MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 38547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_013525	ATA	2	6	2024633	2024638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926981
38502	NC_013525	TCC	2	6	2024698	2024703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926981
38503	NC_013525	CT	3	6	2024752	2024757	0 %	50 %	0 %	50 %	269926981
38504	NC_013525	TTA	2	6	2024781	2024786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926981
38505	NC_013525	AGC	2	6	2024847	2024852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926981
38506	NC_013525	TGG	2	6	2024926	2024931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926981
38507	NC_013525	CCG	2	6	2024940	2024945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269926981
38508	NC_013525	AGC	2	6	2025010	2025015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926981
38509	NC_013525	AGAGG	2	10	2025023	2025032	40 %	0 %	60 %	0 %	269926981
38510	NC_013525	CTA	2	6	2025049	2025054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926981
38511	NC_013525	CT	3	6	2025065	2025070	0 %	50 %	0 %	50 %	269926981
38512	NC_013525	GCA	2	6	2025200	2025205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926981
38513	NC_013525	GAT	2	6	2025218	2025223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926982
38514	NC_013525	TAC	3	9	2025339	2025347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926982
38515	NC_013525	AG	3	6	2025396	2025401	50 %	0 %	50 %	0 %	269926982
38516	NC_013525	TCA	2	6	2025442	2025447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926982
38517	NC_013525	TAC	2	6	2025528	2025533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926982
38518	NC_013525	CTAT	2	8	2025589	2025596	25 %	50 %	0 %	25 %	269926982
38519	NC_013525	AGA	2	6	2025637	2025642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926982
38520	NC_013525	GA	4	8	2025646	2025653	50 %	0 %	50 %	0 %	269926982
38521	NC_013525	TAGC	2	8	2025751	2025758	25 %	25 %	25 %	25 %	269926982
38522	NC_013525	GGCA	2	8	2025764	2025771	25 %	0 %	50 %	25 %	269926982
38523	NC_013525	GAG	2	6	2025798	2025803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926982
38524	NC_013525	TGA	2	6	2025805	2025810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926982
38525	NC_013525	AGC	2	6	2025889	2025894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926982
38526	NC_013525	TCCC	2	8	2025943	2025950	0 %	25 %	0 %	75 %	269926982
38527	NC_013525	TCG	2	6	2025972	2025977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926982
38528	NC_013525	GA	3	6	2026040	2026045	50 %	0 %	50 %	0 %	269926982
38529	NC_013525	CAGG	2	8	2026115	2026122	25 %	0 %	50 %	25 %	269926982
38530	NC_013525	AGA	2	6	2026127	2026132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926982
38531	NC_013525	AG	3	6	2026136	2026141	50 %	0 %	50 %	0 %	269926982
38532	NC_013525	CTC	2	6	2026154	2026159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926982
38533	NC_013525	ACT	2	6	2026162	2026167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926982
38534	NC_013525	ACA	2	6	2026294	2026299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269926982
38535	NC_013525	TGA	2	6	2026301	2026306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926982
38536	NC_013525	AGC	3	9	2026309	2026317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926982
38537	NC_013525	TAC	2	6	2026336	2026341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926982
38538	NC_013525	AGG	2	6	2026435	2026440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926982
38539	NC_013525	CAC	2	6	2026443	2026448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926982
38540	NC_013525	GGGT	2	8	2026522	2026529	0 %	25 %	75 %	0 %	269926982
38541	NC_013525	TTA	2	6	2026537	2026542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926982
38542	NC_013525	TCA	2	6	2026597	2026602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926982
38543	NC_013525	CCT	2	6	2026639	2026644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926982
38544	NC_013525	GA	3	6	2026663	2026668	50 %	0 %	50 %	0 %	269926982
38545	NC_013525	GTTC	2	8	2026859	2026866	0 %	50 %	25 %	25 %	269926982
38546	NC_013525	AAG	2	6	2026875	2026880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926982
38547	NC_013525	GCT	2	6	2026919	2026924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.