MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 43188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_013522	CGGGGC	2	12	1494869	1494880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793045
35003	NC_013522	AAG	2	6	1494903	1494908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269793045
35004	NC_013522	CCA	2	6	1494931	1494936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793045
35005	NC_013522	TCC	2	6	1494990	1494995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793045
35006	NC_013522	AGC	2	6	1495117	1495122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793045
35007	NC_013522	C	6	6	1495146	1495151	0 %	0 %	0 %	100 %	269793045
35008	NC_013522	TCC	2	6	1495161	1495166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793045
35009	NC_013522	CTG	3	9	1495187	1495195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793045
35010	NC_013522	ACC	2	6	1495197	1495202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793045
35011	NC_013522	CGG	2	6	1495239	1495244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793045
35012	NC_013522	GCC	3	9	1495254	1495262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793045
35013	NC_013522	GATAC	2	10	1495351	1495360	40 %	20 %	20 %	20 %	269793045
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35015	NC_013522	G	7	7	1495461	1495467	0 %	0 %	100 %	0 %	269793045
35016	NC_013522	GTT	2	6	1495475	1495480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269793045
35017	NC_013522	CAGGA	2	10	1495497	1495506	40 %	0 %	40 %	20 %	269793045
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35019	NC_013522	CGC	2	6	1495731	1495736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793045
35020	NC_013522	GGC	2	6	1495754	1495759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793045
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35022	NC_013522	GAT	2	6	1495796	1495801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793045
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35031	NC_013522	TGGGCC	2	12	1496203	1496214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269793045
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35035	NC_013522	CCA	2	6	1496471	1496476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793046
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35042	NC_013522	CCG	2	6	1496956	1496961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793046
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35049	NC_013522	C	6	6	1497340	1497345	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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35051	NC_013522	CTGG	2	8	1497427	1497434	0 %	25 %	50 %	25 %	269793047
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35063	NC_013522	AGGA	2	8	1497995	1498002	50 %	0 %	50 %	0 %	269793047
35064	NC_013522	C	6	6	1498096	1498101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35065	NC_013522	AT	3	6	1498124	1498129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35066	NC_013522	GCCCC	2	10	1498140	1498149	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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35069	NC_013522	GGC	2	6	1498357	1498362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793048
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35101	NC_013522	ATG	2	6	1499410	1499415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793049
35102	NC_013522	GGC	2	6	1499442	1499447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793049
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35106	NC_013522	ATGGCG	2	12	1499593	1499604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269793049
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35117	NC_013522	CCA	2	6	1500037	1500042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793050
35118	NC_013522	GGC	2	6	1500122	1500127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793050
35119	NC_013522	CTC	2	6	1500167	1500172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793050
35120	NC_013522	GGC	2	6	1500215	1500220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793050
35121	NC_013522	CCA	2	6	1500284	1500289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793050
35122	NC_013522	CTC	2	6	1500320	1500325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793050
35123	NC_013522	CTC	2	6	1500329	1500334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793050
35124	NC_013522	CTCC	2	8	1500389	1500396	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35125	NC_013522	GATC	2	8	1500436	1500443	25 %	25 %	25 %	25 %	269793051
35126	NC_013522	TCT	3	9	1500492	1500500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793051
35127	NC_013522	GCA	2	6	1500540	1500545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793051
35128	NC_013522	CTT	2	6	1500580	1500585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793051
35129	NC_013522	TCA	2	6	1500654	1500659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793051
35130	NC_013522	TCT	2	6	1500672	1500677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793051
35131	NC_013522	CTT	2	6	1500706	1500711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793051
35132	NC_013522	AGT	2	6	1500741	1500746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793051
35133	NC_013522	TGG	2	6	1500747	1500752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793051
35134	NC_013522	GGT	2	6	1500796	1500801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793051
35135	NC_013522	CA	3	6	1500822	1500827	50 %	0 %	0 %	50 %	269793051
35136	NC_013522	TGG	2	6	1500981	1500986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793051
35137	NC_013522	TCT	2	6	1501059	1501064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793051
35138	NC_013522	CAGC	2	8	1501069	1501076	25 %	0 %	25 %	50 %	269793051
35139	NC_013522	TCT	2	6	1501092	1501097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793051
35140	NC_013522	CTGG	2	8	1501159	1501166	0 %	25 %	50 %	25 %	269793051
35141	NC_013522	CTC	2	6	1501207	1501212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793051
35142	NC_013522	TCC	2	6	1501266	1501271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793051
35143	NC_013522	TCA	2	6	1501308	1501313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793051
35144	NC_013522	GCTT	2	8	1501314	1501321	0 %	50 %	25 %	25 %	269793051
35145	NC_013522	GCG	2	6	1501379	1501384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793051
35146	NC_013522	TC	3	6	1501432	1501437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35147	NC_013522	C	7	7	1501503	1501509	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35148	NC_013522	A	6	6	1501567	1501572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35149	NC_013522	CGA	2	6	1501644	1501649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35150	NC_013522	CGC	2	6	1501653	1501658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35151	NC_013522	GAC	2	6	1501728	1501733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35152	NC_013522	CGG	2	6	1501780	1501785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793052
35153	NC_013522	TGG	3	9	1501854	1501862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793052
35154	NC_013522	ACC	2	6	1501908	1501913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793052
35155	NC_013522	GAA	2	6	1502012	1502017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269793052
35156	NC_013522	GAT	2	6	1502038	1502043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793052
35157	NC_013522	CTT	2	6	1502086	1502091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793052
35158	NC_013522	CCG	2	6	1502098	1502103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793052
35159	NC_013522	G	6	6	1502142	1502147	0 %	0 %	100 %	0 %	269793052
35160	NC_013522	ACT	2	6	1502181	1502186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793052
35161	NC_013522	CTA	2	6	1502191	1502196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793052
35162	NC_013522	GGT	2	6	1502230	1502235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793052
35163	NC_013522	GGA	2	6	1502242	1502247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793052
35164	NC_013522	AGG	2	6	1502289	1502294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793052
35165	NC_013522	AGG	2	6	1502303	1502308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793052
35166	NC_013522	GGA	2	6	1502344	1502349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793052
35167	NC_013522	GCAAG	2	10	1502363	1502372	40 %	0 %	40 %	20 %	269793053
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35169	NC_013522	CTG	2	6	1502404	1502409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793053
35170	NC_013522	AGG	2	6	1502441	1502446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793053
35171	NC_013522	TCC	2	6	1502450	1502455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793053
35172	NC_013522	CCG	2	6	1502471	1502476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793053
35173	NC_013522	GGA	2	6	1502523	1502528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793053
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35178	NC_013522	CGG	2	6	1502763	1502768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793053
35179	NC_013522	CAAGGG	2	12	1502838	1502849	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	269793053
35180	NC_013522	GGT	2	6	1502859	1502864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793053
35181	NC_013522	GCCCA	2	10	1502983	1502992	20 %	0 %	20 %	60 %	269793053
35182	NC_013522	TCCCCC	2	12	1503079	1503090	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	269793053
35183	NC_013522	C	6	6	1503134	1503139	0 %	0 %	0 %	100 %	269793054
35184	NC_013522	AGG	2	6	1503163	1503168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793054
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35187	NC_013522	CCA	2	6	1503247	1503252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793054
35188	NC_013522	TGA	2	6	1503266	1503271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793054
35189	NC_013522	CCG	2	6	1503314	1503319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793054
35190	NC_013522	CGT	2	6	1503395	1503400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793054
35191	NC_013522	TCG	2	6	1503430	1503435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793054
35192	NC_013522	CCCCTG	2	12	1503519	1503530	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	269793054
35193	NC_013522	GGCT	2	8	1503567	1503574	0 %	25 %	50 %	25 %	269793054
35194	NC_013522	TCC	2	6	1503599	1503604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793054
35195	NC_013522	GGC	2	6	1503657	1503662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793054
35196	NC_013522	TCA	2	6	1503665	1503670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793054
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35198	NC_013522	CCA	2	6	1503734	1503739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793054
35199	NC_013522	TCC	2	6	1503751	1503756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793054
35200	NC_013522	GTA	2	6	1503768	1503773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793054
35201	NC_013522	CCT	2	6	1503839	1503844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793054
35202	NC_013522	GGA	2	6	1503878	1503883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793054
35203	NC_013522	CTC	2	6	1503910	1503915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793054
35204	NC_013522	CCT	3	9	1504001	1504009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793054
35205	NC_013522	CAT	2	6	1504023	1504028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793054
35206	NC_013522	CTC	2	6	1504029	1504034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793054
35207	NC_013522	TCA	2	6	1504133	1504138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793054
35208	NC_013522	CTCCA	2	10	1504206	1504215	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35209	NC_013522	C	6	6	1504222	1504227	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35210	NC_013522	GCC	2	6	1504256	1504261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35211	NC_013522	CCT	2	6	1504297	1504302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793055
35212	NC_013522	TGG	2	6	1504351	1504356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793055
35213	NC_013522	GGC	2	6	1504391	1504396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793055
35214	NC_013522	CCG	2	6	1504420	1504425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793055
35215	NC_013522	TGG	2	6	1504428	1504433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793055
35216	NC_013522	CTC	2	6	1504451	1504456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793055
35217	NC_013522	CGT	2	6	1504567	1504572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793055
35218	NC_013522	TGGGCC	2	12	1504575	1504586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269793055
35219	NC_013522	GGTC	2	8	1504636	1504643	0 %	25 %	50 %	25 %	269793055
35220	NC_013522	CCG	2	6	1504767	1504772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793055
35221	NC_013522	CCA	2	6	1504777	1504782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793055
35222	NC_013522	GCG	2	6	1504799	1504804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793055
35223	NC_013522	GGA	2	6	1504882	1504887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793055
35224	NC_013522	TCCC	2	8	1504947	1504954	0 %	25 %	0 %	75 %	269793055
35225	NC_013522	CAC	2	6	1504995	1505000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793055
35226	NC_013522	GTCCA	2	10	1505019	1505028	20 %	20 %	20 %	40 %	269793055
35227	NC_013522	CTC	2	6	1505075	1505080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793055
35228	NC_013522	CTC	2	6	1505087	1505092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793055
35229	NC_013522	AGG	2	6	1505100	1505105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793055
35230	NC_013522	CGT	2	6	1505158	1505163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793055
35231	NC_013522	ACC	2	6	1505199	1505204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793055
35232	NC_013522	GTC	2	6	1505213	1505218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793055
35233	NC_013522	GGC	2	6	1505231	1505236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793055
35234	NC_013522	C	6	6	1505295	1505300	0 %	0 %	0 %	100 %	269793055
35235	NC_013522	ATG	2	6	1505379	1505384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269793055
35236	NC_013522	TCG	2	6	1505400	1505405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793055
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35245	NC_013522	A	6	6	1505980	1505985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35351	NC_013522	GGA	2	6	1511315	1511320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793060
35352	NC_013522	TGC	2	6	1511333	1511338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793060
35353	NC_013522	AGC	2	6	1511362	1511367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793060
35354	NC_013522	CGG	2	6	1511383	1511388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793060
35355	NC_013522	CTC	2	6	1511403	1511408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793060
35356	NC_013522	GAG	2	6	1511427	1511432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793060
35357	NC_013522	CTCG	2	8	1511533	1511540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35358	NC_013522	C	6	6	1511561	1511566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35359	NC_013522	CAA	2	6	1511578	1511583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35360	NC_013522	GGA	2	6	1511683	1511688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793061
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35382	NC_013522	CTGC	2	8	1512328	1512335	0 %	25 %	25 %	50 %	269793061
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35407	NC_013522	AAC	2	6	1513469	1513474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35449	NC_013522	TGTA	2	8	1514982	1514989	25 %	50 %	25 %	0 %	269793063
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35453	NC_013522	C	6	6	1515150	1515155	0 %	0 %	0 %	100 %	269793063
35454	NC_013522	ACG	2	6	1515156	1515161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793063
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35456	NC_013522	CCA	2	6	1515256	1515261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793063
35457	NC_013522	G	6	6	1515358	1515363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35458	NC_013522	GGAGG	2	10	1515365	1515374	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35459	NC_013522	CAC	2	6	1515380	1515385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35460	NC_013522	ACT	2	6	1515403	1515408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793064
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35462	NC_013522	TCC	2	6	1515558	1515563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793064
35463	NC_013522	TTG	2	6	1515618	1515623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269793064
35464	NC_013522	GGT	2	6	1515634	1515639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793064
35465	NC_013522	C	6	6	1515643	1515648	0 %	0 %	0 %	100 %	269793064
35466	NC_013522	TCG	2	6	1515660	1515665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269793064
35467	NC_013522	CCT	2	6	1515670	1515675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793064
35468	NC_013522	CAC	2	6	1515725	1515730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793064
35469	NC_013522	TGG	2	6	1515775	1515780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793064
35470	NC_013522	CAT	2	6	1515902	1515907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269793064
35471	NC_013522	CCG	2	6	1515937	1515942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793064
35472	NC_013522	GAGG	2	8	1515983	1515990	25 %	0 %	75 %	0 %	269793064
35473	NC_013522	CGG	2	6	1515999	1516004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793064
35474	NC_013522	TGG	2	6	1516090	1516095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269793064
35475	NC_013522	C	6	6	1516146	1516151	0 %	0 %	0 %	100 %	269793064
35476	NC_013522	GGC	2	6	1516175	1516180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269793064
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35478	NC_013522	CCA	2	6	1516210	1516215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793064
35479	NC_013522	GCC	2	6	1516295	1516300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793064
35480	NC_013522	TCT	2	6	1516303	1516308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793064
35481	NC_013522	CTC	2	6	1516391	1516396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269793064
35482	NC_013522	CGC	2	6	1516397	1516402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269793064
35483	NC_013522	CCA	2	6	1516432	1516437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269793064
35484	NC_013522	AC	3	6	1516443	1516448	50 %	0 %	0 %	50 %	269793064
35485	NC_013522	TCCT	2	8	1516490	1516497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35486	NC_013522	CCT	2	6	1516571	1516576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35487	NC_013522	GA	3	6	1516646	1516651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35488	NC_013522	TCA	2	6	1516684	1516689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35489	NC_013522	CCA	2	6	1516782	1516787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35490	NC_013522	A	6	6	1516798	1516803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35491	NC_013522	TAAG	2	8	1516814	1516821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35492	NC_013522	GAG	2	6	1516822	1516827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35493	NC_013522	TCGG	2	8	1516877	1516884	0 %	25 %	50 %	25 %	269793065
35494	NC_013522	CCGGC	2	10	1516895	1516904	0 %	0 %	40 %	60 %	269793065
35495	NC_013522	AGG	2	6	1516906	1516911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793065
35496	NC_013522	TCT	2	6	1516943	1516948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269793065
35497	NC_013522	CGA	2	6	1516952	1516957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793065
35498	NC_013522	AGG	2	6	1516981	1516986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793065
35499	NC_013522	ACG	2	6	1516990	1516995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269793065
35500	NC_013522	GGA	2	6	1517042	1517047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269793065

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