MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 25789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_013526	GCC	2	6	646137	646142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839511
15502	NC_013526	GAGG	2	8	646162	646169	25 %	0 %	75 %	0 %	269839511
15503	NC_013526	TAC	2	6	646172	646177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839511
15504	NC_013526	TCG	2	6	646194	646199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839511
15505	NC_013526	CCG	2	6	646248	646253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839511
15506	NC_013526	GTC	2	6	646260	646265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839511
15507	NC_013526	ACC	2	6	646289	646294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839511
15508	NC_013526	CCG	2	6	646326	646331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839511
15509	NC_013526	TGGG	2	8	646343	646350	0 %	25 %	75 %	0 %	269839511
15510	NC_013526	GCAC	2	8	646434	646441	25 %	0 %	25 %	50 %	269839511
15511	NC_013526	TGC	2	6	646446	646451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839511
15512	NC_013526	C	6	6	646490	646495	0 %	0 %	0 %	100 %	269839511
15513	NC_013526	GCA	2	6	646515	646520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839511
15514	NC_013526	CTG	2	6	646526	646531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839511
15515	NC_013526	GGA	2	6	646540	646545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839511
15516	NC_013526	CAC	2	6	646600	646605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839511
15517	NC_013526	TCG	2	6	646726	646731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15518	NC_013526	CCT	2	6	646733	646738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839512
15519	NC_013526	CAGC	2	8	646850	646857	25 %	0 %	25 %	50 %	269839512
15520	NC_013526	ACCC	2	8	646894	646901	25 %	0 %	0 %	75 %	269839512
15521	NC_013526	GA	3	6	646912	646917	50 %	0 %	50 %	0 %	269839512
15522	NC_013526	CCG	2	6	646940	646945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839512
15523	NC_013526	GGC	2	6	646963	646968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839512
15524	NC_013526	TGC	2	6	646993	646998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15525	NC_013526	CGG	2	6	647039	647044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839512
15526	NC_013526	AGC	3	9	647047	647055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15527	NC_013526	TGC	3	9	647095	647103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15528	NC_013526	GCT	2	6	647168	647173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15529	NC_013526	CCA	3	9	647185	647193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839512
15530	NC_013526	ATC	2	6	647196	647201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839512
15531	NC_013526	GTG	2	6	647265	647270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839512
15532	NC_013526	CGA	2	6	647311	647316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15533	NC_013526	TCG	2	6	647320	647325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15534	NC_013526	GTGCG	2	10	647358	647367	0 %	20 %	60 %	20 %	269839512
15535	NC_013526	CCACC	2	10	647430	647439	20 %	0 %	0 %	80 %	269839512
15536	NC_013526	CGAG	2	8	647445	647452	25 %	0 %	50 %	25 %	269839512
15537	NC_013526	ACC	2	6	647542	647547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269839512
15538	NC_013526	GTGGA	2	10	647568	647577	20 %	20 %	60 %	0 %	269839512
15539	NC_013526	GAG	2	6	647583	647588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839512
15540	NC_013526	GGCCA	2	10	647610	647619	20 %	0 %	40 %	40 %	269839512
15541	NC_013526	ACT	2	6	647647	647652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839512
15542	NC_013526	GAG	2	6	647655	647660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839512
15543	NC_013526	GCA	2	6	647663	647668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839512
15544	NC_013526	GGA	2	6	647687	647692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839512
15545	NC_013526	GAG	2	6	647734	647739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839512
15546	NC_013526	GCG	2	6	647742	647747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839513
15547	NC_013526	GCCT	2	8	647792	647799	0 %	25 %	25 %	50 %	269839513
15548	NC_013526	CTG	2	6	647819	647824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15549	NC_013526	GCG	2	6	647851	647856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839513
15550	NC_013526	GGAG	2	8	647857	647864	25 %	0 %	75 %	0 %	269839513
15551	NC_013526	GTG	2	6	647890	647895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839513
15552	NC_013526	GCCT	2	8	647909	647916	0 %	25 %	25 %	50 %	269839513
15553	NC_013526	GGC	2	6	647968	647973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839513
15554	NC_013526	TGG	2	6	647994	647999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839513
15555	NC_013526	TGC	2	6	648018	648023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15556	NC_013526	GCT	2	6	648142	648147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15557	NC_013526	GA	3	6	648218	648223	50 %	0 %	50 %	0 %	269839513
15558	NC_013526	GCG	2	6	648228	648233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839513
15559	NC_013526	ACG	2	6	648276	648281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15560	NC_013526	CCG	2	6	648300	648305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839513
15561	NC_013526	GCT	2	6	648316	648321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15562	NC_013526	CAGT	2	8	648386	648393	25 %	25 %	25 %	25 %	269839513
15563	NC_013526	TTG	2	6	648426	648431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269839513
15564	NC_013526	TCA	2	6	648522	648527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839513
15565	NC_013526	GCT	2	6	648544	648549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15566	NC_013526	GGCA	2	8	648559	648566	25 %	0 %	50 %	25 %	269839513
15567	NC_013526	TGG	2	6	648596	648601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839513
15568	NC_013526	TGC	2	6	648610	648615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15569	NC_013526	CGG	2	6	648625	648630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839513
15570	NC_013526	CAG	2	6	648688	648693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15571	NC_013526	CG	4	8	648763	648770	0 %	0 %	50 %	50 %	269839513
15572	NC_013526	TGA	2	6	648793	648798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839513
15573	NC_013526	GCT	2	6	648859	648864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15574	NC_013526	CGA	2	6	648879	648884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839513
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15577	NC_013526	CAG	2	6	648922	648927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839513
15578	NC_013526	TGG	2	6	648972	648977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839513
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15581	NC_013526	GGCCC	2	10	649066	649075	0 %	0 %	40 %	60 %	269839513
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15583	NC_013526	GGCT	2	8	649108	649115	0 %	25 %	50 %	25 %	269839513
15584	NC_013526	AGG	2	6	649170	649175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839513
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15588	NC_013526	GC	3	6	649378	649383	0 %	0 %	50 %	50 %	269839514
15589	NC_013526	TGG	2	6	649418	649423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839514
15590	NC_013526	CCG	2	6	649467	649472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839514
15591	NC_013526	GGT	2	6	649496	649501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839514
15592	NC_013526	GGAG	2	8	649527	649534	25 %	0 %	75 %	0 %	269839514
15593	NC_013526	AGCG	2	8	649559	649566	25 %	0 %	50 %	25 %	269839514
15594	NC_013526	GGC	2	6	649569	649574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839514
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15597	NC_013526	CGGG	2	8	649600	649607	0 %	0 %	75 %	25 %	269839514
15598	NC_013526	TGG	3	9	649616	649624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839514
15599	NC_013526	TCC	2	6	649646	649651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839514
15600	NC_013526	G	6	6	649738	649743	0 %	0 %	100 %	0 %	269839514
15601	NC_013526	AT	3	6	649877	649882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_013526	AT	3	6	649885	649890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_013526	TGAT	2	8	649895	649902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_013526	CAG	2	6	649971	649976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_013526	AG	3	6	649975	649980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_013526	TCGT	2	8	649998	650005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15607	NC_013526	AGG	2	6	650006	650011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_013526	AG	3	6	650016	650021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_013526	GCA	2	6	650025	650030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_013526	GCC	2	6	650134	650139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15611	NC_013526	AG	3	6	650140	650145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_013526	AGA	2	6	650251	650256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_013526	GCC	2	6	650331	650336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15614	NC_013526	CGGCA	2	10	650354	650363	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15615	NC_013526	GCG	2	6	650364	650369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_013526	TCGA	2	8	650394	650401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15617	NC_013526	CTAC	2	8	650408	650415	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15618	NC_013526	GGA	2	6	650630	650635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_013526	AGATC	2	10	650656	650665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15620	NC_013526	CCTTCA	2	12	650722	650733	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15621	NC_013526	TTC	2	6	650940	650945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_013526	AGC	2	6	650958	650963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15623	NC_013526	TTCA	2	8	651087	651094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15624	NC_013526	GAG	2	6	651108	651113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15625	NC_013526	ACA	2	6	651271	651276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15626	NC_013526	GAT	2	6	651293	651298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15745	NC_013526	AAC	2	6	655930	655935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839518
15746	NC_013526	GCCA	2	8	655977	655984	25 %	0 %	25 %	50 %	269839518
15747	NC_013526	ATC	2	6	656059	656064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839518
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15749	NC_013526	CGA	2	6	656174	656179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839518
15750	NC_013526	GC	3	6	656188	656193	0 %	0 %	50 %	50 %	269839518
15751	NC_013526	CCTC	2	8	656210	656217	0 %	25 %	0 %	75 %	269839518
15752	NC_013526	TCG	2	6	656249	656254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839518
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15780	NC_013526	CGTC	2	8	657071	657078	0 %	25 %	25 %	50 %	269839519
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15797	NC_013526	GGAG	2	8	657579	657586	25 %	0 %	75 %	0 %	269839519
15798	NC_013526	CCG	3	9	657611	657619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839519
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15823	NC_013526	GC	3	6	658653	658658	0 %	0 %	50 %	50 %	269839520
15824	NC_013526	CTC	2	6	658703	658708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15826	NC_013526	G	6	6	658749	658754	0 %	0 %	100 %	0 %	269839521
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15856	NC_013526	CTTGG	2	10	659877	659886	0 %	40 %	40 %	20 %	269839521
15857	NC_013526	CTG	2	6	659887	659892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839521
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15861	NC_013526	GGTGGG	2	12	660045	660056	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	269839521
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15863	NC_013526	CCT	2	6	660130	660135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269839521
15864	NC_013526	CCCA	2	8	660160	660167	25 %	0 %	0 %	75 %	269839521
15865	NC_013526	TCGCG	2	10	660178	660187	0 %	20 %	40 %	40 %	269839521
15866	NC_013526	GT	3	6	660203	660208	0 %	50 %	50 %	0 %	269839521
15867	NC_013526	CCT	2	6	660224	660229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15868	NC_013526	TCA	2	6	660305	660310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839522
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15871	NC_013526	AAC	2	6	660390	660395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269839522
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15876	NC_013526	GTC	2	6	660479	660484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839522
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15891	NC_013526	CTG	2	6	661037	661042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839522
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15895	NC_013526	GGCG	2	8	661279	661286	0 %	0 %	75 %	25 %	269839522
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15898	NC_013526	CCT	2	6	661336	661341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15899	NC_013526	TAT	2	6	661367	661372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15900	NC_013526	GCGG	2	8	661415	661422	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15901	NC_013526	GA	3	6	661516	661521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15917	NC_013526	CCGAC	2	10	661921	661930	20 %	0 %	20 %	60 %	269839523
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15937	NC_013526	GAG	2	6	663104	663109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269839524
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15971	NC_013526	TCG	2	6	664296	664301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839524
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15977	NC_013526	TCG	2	6	664621	664626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269839525
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15982	NC_013526	TTC	2	6	664755	664760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839525
15983	NC_013526	GTG	2	6	664812	664817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839525
15984	NC_013526	GCG	2	6	664818	664823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839525
15985	NC_013526	CTT	2	6	664868	664873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269839525
15986	NC_013526	GGCG	2	8	664904	664911	0 %	0 %	75 %	25 %	269839525
15987	NC_013526	CCG	2	6	664918	664923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269839525
15988	NC_013526	GTG	2	6	664959	664964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269839525
15989	NC_013526	GCGT	2	8	664987	664994	0 %	25 %	50 %	25 %	269839525
15990	NC_013526	TGGC	2	8	665004	665011	0 %	25 %	50 %	25 %	269839525
15991	NC_013526	ATC	2	6	665040	665045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839525
15992	NC_013526	CGG	2	6	665063	665068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839525
15993	NC_013526	TCA	2	6	665209	665214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839525
15994	NC_013526	CCTACG	2	12	665245	665256	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269839525
15995	NC_013526	GCG	2	6	665266	665271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839525
15996	NC_013526	CCTGTA	2	12	665300	665311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269839525
15997	NC_013526	TCA	2	6	665377	665382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269839525
15998	NC_013526	GAT	2	6	665452	665457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269839525
15999	NC_013526	GGC	2	6	665467	665472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269839526
16000	NC_013526	AGC	3	9	665484	665492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269839526

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