MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 43188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_013522	GCCAAG	3	18	635829	635846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792214
15002	NC_013522	ACC	2	6	635866	635871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792214
15003	NC_013522	CCTTC	2	10	635876	635885	0 %	40 %	0 %	60 %	269792214
15004	NC_013522	GAG	2	6	635886	635891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792214
15005	NC_013522	G	8	8	635899	635906	0 %	0 %	100 %	0 %	269792214
15006	NC_013522	CGG	2	6	635950	635955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792214
15007	NC_013522	GAT	2	6	635957	635962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792214
15008	NC_013522	CGG	3	9	635976	635984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792214
15009	NC_013522	TCC	2	6	636000	636005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792214
15010	NC_013522	GGT	2	6	636017	636022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792214
15011	NC_013522	CCG	2	6	636025	636030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792214
15012	NC_013522	G	6	6	636058	636063	0 %	0 %	100 %	0 %	269792214
15013	NC_013522	G	6	6	636122	636127	0 %	0 %	100 %	0 %	269792214
15014	NC_013522	GGA	2	6	636158	636163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792214
15015	NC_013522	TCGAT	2	10	636184	636193	20 %	40 %	20 %	20 %	269792214
15016	NC_013522	TTGG	2	8	636226	636233	0 %	50 %	50 %	0 %	269792215
15017	NC_013522	GTG	2	6	636278	636283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792215
15018	NC_013522	TCC	2	6	636302	636307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792215
15019	NC_013522	TTC	2	6	636308	636313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792215
15020	NC_013522	GGT	3	9	636328	636336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792215
15021	NC_013522	C	6	6	636338	636343	0 %	0 %	0 %	100 %	269792215
15022	NC_013522	CCT	2	6	636412	636417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792215
15023	NC_013522	ACT	2	6	636432	636437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792215
15024	NC_013522	CTT	2	6	636463	636468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792215
15025	NC_013522	TTC	2	6	636527	636532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792215
15026	NC_013522	CCGG	2	8	636561	636568	0 %	0 %	50 %	50 %	269792215
15027	NC_013522	GGT	2	6	636577	636582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792215
15028	NC_013522	TCCC	2	8	636596	636603	0 %	25 %	0 %	75 %	269792215
15029	NC_013522	CCT	2	6	636744	636749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792215
15030	NC_013522	TGG	2	6	636765	636770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792215
15031	NC_013522	GCCTAC	2	12	636785	636796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269792215
15032	NC_013522	GTC	2	6	636808	636813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792215
15033	NC_013522	TGGCCC	2	12	636857	636868	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269792216
15034	NC_013522	CTC	2	6	636885	636890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792216
15035	NC_013522	C	7	7	636923	636929	0 %	0 %	0 %	100 %	269792216
15036	NC_013522	G	6	6	636949	636954	0 %	0 %	100 %	0 %	269792216
15037	NC_013522	AGG	2	6	636992	636997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792216
15038	NC_013522	GGA	2	6	637014	637019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792216
15039	NC_013522	GAT	2	6	637116	637121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792216
15040	NC_013522	GGAG	2	8	637166	637173	25 %	0 %	75 %	0 %	269792216
15041	NC_013522	GGC	2	6	637230	637235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792216
15042	NC_013522	GCG	2	6	637240	637245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792216
15043	NC_013522	G	6	6	637294	637299	0 %	0 %	100 %	0 %	269792216
15044	NC_013522	CGG	2	6	637326	637331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792216
15045	NC_013522	CGGAC	2	10	637473	637482	20 %	0 %	40 %	40 %	269792216
15046	NC_013522	ACT	2	6	637505	637510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792216
15047	NC_013522	GGC	2	6	637556	637561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792216
15048	NC_013522	GGA	2	6	637587	637592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792216
15049	NC_013522	G	7	7	637635	637641	0 %	0 %	100 %	0 %	269792216
15050	NC_013522	GGTG	2	8	637700	637707	0 %	25 %	75 %	0 %	269792216
15051	NC_013522	GAG	2	6	637708	637713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792216
15052	NC_013522	CGC	2	6	637719	637724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792216
15053	NC_013522	GGGAG	2	10	637736	637745	20 %	0 %	80 %	0 %	269792216
15054	NC_013522	TGG	2	6	637765	637770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792216
15055	NC_013522	CTGG	2	8	637803	637810	0 %	25 %	50 %	25 %	269792216
15056	NC_013522	TCC	2	6	637819	637824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792216
15057	NC_013522	C	6	6	637823	637828	0 %	0 %	0 %	100 %	269792216
15058	NC_013522	CTT	2	6	637932	637937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792217
15059	NC_013522	G	6	6	637982	637987	0 %	0 %	100 %	0 %	269792217
15060	NC_013522	CCA	2	6	637994	637999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792217
15061	NC_013522	TGG	2	6	638078	638083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792217
15062	NC_013522	GGT	2	6	638090	638095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792217
15063	NC_013522	GCT	2	6	638102	638107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792217
15064	NC_013522	GCAGG	2	10	638124	638133	20 %	0 %	60 %	20 %	269792217
15065	NC_013522	CAC	2	6	638157	638162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792217
15066	NC_013522	ACG	2	6	638234	638239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792217
15067	NC_013522	CGT	2	6	638249	638254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792217
15068	NC_013522	C	6	6	638366	638371	0 %	0 %	0 %	100 %	269792217
15069	NC_013522	GAGACC	2	12	638437	638448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792217
15070	NC_013522	GGAG	2	8	638462	638469	25 %	0 %	75 %	0 %	269792217
15071	NC_013522	CTC	2	6	638496	638501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792217
15072	NC_013522	CTC	2	6	638520	638525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792217
15073	NC_013522	CGGG	2	8	638574	638581	0 %	0 %	75 %	25 %	269792217
15074	NC_013522	C	6	6	638642	638647	0 %	0 %	0 %	100 %	269792217
15075	NC_013522	CGT	2	6	638666	638671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792217
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15077	NC_013522	CTCTCC	2	12	638713	638724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792217
15078	NC_013522	CCCT	2	8	638761	638768	0 %	25 %	0 %	75 %	269792217
15079	NC_013522	GTT	2	6	638784	638789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269792217
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15083	NC_013522	CGG	3	9	638858	638866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792217
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15085	NC_013522	CGGT	2	8	639025	639032	0 %	25 %	50 %	25 %	269792217
15086	NC_013522	CCT	2	6	639066	639071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792217
15087	NC_013522	CCAGG	2	10	639123	639132	20 %	0 %	40 %	40 %	269792217
15088	NC_013522	GAG	2	6	639147	639152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792217
15089	NC_013522	G	6	6	639174	639179	0 %	0 %	100 %	0 %	269792217
15090	NC_013522	TCC	2	6	639211	639216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792217
15091	NC_013522	TTG	2	6	639379	639384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269792217
15092	NC_013522	CCA	2	6	639467	639472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792217
15093	NC_013522	GGA	2	6	639473	639478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792217
15094	NC_013522	CCA	2	6	639488	639493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792217
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15099	NC_013522	CCTT	3	12	639778	639789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15100	NC_013522	GCG	2	6	639795	639800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_013522	A	6	6	639810	639815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_013522	GAG	3	9	639952	639960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_013522	CGG	2	6	639988	639993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792218
15104	NC_013522	TGA	2	6	640011	640016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792218
15105	NC_013522	GGA	2	6	640023	640028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792218
15106	NC_013522	C	6	6	640033	640038	0 %	0 %	0 %	100 %	269792218
15107	NC_013522	GGT	2	6	640098	640103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792218
15108	NC_013522	GAA	2	6	640110	640115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792218
15109	NC_013522	GAG	2	6	640135	640140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792218
15110	NC_013522	TGA	2	6	640178	640183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792218
15111	NC_013522	TGA	2	6	640289	640294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792218
15112	NC_013522	ACA	2	6	640298	640303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269792218
15113	NC_013522	GT	3	6	640366	640371	0 %	50 %	50 %	0 %	269792218
15114	NC_013522	TGA	2	6	640415	640420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792218
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15117	NC_013522	GTGG	2	8	640598	640605	0 %	25 %	75 %	0 %	269792218
15118	NC_013522	TCC	2	6	640720	640725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792218
15119	NC_013522	G	6	6	640731	640736	0 %	0 %	100 %	0 %	269792218
15120	NC_013522	GCG	2	6	640742	640747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792218
15121	NC_013522	GGC	2	6	640758	640763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792218
15122	NC_013522	CAG	2	6	640806	640811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792218
15123	NC_013522	CTC	2	6	640851	640856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792218
15124	NC_013522	G	6	6	641022	641027	0 %	0 %	100 %	0 %	269792218
15125	NC_013522	CTC	2	6	641068	641073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792218
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15129	NC_013522	G	6	6	641156	641161	0 %	0 %	100 %	0 %	269792218
15130	NC_013522	CTT	2	6	641166	641171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792218
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15132	NC_013522	GAC	2	6	641242	641247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792218
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15153	NC_013522	G	6	6	642012	642017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15154	NC_013522	T	6	6	642030	642035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15155	NC_013522	TGA	2	6	642081	642086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15156	NC_013522	G	6	6	642096	642101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15157	NC_013522	CCG	2	6	642104	642109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792219
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15164	NC_013522	CGCA	2	8	642502	642509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15165	NC_013522	CGC	2	6	642593	642598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792220
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15190	NC_013522	G	6	6	643788	643793	0 %	0 %	100 %	0 %	269792222
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15222	NC_013522	CTGGC	2	10	645349	645358	0 %	20 %	40 %	40 %	269792224
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15228	NC_013522	GTC	2	6	645705	645710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792224
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15232	NC_013522	GGGAG	2	10	645796	645805	20 %	0 %	80 %	0 %	269792224
15233	NC_013522	TGG	2	6	645806	645811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792224
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15237	NC_013522	GGCCCT	2	12	645927	645938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269792224
15238	NC_013522	GGA	2	6	645954	645959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792224
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15240	NC_013522	ATG	2	6	646006	646011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792224
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15242	NC_013522	GGC	2	6	646047	646052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792224
15243	NC_013522	TGG	2	6	646148	646153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792224
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15363	NC_013522	CGG	2	6	650531	650536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792228
15364	NC_013522	GTG	2	6	650537	650542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792228
15365	NC_013522	GGA	2	6	650610	650615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792228
15366	NC_013522	GGC	2	6	650659	650664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792228
15367	NC_013522	G	6	6	650686	650691	0 %	0 %	100 %	0 %	269792228
15368	NC_013522	TGG	3	9	650821	650829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792229
15369	NC_013522	GGC	2	6	650846	650851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792229
15370	NC_013522	ACT	2	6	650863	650868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792229
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15372	NC_013522	GGC	2	6	650930	650935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792229
15373	NC_013522	ATCC	2	8	650938	650945	25 %	25 %	0 %	50 %	269792229
15374	NC_013522	GGGGAC	2	12	650967	650978	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269792229
15375	NC_013522	G	7	7	650990	650996	0 %	0 %	100 %	0 %	269792229
15376	NC_013522	GAG	2	6	651017	651022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792229
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15384	NC_013522	CAA	2	6	651302	651307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269792229
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15387	NC_013522	GAG	2	6	651522	651527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792229
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15389	NC_013522	CGGTT	2	10	651587	651596	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15390	NC_013522	AGG	2	6	651621	651626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15391	NC_013522	ATC	2	6	651629	651634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15392	NC_013522	TCC	2	6	651713	651718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792230
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15400	NC_013522	TGG	2	6	652002	652007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792230
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15404	NC_013522	TTGC	2	8	652126	652133	0 %	50 %	25 %	25 %	269792231
15405	NC_013522	CTG	2	6	652156	652161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792231
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15413	NC_013522	CCCCG	2	10	652499	652508	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15414	NC_013522	CAG	2	6	652575	652580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792232
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15419	NC_013522	CGT	2	6	653119	653124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792233
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15422	NC_013522	GTGG	2	8	653267	653274	0 %	25 %	75 %	0 %	269792233
15423	NC_013522	GAT	2	6	653348	653353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792233
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15446	NC_013522	GTG	3	9	654415	654423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15464	NC_013522	GTCA	2	8	655172	655179	25 %	25 %	25 %	25 %	269792234
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15469	NC_013522	GTG	2	6	655301	655306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792234
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15472	NC_013522	G	7	7	655371	655377	0 %	0 %	100 %	0 %	269792234
15473	NC_013522	GGAT	2	8	655413	655420	25 %	25 %	50 %	0 %	269792234
15474	NC_013522	CTTG	2	8	655438	655445	0 %	50 %	25 %	25 %	269792234
15475	NC_013522	GGA	2	6	655465	655470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792234
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15479	NC_013522	GAT	2	6	655567	655572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792235
15480	NC_013522	TAGGGA	2	12	655579	655590	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	269792235
15481	NC_013522	GGA	3	9	655603	655611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792235
15482	NC_013522	ACG	2	6	655635	655640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792235
15483	NC_013522	CCG	2	6	655731	655736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792235
15484	NC_013522	CGG	2	6	655740	655745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792235
15485	NC_013522	GTC	2	6	655789	655794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792235
15486	NC_013522	AGG	2	6	655806	655811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792235
15487	NC_013522	CGG	2	6	655911	655916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792235
15488	NC_013522	GAG	2	6	655937	655942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792235
15489	NC_013522	AGGG	2	8	655958	655965	25 %	0 %	75 %	0 %	269792235
15490	NC_013522	CTG	2	6	655997	656002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792235
15491	NC_013522	GGC	2	6	656003	656008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792235
15492	NC_013522	GCCC	2	8	656020	656027	0 %	0 %	25 %	75 %	269792235
15493	NC_013522	TA	3	6	656074	656079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15494	NC_013522	ACC	2	6	656145	656150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792236
15495	NC_013522	TG	3	6	656157	656162	0 %	50 %	50 %	0 %	269792236
15496	NC_013522	AGG	2	6	656170	656175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792236
15497	NC_013522	ACA	2	6	656179	656184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269792236
15498	NC_013522	ACC	2	6	656217	656222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792236
15499	NC_013522	GGT	2	6	656228	656233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792236
15500	NC_013522	TGG	2	6	656260	656265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792236

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