MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_011978	CA	3	6	1604728	1604733	50 %	0 %	0 %	50 %	222100608
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35120	NC_011978	CCA	2	6	1609498	1609503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100614
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35122	NC_011978	GATC	2	8	1609585	1609592	25 %	25 %	25 %	25 %	222100614
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35124	NC_011978	TCGCCC	2	12	1609645	1609656	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222100614
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35128	NC_011978	TTG	2	6	1609764	1609769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100614
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35131	NC_011978	ATC	2	6	1609815	1609820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100614
35132	NC_011978	CAGA	2	8	1609824	1609831	50 %	0 %	25 %	25 %	222100614
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35141	NC_011978	GTA	2	6	1610336	1610341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100614
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35149	NC_011978	ATC	2	6	1610478	1610483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100614
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35154	NC_011978	TGT	3	9	1610712	1610720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100615
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35174	NC_011978	ATC	2	6	1611314	1611319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100616
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35178	NC_011978	CGA	3	9	1611468	1611476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100616
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35201	NC_011978	AAGA	2	8	1612219	1612226	75 %	0 %	25 %	0 %	222100616
35202	NC_011978	TCC	2	6	1612237	1612242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100616
35203	NC_011978	GTG	2	6	1612264	1612269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100616
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35205	NC_011978	TCC	2	6	1612345	1612350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35206	NC_011978	A	7	7	1612366	1612372	100 %	0 %	0 %	0 %	222100617
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35217	NC_011978	TCT	2	6	1612869	1612874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100617
35218	NC_011978	CCTG	2	8	1612878	1612885	0 %	25 %	25 %	50 %	222100617
35219	NC_011978	AGC	2	6	1612894	1612899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100617
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35221	NC_011978	ATT	2	6	1612997	1613002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100617
35222	NC_011978	GCG	2	6	1613038	1613043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100617
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35224	NC_011978	ATC	2	6	1613105	1613110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100617
35225	NC_011978	TGG	2	6	1613456	1613461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100617
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35228	NC_011978	TCC	2	6	1613564	1613569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100618
35229	NC_011978	AC	3	6	1613629	1613634	50 %	0 %	0 %	50 %	222100618
35230	NC_011978	CAC	2	6	1613681	1613686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100618
35231	NC_011978	TTC	2	6	1613734	1613739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100618
35232	NC_011978	T	6	6	1613745	1613750	0 %	100 %	0 %	0 %	222100618
35233	NC_011978	CGA	2	6	1613752	1613757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100618
35234	NC_011978	TTC	2	6	1613856	1613861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100618
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35236	NC_011978	TCTT	2	8	1613899	1613906	0 %	75 %	0 %	25 %	222100618
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35473	NC_011978	TCT	2	6	1626321	1626326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100631
35474	NC_011978	ATG	2	6	1626357	1626362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100631
35475	NC_011978	ATC	2	6	1626369	1626374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100631
35476	NC_011978	CTT	2	6	1626394	1626399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100631
35477	NC_011978	CT	4	8	1626484	1626491	0 %	50 %	0 %	50 %	222100631
35478	NC_011978	ACT	2	6	1626513	1626518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100631
35479	NC_011978	CAT	2	6	1626521	1626526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100631
35480	NC_011978	GAA	2	6	1626530	1626535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100631
35481	NC_011978	ACGT	2	8	1626567	1626574	25 %	25 %	25 %	25 %	222100631
35482	NC_011978	TCCT	2	8	1626598	1626605	0 %	50 %	0 %	50 %	222100631
35483	NC_011978	AGT	2	6	1626612	1626617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100631
35484	NC_011978	TCT	2	6	1626685	1626690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100631
35485	NC_011978	GTACTC	2	12	1626698	1626709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222100631
35486	NC_011978	TCC	2	6	1626722	1626727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100631
35487	NC_011978	TCC	2	6	1626758	1626763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100631
35488	NC_011978	CCG	2	6	1626864	1626869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100631
35489	NC_011978	T	6	6	1626891	1626896	0 %	100 %	0 %	0 %	222100631
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35491	NC_011978	ATCT	2	8	1627073	1627080	25 %	50 %	0 %	25 %	222100631
35492	NC_011978	CTT	2	6	1627162	1627167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100631
35493	NC_011978	CT	3	6	1627248	1627253	0 %	50 %	0 %	50 %	222100631
35494	NC_011978	GA	3	6	1627287	1627292	50 %	0 %	50 %	0 %	222100631
35495	NC_011978	ACA	2	6	1627332	1627337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100631
35496	NC_011978	AAC	2	6	1627373	1627378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100631
35497	NC_011978	A	7	7	1627490	1627496	100 %	0 %	0 %	0 %	222100632
35498	NC_011978	A	6	6	1627498	1627503	100 %	0 %	0 %	0 %	222100632
35499	NC_011978	ACC	2	6	1627528	1627533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100632
35500	NC_011978	GAA	2	6	1627623	1627628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100632

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