MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011978	GAA	2	6	179306	179311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4002	NC_011978	GAA	2	6	179330	179335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4003	NC_011978	TCG	2	6	179341	179346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4004	NC_011978	TTCGGG	2	12	179360	179371	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222099165
4005	NC_011978	CGCCAT	2	12	179507	179518	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222099165
4006	NC_011978	AGA	2	6	179524	179529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4007	NC_011978	GAA	2	6	179648	179653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4008	NC_011978	CGA	2	6	179660	179665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4009	NC_011978	AG	3	6	179694	179699	50 %	0 %	50 %	0 %	222099165
4010	NC_011978	GAA	2	6	179738	179743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4011	NC_011978	AAG	2	6	179754	179759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4012	NC_011978	GAG	2	6	179766	179771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099165
4013	NC_011978	TGG	2	6	179872	179877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099165
4014	NC_011978	GA	3	6	179942	179947	50 %	0 %	50 %	0 %	222099165
4015	NC_011978	GA	3	6	179986	179991	50 %	0 %	50 %	0 %	222099165
4016	NC_011978	GT	3	6	180024	180029	0 %	50 %	50 %	0 %	222099165
4017	NC_011978	TGG	2	6	180142	180147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099165
4018	NC_011978	GAA	2	6	180150	180155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4019	NC_011978	ATC	2	6	180177	180182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099165
4020	NC_011978	GGTG	2	8	180211	180218	0 %	25 %	75 %	0 %	222099165
4021	NC_011978	AGA	2	6	180234	180239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4022	NC_011978	GAA	2	6	180284	180289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4023	NC_011978	TGT	2	6	180295	180300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099165
4024	NC_011978	GAT	2	6	180306	180311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099165
4025	NC_011978	TCG	2	6	180397	180402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4026	NC_011978	TC	3	6	180417	180422	0 %	50 %	0 %	50 %	222099165
4027	NC_011978	TGG	2	6	180425	180430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099165
4028	NC_011978	AG	3	6	180444	180449	50 %	0 %	50 %	0 %	222099165
4029	NC_011978	CT	3	6	180453	180458	0 %	50 %	0 %	50 %	222099165
4030	NC_011978	AG	3	6	180549	180554	50 %	0 %	50 %	0 %	222099165
4031	NC_011978	CCA	2	6	180649	180654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099165
4032	NC_011978	CGA	2	6	180734	180739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4033	NC_011978	GA	3	6	180761	180766	50 %	0 %	50 %	0 %	222099165
4034	NC_011978	AG	3	6	180770	180775	50 %	0 %	50 %	0 %	222099165
4035	NC_011978	GAA	2	6	180791	180796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4036	NC_011978	ACG	2	6	180835	180840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4037	NC_011978	GTG	2	6	180909	180914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099165
4038	NC_011978	GGA	2	6	180929	180934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099165
4039	NC_011978	GAA	2	6	180983	180988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4040	NC_011978	A	7	7	180987	180993	100 %	0 %	0 %	0 %	222099165
4041	NC_011978	GAG	2	6	181003	181008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099165
4042	NC_011978	GAC	2	6	181012	181017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4043	NC_011978	CAA	2	6	181055	181060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099165
4044	NC_011978	GAA	2	6	181064	181069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4045	NC_011978	TG	3	6	181104	181109	0 %	50 %	50 %	0 %	222099165
4046	NC_011978	TCT	2	6	181134	181139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099165
4047	NC_011978	TTC	2	6	181177	181182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099165
4048	NC_011978	ATCA	2	8	181258	181265	50 %	25 %	0 %	25 %	222099165
4049	NC_011978	GCA	2	6	181350	181355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4050	NC_011978	GGA	2	6	181401	181406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099165
4051	NC_011978	TTC	2	6	181456	181461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099165
4052	NC_011978	ACA	2	6	181504	181509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099165
4053	NC_011978	TCC	2	6	181601	181606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099165
4054	NC_011978	AGG	2	6	181611	181616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099165
4055	NC_011978	TTC	2	6	181627	181632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099165
4056	NC_011978	CAA	2	6	181672	181677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099165
4057	NC_011978	GAAA	2	8	181726	181733	75 %	0 %	25 %	0 %	222099165
4058	NC_011978	GAA	2	6	181741	181746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099165
4059	NC_011978	CGA	2	6	181760	181765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099165
4060	NC_011978	TAA	2	6	181873	181878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099165
4061	NC_011978	CAT	2	6	181892	181897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099165
4062	NC_011978	GAGG	2	8	181911	181918	25 %	0 %	75 %	0 %	222099165
4063	NC_011978	AGG	2	6	181925	181930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099165
4064	NC_011978	CAT	2	6	182065	182070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099166
4065	NC_011978	GAA	2	6	182166	182171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099166
4066	NC_011978	AG	3	6	182172	182177	50 %	0 %	50 %	0 %	222099166
4067	NC_011978	GGA	2	6	182189	182194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099166
4068	NC_011978	TC	3	6	182209	182214	0 %	50 %	0 %	50 %	222099166
4069	NC_011978	CGTT	2	8	182247	182254	0 %	50 %	25 %	25 %	222099166
4070	NC_011978	GGA	2	6	182279	182284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099167
4071	NC_011978	GAA	2	6	182331	182336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099167
4072	NC_011978	CTC	2	6	182337	182342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099167
4073	NC_011978	AAG	2	6	182351	182356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099167
4074	NC_011978	TCA	2	6	182476	182481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099167
4075	NC_011978	GAA	2	6	182518	182523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099167
4076	NC_011978	GAAG	2	8	182546	182553	50 %	0 %	50 %	0 %	222099167
4077	NC_011978	AGAAC	2	10	182613	182622	60 %	0 %	20 %	20 %	222099167
4078	NC_011978	GAC	2	6	182715	182720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099167
4079	NC_011978	CCT	2	6	182849	182854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099167
4080	NC_011978	GGAA	2	8	182859	182866	50 %	0 %	50 %	0 %	222099167
4081	NC_011978	ATC	2	6	182916	182921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099167
4082	NC_011978	AC	3	6	182983	182988	50 %	0 %	0 %	50 %	222099167
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4084	NC_011978	TCA	2	6	183031	183036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099167
4085	NC_011978	CTC	2	6	183051	183056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099167
4086	NC_011978	AGA	2	6	183068	183073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099167
4087	NC_011978	GAA	2	6	183081	183086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099167
4088	NC_011978	GAAA	2	8	183090	183097	75 %	0 %	25 %	0 %	222099167
4089	NC_011978	TTC	2	6	183162	183167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099167
4090	NC_011978	A	6	6	183185	183190	100 %	0 %	0 %	0 %	222099167
4091	NC_011978	GTT	2	6	183249	183254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099167
4092	NC_011978	TCT	2	6	183284	183289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099167
4093	NC_011978	CAG	2	6	183311	183316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099167
4094	NC_011978	GCG	2	6	183346	183351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099167
4095	NC_011978	GGA	2	6	183374	183379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099167
4096	NC_011978	GAAA	2	8	183427	183434	75 %	0 %	25 %	0 %	222099167
4097	NC_011978	A	6	6	183432	183437	100 %	0 %	0 %	0 %	222099167
4098	NC_011978	A	7	7	183465	183471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_011978	ATG	2	6	183502	183507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099168
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4101	NC_011978	AG	3	6	183563	183568	50 %	0 %	50 %	0 %	222099168
4102	NC_011978	TTC	2	6	183569	183574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099168
4103	NC_011978	TCT	2	6	183599	183604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099169
4104	NC_011978	TTC	2	6	183619	183624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099169
4105	NC_011978	GCC	2	6	183745	183750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099169
4106	NC_011978	CTC	2	6	183766	183771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099169
4107	NC_011978	AGA	2	6	183785	183790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099169
4108	NC_011978	GAA	2	6	183859	183864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099169
4109	NC_011978	CAC	2	6	183915	183920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099169
4110	NC_011978	GAAG	2	8	183975	183982	50 %	0 %	50 %	0 %	222099169
4111	NC_011978	GAA	2	6	184000	184005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099169
4112	NC_011978	TC	3	6	184010	184015	0 %	50 %	0 %	50 %	222099169
4113	NC_011978	AAC	2	6	184033	184038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099169
4114	NC_011978	CGC	2	6	184128	184133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099169
4115	NC_011978	AAAC	2	8	184152	184159	75 %	0 %	0 %	25 %	222099169
4116	NC_011978	CAT	2	6	184200	184205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099169
4117	NC_011978	ACA	2	6	184214	184219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099169
4118	NC_011978	TCC	2	6	184225	184230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099169
4119	NC_011978	CAA	2	6	184245	184250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099169
4120	NC_011978	AGA	2	6	184282	184287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099169
4121	NC_011978	TGG	2	6	184307	184312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099169
4122	NC_011978	CAT	2	6	184329	184334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099169
4123	NC_011978	ACA	2	6	184343	184348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099169
4124	NC_011978	A	7	7	184378	184384	100 %	0 %	0 %	0 %	222099169
4125	NC_011978	CTC	2	6	184459	184464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099169
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4127	NC_011978	TC	3	6	184498	184503	0 %	50 %	0 %	50 %	222099169
4128	NC_011978	AGA	2	6	184526	184531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099169
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4132	NC_011978	GATC	2	8	184629	184636	25 %	25 %	25 %	25 %	222099169
4133	NC_011978	ACA	2	6	184682	184687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099169
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4152	NC_011978	TGC	2	6	185698	185703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099170
4153	NC_011978	AGC	2	6	185863	185868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099170
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4159	NC_011978	GTTTT	2	10	186070	186079	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_011978	CTTTT	2	10	186200	186209	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4161	NC_011978	AG	3	6	186253	186258	50 %	0 %	50 %	0 %	222099172
4162	NC_011978	TCG	2	6	186262	186267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099172
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4228	NC_011978	AAACG	2	10	189602	189611	60 %	0 %	20 %	20 %	222099176
4229	NC_011978	ATC	2	6	189621	189626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099176
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4233	NC_011978	GATC	2	8	189713	189720	25 %	25 %	25 %	25 %	222099176
4234	NC_011978	GAA	2	6	189745	189750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099176
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4237	NC_011978	A	6	6	189877	189882	100 %	0 %	0 %	0 %	222099176
4238	NC_011978	GAAC	2	8	189953	189960	50 %	0 %	25 %	25 %	222099176
4239	NC_011978	TGA	2	6	189961	189966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099176
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4491	NC_011978	GAT	2	6	202138	202143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099188
4492	NC_011978	CTG	2	6	202174	202179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099188
4493	NC_011978	CCA	2	6	202258	202263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099188
4494	NC_011978	T	6	6	202312	202317	0 %	100 %	0 %	0 %	222099188
4495	NC_011978	ACCTTC	2	12	202319	202330	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222099188
4496	NC_011978	CT	3	6	202332	202337	0 %	50 %	0 %	50 %	222099188
4497	NC_011978	CCA	2	6	202361	202366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099188
4498	NC_011978	TCT	2	6	202373	202378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099188
4499	NC_011978	TTC	2	6	202392	202397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099188
4500	NC_011978	TCG	2	6	202403	202408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099188

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