MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 38547

< Previous12...4041424344454647484950...7778Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_013525	GCT	2	6	1154798	1154803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926189
22003	NC_013525	TCT	2	6	1154821	1154826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926189
22004	NC_013525	ACT	2	6	1154834	1154839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926189
22005	NC_013525	CATA	2	8	1154884	1154891	50 %	25 %	0 %	25 %	269926189
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22007	NC_013525	GGA	2	6	1154938	1154943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926189
22008	NC_013525	ATC	2	6	1154993	1154998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926189
22009	NC_013525	TGC	2	6	1155022	1155027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926189
22010	NC_013525	GGT	2	6	1155102	1155107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926189
22011	NC_013525	CGAG	2	8	1155154	1155161	25 %	0 %	50 %	25 %	269926189
22012	NC_013525	TGC	2	6	1155232	1155237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926189
22013	NC_013525	TTA	2	6	1155243	1155248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926189
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22038	NC_013525	CT	3	6	1156630	1156635	0 %	50 %	0 %	50 %	269926189
22039	NC_013525	GAA	2	6	1156652	1156657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926189
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22102	NC_013525	AG	3	6	1159814	1159819	50 %	0 %	50 %	0 %	269926191
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22117	NC_013525	TAC	2	6	1160893	1160898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926192
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22119	NC_013525	TTA	2	6	1160949	1160954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926192
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22122	NC_013525	TAG	2	6	1161111	1161116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926192
22123	NC_013525	GTAC	2	8	1161175	1161182	25 %	25 %	25 %	25 %	269926192
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22128	NC_013525	TAC	2	6	1161416	1161421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926193
22129	NC_013525	TAC	2	6	1161432	1161437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926193
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22149	NC_013525	ACT	2	6	1162816	1162821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926193
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22222	NC_013525	TAG	2	6	1166854	1166859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926199
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22225	NC_013525	GTA	2	6	1167100	1167105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926199
22226	NC_013525	TGG	2	6	1167164	1167169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926199
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22229	NC_013525	GCT	2	6	1167297	1167302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926199
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22232	NC_013525	TGGTT	2	10	1167509	1167518	0 %	60 %	40 %	0 %	269926199
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22234	NC_013525	TGG	2	6	1167600	1167605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926199
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22347	NC_013525	TGC	3	9	1172978	1172986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926204
22348	NC_013525	TGC	2	6	1172993	1172998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926204
22349	NC_013525	GCT	2	6	1173138	1173143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926204
22350	NC_013525	GTCGTA	2	12	1173153	1173164	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269926204
22351	NC_013525	TCT	2	6	1173220	1173225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926204
22352	NC_013525	CCT	2	6	1173231	1173236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926204
22353	NC_013525	GAG	2	6	1173240	1173245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926204
22354	NC_013525	G	6	6	1173245	1173250	0 %	0 %	100 %	0 %	269926204
22355	NC_013525	TGG	2	6	1173359	1173364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926204
22356	NC_013525	CAGC	2	8	1173458	1173465	25 %	0 %	25 %	50 %	269926204
22357	NC_013525	ACC	2	6	1173486	1173491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926204
22358	NC_013525	GTT	2	6	1173549	1173554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926204
22359	NC_013525	TGT	2	6	1173572	1173577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926204
22360	NC_013525	AAG	2	6	1173648	1173653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926204
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22362	NC_013525	TCC	2	6	1173747	1173752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926204
22363	NC_013525	GA	3	6	1173793	1173798	50 %	0 %	50 %	0 %	269926204
22364	NC_013525	TACT	2	8	1173800	1173807	25 %	50 %	0 %	25 %	269926204
22365	NC_013525	ACT	2	6	1173831	1173836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926204
22366	NC_013525	ATT	2	6	1174074	1174079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926205
22367	NC_013525	TGGC	2	8	1174125	1174132	0 %	25 %	50 %	25 %	269926205
22368	NC_013525	GCCC	2	8	1174187	1174194	0 %	0 %	25 %	75 %	269926205
22369	NC_013525	GTT	2	6	1174209	1174214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926205
22370	NC_013525	TTG	2	6	1174240	1174245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926205
22371	NC_013525	TAA	2	6	1174254	1174259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926205
22372	NC_013525	GCC	2	6	1174350	1174355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269926206
22373	NC_013525	CCT	2	6	1174399	1174404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926206
22374	NC_013525	CTT	2	6	1174421	1174426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926206
22375	NC_013525	ATAC	2	8	1174437	1174444	50 %	25 %	0 %	25 %	269926206
22376	NC_013525	GT	3	6	1174485	1174490	0 %	50 %	50 %	0 %	269926206
22377	NC_013525	TTC	2	6	1174515	1174520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926206
22378	NC_013525	GTG	2	6	1174535	1174540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926206
22379	NC_013525	TTATT	2	10	1174577	1174586	20 %	80 %	0 %	0 %	269926206
22380	NC_013525	TATCTT	2	12	1174602	1174613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	269926206
22381	NC_013525	TAG	2	6	1174676	1174681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926206
22382	NC_013525	TCA	2	6	1174822	1174827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926206
22383	NC_013525	TTG	2	6	1174923	1174928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926206
22384	NC_013525	GCT	2	6	1174945	1174950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926206
22385	NC_013525	GAAG	2	8	1174993	1175000	50 %	0 %	50 %	0 %	269926206
22386	NC_013525	CTG	2	6	1175121	1175126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926206
22387	NC_013525	TATTTA	2	12	1175141	1175152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926206
22388	NC_013525	TGT	2	6	1175174	1175179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926206
22389	NC_013525	TTG	2	6	1175182	1175187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926206
22390	NC_013525	CT	3	6	1175446	1175451	0 %	50 %	0 %	50 %	269926206
22391	NC_013525	CTG	2	6	1175501	1175506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926206
22392	NC_013525	TTG	2	6	1175510	1175515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926206
22393	NC_013525	GCG	2	6	1175540	1175545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269926206
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22397	NC_013525	CTA	2	6	1175747	1175752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926207
22398	NC_013525	G	6	6	1175763	1175768	0 %	0 %	100 %	0 %	269926207
22399	NC_013525	TGT	2	6	1175790	1175795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926207
22400	NC_013525	CTC	2	6	1175799	1175804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926207
22401	NC_013525	AGA	2	6	1175838	1175843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926207
22402	NC_013525	AGG	2	6	1175879	1175884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269926207
22403	NC_013525	GT	3	6	1175995	1176000	0 %	50 %	50 %	0 %	269926207
22404	NC_013525	GCT	2	6	1176023	1176028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926207
22405	NC_013525	TGC	2	6	1176040	1176045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926207
22406	NC_013525	GTA	2	6	1176106	1176111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926207
22407	NC_013525	TTG	2	6	1176116	1176121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926207
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22411	NC_013525	ATT	2	6	1176230	1176235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926207
22412	NC_013525	AGTCCA	2	12	1176259	1176270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269926207
22413	NC_013525	TAGG	2	8	1176390	1176397	25 %	25 %	50 %	0 %	269926207
22414	NC_013525	TA	3	6	1176445	1176450	50 %	50 %	0 %	0 %	269926207
22415	NC_013525	CTT	2	6	1176489	1176494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926207
22416	NC_013525	TC	3	6	1176600	1176605	0 %	50 %	0 %	50 %	269926207
22417	NC_013525	AGT	2	6	1176663	1176668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926207
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22420	NC_013525	CTT	2	6	1176735	1176740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926207
22421	NC_013525	GTT	2	6	1176777	1176782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269926207
22422	NC_013525	ATC	2	6	1176991	1176996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926207
22423	NC_013525	CT	3	6	1177066	1177071	0 %	50 %	0 %	50 %	269926207
22424	NC_013525	CTC	2	6	1177110	1177115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926207
22425	NC_013525	TGG	2	6	1177333	1177338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926207
22426	NC_013525	GGT	2	6	1177352	1177357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926207
22427	NC_013525	CTG	2	6	1177455	1177460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269926207
22428	NC_013525	TTGTT	2	10	1177478	1177487	0 %	80 %	20 %	0 %	269926207
22429	NC_013525	ACT	2	6	1177559	1177564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22430	NC_013525	GAAG	2	8	1177629	1177636	50 %	0 %	50 %	0 %	269926208
22431	NC_013525	GGT	2	6	1177652	1177657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926208
22432	NC_013525	CCA	2	6	1177706	1177711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926208
22433	NC_013525	AGA	2	6	1177788	1177793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926208
22434	NC_013525	TCA	2	6	1177827	1177832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926208
22435	NC_013525	GAA	2	6	1177939	1177944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926208
22436	NC_013525	TCA	2	6	1177950	1177955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269926208
22437	NC_013525	GTTG	2	8	1177972	1177979	0 %	50 %	50 %	0 %	269926208
22438	NC_013525	GAA	2	6	1178010	1178015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926208
22439	NC_013525	AAT	2	6	1178026	1178031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269926208
22440	NC_013525	AAC	2	6	1178066	1178071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269926208
22441	NC_013525	ATG	2	6	1178087	1178092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926208
22442	NC_013525	AGAAT	2	10	1178106	1178115	60 %	20 %	20 %	0 %	269926208
22443	NC_013525	GA	4	8	1178144	1178151	50 %	0 %	50 %	0 %	269926208
22444	NC_013525	CTGC	2	8	1178192	1178199	0 %	25 %	25 %	50 %	269926208
22445	NC_013525	TAT	2	6	1178203	1178208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926208
22446	NC_013525	TGA	2	6	1178229	1178234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926208
22447	NC_013525	GA	4	8	1178371	1178378	50 %	0 %	50 %	0 %	269926208
22448	NC_013525	GTA	2	6	1178404	1178409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926208
22449	NC_013525	TA	3	6	1178408	1178413	50 %	50 %	0 %	0 %	269926208
22450	NC_013525	CTT	2	6	1178544	1178549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269926209
22451	NC_013525	GAA	2	6	1178550	1178555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926209
22452	NC_013525	GCTT	2	8	1178619	1178626	0 %	50 %	25 %	25 %	269926209
22453	NC_013525	AAC	2	6	1178764	1178769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269926209
22454	NC_013525	TA	4	8	1178799	1178806	50 %	50 %	0 %	0 %	269926209
22455	NC_013525	CT	3	6	1178810	1178815	0 %	50 %	0 %	50 %	269926209
22456	NC_013525	CAG	2	6	1178840	1178845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269926209
22457	NC_013525	CAGAT	2	10	1178853	1178862	40 %	20 %	20 %	20 %	269926209
22458	NC_013525	GCC	2	6	1178901	1178906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269926209
22459	NC_013525	ACC	2	6	1178910	1178915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269926209
22460	NC_013525	T	6	6	1178951	1178956	0 %	100 %	0 %	0 %	269926209
22461	NC_013525	CCT	2	6	1179016	1179021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269926209
22462	NC_013525	ATCC	2	8	1179034	1179041	25 %	25 %	0 %	50 %	269926209
22463	NC_013525	TGG	2	6	1179063	1179068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269926209
22464	NC_013525	TAT	2	6	1179150	1179155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269926209
22465	NC_013525	GTA	2	6	1179183	1179188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269926209
22466	NC_013525	GAA	2	6	1179210	1179215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269926209
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