MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 43188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29119	NC_013522	CAC	2	6	1253874	1253879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792814
29120	NC_013522	CCA	2	6	1253891	1253896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792814
29121	NC_013522	ACCG	2	8	1253902	1253909	25 %	0 %	25 %	50 %	269792814
29122	NC_013522	TCC	2	6	1253911	1253916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792814
29123	NC_013522	TCT	3	9	1253936	1253944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792814
29124	NC_013522	TCCT	2	8	1253983	1253990	0 %	50 %	0 %	50 %	269792814
29125	NC_013522	CAT	2	6	1254000	1254005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792814
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29127	NC_013522	GCC	2	6	1254084	1254089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792814
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29129	NC_013522	TCT	2	6	1254141	1254146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792815
29130	NC_013522	TCA	2	6	1254179	1254184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792815
29131	NC_013522	G	6	6	1254186	1254191	0 %	0 %	100 %	0 %	269792815
29132	NC_013522	CCT	2	6	1254201	1254206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792815
29133	NC_013522	GCC	2	6	1254245	1254250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792815
29134	NC_013522	C	6	6	1254279	1254284	0 %	0 %	0 %	100 %	269792815
29135	NC_013522	GGA	2	6	1254289	1254294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792815
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29143	NC_013522	TCG	2	6	1254515	1254520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792815
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29148	NC_013522	GCG	2	6	1254659	1254664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792815
29149	NC_013522	CCA	2	6	1254732	1254737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792815
29150	NC_013522	CCA	2	6	1254741	1254746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792815
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29152	NC_013522	CCA	2	6	1254819	1254824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792815
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29154	NC_013522	CCCAC	2	10	1254881	1254890	20 %	0 %	0 %	80 %	269792815
29155	NC_013522	CAC	2	6	1254904	1254909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792815
29156	NC_013522	C	6	6	1254932	1254937	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29157	NC_013522	ACC	2	6	1254968	1254973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792816
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29162	NC_013522	CCT	2	6	1255098	1255103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792816
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29167	NC_013522	C	6	6	1255215	1255220	0 %	0 %	0 %	100 %	269792816
29168	NC_013522	CCT	2	6	1255305	1255310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792816
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29174	NC_013522	CCT	2	6	1255602	1255607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792817
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29177	NC_013522	G	6	6	1255730	1255735	0 %	0 %	100 %	0 %	269792817
29178	NC_013522	GCCA	2	8	1255794	1255801	25 %	0 %	25 %	50 %	269792817
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29182	NC_013522	G	6	6	1255916	1255921	0 %	0 %	100 %	0 %	269792817
29183	NC_013522	CGG	2	6	1255922	1255927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792817
29184	NC_013522	GCG	2	6	1255937	1255942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792817
29185	NC_013522	GGC	2	6	1255968	1255973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792817
29186	NC_013522	AGT	2	6	1256027	1256032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792817
29187	NC_013522	CCCCCA	2	12	1256138	1256149	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	269792817
29188	NC_013522	GAG	2	6	1256166	1256171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792817
29189	NC_013522	TCT	2	6	1256264	1256269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792817
29190	NC_013522	CAG	2	6	1256272	1256277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792817
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29196	NC_013522	TCA	2	6	1256420	1256425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792817
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29198	NC_013522	GGA	2	6	1256466	1256471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792817
29199	NC_013522	GAG	2	6	1256509	1256514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792817
29200	NC_013522	CCA	2	6	1256552	1256557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792817
29201	NC_013522	C	6	6	1256561	1256566	0 %	0 %	0 %	100 %	269792817
29202	NC_013522	AGCC	2	8	1256589	1256596	25 %	0 %	25 %	50 %	269792817
29203	NC_013522	CAGGGT	2	12	1256613	1256624	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269792817
29204	NC_013522	TCCACC	2	12	1256686	1256697	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	269792817
29205	NC_013522	CCT	2	6	1256699	1256704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792817
29206	NC_013522	CTC	3	9	1256724	1256732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792817
29207	NC_013522	C	7	7	1256768	1256774	0 %	0 %	0 %	100 %	269792817
29208	NC_013522	TCC	2	6	1256797	1256802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792817
29209	NC_013522	CAC	2	6	1256835	1256840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792817
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29211	NC_013522	TCC	2	6	1256914	1256919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792817
29212	NC_013522	CCA	2	6	1256930	1256935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792817
29213	NC_013522	CTC	2	6	1256994	1256999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792817
29214	NC_013522	CCT	2	6	1257002	1257007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792817
29215	NC_013522	AGG	2	6	1257049	1257054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792817
29216	NC_013522	GTC	2	6	1257075	1257080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792817
29217	NC_013522	TTA	2	6	1257158	1257163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269792817
29218	NC_013522	G	7	7	1257172	1257178	0 %	0 %	100 %	0 %	269792817
29219	NC_013522	C	6	6	1257258	1257263	0 %	0 %	0 %	100 %	269792817
29220	NC_013522	CAG	2	6	1257267	1257272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792817
29221	NC_013522	AGG	2	6	1257277	1257282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792817
29222	NC_013522	CCA	2	6	1257284	1257289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792817
29223	NC_013522	GCT	2	6	1257411	1257416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792818
29224	NC_013522	C	6	6	1257453	1257458	0 %	0 %	0 %	100 %	269792818
29225	NC_013522	ACC	2	6	1257473	1257478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792818
29226	NC_013522	CAC	2	6	1257508	1257513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792818
29227	NC_013522	G	6	6	1257522	1257527	0 %	0 %	100 %	0 %	269792818
29228	NC_013522	CAC	2	6	1257607	1257612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792818
29229	NC_013522	GGC	2	6	1257652	1257657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792818
29230	NC_013522	GAA	2	6	1257718	1257723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792818
29231	NC_013522	GAA	2	6	1257739	1257744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792818
29232	NC_013522	GAT	2	6	1257787	1257792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792818
29233	NC_013522	CGTC	2	8	1257802	1257809	0 %	25 %	25 %	50 %	269792819
29234	NC_013522	C	6	6	1257882	1257887	0 %	0 %	0 %	100 %	269792819
29235	NC_013522	G	6	6	1257930	1257935	0 %	0 %	100 %	0 %	269792819
29236	NC_013522	C	6	6	1257943	1257948	0 %	0 %	0 %	100 %	269792819
29237	NC_013522	CCA	3	9	1258064	1258072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792819
29238	NC_013522	CCA	2	6	1258076	1258081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792819
29239	NC_013522	CGG	2	6	1258091	1258096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792819
29240	NC_013522	CAG	2	6	1258098	1258103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792819
29241	NC_013522	CAG	2	6	1258111	1258116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792819
29242	NC_013522	CCA	2	6	1258145	1258150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792819
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29244	NC_013522	GAG	2	6	1258263	1258268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792819
29245	NC_013522	ACC	2	6	1258269	1258274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792819
29246	NC_013522	C	7	7	1258273	1258279	0 %	0 %	0 %	100 %	269792819
29247	NC_013522	CGA	2	6	1258296	1258301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792819
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29249	NC_013522	CT	3	6	1258372	1258377	0 %	50 %	0 %	50 %	269792819
29250	NC_013522	GGGC	2	8	1258421	1258428	0 %	0 %	75 %	25 %	269792819
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29261	NC_013522	GCC	2	6	1259134	1259139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792820
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29266	NC_013522	CCT	2	6	1259229	1259234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792820
29267	NC_013522	CCA	2	6	1259259	1259264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792820
29268	NC_013522	CTT	2	6	1259269	1259274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792820
29269	NC_013522	C	6	6	1259339	1259344	0 %	0 %	0 %	100 %	269792820
29270	NC_013522	TGC	2	6	1259408	1259413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792820
29271	NC_013522	ATC	2	6	1259453	1259458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792820
29272	NC_013522	ACC	2	6	1259570	1259575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792820
29273	NC_013522	TCC	2	6	1259606	1259611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792820
29274	NC_013522	GAA	2	6	1259614	1259619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792820
29275	NC_013522	CAT	2	6	1259724	1259729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29278	NC_013522	C	7	7	1259883	1259889	0 %	0 %	0 %	100 %	269792821
29279	NC_013522	GGTC	2	8	1259895	1259902	0 %	25 %	50 %	25 %	269792821
29280	NC_013522	CCA	2	6	1259964	1259969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792821
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29282	NC_013522	TCACCC	2	12	1260009	1260020	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	269792821
29283	NC_013522	CTC	2	6	1260049	1260054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792821
29284	NC_013522	CCT	2	6	1260084	1260089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792821
29285	NC_013522	CCA	2	6	1260123	1260128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792821
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29290	NC_013522	C	6	6	1260314	1260319	0 %	0 %	0 %	100 %	269792821
29291	NC_013522	CCCT	2	8	1260395	1260402	0 %	25 %	0 %	75 %	269792822
29292	NC_013522	CAC	2	6	1260480	1260485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792822
29293	NC_013522	CGT	2	6	1260518	1260523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792822
29294	NC_013522	CGG	2	6	1260543	1260548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792822
29295	NC_013522	ACC	2	6	1260613	1260618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792822
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29299	NC_013522	TGG	2	6	1260787	1260792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792822
29300	NC_013522	CAC	2	6	1260828	1260833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792822
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29302	NC_013522	CCGG	2	8	1261037	1261044	0 %	0 %	50 %	50 %	269792823
29303	NC_013522	AGA	2	6	1261097	1261102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792823
29304	NC_013522	GCA	2	6	1261218	1261223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792823
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29306	NC_013522	CCT	2	6	1261280	1261285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792823
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29309	NC_013522	CCA	2	6	1261412	1261417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792823
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29315	NC_013522	GCT	2	6	1261623	1261628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792823
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29318	NC_013522	CTG	2	6	1261911	1261916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792823
29319	NC_013522	CCG	2	6	1261968	1261973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792823
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29322	NC_013522	GCCA	2	8	1262017	1262024	25 %	0 %	25 %	50 %	269792823
29323	NC_013522	GGT	2	6	1262082	1262087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792823
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29329	NC_013522	GCCG	2	8	1262300	1262307	0 %	0 %	50 %	50 %	269792823
29330	NC_013522	CTC	2	6	1262328	1262333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792823
29331	NC_013522	TAT	2	6	1262370	1262375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269792823
29332	NC_013522	CTT	2	6	1262394	1262399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792823
29333	NC_013522	GTA	2	6	1262421	1262426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792823
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29336	NC_013522	CCG	2	6	1262553	1262558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792823
29337	NC_013522	TGT	2	6	1262579	1262584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269792823
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29339	NC_013522	TCC	2	6	1262671	1262676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792823
29340	NC_013522	CCA	2	6	1262717	1262722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792823
29341	NC_013522	TCC	2	6	1262758	1262763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792823
29342	NC_013522	TCC	2	6	1262779	1262784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792823
29343	NC_013522	CGT	2	6	1262789	1262794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792823
29344	NC_013522	GGA	2	6	1262795	1262800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792823
29345	NC_013522	GCC	2	6	1262803	1262808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792823
29346	NC_013522	GCC	2	6	1262848	1262853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792823
29347	NC_013522	CGC	2	6	1262882	1262887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792823
29348	NC_013522	GCT	2	6	1262897	1262902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792823
29349	NC_013522	GCG	2	6	1262917	1262922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792823
29350	NC_013522	TCA	2	6	1262945	1262950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792823
29351	NC_013522	CCTG	2	8	1262954	1262961	0 %	25 %	25 %	50 %	269792823
29352	NC_013522	CGA	2	6	1263012	1263017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792823
29353	NC_013522	TCC	2	6	1263028	1263033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792823
29354	NC_013522	GCC	2	6	1263038	1263043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792823
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29467	NC_013522	TCC	2	6	1267507	1267512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29468	NC_013522	TGG	2	6	1267516	1267521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29469	NC_013522	CTT	2	6	1267541	1267546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792828
29470	NC_013522	CTC	2	6	1267547	1267552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792828
29471	NC_013522	CTT	2	6	1267559	1267564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792828
29472	NC_013522	GAT	2	6	1267655	1267660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792828
29473	NC_013522	GTC	2	6	1267667	1267672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792828
29474	NC_013522	GAA	2	6	1267694	1267699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792828
29475	NC_013522	CGG	2	6	1267705	1267710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792828
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29477	NC_013522	C	6	6	1267723	1267728	0 %	0 %	0 %	100 %	269792828
29478	NC_013522	CTT	3	9	1267766	1267774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792828
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29481	NC_013522	CTG	3	9	1267847	1267855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792828
29482	NC_013522	CCT	2	6	1267872	1267877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29483	NC_013522	T	6	6	1267883	1267888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29484	NC_013522	TGCG	2	8	1267901	1267908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29485	NC_013522	AAG	3	9	1267980	1267988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792829
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29495	NC_013522	CTGG	2	8	1268456	1268463	0 %	25 %	50 %	25 %	269792829
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29497	NC_013522	ACC	2	6	1268502	1268507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792829
29498	NC_013522	CTC	2	6	1268516	1268521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792829
29499	NC_013522	GCT	2	6	1268527	1268532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792829
29500	NC_013522	GTA	2	6	1268543	1268548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792829

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