MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 38547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_013525	AATC	2	8	1262122	1262129	50 %	25 %	0 %	25 %	269926269
24002	NC_013525	TTC	3	9	1262192	1262200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926269
24003	NC_013525	GGAT	2	8	1262225	1262232	25 %	25 %	50 %	0 %	269926269
24004	NC_013525	TCC	2	6	1262246	1262251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926269
24005	NC_013525	GAG	2	6	1262271	1262276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926269
24006	NC_013525	TCG	2	6	1262456	1262461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926270
24007	NC_013525	AT	3	6	1262543	1262548	50 %	50 %	0 %	0 %	269926270
24008	NC_013525	CCA	2	6	1262713	1262718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926270
24009	NC_013525	TGC	2	6	1262747	1262752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926270
24010	NC_013525	CCT	2	6	1262770	1262775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926270
24011	NC_013525	TGC	2	6	1262787	1262792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926270
24012	NC_013525	TCC	2	6	1262877	1262882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926270
24013	NC_013525	TTC	2	6	1262899	1262904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926270
24014	NC_013525	GTT	2	6	1262905	1262910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926270
24015	NC_013525	GTA	3	9	1262920	1262928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926270
24016	NC_013525	CAG	2	6	1262941	1262946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926270
24017	NC_013525	GAG	2	6	1263037	1263042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926270
24018	NC_013525	AG	3	6	1263095	1263100	50 %	0 %	50 %	0 %	269926270
24019	NC_013525	ATTT	2	8	1263101	1263108	25 %	75 %	0 %	0 %	269926270
24020	NC_013525	TTA	2	6	1263265	1263270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926270
24021	NC_013525	ACT	2	6	1263362	1263367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926270
24022	NC_013525	TCC	2	6	1263384	1263389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926270
24023	NC_013525	TTAC	2	8	1263455	1263462	25 %	50 %	0 %	25 %	269926270
24024	NC_013525	GTT	2	6	1263701	1263706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926270
24025	NC_013525	CTT	2	6	1263728	1263733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926271
24026	NC_013525	GTG	2	6	1263887	1263892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926271
24027	NC_013525	TCGA	2	8	1263940	1263947	25 %	25 %	25 %	25 %	269926271
24028	NC_013525	CTT	2	6	1263953	1263958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926271
24029	NC_013525	ATC	3	9	1264003	1264011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926271
24030	NC_013525	TAT	2	6	1264083	1264088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926271
24031	NC_013525	GATG	2	8	1264172	1264179	25 %	25 %	50 %	0 %	269926271
24032	NC_013525	GCTA	2	8	1264239	1264246	25 %	25 %	25 %	25 %	269926271
24033	NC_013525	TAC	2	6	1264260	1264265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926271
24034	NC_013525	AT	3	6	1264305	1264310	50 %	50 %	0 %	0 %	269926271
24035	NC_013525	AAG	2	6	1264321	1264326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926271
24036	NC_013525	TTC	2	6	1264425	1264430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926271
24037	NC_013525	TG	3	6	1264441	1264446	0 %	50 %	50 %	0 %	269926271
24038	NC_013525	GATCC	2	10	1264451	1264460	20 %	20 %	20 %	40 %	269926271
24039	NC_013525	TCT	2	6	1264462	1264467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926271
24040	NC_013525	TTA	2	6	1264516	1264521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926271
24041	NC_013525	TTA	2	6	1264562	1264567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926271
24042	NC_013525	GT	3	6	1264597	1264602	0 %	50 %	50 %	0 %	269926271
24043	NC_013525	TGA	2	6	1264620	1264625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926271
24044	NC_013525	TTAG	2	8	1264654	1264661	25 %	50 %	25 %	0 %	269926271
24045	NC_013525	TC	3	6	1264664	1264669	0 %	50 %	0 %	50 %	269926271
24046	NC_013525	G	6	6	1264706	1264711	0 %	0 %	100 %	0 %	269926271
24047	NC_013525	T	6	6	1264730	1264735	0 %	100 %	0 %	0 %	269926271
24048	NC_013525	TAC	2	6	1264815	1264820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926271
24049	NC_013525	CTA	2	6	1264859	1264864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926271
24050	NC_013525	GTA	2	6	1264916	1264921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926271
24051	NC_013525	TAT	2	6	1264992	1264997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926271
24052	NC_013525	T	6	6	1265022	1265027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24053	NC_013525	GGA	2	6	1265062	1265067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926272
24054	NC_013525	TAA	2	6	1265074	1265079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926272
24055	NC_013525	CT	3	6	1265128	1265133	0 %	50 %	0 %	50 %	269926272
24056	NC_013525	CTG	2	6	1265149	1265154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926272
24057	NC_013525	TGA	2	6	1265181	1265186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24058	NC_013525	TTG	2	6	1265373	1265378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926273
24059	NC_013525	CT	3	6	1265410	1265415	0 %	50 %	0 %	50 %	269926273
24060	NC_013525	CAT	2	6	1265441	1265446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926273
24061	NC_013525	CCG	2	6	1265509	1265514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269926273
24062	NC_013525	CTC	2	6	1265525	1265530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926273
24063	NC_013525	CTA	2	6	1265537	1265542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926273
24064	NC_013525	CTTA	2	8	1265577	1265584	25 %	50 %	0 %	25 %	269926273
24065	NC_013525	GCTG	2	8	1265585	1265592	0 %	25 %	50 %	25 %	269926273
24066	NC_013525	TTG	2	6	1265626	1265631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926273
24067	NC_013525	ATGTT	2	10	1265642	1265651	20 %	60 %	20 %	0 %	269926273
24068	NC_013525	TTCT	2	8	1265704	1265711	0 %	75 %	0 %	25 %	269926273
24069	NC_013525	GAT	2	6	1265832	1265837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24070	NC_013525	TAC	2	6	1265846	1265851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926273
24071	NC_013525	TC	3	6	1265927	1265932	0 %	50 %	0 %	50 %	269926273
24072	NC_013525	TC	3	6	1265948	1265953	0 %	50 %	0 %	50 %	269926273
24073	NC_013525	TTC	2	6	1265964	1265969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926273
24074	NC_013525	ATGG	2	8	1265977	1265984	25 %	25 %	50 %	0 %	269926273
24075	NC_013525	CTG	2	6	1266030	1266035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926273
24076	NC_013525	ACC	2	6	1266046	1266051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926273
24077	NC_013525	TGAG	2	8	1266103	1266110	25 %	25 %	50 %	0 %	269926273
24078	NC_013525	GCC	2	6	1266147	1266152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269926273
24079	NC_013525	ATGG	2	8	1266196	1266203	25 %	25 %	50 %	0 %	269926273
24080	NC_013525	TGA	2	6	1266224	1266229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24081	NC_013525	TTGT	2	8	1266252	1266259	0 %	75 %	25 %	0 %	269926273
24082	NC_013525	TCC	2	6	1266289	1266294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926273
24083	NC_013525	TAG	2	6	1266344	1266349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24084	NC_013525	TC	3	6	1266387	1266392	0 %	50 %	0 %	50 %	269926273
24085	NC_013525	CTG	2	6	1266400	1266405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926273
24086	NC_013525	ATA	2	6	1266418	1266423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926273
24087	NC_013525	TCA	2	6	1266425	1266430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926273
24088	NC_013525	GTA	2	6	1266434	1266439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24089	NC_013525	TAC	2	6	1266489	1266494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926273
24090	NC_013525	GCC	2	6	1266505	1266510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269926273
24091	NC_013525	TC	3	6	1266674	1266679	0 %	50 %	0 %	50 %	269926273
24092	NC_013525	AGT	2	6	1266745	1266750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24093	NC_013525	ATC	2	6	1266769	1266774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926273
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24095	NC_013525	AT	3	6	1266820	1266825	50 %	50 %	0 %	0 %	269926273
24096	NC_013525	ATG	2	6	1266836	1266841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24097	NC_013525	GCA	2	6	1266850	1266855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926273
24098	NC_013525	ATG	2	6	1266865	1266870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926273
24099	NC_013525	GAA	2	6	1266879	1266884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926273
24100	NC_013525	AT	3	6	1266897	1266902	50 %	50 %	0 %	0 %	269926273
24101	NC_013525	AT	3	6	1266920	1266925	50 %	50 %	0 %	0 %	269926273
24102	NC_013525	CTTG	2	8	1266984	1266991	0 %	50 %	25 %	25 %	269926274
24103	NC_013525	TGA	2	6	1267081	1267086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926274
24104	NC_013525	TCG	2	6	1267094	1267099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926274
24105	NC_013525	GTA	2	6	1267201	1267206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926274
24106	NC_013525	ATG	2	6	1267289	1267294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926274
24107	NC_013525	TCT	2	6	1267304	1267309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926274
24108	NC_013525	TCC	2	6	1267329	1267334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926274
24109	NC_013525	TTC	2	6	1267429	1267434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926274
24110	NC_013525	TAT	2	6	1267465	1267470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926274
24111	NC_013525	GTAA	2	8	1267524	1267531	50 %	25 %	25 %	0 %	269926274
24112	NC_013525	GAT	2	6	1267604	1267609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926274
24113	NC_013525	TTC	2	6	1267633	1267638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926274
24114	NC_013525	CCT	2	6	1267664	1267669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926274
24115	NC_013525	CT	3	6	1267716	1267721	0 %	50 %	0 %	50 %	269926274
24116	NC_013525	AGC	2	6	1267912	1267917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926274
24117	NC_013525	CAT	2	6	1267921	1267926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926274
24118	NC_013525	TCTAT	2	10	1267946	1267955	20 %	60 %	0 %	20 %	269926274
24119	NC_013525	CT	3	6	1268015	1268020	0 %	50 %	0 %	50 %	269926274
24120	NC_013525	GA	3	6	1268173	1268178	50 %	0 %	50 %	0 %	269926274
24121	NC_013525	TCT	2	6	1268264	1268269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926274
24122	NC_013525	T	6	6	1268330	1268335	0 %	100 %	0 %	0 %	269926274
24123	NC_013525	CTT	2	6	1268358	1268363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926274
24124	NC_013525	TGT	2	6	1268408	1268413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926274
24125	NC_013525	CTG	2	6	1268475	1268480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926274
24126	NC_013525	GT	3	6	1268529	1268534	0 %	50 %	50 %	0 %	269926274
24127	NC_013525	TAT	2	6	1268545	1268550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926274
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24129	NC_013525	TCT	2	6	1268600	1268605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926274
24130	NC_013525	CTAT	2	8	1268621	1268628	25 %	50 %	0 %	25 %	269926274
24131	NC_013525	AG	3	6	1268675	1268680	50 %	0 %	50 %	0 %	269926274
24132	NC_013525	TC	4	8	1268756	1268763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24133	NC_013525	TTTG	2	8	1268784	1268791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24134	NC_013525	T	6	6	1268798	1268803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24135	NC_013525	GTA	2	6	1268859	1268864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24138	NC_013525	TGC	2	6	1268970	1268975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926275
24139	NC_013525	GAT	2	6	1268995	1269000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926275
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24141	NC_013525	A	7	7	1269099	1269105	100 %	0 %	0 %	0 %	269926275
24142	NC_013525	CTA	2	6	1269171	1269176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926275
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24177	NC_013525	CTCTAT	2	12	1270837	1270848	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	269926277
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24188	NC_013525	TTTA	2	8	1271918	1271925	25 %	75 %	0 %	0 %	269926278
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24215	NC_013525	AAT	2	6	1273372	1273377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926280
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24228	NC_013525	TA	3	6	1273886	1273891	50 %	50 %	0 %	0 %	269926280
24229	NC_013525	GTAG	2	8	1273901	1273908	25 %	25 %	50 %	0 %	269926280
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24232	NC_013525	AAT	2	6	1274073	1274078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926280
24233	NC_013525	ACT	2	6	1274100	1274105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926280
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24364	NC_013525	TTC	2	6	1280687	1280692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926286
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24469	NC_013525	TTA	2	6	1286343	1286348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926291
24470	NC_013525	AGAT	2	8	1286370	1286377	50 %	25 %	25 %	0 %	269926291
24471	NC_013525	AAT	2	6	1286411	1286416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926291
24472	NC_013525	ATC	2	6	1286579	1286584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926291
24473	NC_013525	TTA	2	6	1286659	1286664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926291
24474	NC_013525	CTT	2	6	1286722	1286727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926291
24475	NC_013525	CT	3	6	1286734	1286739	0 %	50 %	0 %	50 %	269926291
24476	NC_013525	CAG	3	9	1286741	1286749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926291
24477	NC_013525	TAGT	2	8	1286754	1286761	25 %	50 %	25 %	0 %	269926291
24478	NC_013525	TCC	2	6	1286781	1286786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926291
24479	NC_013525	CTT	2	6	1286851	1286856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926291
24480	NC_013525	AT	3	6	1286917	1286922	50 %	50 %	0 %	0 %	269926291
24481	NC_013525	AACT	2	8	1286936	1286943	50 %	25 %	0 %	25 %	269926291
24482	NC_013525	CTG	2	6	1286952	1286957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926291
24483	NC_013525	AGG	2	6	1286993	1286998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926291
24484	NC_013525	ACC	2	6	1287020	1287025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926291
24485	NC_013525	CAG	2	6	1287154	1287159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926291
24486	NC_013525	GATTT	2	10	1287164	1287173	20 %	60 %	20 %	0 %	269926291
24487	NC_013525	ATGCG	2	10	1287194	1287203	20 %	20 %	40 %	20 %	269926291
24488	NC_013525	A	6	6	1287213	1287218	100 %	0 %	0 %	0 %	269926291
24489	NC_013525	GGT	2	6	1287253	1287258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926292
24490	NC_013525	TC	3	6	1287299	1287304	0 %	50 %	0 %	50 %	269926292
24491	NC_013525	GTAC	2	8	1287338	1287345	25 %	25 %	25 %	25 %	269926292
24492	NC_013525	CAG	3	9	1287356	1287364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926292
24493	NC_013525	TTC	2	6	1287424	1287429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926292
24494	NC_013525	AAGA	2	8	1287440	1287447	75 %	0 %	25 %	0 %	269926292
24495	NC_013525	CTG	3	9	1287458	1287466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926292
24496	NC_013525	CTT	2	6	1287524	1287529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926292
24497	NC_013525	TCT	2	6	1287561	1287566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926292
24498	NC_013525	TAC	2	6	1287582	1287587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24499	NC_013525	CAG	2	6	1287632	1287637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926293
24500	NC_013525	GCT	2	6	1287797	1287802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926293

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