MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 63319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52502	NC_013889	CCTTAC	2	12	2274992	2275003	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	289209322
52503	NC_013889	CTT	2	6	2275023	2275028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209322
52504	NC_013889	CG	3	6	2275095	2275100	0 %	0 %	50 %	50 %	289209322
52505	NC_013889	CG	3	6	2275102	2275107	0 %	0 %	50 %	50 %	289209322
52506	NC_013889	GCA	2	6	2275247	2275252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209322
52507	NC_013889	GGC	3	9	2275278	2275286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209323
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52509	NC_013889	GGT	2	6	2275362	2275367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209323
52510	NC_013889	GC	3	6	2275446	2275451	0 %	0 %	50 %	50 %	289209323
52511	NC_013889	GGC	2	6	2275469	2275474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209323
52512	NC_013889	GC	3	6	2275528	2275533	0 %	0 %	50 %	50 %	289209323
52513	NC_013889	ATG	2	6	2275552	2275557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209323
52514	NC_013889	GCT	2	6	2275568	2275573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209323
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52521	NC_013889	GCAT	2	8	2276028	2276035	25 %	25 %	25 %	25 %	289209324
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52525	NC_013889	CG	3	6	2276256	2276261	0 %	0 %	50 %	50 %	289209324
52526	NC_013889	TCGT	2	8	2276287	2276294	0 %	50 %	25 %	25 %	289209324
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52548	NC_013889	GCCC	2	8	2277232	2277239	0 %	0 %	25 %	75 %	289209326
52549	NC_013889	C	6	6	2277237	2277242	0 %	0 %	0 %	100 %	289209326
52550	NC_013889	CGT	2	6	2277251	2277256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209326
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52553	NC_013889	GAC	3	9	2277361	2277369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209326
52554	NC_013889	CTT	2	6	2277466	2277471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209327
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52566	NC_013889	CGC	2	6	2277729	2277734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209328
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52569	NC_013889	GTCAT	2	10	2277835	2277844	20 %	40 %	20 %	20 %	289209328
52570	NC_013889	CCA	2	6	2277941	2277946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209328
52571	NC_013889	GC	3	6	2278041	2278046	0 %	0 %	50 %	50 %	289209328
52572	NC_013889	CAC	2	6	2278136	2278141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209328
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52580	NC_013889	TGCG	2	8	2278557	2278564	0 %	25 %	50 %	25 %	289209329
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52582	NC_013889	GACCT	2	10	2278628	2278637	20 %	20 %	20 %	40 %	289209329
52583	NC_013889	GCC	2	6	2278740	2278745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209329
52584	NC_013889	TGCG	2	8	2278786	2278793	0 %	25 %	50 %	25 %	289209329
52585	NC_013889	TTG	2	6	2278857	2278862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209329
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52587	NC_013889	CGT	2	6	2278897	2278902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209329
52588	NC_013889	CCG	2	6	2279021	2279026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52589	NC_013889	AGTT	2	8	2279064	2279071	25 %	50 %	25 %	0 %	289209330
52590	NC_013889	CGG	2	6	2279095	2279100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209330
52591	NC_013889	TCA	2	6	2279113	2279118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209330
52592	NC_013889	GTCG	2	8	2279135	2279142	0 %	25 %	50 %	25 %	289209330
52593	NC_013889	CG	3	6	2279193	2279198	0 %	0 %	50 %	50 %	289209330
52594	NC_013889	TTG	2	6	2279202	2279207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209330
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52598	NC_013889	TCAC	2	8	2279379	2279386	25 %	25 %	0 %	50 %	289209331
52599	NC_013889	AAT	2	6	2279389	2279394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289209331
52600	NC_013889	ACG	2	6	2279402	2279407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52601	NC_013889	GCC	2	6	2279425	2279430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209331
52602	NC_013889	GAC	2	6	2279610	2279615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52603	NC_013889	GCG	2	6	2279664	2279669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209331
52604	NC_013889	TCG	2	6	2279711	2279716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52605	NC_013889	GCA	2	6	2279730	2279735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209331
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52609	NC_013889	CG	3	6	2279950	2279955	0 %	0 %	50 %	50 %	289209331
52610	NC_013889	CTCCGG	2	12	2279956	2279967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289209331
52611	NC_013889	GC	3	6	2280009	2280014	0 %	0 %	50 %	50 %	289209331
52612	NC_013889	GTC	2	6	2280073	2280078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52613	NC_013889	CAG	2	6	2280100	2280105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52614	NC_013889	AGC	2	6	2280134	2280139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52615	NC_013889	GTC	2	6	2280145	2280150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52616	NC_013889	CACC	2	8	2280192	2280199	25 %	0 %	0 %	75 %	289209331
52617	NC_013889	CAG	2	6	2280208	2280213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52618	NC_013889	ACC	2	6	2280257	2280262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209331
52619	NC_013889	TTC	2	6	2280302	2280307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209331
52620	NC_013889	CG	3	6	2280396	2280401	0 %	0 %	50 %	50 %	289209331
52621	NC_013889	CTT	2	6	2280457	2280462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209331
52622	NC_013889	CGT	2	6	2280472	2280477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209331
52623	NC_013889	CGC	2	6	2280481	2280486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209331
52624	NC_013889	CTT	2	6	2280544	2280549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209331
52625	NC_013889	AGG	2	6	2280621	2280626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209332
52626	NC_013889	CAG	2	6	2280769	2280774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52627	NC_013889	ACG	2	6	2280814	2280819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52628	NC_013889	TTC	2	6	2280853	2280858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209332
52629	NC_013889	TCGACC	2	12	2280866	2280877	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289209332
52630	NC_013889	TCA	2	6	2280879	2280884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209332
52631	NC_013889	GAG	2	6	2280892	2280897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209332
52632	NC_013889	CCTT	2	8	2280920	2280927	0 %	50 %	0 %	50 %	289209332
52633	NC_013889	CCA	2	6	2281014	2281019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209332
52634	NC_013889	CTC	2	6	2281054	2281059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209332
52635	NC_013889	TTG	2	6	2281067	2281072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209332
52636	NC_013889	ACC	2	6	2281102	2281107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209332
52637	NC_013889	CTT	2	6	2281143	2281148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209332
52638	NC_013889	ACC	2	6	2281189	2281194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209332
52639	NC_013889	CTT	2	6	2281231	2281236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209332
52640	NC_013889	CCA	2	6	2281308	2281313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209332
52641	NC_013889	GAT	2	6	2281345	2281350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209332
52642	NC_013889	TCG	2	6	2281367	2281372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52643	NC_013889	T	6	6	2281428	2281433	0 %	100 %	0 %	0 %	289209332
52644	NC_013889	TAC	2	6	2281533	2281538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209332
52645	NC_013889	CGA	2	6	2281560	2281565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52646	NC_013889	CG	3	6	2281582	2281587	0 %	0 %	50 %	50 %	289209332
52647	NC_013889	CGG	2	6	2281649	2281654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209332
52648	NC_013889	AC	3	6	2281704	2281709	50 %	0 %	0 %	50 %	289209332
52649	NC_013889	GGTC	2	8	2281737	2281744	0 %	25 %	50 %	25 %	289209332
52650	NC_013889	TCG	2	6	2281775	2281780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52651	NC_013889	ACC	2	6	2281868	2281873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209332
52652	NC_013889	CGG	3	9	2282034	2282042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209332
52653	NC_013889	TCG	2	6	2282087	2282092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52654	NC_013889	TCG	2	6	2282129	2282134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52655	NC_013889	AGA	2	6	2282139	2282144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289209332
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52657	NC_013889	CCAC	2	8	2282363	2282370	25 %	0 %	0 %	75 %	289209332
52658	NC_013889	CACCG	2	10	2282386	2282395	20 %	0 %	20 %	60 %	289209332
52659	NC_013889	GAT	2	6	2282455	2282460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209332
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52661	NC_013889	CGC	2	6	2282515	2282520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209332
52662	NC_013889	GGTGAT	2	12	2282524	2282535	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289209332
52663	NC_013889	GTTCCT	2	12	2282541	2282552	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289209332
52664	NC_013889	TCCA	2	8	2282555	2282562	25 %	25 %	0 %	50 %	289209332
52665	NC_013889	GGC	2	6	2282572	2282577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209332
52666	NC_013889	GTC	4	12	2282636	2282647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209332
52667	NC_013889	GC	3	6	2282664	2282669	0 %	0 %	50 %	50 %	289209332
52668	NC_013889	CT	3	6	2282723	2282728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52669	NC_013889	CTT	2	6	2282798	2282803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209333
52670	NC_013889	CGG	2	6	2282806	2282811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209333
52671	NC_013889	CGG	2	6	2282824	2282829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209333
52672	NC_013889	CGCC	2	8	2282842	2282849	0 %	0 %	25 %	75 %	289209333
52673	NC_013889	GCC	2	6	2282963	2282968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209333
52674	NC_013889	ACG	2	6	2282972	2282977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209333
52675	NC_013889	TGT	2	6	2283004	2283009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209333
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52677	NC_013889	GC	3	6	2283067	2283072	0 %	0 %	50 %	50 %	289209333
52678	NC_013889	CGAC	2	8	2283091	2283098	25 %	0 %	25 %	50 %	289209333
52679	NC_013889	TGA	2	6	2283124	2283129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209333
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52685	NC_013889	ACGC	2	8	2283442	2283449	25 %	0 %	25 %	50 %	289209334
52686	NC_013889	GC	3	6	2283448	2283453	0 %	0 %	50 %	50 %	289209334
52687	NC_013889	CTT	2	6	2283478	2283483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289209334
52688	NC_013889	GCG	2	6	2283525	2283530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209334
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52690	NC_013889	CGC	2	6	2283686	2283691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52691	NC_013889	GAAGG	2	10	2283709	2283718	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52692	NC_013889	GGT	2	6	2283737	2283742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209335
52693	NC_013889	CCT	2	6	2283790	2283795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209335
52694	NC_013889	GCG	2	6	2283833	2283838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209335
52695	NC_013889	TCG	2	6	2283918	2283923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52696	NC_013889	AGG	2	6	2283973	2283978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289209335
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52698	NC_013889	GCT	2	6	2284051	2284056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52699	NC_013889	GTC	2	6	2284058	2284063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52700	NC_013889	GGACGC	2	12	2284087	2284098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289209335
52701	NC_013889	CAT	2	6	2284160	2284165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209335
52702	NC_013889	AGT	2	6	2284259	2284264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209335
52703	NC_013889	CGC	2	6	2284267	2284272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209335
52704	NC_013889	GCT	2	6	2284420	2284425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52705	NC_013889	CGGC	2	8	2284477	2284484	0 %	0 %	50 %	50 %	289209335
52706	NC_013889	ACC	2	6	2284529	2284534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209335
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52708	NC_013889	GGCG	2	8	2284570	2284577	0 %	0 %	75 %	25 %	289209335
52709	NC_013889	GCA	2	6	2284636	2284641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52710	NC_013889	CGT	3	9	2284687	2284695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52711	NC_013889	CAC	2	6	2284757	2284762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209335
52712	NC_013889	CGTC	2	8	2284786	2284793	0 %	25 %	25 %	50 %	289209335
52713	NC_013889	CGA	2	6	2284816	2284821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52714	NC_013889	GCC	2	6	2284841	2284846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209335
52715	NC_013889	GGGT	2	8	2284863	2284870	0 %	25 %	75 %	0 %	289209335
52716	NC_013889	CCT	2	6	2284891	2284896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289209335
52717	NC_013889	TGG	2	6	2284933	2284938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289209335
52718	NC_013889	GCGCTC	2	12	2284958	2284969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	289209335
52719	NC_013889	GTC	2	6	2284979	2284984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52720	NC_013889	TTG	2	6	2285034	2285039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289209335
52721	NC_013889	GCG	2	6	2285181	2285186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289209335
52722	NC_013889	CACC	2	8	2285191	2285198	25 %	0 %	0 %	75 %	289209335
52723	NC_013889	TCG	2	6	2285304	2285309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
52724	NC_013889	CAG	2	6	2285348	2285353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289209335
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52727	NC_013889	CCG	2	6	2285404	2285409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209335
52728	NC_013889	GAT	2	6	2285462	2285467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209335
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52730	NC_013889	CTG	2	6	2285486	2285491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289209335
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52732	NC_013889	CCA	2	6	2285536	2285541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289209335
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52734	NC_013889	CG	3	6	2285601	2285606	0 %	0 %	50 %	50 %	289209335
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52736	NC_013889	CG	3	6	2285748	2285753	0 %	0 %	50 %	50 %	289209335
52737	NC_013889	CAT	2	6	2285765	2285770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289209335
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52759	NC_013889	AGT	2	6	2286892	2286897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289209335
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52831	NC_013889	GCGG	2	8	2289879	2289886	0 %	0 %	75 %	25 %	289209336
52832	NC_013889	CCG	2	6	2289907	2289912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209336
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52839	NC_013889	CGC	2	6	2290206	2290211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209336
52840	NC_013889	CG	3	6	2290443	2290448	0 %	0 %	50 %	50 %	289209336
52841	NC_013889	GCC	2	6	2290461	2290466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289209336
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52844	NC_013889	CCAGAC	2	12	2290667	2290678	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289209336
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