MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 25789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013526	ATC	2	6	39581	39586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838955
1002	NC_013526	CGG	2	6	39592	39597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838955
1003	NC_013526	ACC	3	9	39599	39607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838955
1004	NC_013526	GGT	2	6	39649	39654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838955
1005	NC_013526	C	7	7	39664	39670	0 %	0 %	0 %	100 %	269838955
1006	NC_013526	GGT	3	9	39706	39714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838955
1007	NC_013526	GGC	2	6	39719	39724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838955
1008	NC_013526	GAT	2	6	39781	39786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838955
1009	NC_013526	GAC	2	6	39841	39846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838955
1010	NC_013526	GGA	2	6	39856	39861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838955
1011	NC_013526	TGG	2	6	39882	39887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838955
1012	NC_013526	GCC	2	6	39893	39898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838955
1013	NC_013526	GGT	2	6	39901	39906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838955
1014	NC_013526	CCG	2	6	39918	39923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838955
1015	NC_013526	AGA	2	6	39924	39929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269838955
1016	NC_013526	GCC	2	6	39935	39940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838955
1017	NC_013526	GTG	2	6	39980	39985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838955
1018	NC_013526	GAG	2	6	40007	40012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838955
1019	NC_013526	ATC	2	6	40043	40048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838955
1020	NC_013526	CAG	2	6	40064	40069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1021	NC_013526	AGGG	2	8	40173	40180	25 %	0 %	75 %	0 %	269838956
1022	NC_013526	GGT	2	6	40210	40215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838956
1023	NC_013526	CG	3	6	40219	40224	0 %	0 %	50 %	50 %	269838956
1024	NC_013526	GCC	2	6	40234	40239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838956
1025	NC_013526	CAG	2	6	40244	40249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1026	NC_013526	AGT	2	6	40297	40302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838956
1027	NC_013526	CAT	2	6	40349	40354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838956
1028	NC_013526	CTC	3	9	40391	40399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
1029	NC_013526	CTG	2	6	40409	40414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1030	NC_013526	TCC	2	6	40452	40457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
1031	NC_013526	TCC	2	6	40539	40544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
1032	NC_013526	CGC	2	6	40551	40556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838956
1033	NC_013526	CCTCA	2	10	40586	40595	20 %	20 %	0 %	60 %	269838956
1034	NC_013526	CGC	2	6	40628	40633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838956
1035	NC_013526	GCA	2	6	40657	40662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1036	NC_013526	GCA	2	6	40664	40669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1037	NC_013526	GCCC	2	8	40691	40698	0 %	0 %	25 %	75 %	269838956
1038	NC_013526	GGCC	2	8	40699	40706	0 %	0 %	50 %	50 %	269838956
1039	NC_013526	GTA	2	6	40712	40717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838956
1040	NC_013526	GGCG	2	8	40730	40737	0 %	0 %	75 %	25 %	269838956
1041	NC_013526	ACC	3	9	40803	40811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838956
1042	NC_013526	CTG	2	6	40835	40840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1043	NC_013526	GCG	2	6	40862	40867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838956
1044	NC_013526	GTA	2	6	40877	40882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838956
1045	NC_013526	CGG	2	6	40927	40932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838956
1046	NC_013526	TGG	2	6	40936	40941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838956
1047	NC_013526	CCT	2	6	40976	40981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
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1049	NC_013526	CCT	2	6	40996	41001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
1050	NC_013526	AGC	2	6	41028	41033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1051	NC_013526	TGC	2	6	41061	41066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1052	NC_013526	CCA	3	9	41116	41124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838956
1053	NC_013526	GGTGGC	2	12	41174	41185	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269838956
1054	NC_013526	CGG	2	6	41201	41206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838956
1055	NC_013526	CCT	2	6	41215	41220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
1056	NC_013526	ACC	2	6	41223	41228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838956
1057	NC_013526	AGG	2	6	41245	41250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838956
1058	NC_013526	CCA	2	6	41293	41298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838956
1059	NC_013526	GTC	2	6	41318	41323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1060	NC_013526	CTC	2	6	41327	41332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
1061	NC_013526	GCC	2	6	41342	41347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838956
1062	NC_013526	GCT	2	6	41432	41437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1063	NC_013526	CCT	2	6	41461	41466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838956
1064	NC_013526	TCA	2	6	41488	41493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838956
1065	NC_013526	CAG	2	6	41498	41503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1066	NC_013526	G	6	6	41503	41508	0 %	0 %	100 %	0 %	269838956
1067	NC_013526	ACC	2	6	41511	41516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838956
1068	NC_013526	GCA	2	6	41530	41535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838956
1069	NC_013526	ACA	2	6	41608	41613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269838956
1070	NC_013526	CT	3	6	41713	41718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_013526	CAA	2	6	41745	41750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013526	TCC	2	6	41763	41768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_013526	CCCA	2	8	41811	41818	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_013526	CACC	2	8	41887	41894	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1075	NC_013526	GGA	2	6	42102	42107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838957
1076	NC_013526	GAG	2	6	42115	42120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269838957
1077	NC_013526	CCT	2	6	42165	42170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838957
1078	NC_013526	GAC	2	6	42196	42201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838957
1079	NC_013526	GCGG	2	8	42204	42211	0 %	0 %	75 %	25 %	269838957
1080	NC_013526	CTG	2	6	42241	42246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838957
1081	NC_013526	CAA	2	6	42252	42257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269838957
1082	NC_013526	TGG	2	6	42302	42307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838957
1083	NC_013526	CGG	2	6	42342	42347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838957
1084	NC_013526	CTC	2	6	42366	42371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838957
1085	NC_013526	ATC	2	6	42406	42411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838957
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1087	NC_013526	GTG	2	6	42513	42518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838957
1088	NC_013526	CAA	2	6	42543	42548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269838957
1089	NC_013526	TCC	2	6	42603	42608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838958
1090	NC_013526	TCGG	2	8	42609	42616	0 %	25 %	50 %	25 %	269838958
1091	NC_013526	CCA	2	6	42649	42654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838958
1092	NC_013526	C	6	6	42655	42660	0 %	0 %	0 %	100 %	269838958
1093	NC_013526	CCTT	2	8	42768	42775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_013526	G	6	6	42864	42869	0 %	0 %	100 %	0 %	269838959
1095	NC_013526	CTC	2	6	42883	42888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838959
1096	NC_013526	TGA	2	6	42897	42902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838959
1097	NC_013526	CTG	2	6	42916	42921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838959
1098	NC_013526	CCA	2	6	42960	42965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838959
1099	NC_013526	TGG	2	6	43031	43036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269838959
1100	NC_013526	CGCC	2	8	43155	43162	0 %	0 %	25 %	75 %	269838959
1101	NC_013526	AGGT	2	8	43262	43269	25 %	25 %	50 %	0 %	269838959
1102	NC_013526	GC	3	6	43304	43309	0 %	0 %	50 %	50 %	269838959
1103	NC_013526	TCC	3	9	43316	43324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838959
1104	NC_013526	GCC	2	6	43327	43332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838959
1105	NC_013526	CTG	2	6	43354	43359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838959
1106	NC_013526	CGC	2	6	43374	43379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838959
1107	NC_013526	TGCG	2	8	43398	43405	0 %	25 %	50 %	25 %	269838959
1108	NC_013526	CT	3	6	43407	43412	0 %	50 %	0 %	50 %	269838959
1109	NC_013526	CTG	2	6	43421	43426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838959
1110	NC_013526	CG	3	6	43434	43439	0 %	0 %	50 %	50 %	269838959
1111	NC_013526	CAG	2	6	43471	43476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838959
1112	NC_013526	CCTG	2	8	43482	43489	0 %	25 %	25 %	50 %	269838959
1113	NC_013526	CCA	2	6	43518	43523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838959
1114	NC_013526	GCA	2	6	43548	43553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838959
1115	NC_013526	TGA	2	6	43557	43562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269838959
1116	NC_013526	CGG	2	6	43587	43592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269838959
1117	NC_013526	CTC	2	6	43627	43632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838959
1118	NC_013526	CAC	2	6	43657	43662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269838959
1119	NC_013526	CAG	2	6	43681	43686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838959
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1121	NC_013526	CAT	2	6	43741	43746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269838959
1122	NC_013526	CG	3	6	43777	43782	0 %	0 %	50 %	50 %	269838960
1123	NC_013526	CGCC	2	8	43784	43791	0 %	0 %	25 %	75 %	269838960
1124	NC_013526	CG	3	6	43799	43804	0 %	0 %	50 %	50 %	269838960
1125	NC_013526	CAGC	2	8	43806	43813	25 %	0 %	25 %	50 %	269838960
1126	NC_013526	CTC	2	6	43881	43886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269838960
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1248	NC_013526	CCT	2	6	49056	49061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1249	NC_013526	GCA	2	6	49184	49189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269838964
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1251	NC_013526	TCG	2	6	49222	49227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838964
1252	NC_013526	CGC	2	6	49236	49241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269838964
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1260	NC_013526	GGCC	2	8	49477	49484	0 %	0 %	50 %	50 %	269838964
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1274	NC_013526	GCCCT	2	10	49924	49933	0 %	20 %	20 %	60 %	269838964
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1282	NC_013526	GTC	2	6	50111	50116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269838965
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