MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54502	NC_013889	GC	3	6	2360449	2360454	0 %	0 %	50 %	50 %	289209400
54503	NC_013889	GTG	2	6	2360531	2360536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209400
54504	NC_013889	CCCG	2	8	2360539	2360546	0 %	0 %	25 %	75 %	289209400
54505	NC_013889	CGC	2	6	2360554	2360559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209400
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54508	NC_013889	CCG	2	6	2360599	2360604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209400
54509	NC_013889	CTG	2	6	2360675	2360680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209400
54510	NC_013889	GC	3	6	2360701	2360706	0 %	0 %	50 %	50 %	289209400
54511	NC_013889	TGC	3	9	2360712	2360720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209400
54512	NC_013889	CCGC	2	8	2360731	2360738	0 %	0 %	25 %	75 %	289209400
54513	NC_013889	CGA	2	6	2360812	2360817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209400
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54518	NC_013889	TGGG	2	8	2361038	2361045	0 %	25 %	75 %	0 %	289209400
54519	NC_013889	GC	3	6	2361051	2361056	0 %	0 %	50 %	50 %	289209400
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54559	NC_013889	CGC	2	6	2362362	2362367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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54600	NC_013889	CAG	2	6	2364371	2364376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209403
54601	NC_013889	CGGG	2	8	2364387	2364394	0 %	0 %	75 %	25 %	289209403
54602	NC_013889	TAC	2	6	2364446	2364451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209403
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54614	NC_013889	CCAT	2	8	2364962	2364969	25 %	25 %	0 %	50 %	289209404
54615	NC_013889	G	6	6	2364973	2364978	0 %	0 %	100 %	0 %	289209404
54616	NC_013889	CCT	2	6	2364995	2365000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209404
54617	NC_013889	GCCC	2	8	2365007	2365014	0 %	0 %	25 %	75 %	289209404
54618	NC_013889	GGCCT	2	10	2365051	2365060	0 %	20 %	40 %	40 %	289209404
54619	NC_013889	ACC	2	6	2365081	2365086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209404
54620	NC_013889	GGC	2	6	2365107	2365112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209404
54621	NC_013889	AGG	2	6	2365130	2365135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209404
54622	NC_013889	GCG	2	6	2365252	2365257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209404
54623	NC_013889	GATC	2	8	2365362	2365369	25 %	25 %	25 %	25 %	289209404
54624	NC_013889	GCCC	2	8	2365393	2365400	0 %	0 %	25 %	75 %	289209404
54625	NC_013889	GC	3	6	2365405	2365410	0 %	0 %	50 %	50 %	289209404
54626	NC_013889	CTG	3	9	2365411	2365419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209404
54627	NC_013889	CTG	2	6	2365426	2365431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209404
54628	NC_013889	CGA	2	6	2365443	2365448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209404
54629	NC_013889	GGC	2	6	2365455	2365460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209404
54630	NC_013889	GC	4	8	2365544	2365551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54631	NC_013889	TGCGG	2	10	2365702	2365711	0 %	20 %	60 %	20 %	289209405
54632	NC_013889	CGG	2	6	2365740	2365745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209405
54633	NC_013889	CGG	2	6	2365778	2365783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209405
54634	NC_013889	TCGATA	2	12	2365841	2365852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	289209405
54635	NC_013889	GAC	2	6	2365883	2365888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209405
54636	NC_013889	CGC	2	6	2365905	2365910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209405
54637	NC_013889	CTG	2	6	2365924	2365929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209405
54638	NC_013889	CTC	2	6	2365936	2365941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209405
54639	NC_013889	CTG	2	6	2365954	2365959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209405
54640	NC_013889	GCC	2	6	2365962	2365967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209405
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54642	NC_013889	CG	3	6	2366005	2366010	0 %	0 %	50 %	50 %	289209405
54643	NC_013889	GCGCC	2	10	2366018	2366027	0 %	0 %	40 %	60 %	289209405
54644	NC_013889	TCC	2	6	2366089	2366094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209405
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54646	NC_013889	GGC	2	6	2366268	2366273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209405
54647	NC_013889	GATCGA	2	12	2366289	2366300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289209405
54648	NC_013889	GCT	2	6	2366369	2366374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54649	NC_013889	CTG	2	6	2366393	2366398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54650	NC_013889	CCA	2	6	2366427	2366432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209406
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54652	NC_013889	CG	3	6	2366499	2366504	0 %	0 %	50 %	50 %	289209406
54653	NC_013889	ACC	2	6	2366591	2366596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209406
54654	NC_013889	CCCG	2	8	2366606	2366613	0 %	0 %	25 %	75 %	289209406
54655	NC_013889	CTG	2	6	2366626	2366631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209406
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54665	NC_013889	GC	3	6	2367040	2367045	0 %	0 %	50 %	50 %	289209406
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54671	NC_013889	GGA	2	6	2367294	2367299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209406
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54679	NC_013889	ACGGGA	2	12	2367712	2367723	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	289209407
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54681	NC_013889	CGCC	2	8	2367764	2367771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54682	NC_013889	ATC	2	6	2367792	2367797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54687	NC_013889	GAT	2	6	2367982	2367987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209408
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54702	NC_013889	CGG	3	9	2368542	2368550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209408
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54714	NC_013889	CTA	2	6	2368981	2368986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209409
54715	NC_013889	TTC	2	6	2369033	2369038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54722	NC_013889	GAC	2	6	2369535	2369540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209410
54723	NC_013889	CGT	3	9	2369552	2369560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209410
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54730	NC_013889	GTC	3	9	2369861	2369869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209411
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54732	NC_013889	CGG	2	6	2370110	2370115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209411
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54969	NC_013889	GGGTC	2	10	2380363	2380372	0 %	20 %	60 %	20 %	289209421
54970	NC_013889	GCC	2	6	2380502	2380507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209421
54971	NC_013889	C	6	6	2380564	2380569	0 %	0 %	0 %	100 %	289209421
54972	NC_013889	GCA	2	6	2380591	2380596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209421
54973	NC_013889	GCG	2	6	2380627	2380632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209421
54974	NC_013889	TCA	2	6	2380671	2380676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209421
54975	NC_013889	CCT	2	6	2380690	2380695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209421
54976	NC_013889	GTCG	2	8	2380747	2380754	0 %	25 %	50 %	25 %	289209422
54977	NC_013889	GCG	2	6	2380834	2380839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209422
54978	NC_013889	CCA	2	6	2380869	2380874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209422
54979	NC_013889	CAG	2	6	2380930	2380935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209422
54980	NC_013889	AGT	2	6	2381007	2381012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209422
54981	NC_013889	CCT	2	6	2381031	2381036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209422
54982	NC_013889	GCCA	2	8	2381097	2381104	25 %	0 %	25 %	50 %	289209422
54983	NC_013889	GAT	2	6	2381122	2381127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209422
54984	NC_013889	TCG	2	6	2381135	2381140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209422
54985	NC_013889	CCA	2	6	2381141	2381146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209422
54986	NC_013889	GTTC	2	8	2381157	2381164	0 %	50 %	25 %	25 %	289209422
54987	NC_013889	GC	3	6	2381241	2381246	0 %	0 %	50 %	50 %	289209422
54988	NC_013889	GTC	2	6	2381269	2381274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209422
54989	NC_013889	TGC	2	6	2381307	2381312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209422
54990	NC_013889	GTC	2	6	2381320	2381325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209422
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54992	NC_013889	GACGTA	2	12	2381368	2381379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289209422
54993	NC_013889	CGG	2	6	2381439	2381444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209422
54994	NC_013889	GCC	2	6	2381512	2381517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209422
54995	NC_013889	CAG	2	6	2381587	2381592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209422
54996	NC_013889	GTC	2	6	2381617	2381622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209422
54997	NC_013889	GGT	2	6	2381745	2381750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209422
54998	NC_013889	CTG	2	6	2381758	2381763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209422
54999	NC_013889	CAC	2	6	2381764	2381769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209422
55000	NC_013889	CGG	2	6	2381793	2381798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209422

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