 %	289209464
56015	NC_013889	GCG	2	6	2422716	2422721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209464
56016	NC_013889	GCT	2	6	2422724	2422729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209464
56017	NC_013889	ACG	3	9	2422846	2422854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209464
56018	NC_013889	GACT	2	8	2422866	2422873	25 %	25 %	25 %	25 %	289209464
56019	NC_013889	CGA	2	6	2422891	2422896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56020	NC_013889	CGC	2	6	2422930	2422935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209465
56021	NC_013889	GCT	2	6	2422954	2422959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56022	NC_013889	CAG	2	6	2422976	2422981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56023	NC_013889	TCG	2	6	2423141	2423146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56024	NC_013889	GCG	2	6	2423174	2423179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209465
56025	NC_013889	CGC	2	6	2423216	2423221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209465
56026	NC_013889	CCA	2	6	2423230	2423235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209465
56027	NC_013889	GCT	2	6	2423245	2423250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56028	NC_013889	GGA	2	6	2423281	2423286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209465
56029	NC_013889	CAC	2	6	2423297	2423302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209465
56030	NC_013889	GC	3	6	2423315	2423320	0 %	0 %	50 %	50 %	289209465
56031	NC_013889	CGG	2	6	2423337	2423342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209465
56032	NC_013889	AAC	2	6	2423349	2423354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209465
56033	NC_013889	TCG	2	6	2423382	2423387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56034	NC_013889	GCA	2	6	2423401	2423406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56035	NC_013889	CAG	2	6	2423472	2423477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56036	NC_013889	TGG	2	6	2423505	2423510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209465
56037	NC_013889	GGTG	2	8	2423611	2423618	0 %	25 %	75 %	0 %	289209465
56038	NC_013889	GC	4	8	2423631	2423638	0 %	0 %	50 %	50 %	289209465
56039	NC_013889	CGA	2	6	2423827	2423832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209465
56040	NC_013889	GCCG	2	8	2423872	2423879	0 %	0 %	50 %	50 %	289209465
56041	NC_013889	CG	3	6	2424010	2424015	0 %	0 %	50 %	50 %	289209465
56042	NC_013889	CGGAGC	2	12	2424051	2424062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289209465
56043	NC_013889	C	6	6	2424066	2424071	0 %	0 %	0 %	100 %	289209465
56044	NC_013889	CCT	2	6	2424088	2424093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209465
56045	NC_013889	GCC	2	6	2424101	2424106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209465
56046	NC_013889	CCG	2	6	2424135	2424140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209465
56047	NC_013889	ATC	2	6	2424161	2424166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209465
56048	NC_013889	GCG	2	6	2424167	2424172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209465
56049	NC_013889	ACC	2	6	2424322	2424327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209466
56050	NC_013889	TCAT	2	8	2424413	2424420	25 %	50 %	0 %	25 %	289209466
56051	NC_013889	GC	4	8	2424432	2424439	0 %	0 %	50 %	50 %	289209466
56052	NC_013889	CGT	2	6	2424450	2424455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209466
56053	NC_013889	CTG	2	6	2424505	2424510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209466
56054	NC_013889	CG	3	6	2424566	2424571	0 %	0 %	50 %	50 %	289209466
56055	NC_013889	CCG	3	9	2424572	2424580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209466
56056	NC_013889	CGA	2	6	2424597	2424602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209466
56057	NC_013889	CGC	2	6	2424708	2424713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209466
56058	NC_013889	CAA	2	6	2424726	2424731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209466
56059	NC_013889	ACC	2	6	2424764	2424769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209466
56060	NC_013889	GTG	2	6	2424814	2424819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209466
56061	NC_013889	CG	3	6	2424833	2424838	0 %	0 %	50 %	50 %	289209466
56062	NC_013889	CG	3	6	2424858	2424863	0 %	0 %	50 %	50 %	289209466
56063	NC_013889	CCG	2	6	2424895	2424900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209466
56064	NC_013889	CGC	2	6	2424977	2424982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209466
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56066	NC_013889	ACG	2	6	2425064	2425069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209466
56067	NC_013889	GCT	2	6	2425107	2425112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209466
56068	NC_013889	GGAC	2	8	2425179	2425186	25 %	0 %	50 %	25 %	289209466
56069	NC_013889	GAG	2	6	2425198	2425203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209466
56070	NC_013889	CGA	2	6	2425221	2425226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209466
56071	NC_013889	GC	3	6	2425239	2425244	0 %	0 %	50 %	50 %	289209466
56072	NC_013889	GCCCT	2	10	2425321	2425330	0 %	20 %	20 %	60 %	289209466
56073	NC_013889	CTT	2	6	2425383	2425388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56074	NC_013889	GCT	2	6	2425389	2425394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56075	NC_013889	CGCA	2	8	2425404	2425411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56076	NC_013889	GGA	2	6	2425462	2425467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56077	NC_013889	GTC	2	6	2425489	2425494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209467
56078	NC_013889	CTG	2	6	2425516	2425521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209467
56079	NC_013889	TCT	2	6	2425575	2425580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209467
56080	NC_013889	CAG	2	6	2425630	2425635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209467
56081	NC_013889	TGC	2	6	2425653	2425658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209467
56082	NC_013889	GCGGAT	2	12	2425669	2425680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289209467
56083	NC_013889	GCCGG	2	10	2425724	2425733	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56084	NC_013889	CAA	2	6	2425769	2425774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56085	NC_013889	CA	3	6	2425778	2425783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56086	NC_013889	CAGAA	2	10	2425790	2425799	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56087	NC_013889	GTG	2	6	2425835	2425840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56088	NC_013889	CAT	2	6	2425869	2425874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56089	NC_013889	GCCC	2	8	2425939	2425946	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56090	NC_013889	CGA	2	6	2425989	2425994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209468
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56098	NC_013889	CAG	2	6	2426216	2426221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209468
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56101	NC_013889	GCG	2	6	2426318	2426323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56102	NC_013889	GGA	2	6	2426504	2426509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209469
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56104	NC_013889	TCG	2	6	2426518	2426523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209469
56105	NC_013889	GC	3	6	2426529	2426534	0 %	0 %	50 %	50 %	289209469
56106	NC_013889	GC	3	6	2426605	2426610	0 %	0 %	50 %	50 %	289209469
56107	NC_013889	ACC	3	9	2426628	2426636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209469
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56111	NC_013889	GC	3	6	2426742	2426747	0 %	0 %	50 %	50 %	289209469
56112	NC_013889	GCC	2	6	2426796	2426801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209469
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56115	NC_013889	CTCG	2	8	2426877	2426884	0 %	25 %	25 %	50 %	289209469
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56117	NC_013889	GGT	2	6	2426934	2426939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209469
56118	NC_013889	GCA	2	6	2427062	2427067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209469
56119	NC_013889	GTGC	2	8	2427171	2427178	0 %	25 %	50 %	25 %	289209470
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56235	NC_013889	ATC	2	6	2432261	2432266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209473
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56463	NC_013889	GCAA	2	8	2441727	2441734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56464	NC_013889	GTT	2	6	2441743	2441748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56465	NC_013889	GCGCG	2	10	2441761	2441770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56466	NC_013889	CAA	2	6	2441844	2441849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56467	NC_013889	GGC	2	6	2441854	2441859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56468	NC_013889	GGC	2	6	2441960	2441965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209481
56469	NC_013889	GTC	2	6	2441968	2441973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209481
56470	NC_013889	CGT	2	6	2441985	2441990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209481
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56499	NC_013889	GCG	2	6	2443245	2443250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209481
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