MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga naphthophila RKU-10

Total Repeats: 39895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013642	GAA	2	6	69124	69129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411519
1502	NC_013642	TCC	2	6	69149	69154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411519
1503	NC_013642	TCT	2	6	69285	69290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411519
1504	NC_013642	GGA	2	6	69312	69317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411519
1505	NC_013642	GAA	2	6	69334	69339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411519
1506	NC_013642	A	6	6	69414	69419	100 %	0 %	0 %	0 %	281411519
1507	NC_013642	T	6	6	69437	69442	0 %	100 %	0 %	0 %	281411519
1508	NC_013642	GT	3	6	69479	69484	0 %	50 %	50 %	0 %	281411519
1509	NC_013642	CTT	2	6	69486	69491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411519
1510	NC_013642	AGG	2	6	69580	69585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411519
1511	NC_013642	CA	3	6	69619	69624	50 %	0 %	0 %	50 %	281411520
1512	NC_013642	GAA	2	6	69632	69637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411520
1513	NC_013642	GAAA	2	8	69640	69647	75 %	0 %	25 %	0 %	281411520
1514	NC_013642	A	6	6	69723	69728	100 %	0 %	0 %	0 %	281411520
1515	NC_013642	GAAT	2	8	69748	69755	50 %	25 %	25 %	0 %	281411520
1516	NC_013642	GAT	2	6	69785	69790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411520
1517	NC_013642	A	6	6	69857	69862	100 %	0 %	0 %	0 %	281411520
1518	NC_013642	GA	3	6	69909	69914	50 %	0 %	50 %	0 %	281411520
1519	NC_013642	AGA	2	6	69958	69963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411520
1520	NC_013642	GAA	2	6	69968	69973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411520
1521	NC_013642	GTA	2	6	69989	69994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411520
1522	NC_013642	GAAG	2	8	70066	70073	50 %	0 %	50 %	0 %	281411520
1523	NC_013642	A	7	7	70128	70134	100 %	0 %	0 %	0 %	281411521
1524	NC_013642	ACT	2	6	70137	70142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411521
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1527	NC_013642	AGG	2	6	70278	70283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411521
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1529	NC_013642	TGG	2	6	70375	70380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411521
1530	NC_013642	CTT	2	6	70381	70386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411521
1531	NC_013642	GAT	2	6	70388	70393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411521
1532	NC_013642	AT	3	6	70392	70397	50 %	50 %	0 %	0 %	281411521
1533	NC_013642	AG	3	6	70400	70405	50 %	0 %	50 %	0 %	281411521
1534	NC_013642	GAA	2	6	70466	70471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411521
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1536	NC_013642	CT	3	6	70524	70529	0 %	50 %	0 %	50 %	281411521
1537	NC_013642	CGGAG	2	10	70543	70552	20 %	0 %	60 %	20 %	281411521
1538	NC_013642	TGG	2	6	70645	70650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411521
1539	NC_013642	AGA	2	6	70666	70671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411521
1540	NC_013642	GA	3	6	70703	70708	50 %	0 %	50 %	0 %	281411521
1541	NC_013642	GA	3	6	70715	70720	50 %	0 %	50 %	0 %	281411521
1542	NC_013642	GGC	2	6	70724	70729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411521
1543	NC_013642	GTG	2	6	70764	70769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411521
1544	NC_013642	CGG	2	6	70876	70881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281411521
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1546	NC_013642	AAC	2	6	70996	71001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281411521
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1550	NC_013642	AG	3	6	71168	71173	50 %	0 %	50 %	0 %	281411521
1551	NC_013642	GAAA	2	8	71174	71181	75 %	0 %	25 %	0 %	281411521
1552	NC_013642	GAA	2	6	71189	71194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411521
1553	NC_013642	A	6	6	71201	71206	100 %	0 %	0 %	0 %	281411521
1554	NC_013642	CATC	2	8	71317	71324	25 %	25 %	0 %	50 %	281411522
1555	NC_013642	TTC	2	6	71344	71349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1556	NC_013642	CTT	2	6	71352	71357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1557	NC_013642	GGA	2	6	71414	71419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281411522
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1559	NC_013642	CTT	2	6	71490	71495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1560	NC_013642	TCC	2	6	71560	71565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411522
1561	NC_013642	TTC	2	6	71577	71582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1562	NC_013642	TTC	2	6	71614	71619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1563	NC_013642	CT	3	6	71631	71636	0 %	50 %	0 %	50 %	281411522
1564	NC_013642	AGA	2	6	71654	71659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411522
1565	NC_013642	CTT	2	6	71715	71720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1566	NC_013642	TCT	2	6	71728	71733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1567	NC_013642	CAG	2	6	71797	71802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411522
1568	NC_013642	CGTT	2	8	71817	71824	0 %	50 %	25 %	25 %	281411522
1569	NC_013642	CAC	2	6	71830	71835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411522
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1571	NC_013642	TTC	2	6	71927	71932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1572	NC_013642	TTCTT	2	10	71940	71949	0 %	80 %	0 %	20 %	281411522
1573	NC_013642	GATC	2	8	71994	72001	25 %	25 %	25 %	25 %	281411522
1574	NC_013642	TCT	2	6	72050	72055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1575	NC_013642	TCGAAA	2	12	72068	72079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	281411522
1576	NC_013642	TCC	2	6	72109	72114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411522
1577	NC_013642	CTT	2	6	72219	72224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1578	NC_013642	CTT	2	6	72230	72235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411522
1579	NC_013642	CG	3	6	72246	72251	0 %	0 %	50 %	50 %	281411522
1580	NC_013642	T	6	6	72265	72270	0 %	100 %	0 %	0 %	281411522
1581	NC_013642	GCT	2	6	72290	72295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411522
1582	NC_013642	GTC	2	6	72336	72341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281411523
1583	NC_013642	ATG	2	6	72364	72369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411523
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1585	NC_013642	TTTC	2	8	72389	72396	0 %	75 %	0 %	25 %	281411523
1586	NC_013642	TTC	2	6	72425	72430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411523
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1589	NC_013642	CAC	2	6	72588	72593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411523
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1591	NC_013642	TCT	2	6	72635	72640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411523
1592	NC_013642	AG	4	8	72666	72673	50 %	0 %	50 %	0 %	281411523
1593	NC_013642	TTC	2	6	72723	72728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411523
1594	NC_013642	TCT	2	6	72734	72739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411523
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1597	NC_013642	GAT	2	6	72876	72881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411523
1598	NC_013642	GTCT	2	8	72924	72931	0 %	50 %	25 %	25 %	281411523
1599	NC_013642	ATCC	2	8	72938	72945	25 %	25 %	0 %	50 %	281411523
1600	NC_013642	CAG	2	6	72995	73000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281411523
1601	NC_013642	ACT	2	6	73138	73143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411523
1602	NC_013642	TTC	2	6	73145	73150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411523
1603	NC_013642	CAC	2	6	73227	73232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411523
1604	NC_013642	AGA	2	6	73256	73261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411524
1605	NC_013642	ATC	2	6	73318	73323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281411524
1606	NC_013642	CAC	2	6	73353	73358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411524
1607	NC_013642	CGCTAT	2	12	73387	73398	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281411524
1608	NC_013642	AAG	2	6	73473	73478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411524
1609	NC_013642	CCA	2	6	73611	73616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281411524
1610	NC_013642	C	7	7	73627	73633	0 %	0 %	0 %	100 %	281411525
1611	NC_013642	CTT	2	6	73711	73716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411525
1612	NC_013642	TCTT	2	8	73861	73868	0 %	75 %	0 %	25 %	281411525
1613	NC_013642	TTC	2	6	73919	73924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411525
1614	NC_013642	GAT	2	6	73925	73930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411525
1615	NC_013642	TCC	2	6	73958	73963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411525
1616	NC_013642	TC	3	6	74058	74063	0 %	50 %	0 %	50 %	281411525
1617	NC_013642	CTT	2	6	74092	74097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411525
1618	NC_013642	TGT	2	6	74155	74160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281411525
1619	NC_013642	TTTC	2	8	74278	74285	0 %	75 %	0 %	25 %	281411525
1620	NC_013642	GC	3	6	74310	74315	0 %	0 %	50 %	50 %	281411525
1621	NC_013642	TGA	2	6	74317	74322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411525
1622	NC_013642	TCT	3	9	74328	74336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411525
1623	NC_013642	TCC	2	6	74385	74390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281411525
1624	NC_013642	T	6	6	74418	74423	0 %	100 %	0 %	0 %	281411525
1625	NC_013642	ATG	2	6	74439	74444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411525
1626	NC_013642	TGG	2	6	74590	74595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411525
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1628	NC_013642	AG	3	6	74602	74607	50 %	0 %	50 %	0 %	281411525
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1758	NC_013642	CTT	2	6	80566	80571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411532
1759	NC_013642	GAT	2	6	80578	80583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411532
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1761	NC_013642	TGA	2	6	80679	80684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281411532
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1785	NC_013642	AAT	2	6	82151	82156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281411533
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1994	NC_013642	ATCT	2	8	92559	92566	25 %	50 %	0 %	25 %	281411544
1995	NC_013642	T	6	6	92595	92600	0 %	100 %	0 %	0 %	281411544
1996	NC_013642	TAA	2	6	92689	92694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_013642	GAA	2	6	92845	92850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411545
1998	NC_013642	GGT	2	6	92908	92913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281411545
1999	NC_013642	CTT	2	6	92920	92925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281411545
2000	NC_013642	AAG	2	6	92960	92965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281411545

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