MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 25789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_013526	CTG	2	6	665525	665530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839526
16003	NC_013526	GCC	2	6	665531	665536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839526
16004	NC_013526	CTG	3	9	665552	665560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839526
16005	NC_013526	GCC	2	6	665614	665619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839526
16006	NC_013526	CGG	2	6	665682	665687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839526
16007	NC_013526	CTT	2	6	665704	665709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839526
16008	NC_013526	TGG	2	6	665751	665756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839526
16009	NC_013526	CTC	3	9	665767	665775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839526
16010	NC_013526	TGG	2	6	665778	665783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839526
16011	NC_013526	CCGG	2	8	665811	665818	0 %	0 %	50 %	50 %	269839526
16012	NC_013526	CTG	2	6	665831	665836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839526
16013	NC_013526	CCA	2	6	665844	665849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839526
16014	NC_013526	TGA	2	6	665850	665855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839526
16015	NC_013526	CAT	2	6	665872	665877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839526
16016	NC_013526	TCC	2	6	665970	665975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839526
16017	NC_013526	TTC	2	6	665984	665989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839526
16018	NC_013526	CAG	2	6	665998	666003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839526
16019	NC_013526	GCG	2	6	666017	666022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839526
16020	NC_013526	CTG	2	6	666065	666070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839526
16021	NC_013526	TCGT	2	8	666110	666117	0 %	50 %	25 %	25 %	269839526
16022	NC_013526	GCC	2	6	666206	666211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839526
16023	NC_013526	TCC	2	6	666261	666266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839526
16024	NC_013526	CTT	2	6	666283	666288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839526
16025	NC_013526	AGG	2	6	666342	666347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839526
16026	NC_013526	AGG	2	6	666401	666406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839527
16027	NC_013526	CAG	2	6	666442	666447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16028	NC_013526	CCTCC	2	10	666458	666467	0 %	20 %	0 %	80 %	269839527
16029	NC_013526	GC	3	6	666488	666493	0 %	0 %	50 %	50 %	269839527
16030	NC_013526	CAC	2	6	666526	666531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839527
16031	NC_013526	GCA	2	6	666573	666578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16032	NC_013526	GTC	2	6	666592	666597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16033	NC_013526	CCA	2	6	666666	666671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839527
16034	NC_013526	CTG	2	6	666722	666727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16035	NC_013526	CCACCG	2	12	666732	666743	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	269839527
16036	NC_013526	GCA	2	6	666798	666803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16037	NC_013526	CAGG	2	8	666840	666847	25 %	0 %	50 %	25 %	269839527
16038	NC_013526	CAG	2	6	666880	666885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16039	NC_013526	CCT	2	6	666886	666891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839527
16040	NC_013526	CAG	2	6	666919	666924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16041	NC_013526	CAC	2	6	666943	666948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839527
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16043	NC_013526	ACC	2	6	667092	667097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839527
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16045	NC_013526	C	6	6	667174	667179	0 %	0 %	0 %	100 %	269839527
16046	NC_013526	CCCCCA	2	12	667185	667196	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	269839527
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16048	NC_013526	GCA	2	6	667221	667226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16049	NC_013526	TACCAG	2	12	667241	667252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269839527
16050	NC_013526	CTGGG	2	10	667352	667361	0 %	20 %	60 %	20 %	269839527
16051	NC_013526	GCA	3	9	667392	667400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16052	NC_013526	CGT	2	6	667431	667436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839527
16053	NC_013526	GC	3	6	667440	667445	0 %	0 %	50 %	50 %	269839527
16054	NC_013526	CTC	2	6	667492	667497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16055	NC_013526	CGC	2	6	667622	667627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839528
16056	NC_013526	GC	3	6	667648	667653	0 %	0 %	50 %	50 %	269839528
16057	NC_013526	CTC	2	6	667725	667730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839528
16058	NC_013526	CACG	2	8	667775	667782	25 %	0 %	25 %	50 %	269839528
16059	NC_013526	CCTCC	2	10	667881	667890	0 %	20 %	0 %	80 %	269839528
16060	NC_013526	CCT	2	6	667967	667972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839528
16061	NC_013526	AG	3	6	667997	668002	50 %	0 %	50 %	0 %	269839528
16062	NC_013526	CGG	2	6	668012	668017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839528
16063	NC_013526	GCA	2	6	668022	668027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839528
16064	NC_013526	CGT	2	6	668060	668065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839528
16065	NC_013526	CGGG	2	8	668073	668080	0 %	0 %	75 %	25 %	269839528
16066	NC_013526	C	7	7	668088	668094	0 %	0 %	0 %	100 %	269839528
16067	NC_013526	CGA	2	6	668105	668110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839528
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16071	NC_013526	CAG	2	6	668202	668207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839528
16072	NC_013526	CAG	2	6	668217	668222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839528
16073	NC_013526	GTA	2	6	668253	668258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839528
16074	NC_013526	TGCC	2	8	668272	668279	0 %	25 %	25 %	50 %	269839528
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16079	NC_013526	TCG	2	6	668650	668655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839528
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16084	NC_013526	GTC	2	6	668821	668826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839528
16085	NC_013526	CCCT	2	8	668878	668885	0 %	25 %	0 %	75 %	269839528
16086	NC_013526	CAG	2	6	668898	668903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839528
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16088	NC_013526	CGG	2	6	668934	668939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839528
16089	NC_013526	CCGG	2	8	668953	668960	0 %	0 %	50 %	50 %	269839528
16090	NC_013526	AGC	2	6	668965	668970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839528
16091	NC_013526	TCCC	2	8	669022	669029	0 %	25 %	0 %	75 %	269839528
16092	NC_013526	ATG	2	6	669034	669039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839528
16093	NC_013526	TGCC	2	8	669064	669071	0 %	25 %	25 %	50 %	269839528
16094	NC_013526	GCGGG	2	10	669108	669117	0 %	0 %	80 %	20 %	269839528
16095	NC_013526	GC	3	6	669121	669126	0 %	0 %	50 %	50 %	269839528
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16101	NC_013526	GCT	2	6	669394	669399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839529
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16103	NC_013526	GCTGAC	2	12	669418	669429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269839529
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16106	NC_013526	AGGG	2	8	669596	669603	25 %	0 %	75 %	0 %	269839529
16107	NC_013526	ATC	2	6	669611	669616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839529
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16110	NC_013526	CAA	2	6	669703	669708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839529
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16115	NC_013526	GGA	2	6	669889	669894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839529
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16117	NC_013526	GAG	2	6	669926	669931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839529
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16119	NC_013526	TGC	2	6	669947	669952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839529
16120	NC_013526	GGC	2	6	669955	669960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839529
16121	NC_013526	ACG	2	6	669969	669974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839529
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16124	NC_013526	CG	3	6	670014	670019	0 %	0 %	50 %	50 %	269839529
16125	NC_013526	GCT	2	6	670048	670053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839529
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16130	NC_013526	GC	3	6	670254	670259	0 %	0 %	50 %	50 %	269839530
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16143	NC_013526	TGC	2	6	670672	670677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839530
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16154	NC_013526	GCT	2	6	671096	671101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839530
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16158	NC_013526	GTCG	2	8	671176	671183	0 %	25 %	50 %	25 %	269839531
16159	NC_013526	G	7	7	671183	671189	0 %	0 %	100 %	0 %	269839531
16160	NC_013526	AGGCG	2	10	671199	671208	20 %	0 %	60 %	20 %	269839531
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16165	NC_013526	CGCC	2	8	671345	671352	0 %	0 %	25 %	75 %	269839531
16166	NC_013526	TCA	2	6	671418	671423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839531
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16170	NC_013526	GCT	2	6	671524	671529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839531
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16174	NC_013526	CTG	2	6	671660	671665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839531
16175	NC_013526	CTA	2	6	671728	671733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839531
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16180	NC_013526	CTT	2	6	671821	671826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839531
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16182	NC_013526	CTG	2	6	671924	671929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839531
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16186	NC_013526	G	6	6	672053	672058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16187	NC_013526	AGG	2	6	672123	672128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16188	NC_013526	TGG	2	6	672174	672179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839532
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16190	NC_013526	GCTC	2	8	672198	672205	0 %	25 %	25 %	50 %	269839532
16191	NC_013526	G	7	7	672215	672221	0 %	0 %	100 %	0 %	269839532
16192	NC_013526	CA	3	6	672250	672255	50 %	0 %	0 %	50 %	269839532
16193	NC_013526	CGAC	2	8	672303	672310	25 %	0 %	25 %	50 %	269839532
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16197	NC_013526	GTT	2	6	672559	672564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269839532
16198	NC_013526	TAC	2	6	672632	672637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839532
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16203	NC_013526	TCG	2	6	672840	672845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839532
16204	NC_013526	GATCT	2	10	672905	672914	20 %	40 %	20 %	20 %	269839532
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16206	NC_013526	TTC	2	6	673001	673006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839532
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16209	NC_013526	AAG	2	6	673127	673132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269839532
16210	NC_013526	GCT	2	6	673148	673153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839532
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16214	NC_013526	CAAC	2	8	673335	673342	50 %	0 %	0 %	50 %	269839532
16215	NC_013526	CAG	2	6	673346	673351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839532
16216	NC_013526	AAC	2	6	673394	673399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839532
16217	NC_013526	GGC	2	6	673417	673422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839532
16218	NC_013526	CAA	2	6	673444	673449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839532
16219	NC_013526	GCT	2	6	673450	673455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839532
16220	NC_013526	GCAA	2	8	673468	673475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16221	NC_013526	CT	3	6	673529	673534	0 %	50 %	0 %	50 %	269839533
16222	NC_013526	CTGG	2	8	673631	673638	0 %	25 %	50 %	25 %	269839533
16223	NC_013526	C	6	6	673654	673659	0 %	0 %	0 %	100 %	269839533
16224	NC_013526	CCGG	2	8	673693	673700	0 %	0 %	50 %	50 %	269839533
16225	NC_013526	GGA	2	6	673718	673723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839533
16226	NC_013526	GTG	2	6	673785	673790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839533
16227	NC_013526	CTG	2	6	673794	673799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839533
16228	NC_013526	CGC	2	6	673810	673815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839533
16229	NC_013526	CAA	2	6	673883	673888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839533
16230	NC_013526	GA	3	6	673891	673896	50 %	0 %	50 %	0 %	269839533
16231	NC_013526	GGT	2	6	673922	673927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839533
16232	NC_013526	C	6	6	673943	673948	0 %	0 %	0 %	100 %	269839533
16233	NC_013526	GC	3	6	673988	673993	0 %	0 %	50 %	50 %	269839533
16234	NC_013526	CCG	2	6	673994	673999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839533
16235	NC_013526	GGTG	2	8	674029	674036	0 %	25 %	75 %	0 %	269839533
16236	NC_013526	GCG	2	6	674116	674121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839533
16237	NC_013526	GTGG	2	8	674201	674208	0 %	25 %	75 %	0 %	269839533
16238	NC_013526	TGC	2	6	674211	674216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839533
16239	NC_013526	CCTC	2	8	674248	674255	0 %	25 %	0 %	75 %	269839533
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16482	NC_013526	TGG	2	6	683993	683998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839539
16483	NC_013526	GCTC	2	8	684060	684067	0 %	25 %	25 %	50 %	269839539
16484	NC_013526	TACT	2	8	684125	684132	25 %	50 %	0 %	25 %	269839539
16485	NC_013526	GC	3	6	684139	684144	0 %	0 %	50 %	50 %	269839539
16486	NC_013526	GAG	2	6	684217	684222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839539
16487	NC_013526	AGC	2	6	684245	684250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839539
16488	NC_013526	TGA	2	6	684361	684366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16489	NC_013526	GC	3	6	684417	684422	0 %	0 %	50 %	50 %	269839540
16490	NC_013526	ACG	2	6	684426	684431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839540
16491	NC_013526	TGC	3	9	684462	684470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839540
16492	NC_013526	CCCAG	2	10	684501	684510	20 %	0 %	20 %	60 %	269839540
16493	NC_013526	ACTGGT	2	12	684609	684620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269839540
16494	NC_013526	TGC	2	6	684636	684641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839540
16495	NC_013526	GGA	2	6	684652	684657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839540
16496	NC_013526	TGGGGG	2	12	684666	684677	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	269839540
16497	NC_013526	TGG	2	6	684679	684684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839540
16498	NC_013526	G	6	6	684683	684688	0 %	0 %	100 %	0 %	269839540
16499	NC_013526	ACCA	2	8	684710	684717	50 %	0 %	0 %	50 %	269839540
16500	NC_013526	GGT	2	6	684765	684770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839540

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