MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 43188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_013522	ATC	2	6	593332	593337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792170
14003	NC_013522	CAC	2	6	593349	593354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792170
14004	NC_013522	GCC	4	12	593404	593415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792170
14005	NC_013522	CTC	2	6	593418	593423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14006	NC_013522	GGC	2	6	593430	593435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792170
14007	NC_013522	CGT	2	6	593450	593455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792170
14008	NC_013522	GTC	2	6	593523	593528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792170
14009	NC_013522	CTC	2	6	593565	593570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14010	NC_013522	G	6	6	593585	593590	0 %	0 %	100 %	0 %	269792170
14011	NC_013522	TCC	2	6	593599	593604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14012	NC_013522	CCT	2	6	593606	593611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14013	NC_013522	GCC	2	6	593614	593619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792170
14014	NC_013522	CTC	2	6	593628	593633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14015	NC_013522	CCT	2	6	593648	593653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14016	NC_013522	CAA	2	6	593657	593662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269792170
14017	NC_013522	CGCC	2	8	593684	593691	0 %	0 %	25 %	75 %	269792170
14018	NC_013522	GGC	2	6	593694	593699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792170
14019	NC_013522	GGC	2	6	593706	593711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792170
14020	NC_013522	CAG	2	6	593721	593726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792170
14021	NC_013522	TGG	2	6	593753	593758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792170
14022	NC_013522	CAC	2	6	593853	593858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792170
14023	NC_013522	CTC	2	6	593859	593864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14024	NC_013522	CCTG	2	8	593867	593874	0 %	25 %	25 %	50 %	269792170
14025	NC_013522	GCC	2	6	593908	593913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792170
14026	NC_013522	GCC	2	6	593938	593943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792170
14027	NC_013522	CCT	2	6	593963	593968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14028	NC_013522	TCC	2	6	594049	594054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
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14030	NC_013522	GCC	2	6	594082	594087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792170
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14032	NC_013522	CGG	3	9	594101	594109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792170
14033	NC_013522	CGGTG	2	10	594197	594206	0 %	20 %	60 %	20 %	269792170
14034	NC_013522	CCTC	2	8	594215	594222	0 %	25 %	0 %	75 %	269792170
14035	NC_013522	CTT	2	6	594267	594272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792170
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14040	NC_013522	GAA	2	6	594459	594464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792170
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14042	NC_013522	AGT	2	6	594491	594496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792170
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14044	NC_013522	CCGCC	2	10	594528	594537	0 %	0 %	20 %	80 %	269792170
14045	NC_013522	ATC	2	6	594592	594597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792170
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14047	NC_013522	AGG	2	6	594671	594676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792170
14048	NC_013522	TGA	2	6	594767	594772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792170
14049	NC_013522	CCG	2	6	594778	594783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792170
14050	NC_013522	TCC	2	6	594823	594828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792170
14051	NC_013522	CGT	2	6	594863	594868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792170
14052	NC_013522	CGC	2	6	594890	594895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792170
14053	NC_013522	GTC	3	9	594996	595004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792170
14054	NC_013522	CAGCGT	2	12	595056	595067	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269792170
14055	NC_013522	GCTG	2	8	595073	595080	0 %	25 %	50 %	25 %	269792170
14056	NC_013522	GTT	2	6	595104	595109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269792170
14057	NC_013522	ATC	2	6	595114	595119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792170
14058	NC_013522	CCA	2	6	595172	595177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792170
14059	NC_013522	CCA	2	6	595181	595186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792170
14060	NC_013522	CTT	2	6	595230	595235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792170
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14062	NC_013522	TA	3	6	595298	595303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_013522	GGC	2	6	595515	595520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792171
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14074	NC_013522	TCC	2	6	595997	596002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792171
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14078	NC_013522	GCCC	2	8	596204	596211	0 %	0 %	25 %	75 %	269792171
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14089	NC_013522	CGG	2	6	596682	596687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792171
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14093	NC_013522	C	6	6	596811	596816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14094	NC_013522	G	6	6	596850	596855	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_013522	TCTTG	2	10	596901	596910	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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14102	NC_013522	CAC	2	6	597196	597201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792172
14103	NC_013522	AGA	2	6	597221	597226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269792172
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14105	NC_013522	C	6	6	597256	597261	0 %	0 %	0 %	100 %	269792172
14106	NC_013522	G	6	6	597336	597341	0 %	0 %	100 %	0 %	269792172
14107	NC_013522	TCC	2	6	597455	597460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792172
14108	NC_013522	TAT	2	6	597505	597510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269792172
14109	NC_013522	TG	3	6	597550	597555	0 %	50 %	50 %	0 %	269792172
14110	NC_013522	CCA	2	6	597570	597575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792172
14111	NC_013522	CCCT	2	8	597587	597594	0 %	25 %	0 %	75 %	269792172
14112	NC_013522	AGG	2	6	597596	597601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792172
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14116	NC_013522	C	6	6	597704	597709	0 %	0 %	0 %	100 %	269792172
14117	NC_013522	CGG	2	6	597711	597716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792172
14118	NC_013522	C	7	7	597726	597732	0 %	0 %	0 %	100 %	269792172
14119	NC_013522	C	6	6	597744	597749	0 %	0 %	0 %	100 %	269792172
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14121	NC_013522	ACC	2	6	597800	597805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792172
14122	NC_013522	TAA	2	6	597834	597839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_013522	CAT	2	6	597847	597852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_013522	TTG	2	6	597867	597872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_013522	G	6	6	597949	597954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_013522	GGCG	2	8	597993	598000	0 %	0 %	75 %	25 %	269792173
14127	NC_013522	TGA	2	6	598070	598075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792173
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14130	NC_013522	TGG	2	6	598154	598159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792173
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14134	NC_013522	CAT	3	9	598317	598325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792173
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14145	NC_013522	GGT	2	6	598767	598772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792173
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14152	NC_013522	GGT	2	6	598997	599002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14153	NC_013522	TGG	2	6	599131	599136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792174
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14240	NC_013522	CAG	2	6	603446	603451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792177
14241	NC_013522	GCC	2	6	603498	603503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792177
14242	NC_013522	GCT	2	6	603544	603549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792177
14243	NC_013522	CATC	2	8	603643	603650	25 %	25 %	0 %	50 %	269792177
14244	NC_013522	ACG	3	9	603774	603782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792178
14245	NC_013522	ATG	3	9	603791	603799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792178
14246	NC_013522	GGT	2	6	603838	603843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792178
14247	NC_013522	CGG	2	6	603927	603932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792178
14248	NC_013522	GAC	2	6	603971	603976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269792178
14249	NC_013522	CGGTC	2	10	604000	604009	0 %	20 %	40 %	40 %	269792178
14250	NC_013522	GAG	2	6	604013	604018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792178
14251	NC_013522	TCA	2	6	604056	604061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792178
14252	NC_013522	TGGCCA	2	12	604125	604136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269792178
14253	NC_013522	G	6	6	604186	604191	0 %	0 %	100 %	0 %	269792178
14254	NC_013522	CGG	2	6	604221	604226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792178
14255	NC_013522	GGC	2	6	604252	604257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792178
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14257	NC_013522	TCC	2	6	604271	604276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792178
14258	NC_013522	TGA	2	6	604290	604295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792178
14259	NC_013522	TTC	2	6	604400	604405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269792178
14260	NC_013522	AGG	3	9	604416	604424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792178
14261	NC_013522	C	7	7	604442	604448	0 %	0 %	0 %	100 %	269792178
14262	NC_013522	CAC	2	6	604459	604464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792178
14263	NC_013522	TGC	2	6	604556	604561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792178
14264	NC_013522	ACT	2	6	604563	604568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792178
14265	NC_013522	CTG	2	6	604637	604642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792178
14266	NC_013522	GATC	2	8	604674	604681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14267	NC_013522	CCT	2	6	604754	604759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792179
14268	NC_013522	TCA	2	6	604811	604816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792179
14269	NC_013522	CCT	2	6	604856	604861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792179
14270	NC_013522	CGTC	2	8	604906	604913	0 %	25 %	25 %	50 %	269792179
14271	NC_013522	TCCGC	2	10	604964	604973	0 %	20 %	20 %	60 %	269792179
14272	NC_013522	GAG	2	6	604992	604997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792179
14273	NC_013522	CGCC	2	8	605072	605079	0 %	0 %	25 %	75 %	269792179
14274	NC_013522	CCG	2	6	605149	605154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792179
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14279	NC_013522	TCA	2	6	605498	605503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792180
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14296	NC_013522	GGA	2	6	606204	606209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14297	NC_013522	C	7	7	606219	606225	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14298	NC_013522	CATGAC	2	12	606233	606244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14299	NC_013522	G	7	7	606246	606252	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14300	NC_013522	C	6	6	606358	606363	0 %	0 %	0 %	100 %	269792181
14301	NC_013522	GCG	2	6	606420	606425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792181
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14308	NC_013522	GCC	2	6	606680	606685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792181
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14310	NC_013522	GCT	2	6	606736	606741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792181
14311	NC_013522	GTC	2	6	606869	606874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792181
14312	NC_013522	TGG	2	6	606877	606882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792181
14313	NC_013522	C	6	6	606898	606903	0 %	0 %	0 %	100 %	269792181
14314	NC_013522	TCC	2	6	606919	606924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792181
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14320	NC_013522	CCA	2	6	607072	607077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792181
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14324	NC_013522	CTC	2	6	607229	607234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14325	NC_013522	G	7	7	607271	607277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14326	NC_013522	CGG	2	6	607292	607297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14327	NC_013522	TCA	2	6	607313	607318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14330	NC_013522	C	6	6	607464	607469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14331	NC_013522	CAGCC	2	10	607493	607502	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14332	NC_013522	GTC	2	6	607539	607544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14333	NC_013522	GGC	2	6	607551	607556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14335	NC_013522	GGGC	2	8	607625	607632	0 %	0 %	75 %	25 %	269792182
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14349	NC_013522	ACC	2	6	608231	608236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269792182
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14353	NC_013522	GCGG	2	8	608331	608338	0 %	0 %	75 %	25 %	269792182
14354	NC_013522	GCC	2	6	608344	608349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792182
14355	NC_013522	GA	3	6	608461	608466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14356	NC_013522	GTG	2	6	608470	608475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_013522	GATG	2	8	608488	608495	25 %	25 %	50 %	0 %	269792183
14358	NC_013522	TGG	2	6	608544	608549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792183
14359	NC_013522	GGC	2	6	608572	608577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792183
14360	NC_013522	C	7	7	608786	608792	0 %	0 %	0 %	100 %	269792183
14361	NC_013522	CAAGGT	2	12	608896	608907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269792183
14362	NC_013522	GTG	2	6	608945	608950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792183
14363	NC_013522	TGG	2	6	609018	609023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269792183
14364	NC_013522	GC	3	6	609046	609051	0 %	0 %	50 %	50 %	269792183
14365	NC_013522	G	6	6	609089	609094	0 %	0 %	100 %	0 %	269792183
14366	NC_013522	GGCG	2	8	609099	609106	0 %	0 %	75 %	25 %	269792183
14367	NC_013522	GCGGGT	2	12	609160	609171	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	269792183
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14371	NC_013522	GTCC	2	8	609274	609281	0 %	25 %	25 %	50 %	269792184
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14483	NC_013522	G	6	6	613495	613500	0 %	0 %	100 %	0 %	269792188
14484	NC_013522	GGGAG	2	10	613507	613516	20 %	0 %	80 %	0 %	269792188
14485	NC_013522	GCG	2	6	613610	613615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792188
14486	NC_013522	GAG	2	6	613627	613632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269792188
14487	NC_013522	TCC	2	6	613640	613645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792188
14488	NC_013522	CGG	2	6	613716	613721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269792188
14489	NC_013522	TCA	2	6	613770	613775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269792188
14490	NC_013522	GTC	2	6	613777	613782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792188
14491	NC_013522	TATG	2	8	613801	613808	25 %	50 %	25 %	0 %	269792188
14492	NC_013522	AGGT	2	8	613940	613947	25 %	25 %	50 %	0 %	269792188
14493	NC_013522	GTA	2	6	613951	613956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269792188
14494	NC_013522	CCT	2	6	613974	613979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269792188
14495	NC_013522	CGT	2	6	614019	614024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269792188
14496	NC_013522	GCC	2	6	614028	614033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269792188
14497	NC_013522	TGT	2	6	614064	614069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269792188
14498	NC_013522	TC	3	6	614094	614099	0 %	50 %	0 %	50 %	269792188
14499	NC_013522	C	8	8	614178	614185	0 %	0 %	0 %	100 %	269792188
14500	NC_013522	CGCC	2	8	614193	614200	0 %	0 %	25 %	75 %	269792188

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