MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_013889	TC	3	6	2296908	2296913	0 %	50 %	0 %	50 %	289209343
53002	NC_013889	CAT	2	6	2297122	2297127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53003	NC_013889	ACC	2	6	2297187	2297192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53004	NC_013889	TGG	2	6	2297225	2297230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53005	NC_013889	GAG	2	6	2297234	2297239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53006	NC_013889	CAG	2	6	2297264	2297269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53007	NC_013889	CTC	2	6	2297306	2297311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53008	NC_013889	CG	3	6	2297370	2297375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53009	NC_013889	GC	3	6	2297392	2297397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53010	NC_013889	TTCCA	2	10	2297450	2297459	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53011	NC_013889	CG	3	6	2297503	2297508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53012	NC_013889	CG	3	6	2297621	2297626	0 %	0 %	50 %	50 %	289209344
53013	NC_013889	CAG	2	6	2297629	2297634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53014	NC_013889	GAG	2	6	2297704	2297709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209344
53015	NC_013889	GCT	2	6	2297751	2297756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53016	NC_013889	CCA	2	6	2297852	2297857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209344
53017	NC_013889	CGA	2	6	2297871	2297876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53018	NC_013889	CGT	2	6	2297966	2297971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53019	NC_013889	GAC	2	6	2297980	2297985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53020	NC_013889	CGA	3	9	2297991	2297999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53021	NC_013889	GGC	2	6	2298028	2298033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209344
53022	NC_013889	CGC	2	6	2298054	2298059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209344
53023	NC_013889	GAC	2	6	2298070	2298075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53024	NC_013889	GTG	2	6	2298082	2298087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209344
53025	NC_013889	CAA	2	6	2298096	2298101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209344
53026	NC_013889	TGC	2	6	2298194	2298199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53027	NC_013889	CCG	2	6	2298214	2298219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209344
53028	NC_013889	CG	3	6	2298243	2298248	0 %	0 %	50 %	50 %	289209344
53029	NC_013889	GCG	2	6	2298282	2298287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209344
53030	NC_013889	CGAT	2	8	2298335	2298342	25 %	25 %	25 %	25 %	289209344
53031	NC_013889	AGC	2	6	2298406	2298411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53032	NC_013889	GATC	2	8	2298423	2298430	25 %	25 %	25 %	25 %	289209344
53033	NC_013889	GAG	2	6	2298442	2298447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209344
53034	NC_013889	AGG	2	6	2298455	2298460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209344
53035	NC_013889	GAT	2	6	2298492	2298497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209344
53036	NC_013889	GC	3	6	2298668	2298673	0 %	0 %	50 %	50 %	289209344
53037	NC_013889	TGG	2	6	2298710	2298715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209344
53038	NC_013889	GGC	2	6	2298756	2298761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209344
53039	NC_013889	C	6	6	2298844	2298849	0 %	0 %	0 %	100 %	289209344
53040	NC_013889	ACA	2	6	2298851	2298856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209344
53041	NC_013889	CCT	2	6	2298860	2298865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209344
53042	NC_013889	CTG	2	6	2298871	2298876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209344
53043	NC_013889	ATC	2	6	2298877	2298882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209344
53044	NC_013889	GC	3	6	2298895	2298900	0 %	0 %	50 %	50 %	289209344
53045	NC_013889	GGA	2	6	2298927	2298932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209344
53046	NC_013889	AGG	2	6	2298956	2298961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209344
53047	NC_013889	AAGG	2	8	2299141	2299148	50 %	0 %	50 %	0 %	289209344
53048	NC_013889	CGC	2	6	2299239	2299244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53049	NC_013889	GTC	2	6	2299423	2299428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209345
53050	NC_013889	AAG	2	6	2299438	2299443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289209345
53051	NC_013889	TGC	2	6	2299523	2299528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209345
53052	NC_013889	GCTCAA	2	12	2299605	2299616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289209345
53053	NC_013889	GCG	2	6	2299631	2299636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209345
53054	NC_013889	CGC	3	9	2299644	2299652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209345
53055	NC_013889	CGA	2	6	2299677	2299682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209345
53056	NC_013889	TGG	2	6	2299685	2299690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209345
53057	NC_013889	CGG	3	9	2299811	2299819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209345
53058	NC_013889	TCG	2	6	2299820	2299825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209345
53059	NC_013889	TGG	2	6	2299826	2299831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209345
53060	NC_013889	GTG	2	6	2299837	2299842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209345
53061	NC_013889	CTG	2	6	2299852	2299857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209345
53062	NC_013889	TGG	2	6	2299928	2299933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209345
53063	NC_013889	TGG	3	9	2299960	2299968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209345
53064	NC_013889	CGG	2	6	2300017	2300022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209345
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53067	NC_013889	CGA	2	6	2300229	2300234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209345
53068	NC_013889	CTG	2	6	2300410	2300415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209345
53069	NC_013889	CGG	2	6	2300451	2300456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209345
53070	NC_013889	GGTCA	2	10	2300494	2300503	20 %	20 %	40 %	20 %	289209345
53071	NC_013889	AC	3	6	2300527	2300532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53072	NC_013889	CCCG	2	8	2300593	2300600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53073	NC_013889	GCC	2	6	2300681	2300686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53074	NC_013889	GTT	2	6	2300688	2300693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53075	NC_013889	GC	3	6	2300705	2300710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53076	NC_013889	ACGC	2	8	2300768	2300775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53077	NC_013889	CGAGCG	2	12	2300786	2300797	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289209346
53078	NC_013889	GCT	2	6	2300886	2300891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209346
53079	NC_013889	CG	3	6	2300965	2300970	0 %	0 %	50 %	50 %	289209346
53080	NC_013889	GAC	2	6	2300995	2301000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209346
53081	NC_013889	CTG	2	6	2301013	2301018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209346
53082	NC_013889	GCGA	2	8	2301044	2301051	25 %	0 %	50 %	25 %	289209346
53083	NC_013889	CGACA	2	10	2301204	2301213	40 %	0 %	20 %	40 %	289209346
53084	NC_013889	GCT	2	6	2301216	2301221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209346
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53086	NC_013889	CG	3	6	2301267	2301272	0 %	0 %	50 %	50 %	289209346
53087	NC_013889	CAC	2	6	2301273	2301278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209346
53088	NC_013889	CTGG	2	8	2301312	2301319	0 %	25 %	50 %	25 %	289209346
53089	NC_013889	GCT	2	6	2301321	2301326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209346
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53092	NC_013889	GCT	2	6	2301465	2301470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209346
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53098	NC_013889	ATCCCG	2	12	2301589	2301600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289209346
53099	NC_013889	GCC	2	6	2301619	2301624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209346
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53101	NC_013889	TGG	2	6	2301656	2301661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209346
53102	NC_013889	GCG	2	6	2301694	2301699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209347
53103	NC_013889	CGA	2	6	2301922	2301927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209347
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53105	NC_013889	GCT	2	6	2302033	2302038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209347
53106	NC_013889	GGCT	2	8	2302045	2302052	0 %	25 %	50 %	25 %	289209347
53107	NC_013889	TCG	3	9	2302077	2302085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209347
53108	NC_013889	GGA	2	6	2302096	2302101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209347
53109	NC_013889	CAT	2	6	2302156	2302161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209347
53110	NC_013889	GCC	2	6	2302188	2302193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209347
53111	NC_013889	GCG	2	6	2302197	2302202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209347
53112	NC_013889	C	7	7	2302379	2302385	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53113	NC_013889	GCC	2	6	2302447	2302452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53114	NC_013889	AAC	2	6	2302476	2302481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289209348
53115	NC_013889	CTG	2	6	2302502	2302507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209348
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53117	NC_013889	GAA	2	6	2302760	2302765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289209348
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53234	NC_013889	GC	3	6	2308086	2308091	0 %	0 %	50 %	50 %	289209351
53235	NC_013889	TGA	2	6	2308192	2308197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209351
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53262	NC_013889	CTG	2	6	2309506	2309511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209353
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53280	NC_013889	ATT	2	6	2310743	2310748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53304	NC_013889	GCA	2	6	2311761	2311766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209355
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53307	NC_013889	CCAACG	2	12	2311880	2311891	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289209355
53308	NC_013889	GT	3	6	2311961	2311966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53309	NC_013889	CGG	2	6	2312018	2312023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53325	NC_013889	GCT	2	6	2312698	2312703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209356
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53331	NC_013889	GATCGC	2	12	2312903	2312914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289209356
53332	NC_013889	GCGG	2	8	2312915	2312922	0 %	0 %	75 %	25 %	289209356
53333	NC_013889	GAAT	2	8	2313033	2313040	50 %	25 %	25 %	0 %	289209356
53334	NC_013889	CCT	2	6	2313064	2313069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209356
53335	NC_013889	CG	3	6	2313074	2313079	0 %	0 %	50 %	50 %	289209356
53336	NC_013889	CTT	2	6	2313122	2313127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209356
53337	NC_013889	CG	3	6	2313133	2313138	0 %	0 %	50 %	50 %	289209356
53338	NC_013889	GAG	2	6	2313144	2313149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209356
53339	NC_013889	CCGATG	2	12	2313150	2313161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289209356
53340	NC_013889	ATCTCG	2	12	2313162	2313173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289209356
53341	NC_013889	TCG	2	6	2313177	2313182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209356
53342	NC_013889	CGA	2	6	2313193	2313198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209356
53343	NC_013889	CTT	2	6	2313254	2313259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209356
53344	NC_013889	CAT	2	6	2313263	2313268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209356
53345	NC_013889	TCGT	2	8	2313283	2313290	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53346	NC_013889	GCC	2	6	2313304	2313309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209357
53347	NC_013889	CTT	2	6	2313321	2313326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209357
53348	NC_013889	CG	3	6	2313412	2313417	0 %	0 %	50 %	50 %	289209357
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53469	NC_013889	CCG	2	6	2318464	2318469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209361
53470	NC_013889	TGCC	2	8	2318501	2318508	0 %	25 %	25 %	50 %	289209361
53471	NC_013889	CGG	2	6	2318522	2318527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209362
53472	NC_013889	GCC	2	6	2318615	2318620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209362
53473	NC_013889	GCA	2	6	2318656	2318661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209362
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53477	NC_013889	CCCG	2	8	2318748	2318755	0 %	0 %	25 %	75 %	289209362
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53499	NC_013889	CAG	2	6	2319596	2319601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209362
53500	NC_013889	GCC	3	9	2319609	2319617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209362

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