MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 43188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_013522	GAG	2	6	1539575	1539580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36003	NC_013522	GCG	2	6	1539626	1539631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36004	NC_013522	GCC	2	6	1539707	1539712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36005	NC_013522	GGGGC	2	10	1539728	1539737	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
36006	NC_013522	CTT	2	6	1539748	1539753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36007	NC_013522	G	7	7	1539987	1539993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36008	NC_013522	ATG	2	6	1540034	1540039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36009	NC_013522	GCCA	2	8	1540061	1540068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36010	NC_013522	TCT	2	6	1540095	1540100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36011	NC_013522	AGG	3	9	1540113	1540121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36012	NC_013522	GAG	2	6	1540132	1540137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36013	NC_013522	GAG	3	9	1540148	1540156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36014	NC_013522	GTG	2	6	1540175	1540180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36015	NC_013522	CCA	2	6	1540230	1540235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36016	NC_013522	GGGA	2	8	1540242	1540249	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36017	NC_013522	CACC	2	8	1540312	1540319	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36018	NC_013522	TGG	2	6	1540329	1540334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36019	NC_013522	GCC	2	6	1540426	1540431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36020	NC_013522	CGG	2	6	1540463	1540468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36021	NC_013522	ATT	2	6	1540574	1540579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36022	NC_013522	TAG	2	6	1540606	1540611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36023	NC_013522	CTG	2	6	1540689	1540694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36025	NC_013522	TCC	2	6	1540746	1540751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36026	NC_013522	GGA	2	6	1540754	1540759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36028	NC_013522	GGA	2	6	1540850	1540855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36029	NC_013522	TGG	2	6	1540864	1540869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36030	NC_013522	GGA	2	6	1540889	1540894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36031	NC_013522	TGG	2	6	1540906	1540911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36032	NC_013522	GTG	2	6	1540935	1540940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36034	NC_013522	GAC	3	9	1540962	1540970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36035	NC_013522	AGGA	2	8	1540995	1541002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36036	NC_013522	ACC	2	6	1541025	1541030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36038	NC_013522	CCGGT	2	10	1541058	1541067	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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36041	NC_013522	AGG	2	6	1541470	1541475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36044	NC_013522	CGGAT	2	10	1541559	1541568	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36045	NC_013522	GAG	2	6	1541606	1541611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36046	NC_013522	AGG	2	6	1541628	1541633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36047	NC_013522	GCC	2	6	1541663	1541668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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36049	NC_013522	GAT	2	6	1541746	1541751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36050	NC_013522	GCC	2	6	1541760	1541765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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36052	NC_013522	GGC	2	6	1541785	1541790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36053	NC_013522	CTG	2	6	1541870	1541875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36054	NC_013522	CGC	2	6	1541884	1541889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36055	NC_013522	CGGG	2	8	1541903	1541910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36056	NC_013522	GGT	2	6	1541932	1541937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36057	NC_013522	GAG	2	6	1541942	1541947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36058	NC_013522	GGA	2	6	1541962	1541967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36059	NC_013522	GGA	2	6	1542037	1542042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36060	NC_013522	GGC	2	6	1542160	1542165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36061	NC_013522	GGA	2	6	1542172	1542177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36062	NC_013522	GCG	2	6	1542204	1542209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36063	NC_013522	CGC	2	6	1542217	1542222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36064	NC_013522	CAG	2	6	1542248	1542253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36068	NC_013522	AGG	2	6	1542435	1542440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36069	NC_013522	CT	3	6	1542495	1542500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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36093	NC_013522	CCTATA	2	12	1543699	1543710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36094	NC_013522	C	6	6	1543750	1543755	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36095	NC_013522	CCA	2	6	1543761	1543766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36101	NC_013522	AC	3	6	1544021	1544026	50 %	0 %	0 %	50 %	269793084
36102	NC_013522	CAT	2	6	1544135	1544140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36104	NC_013522	CGA	2	6	1544160	1544165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36105	NC_013522	CCG	3	9	1544169	1544177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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36107	NC_013522	GCC	2	6	1544263	1544268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36108	NC_013522	CAAC	2	8	1544367	1544374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36109	NC_013522	C	6	6	1544413	1544418	0 %	0 %	0 %	100 %	269793085
36110	NC_013522	TCC	2	6	1544511	1544516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793085
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36114	NC_013522	CCCG	2	8	1544864	1544871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36115	NC_013522	CTA	2	6	1544900	1544905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36117	NC_013522	CCG	2	6	1544948	1544953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36118	NC_013522	GGTG	2	8	1545027	1545034	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36119	NC_013522	G	6	6	1545050	1545055	0 %	0 %	100 %	0 %	269793086
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36124	NC_013522	AGG	2	6	1545284	1545289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793086
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36134	NC_013522	CCAG	2	8	1545725	1545732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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36137	NC_013522	CATT	2	8	1545808	1545815	25 %	50 %	0 %	25 %	269793087
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36154	NC_013522	ACG	2	6	1546936	1546941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36230	NC_013522	CTC	2	6	1551622	1551627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36231	NC_013522	TCGT	2	8	1551637	1551644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36232	NC_013522	ACC	2	6	1551687	1551692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793092
36233	NC_013522	AGCA	2	8	1551702	1551709	50 %	0 %	25 %	25 %	269793092
36234	NC_013522	GGAT	2	8	1551801	1551808	25 %	25 %	50 %	0 %	269793092
36235	NC_013522	CAT	2	6	1551821	1551826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793092
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36238	NC_013522	AAG	2	6	1551995	1552000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269793093
36239	NC_013522	CGA	2	6	1552101	1552106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793093
36240	NC_013522	GCA	2	6	1552113	1552118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793093
36241	NC_013522	CGT	2	6	1552121	1552126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793093
36242	NC_013522	CTGG	2	8	1552183	1552190	0 %	25 %	50 %	25 %	269793093
36243	NC_013522	C	6	6	1552242	1552247	0 %	0 %	0 %	100 %	269793093
36244	NC_013522	GCCATG	2	12	1552262	1552273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269793093
36245	NC_013522	GA	3	6	1552313	1552318	50 %	0 %	50 %	0 %	269793093
36246	NC_013522	CG	3	6	1552353	1552358	0 %	0 %	50 %	50 %	269793093
36247	NC_013522	G	6	6	1552358	1552363	0 %	0 %	100 %	0 %	269793093
36248	NC_013522	TCA	2	6	1552377	1552382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793093
36249	NC_013522	GACA	2	8	1552429	1552436	50 %	0 %	25 %	25 %	269793093
36250	NC_013522	TCG	2	6	1552481	1552486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793093
36251	NC_013522	TC	3	6	1552513	1552518	0 %	50 %	0 %	50 %	269793093
36252	NC_013522	GCTG	2	8	1552539	1552546	0 %	25 %	50 %	25 %	269793093
36253	NC_013522	CCT	2	6	1552581	1552586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793094
36254	NC_013522	CCA	2	6	1552630	1552635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793094
36255	NC_013522	CGA	2	6	1552640	1552645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793094
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36260	NC_013522	CGC	2	6	1552968	1552973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793094
36261	NC_013522	CGA	2	6	1553024	1553029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36262	NC_013522	TGC	2	6	1553110	1553115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36263	NC_013522	GGC	2	6	1553214	1553219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793094
36264	NC_013522	TGG	2	6	1553240	1553245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793094
36265	NC_013522	CCA	2	6	1553345	1553350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793094
36266	NC_013522	GTC	2	6	1553376	1553381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36267	NC_013522	GCA	2	6	1553417	1553422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36268	NC_013522	CGG	2	6	1553427	1553432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793094
36269	NC_013522	CAC	2	6	1553469	1553474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793094
36270	NC_013522	TTC	2	6	1553532	1553537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793094
36271	NC_013522	GTG	2	6	1553545	1553550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793094
36272	NC_013522	GCTCCA	2	12	1553555	1553566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269793094
36273	NC_013522	CGA	2	6	1553570	1553575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36274	NC_013522	TCT	2	6	1553639	1553644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793094
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36276	NC_013522	GCG	3	9	1553670	1553678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793094
36277	NC_013522	GTG	2	6	1553808	1553813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793094
36278	NC_013522	CCG	2	6	1553858	1553863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793094
36279	NC_013522	GCGA	2	8	1553896	1553903	25 %	0 %	50 %	25 %	269793094
36280	NC_013522	ATG	2	6	1553962	1553967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793094
36281	NC_013522	GGC	2	6	1554062	1554067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793094
36282	NC_013522	GCA	2	6	1554068	1554073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36283	NC_013522	GCT	2	6	1554095	1554100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36284	NC_013522	TGA	2	6	1554101	1554106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793094
36285	NC_013522	GCA	2	6	1554299	1554304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793094
36286	NC_013522	CAC	3	9	1554348	1554356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793094
36287	NC_013522	CTT	2	6	1554482	1554487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793094
36288	NC_013522	ACTC	2	8	1554545	1554552	25 %	25 %	0 %	50 %	269793094
36289	NC_013522	CCTC	2	8	1554584	1554591	0 %	25 %	0 %	75 %	269793095
36290	NC_013522	GTT	2	6	1554648	1554653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269793095
36291	NC_013522	TTC	2	6	1554664	1554669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793095
36292	NC_013522	TCG	2	6	1554809	1554814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36293	NC_013522	CCG	2	6	1554837	1554842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793095
36294	NC_013522	C	6	6	1554843	1554848	0 %	0 %	0 %	100 %	269793095
36295	NC_013522	TGA	2	6	1554866	1554871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793095
36296	NC_013522	CAG	2	6	1554916	1554921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36297	NC_013522	CGT	2	6	1554963	1554968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36298	NC_013522	ATG	2	6	1554986	1554991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793095
36299	NC_013522	CGG	2	6	1554998	1555003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793095
36300	NC_013522	TGA	2	6	1555131	1555136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793095
36301	NC_013522	GGC	2	6	1555215	1555220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793095
36302	NC_013522	CCT	2	6	1555239	1555244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793095
36303	NC_013522	GAC	2	6	1555255	1555260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36304	NC_013522	TCGC	2	8	1555270	1555277	0 %	25 %	25 %	50 %	269793095
36305	NC_013522	TTC	2	6	1555307	1555312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793095
36306	NC_013522	GCC	2	6	1555324	1555329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793095
36307	NC_013522	CAG	2	6	1555387	1555392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36308	NC_013522	GC	3	6	1555450	1555455	0 %	0 %	50 %	50 %	269793095
36309	NC_013522	CT	3	6	1555490	1555495	0 %	50 %	0 %	50 %	269793095
36310	NC_013522	TCC	2	6	1555502	1555507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793095
36311	NC_013522	ACAT	2	8	1555535	1555542	50 %	25 %	0 %	25 %	269793095
36312	NC_013522	TCG	2	6	1555544	1555549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36313	NC_013522	TCC	2	6	1555631	1555636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793095
36314	NC_013522	GC	3	6	1555688	1555693	0 %	0 %	50 %	50 %	269793095
36315	NC_013522	GTT	2	6	1555734	1555739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269793095
36316	NC_013522	TGA	2	6	1555773	1555778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793095
36317	NC_013522	CCG	2	6	1555811	1555816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793095
36318	NC_013522	CTC	2	6	1555876	1555881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793095
36319	NC_013522	CAC	2	6	1555906	1555911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793095
36320	NC_013522	TCCAG	2	10	1556025	1556034	20 %	20 %	20 %	40 %	269793095
36321	NC_013522	GCC	2	6	1556081	1556086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793095
36322	NC_013522	AGC	2	6	1556093	1556098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36323	NC_013522	TTC	2	6	1556117	1556122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793095
36324	NC_013522	TCC	2	6	1556186	1556191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793095
36325	NC_013522	ACC	2	6	1556288	1556293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793095
36326	NC_013522	AGC	2	6	1556393	1556398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36327	NC_013522	GGCGC	2	10	1556485	1556494	0 %	0 %	60 %	40 %	269793095
36328	NC_013522	GCT	2	6	1556539	1556544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36329	NC_013522	GAGCAG	2	12	1556626	1556637	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	269793095
36330	NC_013522	CCCA	2	8	1556698	1556705	25 %	0 %	0 %	75 %	269793095
36331	NC_013522	CGG	2	6	1556742	1556747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793095
36332	NC_013522	GCCGC	2	10	1556803	1556812	0 %	0 %	40 %	60 %	269793095
36333	NC_013522	TCT	2	6	1556894	1556899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793095
36334	NC_013522	CCG	2	6	1556931	1556936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793095
36335	NC_013522	GTC	2	6	1556959	1556964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793095
36336	NC_013522	ATG	2	6	1557089	1557094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793095
36337	NC_013522	GA	3	6	1557173	1557178	50 %	0 %	50 %	0 %	269793095
36338	NC_013522	GACG	2	8	1557205	1557212	25 %	0 %	50 %	25 %	269793095
36339	NC_013522	CGC	2	6	1557262	1557267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793095
36340	NC_013522	GGC	2	6	1557268	1557273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793095
36341	NC_013522	GTA	2	6	1557445	1557450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793095
36342	NC_013522	GTT	3	9	1557454	1557462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269793095
36343	NC_013522	GTT	2	6	1557482	1557487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36344	NC_013522	TCC	2	6	1557570	1557575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793096
36345	NC_013522	CAA	2	6	1557590	1557595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269793096
36346	NC_013522	CAG	2	6	1557606	1557611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793096
36347	NC_013522	CGC	2	6	1557754	1557759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793096
36348	NC_013522	TCT	2	6	1557763	1557768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793096
36349	NC_013522	ACG	2	6	1557781	1557786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793096
36350	NC_013522	GCG	2	6	1557839	1557844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793096
36351	NC_013522	CAG	2	6	1557855	1557860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793096
36352	NC_013522	AGC	2	6	1557865	1557870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793096
36353	NC_013522	CCG	2	6	1557875	1557880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793096
36354	NC_013522	GTT	2	6	1557964	1557969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269793096
36355	NC_013522	CTC	2	6	1557984	1557989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793096
36356	NC_013522	CTT	2	6	1558056	1558061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793096
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36474	NC_013522	GC	3	6	1564009	1564014	0 %	0 %	50 %	50 %	269793099
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