MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_013889	GCC	2	6	2401060	2401065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209439
55502	NC_013889	GTC	2	6	2401067	2401072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209439
55503	NC_013889	GTG	2	6	2401107	2401112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209439
55504	NC_013889	CGA	2	6	2401113	2401118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209439
55505	NC_013889	CGA	2	6	2401140	2401145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209439
55506	NC_013889	CG	3	6	2401148	2401153	0 %	0 %	50 %	50 %	289209439
55507	NC_013889	CGG	2	6	2401158	2401163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209439
55508	NC_013889	TTC	2	6	2401168	2401173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209439
55509	NC_013889	GAC	2	6	2401174	2401179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209439
55510	NC_013889	GGC	2	6	2401189	2401194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209439
55511	NC_013889	TCG	2	6	2401259	2401264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209439
55512	NC_013889	GCGAGC	2	12	2401289	2401300	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289209439
55513	NC_013889	CGGG	2	8	2401382	2401389	0 %	0 %	75 %	25 %	289209439
55514	NC_013889	GCC	2	6	2401416	2401421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209439
55515	NC_013889	CG	3	6	2401499	2401504	0 %	0 %	50 %	50 %	289209439
55516	NC_013889	CTGG	2	8	2401506	2401513	0 %	25 %	50 %	25 %	289209439
55517	NC_013889	CCG	2	6	2401520	2401525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209439
55518	NC_013889	CAA	2	6	2401536	2401541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55519	NC_013889	GAC	2	6	2401543	2401548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55520	NC_013889	GCCG	2	8	2401580	2401587	0 %	0 %	50 %	50 %	289209440
55521	NC_013889	CGC	2	6	2401592	2401597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209440
55522	NC_013889	CGC	2	6	2401619	2401624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209440
55523	NC_013889	GC	3	6	2401645	2401650	0 %	0 %	50 %	50 %	289209440
55524	NC_013889	GAC	2	6	2401652	2401657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209440
55525	NC_013889	CTG	3	9	2401745	2401753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209440
55526	NC_013889	GAG	2	6	2401754	2401759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209440
55527	NC_013889	GCC	3	9	2401763	2401771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209440
55528	NC_013889	GGT	2	6	2401807	2401812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209440
55529	NC_013889	GAA	2	6	2401822	2401827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289209440
55530	NC_013889	GCC	2	6	2401838	2401843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209440
55531	NC_013889	GC	3	6	2401873	2401878	0 %	0 %	50 %	50 %	289209440
55532	NC_013889	CG	3	6	2401883	2401888	0 %	0 %	50 %	50 %	289209440
55533	NC_013889	CAC	2	6	2401945	2401950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209440
55534	NC_013889	CAT	2	6	2401966	2401971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209440
55535	NC_013889	CGA	2	6	2401972	2401977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209440
55536	NC_013889	GTG	2	6	2401988	2401993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209440
55537	NC_013889	ATG	2	6	2402075	2402080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209440
55538	NC_013889	GGC	2	6	2402225	2402230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209440
55539	NC_013889	CCG	2	6	2402353	2402358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209440
55540	NC_013889	CGA	2	6	2402365	2402370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209440
55541	NC_013889	GCC	3	9	2402426	2402434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209440
55542	NC_013889	GGCT	2	8	2402441	2402448	0 %	25 %	50 %	25 %	289209440
55543	NC_013889	GC	3	6	2402455	2402460	0 %	0 %	50 %	50 %	289209440
55544	NC_013889	GC	3	6	2402491	2402496	0 %	0 %	50 %	50 %	289209440
55545	NC_013889	CTA	2	6	2402518	2402523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209440
55546	NC_013889	GGA	2	6	2402551	2402556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209440
55547	NC_013889	GAGC	2	8	2402568	2402575	25 %	0 %	50 %	25 %	289209440
55548	NC_013889	CGC	2	6	2402627	2402632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209441
55549	NC_013889	GCA	2	6	2402664	2402669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209441
55550	NC_013889	GAG	2	6	2402713	2402718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209441
55551	NC_013889	TCC	2	6	2402734	2402739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209441
55552	NC_013889	GACC	2	8	2402805	2402812	25 %	0 %	25 %	50 %	289209441
55553	NC_013889	GC	3	6	2402820	2402825	0 %	0 %	50 %	50 %	289209441
55554	NC_013889	CGA	3	9	2402850	2402858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209441
55555	NC_013889	ACA	2	6	2402876	2402881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209441
55556	NC_013889	CGGC	2	8	2402934	2402941	0 %	0 %	50 %	50 %	289209441
55557	NC_013889	CGG	2	6	2402961	2402966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209441
55558	NC_013889	GCT	2	6	2402979	2402984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209441
55559	NC_013889	CTG	2	6	2402992	2402997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209441
55560	NC_013889	GCG	2	6	2403037	2403042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209441
55561	NC_013889	CGAT	2	8	2403080	2403087	25 %	25 %	25 %	25 %	289209441
55562	NC_013889	CCG	2	6	2403122	2403127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209441
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55565	NC_013889	GCTG	2	8	2403277	2403284	0 %	25 %	50 %	25 %	289209441
55566	NC_013889	GCC	2	6	2403325	2403330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209441
55567	NC_013889	ACC	2	6	2403367	2403372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209441
55568	NC_013889	GC	3	6	2403462	2403467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55569	NC_013889	TTCC	2	8	2403495	2403502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55570	NC_013889	G	6	6	2403508	2403513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55571	NC_013889	ACC	2	6	2403579	2403584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209442
55572	NC_013889	GAG	2	6	2403603	2403608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209442
55573	NC_013889	GCA	2	6	2403667	2403672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209442
55574	NC_013889	GCC	2	6	2403679	2403684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209442
55575	NC_013889	GC	3	6	2403698	2403703	0 %	0 %	50 %	50 %	289209442
55576	NC_013889	GAT	2	6	2403704	2403709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209442
55577	NC_013889	CGG	2	6	2403734	2403739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209442
55578	NC_013889	AGG	2	6	2403766	2403771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209442
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55581	NC_013889	GAG	2	6	2403897	2403902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209442
55582	NC_013889	ACA	2	6	2403994	2403999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209442
55583	NC_013889	GC	3	6	2404016	2404021	0 %	0 %	50 %	50 %	289209442
55584	NC_013889	GC	3	6	2404034	2404039	0 %	0 %	50 %	50 %	289209442
55585	NC_013889	CGGCG	2	10	2404047	2404056	0 %	0 %	60 %	40 %	289209442
55586	NC_013889	CCG	2	6	2404120	2404125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209442
55587	NC_013889	GGCCG	2	10	2404202	2404211	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55588	NC_013889	CATC	2	8	2404238	2404245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55589	NC_013889	GC	3	6	2404248	2404253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55590	NC_013889	GCC	2	6	2404270	2404275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55591	NC_013889	GACC	2	8	2404324	2404331	25 %	0 %	25 %	50 %	289209443
55592	NC_013889	ATCT	2	8	2404339	2404346	25 %	50 %	0 %	25 %	289209443
55593	NC_013889	GCT	2	6	2404347	2404352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209443
55594	NC_013889	GCC	2	6	2404395	2404400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209443
55595	NC_013889	ATCTTC	2	12	2404411	2404422	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289209443
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55597	NC_013889	CGGC	2	8	2404448	2404455	0 %	0 %	50 %	50 %	289209443
55598	NC_013889	CG	3	6	2404508	2404513	0 %	0 %	50 %	50 %	289209443
55599	NC_013889	CCGC	2	8	2404515	2404522	0 %	0 %	25 %	75 %	289209443
55600	NC_013889	CTG	2	6	2404612	2404617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209443
55601	NC_013889	GGT	2	6	2404641	2404646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209443
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55618	NC_013889	G	6	6	2405136	2405141	0 %	0 %	100 %	0 %	289209443
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55736	NC_013889	TGA	2	6	2410281	2410286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209450
55737	NC_013889	TCA	2	6	2410404	2410409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209450
55738	NC_013889	CTG	2	6	2410421	2410426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209450
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55829	NC_013889	CGCC	2	8	2414519	2414526	0 %	0 %	25 %	75 %	289209454
55830	NC_013889	GGCG	2	8	2414532	2414539	0 %	0 %	75 %	25 %	289209454
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55839	NC_013889	CG	4	8	2415029	2415036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55840	NC_013889	CCGCCA	2	12	2415056	2415067	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	289209455
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55845	NC_013889	CGGC	2	8	2415396	2415403	0 %	0 %	50 %	50 %	289209455
55846	NC_013889	CTG	2	6	2415424	2415429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209455
55847	NC_013889	CG	3	6	2415498	2415503	0 %	0 %	50 %	50 %	289209455
55848	NC_013889	GCGT	2	8	2415512	2415519	0 %	25 %	50 %	25 %	289209455
55849	NC_013889	GGC	2	6	2415520	2415525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209455
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55968	NC_013889	ACC	2	6	2420732	2420737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209461
55969	NC_013889	GT	3	6	2420742	2420747	0 %	50 %	50 %	0 %	289209461
55970	NC_013889	CGC	2	6	2420766	2420771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209461
55971	NC_013889	GC	3	6	2420851	2420856	0 %	0 %	50 %	50 %	289209461
55972	NC_013889	GC	3	6	2420954	2420959	0 %	0 %	50 %	50 %	289209462
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55994	NC_013889	CTG	2	6	2421786	2421791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209463
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55998	NC_013889	GTCCAC	2	12	2422029	2422040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289209463
55999	NC_013889	GCC	2	6	2422052	2422057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209463
56000	NC_013889	ATG	2	6	2422084	2422089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209463

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