MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 39895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013642	CTC	2	6	14	19	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013642	TCC	2	6	29	34	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013642	AG	3	6	43	48	50 %	0 %	50 %	0 %	281411445
4	NC_013642	GTC	2	6	140	145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411445
5	NC_013642	TCGG	2	8	149	156	0 %	25 %	50 %	25 %	281411445
6	NC_013642	GAA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411445
7	NC_013642	TAT	2	6	191	196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411445
8	NC_013642	CTC	2	6	277	282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411445
9	NC_013642	GAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411445
10	NC_013642	TCG	2	6	357	362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411445
11	NC_013642	TTCG	2	8	376	383	0 %	50 %	25 %	25 %	281411445
12	NC_013642	CAGG	2	8	417	424	25 %	0 %	50 %	25 %	281411445
13	NC_013642	CGG	2	6	445	450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411445
14	NC_013642	TCT	2	6	472	477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411445
15	NC_013642	CGT	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411445
16	NC_013642	GAAC	2	8	505	512	50 %	0 %	25 %	25 %	281411445
17	NC_013642	TTG	2	6	561	566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411445
18	NC_013642	AAG	2	6	576	581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411445
19	NC_013642	A	6	6	613	618	100 %	0 %	0 %	0 %	281411445
20	NC_013642	TTC	2	6	627	632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411445
21	NC_013642	AAGA	2	8	853	860	75 %	0 %	25 %	0 %	281411445
22	NC_013642	GAC	2	6	923	928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411445
23	NC_013642	CAT	2	6	952	957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411445
24	NC_013642	GATC	2	8	994	1001	25 %	25 %	25 %	25 %	281411445
25	NC_013642	GAAG	2	8	1003	1010	50 %	0 %	50 %	0 %	281411445
26	NC_013642	GTC	2	6	1085	1090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411445
27	NC_013642	CAG	2	6	1129	1134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411445
28	NC_013642	CGT	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411445
29	NC_013642	A	6	6	1262	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	281411445
30	NC_013642	CTC	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411445
31	NC_013642	AACA	2	8	1292	1299	75 %	0 %	0 %	25 %	281411445
32	NC_013642	CTC	2	6	1361	1366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411446
33	NC_013642	AGA	2	6	1515	1520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411446
34	NC_013642	CTT	2	6	1541	1546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411446
35	NC_013642	ACG	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411446
36	NC_013642	TTCC	2	8	1582	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	281411446
37	NC_013642	AC	3	6	1627	1632	50 %	0 %	0 %	50 %	281411446
38	NC_013642	T	6	6	1680	1685	0 %	100 %	0 %	0 %	281411446
39	NC_013642	T	6	6	1713	1718	0 %	100 %	0 %	0 %	281411446
40	NC_013642	CTTT	2	8	1733	1740	0 %	75 %	0 %	25 %	281411446
41	NC_013642	CCAT	2	8	1869	1876	25 %	25 %	0 %	50 %	281411446
42	NC_013642	AG	3	6	1889	1894	50 %	0 %	50 %	0 %	281411446
43	NC_013642	TTC	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411446
44	NC_013642	CATGGA	2	12	1950	1961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	281411446
45	NC_013642	TGT	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411446
46	NC_013642	AAC	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411446
47	NC_013642	CTT	2	6	2136	2141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411446
48	NC_013642	ACC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411446
49	NC_013642	T	6	6	2311	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	281411447
50	NC_013642	CTT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411447
51	NC_013642	TGA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411447
52	NC_013642	ATG	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411447
53	NC_013642	GATC	2	8	2454	2461	25 %	25 %	25 %	25 %	281411447
54	NC_013642	GAA	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411447
55	NC_013642	T	6	6	2518	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	281411447
56	NC_013642	GATC	2	8	2559	2566	25 %	25 %	25 %	25 %	281411447
57	NC_013642	AG	3	6	2614	2619	50 %	0 %	50 %	0 %	281411447
58	NC_013642	ACA	2	6	2729	2734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411447
59	NC_013642	TC	4	8	2741	2748	0 %	50 %	0 %	50 %	281411447
60	NC_013642	TC	3	6	2752	2757	0 %	50 %	0 %	50 %	281411447
61	NC_013642	AGA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411447
62	NC_013642	CTGA	2	8	2887	2894	25 %	25 %	25 %	25 %	281411447
63	NC_013642	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411447
64	NC_013642	ACG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411447
65	NC_013642	CTT	2	6	3103	3108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411447
66	NC_013642	CGT	2	6	3152	3157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411448
67	NC_013642	GAA	2	6	3177	3182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411448
68	NC_013642	CTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411448
69	NC_013642	GTA	3	9	3231	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411448
70	NC_013642	TCT	2	6	3286	3291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411448
71	NC_013642	CT	3	6	3388	3393	0 %	50 %	0 %	50 %	281411448
72	NC_013642	ACA	2	6	3421	3426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411448
73	NC_013642	AGA	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411448
74	NC_013642	GGGA	2	8	3704	3711	25 %	0 %	75 %	0 %	281411448
75	NC_013642	TTG	2	6	3731	3736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411448
76	NC_013642	AAG	2	6	3741	3746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411448
77	NC_013642	AAG	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411448
78	NC_013642	CT	3	6	3872	3877	0 %	50 %	0 %	50 %	281411448
79	NC_013642	CTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411448
80	NC_013642	TTTC	2	8	4016	4023	0 %	75 %	0 %	25 %	281411448
81	NC_013642	AG	5	10	4181	4190	50 %	0 %	50 %	0 %	281411448
82	NC_013642	TGA	2	6	4223	4228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411448
83	NC_013642	T	6	6	4241	4246	0 %	100 %	0 %	0 %	281411448
84	NC_013642	CCT	2	6	4268	4273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411449
85	NC_013642	TCC	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411449
86	NC_013642	CCA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411449
87	NC_013642	TGG	3	9	4510	4518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411449
88	NC_013642	CTC	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411449
89	NC_013642	T	7	7	4600	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	281411449
90	NC_013642	TC	3	6	4658	4663	0 %	50 %	0 %	50 %	281411449
91	NC_013642	GGCATC	2	12	4694	4705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	281411449
92	NC_013642	GAA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411449
93	NC_013642	AG	3	6	4976	4981	50 %	0 %	50 %	0 %	281411449
94	NC_013642	TAT	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411449
95	NC_013642	GAAC	2	8	5076	5083	50 %	0 %	25 %	25 %	281411449
96	NC_013642	ATCGA	2	10	5112	5121	40 %	20 %	20 %	20 %	281411449
97	NC_013642	AAC	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411449
98	NC_013642	TAT	2	6	5330	5335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411449
99	NC_013642	ACC	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411449
100	NC_013642	TCC	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411449
101	NC_013642	T	7	7	5491	5497	0 %	100 %	0 %	0 %	281411449
102	NC_013642	AAGA	2	8	5504	5511	75 %	0 %	25 %	0 %	281411449
103	NC_013642	GAG	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411449
104	NC_013642	TCC	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411449
105	NC_013642	GTT	2	6	5573	5578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411449
106	NC_013642	TCC	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411449
107	NC_013642	TCC	3	9	5628	5636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411449
108	NC_013642	AAC	2	6	5645	5650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411449
109	NC_013642	T	6	6	5805	5810	0 %	100 %	0 %	0 %	281411450
110	NC_013642	CTTC	2	8	5839	5846	0 %	50 %	0 %	50 %	281411450
111	NC_013642	AGC	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411450
112	NC_013642	ATG	2	6	5878	5883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411450
113	NC_013642	CTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411450
114	NC_013642	GAA	2	6	6046	6051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411450
115	NC_013642	ATC	2	6	6114	6119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411450
116	NC_013642	TAA	2	6	6142	6147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411450
117	NC_013642	A	6	6	6208	6213	100 %	0 %	0 %	0 %	281411450
118	NC_013642	CTC	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411450
119	NC_013642	TCT	2	6	6253	6258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411451
120	NC_013642	TTC	2	6	6329	6334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411451
121	NC_013642	GCC	2	6	6392	6397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411451
122	NC_013642	TCT	2	6	6435	6440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411451
123	NC_013642	GTA	2	6	6463	6468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411451
124	NC_013642	TGT	2	6	6506	6511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411451
125	NC_013642	AGG	2	6	6577	6582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411451
126	NC_013642	T	6	6	6594	6599	0 %	100 %	0 %	0 %	281411451
127	NC_013642	TAT	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411451
128	NC_013642	GGC	2	6	6681	6686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411451
129	NC_013642	GGT	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411451
130	NC_013642	TCTTTC	2	12	6960	6971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411451
131	NC_013642	TCC	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411451
132	NC_013642	TC	3	6	7055	7060	0 %	50 %	0 %	50 %	281411451
133	NC_013642	TCG	2	6	7134	7139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411451
134	NC_013642	ATC	2	6	7154	7159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411451
135	NC_013642	GA	3	6	7160	7165	50 %	0 %	50 %	0 %	281411451
136	NC_013642	GAA	2	6	7179	7184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411451
137	NC_013642	TAC	2	6	7196	7201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411451
138	NC_013642	TAT	2	6	7226	7231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281411451
139	NC_013642	A	6	6	7262	7267	100 %	0 %	0 %	0 %	281411451
140	NC_013642	GAA	2	6	7342	7347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013642	TTC	2	6	7482	7487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013642	CG	3	6	7488	7493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013642	ATCA	2	8	7530	7537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013642	CTT	2	6	7642	7647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013642	CAT	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013642	GA	3	6	7801	7806	50 %	0 %	50 %	0 %	281411452
147	NC_013642	TCT	2	6	7830	7835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
148	NC_013642	GA	3	6	7838	7843	50 %	0 %	50 %	0 %	281411452
149	NC_013642	TCT	2	6	7914	7919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
150	NC_013642	TCT	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
151	NC_013642	TC	3	6	7996	8001	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
152	NC_013642	CTT	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
153	NC_013642	TCT	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
154	NC_013642	CT	3	6	8142	8147	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
155	NC_013642	GCT	2	6	8211	8216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411452
156	NC_013642	TCTGC	2	10	8248	8257	0 %	40 %	20 %	40 %	281411452
157	NC_013642	TC	3	6	8281	8286	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
158	NC_013642	TC	3	6	8313	8318	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
159	NC_013642	CTG	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411452
160	NC_013642	GTTT	2	8	8353	8360	0 %	75 %	25 %	0 %	281411452
161	NC_013642	CTC	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411452
162	NC_013642	CT	4	8	8383	8390	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
163	NC_013642	CTT	2	6	8479	8484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
164	NC_013642	TGT	2	6	8521	8526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411452
165	NC_013642	TCT	2	6	8542	8547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
166	NC_013642	CTT	2	6	8551	8556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
167	NC_013642	CT	3	6	8583	8588	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
168	NC_013642	GA	3	6	8592	8597	50 %	0 %	50 %	0 %	281411452
169	NC_013642	CT	3	6	8627	8632	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
170	NC_013642	ATG	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411452
171	NC_013642	ATC	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411452
172	NC_013642	CTT	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
173	NC_013642	CT	3	6	8691	8696	0 %	50 %	0 %	50 %	281411452
174	NC_013642	CTG	2	6	8780	8785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411452
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179	NC_013642	AAG	2	6	8897	8902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411452
180	NC_013642	TCT	2	6	8971	8976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411452
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182	NC_013642	CTTT	2	8	9013	9020	0 %	75 %	0 %	25 %	281411452
183	NC_013642	GCC	2	6	9044	9049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281411452
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220	NC_013642	C	6	6	10905	10910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
221	NC_013642	T	7	7	10941	10947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_013642	AGG	2	6	11010	11015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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226	NC_013642	A	7	7	11147	11153	100 %	0 %	0 %	0 %	281411454
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241	NC_013642	CTA	2	6	11838	11843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411454
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259	NC_013642	T	6	6	12573	12578	0 %	100 %	0 %	0 %	281411455
260	NC_013642	GAA	2	6	12597	12602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411456
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262	NC_013642	CGAT	2	8	12701	12708	25 %	25 %	25 %	25 %	281411456
263	NC_013642	CTT	2	6	12771	12776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411456
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265	NC_013642	TTC	2	6	12838	12843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411456
266	NC_013642	CCA	2	6	12860	12865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411456
267	NC_013642	CT	3	6	12899	12904	0 %	50 %	0 %	50 %	281411456
268	NC_013642	GA	3	6	12957	12962	50 %	0 %	50 %	0 %	281411456
269	NC_013642	GTTC	2	8	12971	12978	0 %	50 %	25 %	25 %	281411456
270	NC_013642	GAA	2	6	13002	13007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411456
271	NC_013642	GGA	2	6	13121	13126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411456
272	NC_013642	TTC	2	6	13150	13155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411456
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381	NC_013642	ACT	2	6	17960	17965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411462
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398	NC_013642	TCTA	2	8	18767	18774	25 %	50 %	0 %	25 %	281411462
399	NC_013642	GAG	2	6	18865	18870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411462
400	NC_013642	CCT	2	6	18872	18877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411462
401	NC_013642	GAAGT	2	10	18997	19006	40 %	20 %	40 %	0 %	281411462
402	NC_013642	CTC	2	6	19035	19040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411462
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