MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_011978	CAG	2	6	1833477	1833482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100851
40003	NC_011978	TTC	2	6	1833486	1833491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100851
40004	NC_011978	CACGTC	2	12	1833501	1833512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222100851
40005	NC_011978	AGA	2	6	1833523	1833528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100851
40006	NC_011978	TC	4	8	1833560	1833567	0 %	50 %	0 %	50 %	222100851
40007	NC_011978	CGG	2	6	1833734	1833739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100851
40008	NC_011978	CA	3	6	1833752	1833757	50 %	0 %	0 %	50 %	222100851
40009	NC_011978	CCT	2	6	1833761	1833766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100851
40010	NC_011978	ACC	2	6	1833879	1833884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100851
40011	NC_011978	CCT	2	6	1833891	1833896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100851
40012	NC_011978	GTT	2	6	1833927	1833932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100851
40013	NC_011978	TTCT	2	8	1833933	1833940	0 %	75 %	0 %	25 %	222100851
40014	NC_011978	AG	3	6	1833952	1833957	50 %	0 %	50 %	0 %	222100851
40015	NC_011978	CAA	2	6	1834079	1834084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100851
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40017	NC_011978	GATC	2	8	1834131	1834138	25 %	25 %	25 %	25 %	222100852
40018	NC_011978	AGA	2	6	1834155	1834160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100852
40019	NC_011978	CCT	2	6	1834198	1834203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100852
40020	NC_011978	CTTC	2	8	1834240	1834247	0 %	50 %	0 %	50 %	222100852
40021	NC_011978	AAG	2	6	1834261	1834266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100852
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40025	NC_011978	CTTT	2	8	1834404	1834411	0 %	75 %	0 %	25 %	222100852
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40029	NC_011978	T	6	6	1834699	1834704	0 %	100 %	0 %	0 %	222100852
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40033	NC_011978	A	6	6	1834849	1834854	100 %	0 %	0 %	0 %	222100853
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40039	NC_011978	TCT	2	6	1835274	1835279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100853
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40041	NC_011978	T	6	6	1835326	1835331	0 %	100 %	0 %	0 %	222100853
40042	NC_011978	GA	3	6	1835343	1835348	50 %	0 %	50 %	0 %	222100853
40043	NC_011978	AAT	2	6	1835399	1835404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100853
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40047	NC_011978	T	6	6	1835586	1835591	0 %	100 %	0 %	0 %	222100853
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40052	NC_011978	TTC	2	6	1835808	1835813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100853
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40054	NC_011978	TGA	2	6	1835988	1835993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100853
40055	NC_011978	ATC	2	6	1835996	1836001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100853
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40057	NC_011978	CTT	2	6	1836050	1836055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100853
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40059	NC_011978	TGA	3	9	1836093	1836101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100853
40060	NC_011978	TCT	2	6	1836169	1836174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100853
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40063	NC_011978	CCTT	2	8	1836283	1836290	0 %	50 %	0 %	50 %	222100853
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40067	NC_011978	TCG	2	6	1836414	1836419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100853
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40089	NC_011978	TCTGGA	2	12	1837493	1837504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222100854
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40101	NC_011978	GTA	2	6	1838194	1838199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100855
40102	NC_011978	CTT	2	6	1838225	1838230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100855
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40105	NC_011978	TTTC	2	8	1838318	1838325	0 %	75 %	0 %	25 %	222100855
40106	NC_011978	TCC	2	6	1838344	1838349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100855
40107	NC_011978	ACC	2	6	1838380	1838385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100855
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40109	NC_011978	ATA	2	6	1838563	1838568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100855
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40356	NC_011978	TTCC	2	8	1848142	1848149	0 %	50 %	0 %	50 %	222100868
40357	NC_011978	AG	3	6	1848159	1848164	50 %	0 %	50 %	0 %	222100868
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40369	NC_011978	TTCT	2	8	1848607	1848614	0 %	75 %	0 %	25 %	222100869
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40383	NC_011978	CTG	2	6	1849118	1849123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100870
40384	NC_011978	ACC	2	6	1849176	1849181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100870
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40443	NC_011978	TG	3	6	1851339	1851344	0 %	50 %	50 %	0 %	222100872
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40457	NC_011978	CTG	2	6	1851956	1851961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100873
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40466	NC_011978	CCT	2	6	1852295	1852300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100874
40467	NC_011978	CT	3	6	1852379	1852384	0 %	50 %	0 %	50 %	222100874
40468	NC_011978	CTT	2	6	1852392	1852397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100874
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40471	NC_011978	TTC	2	6	1852554	1852559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100874
40472	NC_011978	TCC	2	6	1852606	1852611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100874
40473	NC_011978	GTT	2	6	1852632	1852637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100874
40474	NC_011978	TTGC	2	8	1852654	1852661	0 %	50 %	25 %	25 %	222100874
40475	NC_011978	T	6	6	1852667	1852672	0 %	100 %	0 %	0 %	222100874
40476	NC_011978	CA	3	6	1852726	1852731	50 %	0 %	0 %	50 %	222100874
40477	NC_011978	TTC	2	6	1852740	1852745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100874
40478	NC_011978	GAA	2	6	1852763	1852768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100874
40479	NC_011978	CTCTC	2	10	1852825	1852834	0 %	40 %	0 %	60 %	222100874
40480	NC_011978	CCA	2	6	1852847	1852852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100874
40481	NC_011978	CAT	2	6	1852907	1852912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100874
40482	NC_011978	CAC	2	6	1852971	1852976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100874
40483	NC_011978	GATC	2	8	1853018	1853025	25 %	25 %	25 %	25 %	222100874
40484	NC_011978	TC	3	6	1853071	1853076	0 %	50 %	0 %	50 %	222100874
40485	NC_011978	TCC	2	6	1853079	1853084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100874
40486	NC_011978	TCG	2	6	1853119	1853124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100874
40487	NC_011978	CCT	2	6	1853150	1853155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100874
40488	NC_011978	G	6	6	1853227	1853232	0 %	0 %	100 %	0 %	222100874
40489	NC_011978	TGG	2	6	1853246	1853251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100874
40490	NC_011978	GAAC	2	8	1853258	1853265	50 %	0 %	25 %	25 %	222100874
40491	NC_011978	GGGA	2	8	1853273	1853280	25 %	0 %	75 %	0 %	222100874
40492	NC_011978	TTC	2	6	1853283	1853288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100874
40493	NC_011978	TAT	2	6	1853343	1853348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100874
40494	NC_011978	ATT	2	6	1853632	1853637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100874
40495	NC_011978	CAC	2	6	1853661	1853666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100874
40496	NC_011978	TAT	2	6	1853750	1853755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40497	NC_011978	AGG	2	6	1853787	1853792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100875
40498	NC_011978	A	7	7	1853802	1853808	100 %	0 %	0 %	0 %	222100875
40499	NC_011978	CAC	2	6	1853855	1853860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100875
40500	NC_011978	TCC	2	6	1854037	1854042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100875

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