MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011978	AAC	2	6	134939	134944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099114
3002	NC_011978	GT	3	6	134962	134967	0 %	50 %	50 %	0 %	222099115
3003	NC_011978	ACC	2	6	134982	134987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099115
3004	NC_011978	TCG	2	6	135018	135023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099115
3005	NC_011978	CAA	2	6	135034	135039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099115
3006	NC_011978	AC	3	6	135070	135075	50 %	0 %	0 %	50 %	222099115
3007	NC_011978	AGT	2	6	135145	135150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099115
3008	NC_011978	CTT	2	6	135192	135197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099116
3009	NC_011978	TTCACC	2	12	135263	135274	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222099116
3010	NC_011978	CT	3	6	135304	135309	0 %	50 %	0 %	50 %	222099116
3011	NC_011978	TA	3	6	135313	135318	50 %	50 %	0 %	0 %	222099116
3012	NC_011978	A	6	6	135392	135397	100 %	0 %	0 %	0 %	222099116
3013	NC_011978	TTC	2	6	135437	135442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099116
3014	NC_011978	TCT	2	6	135479	135484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099116
3015	NC_011978	GAG	2	6	135495	135500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099116
3016	NC_011978	CT	3	6	135526	135531	0 %	50 %	0 %	50 %	222099116
3017	NC_011978	TC	3	6	135647	135652	0 %	50 %	0 %	50 %	222099116
3018	NC_011978	TCT	2	6	135714	135719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099116
3019	NC_011978	GAA	2	6	135768	135773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099116
3020	NC_011978	GGAT	2	8	135779	135786	25 %	25 %	50 %	0 %	222099116
3021	NC_011978	AAC	2	6	135792	135797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099116
3022	NC_011978	CGA	2	6	136020	136025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099116
3023	NC_011978	T	6	6	136036	136041	0 %	100 %	0 %	0 %	222099116
3024	NC_011978	CTG	2	6	136062	136067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099116
3025	NC_011978	CTC	2	6	136179	136184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099117
3026	NC_011978	TCT	2	6	136229	136234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3027	NC_011978	TCT	2	6	136316	136321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3028	NC_011978	TTG	2	6	136399	136404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099117
3029	NC_011978	TCTG	2	8	136425	136432	0 %	50 %	25 %	25 %	222099117
3030	NC_011978	TTC	2	6	136473	136478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3031	NC_011978	CGGAT	2	10	136485	136494	20 %	20 %	40 %	20 %	222099117
3032	NC_011978	TCAC	2	8	136600	136607	25 %	25 %	0 %	50 %	222099117
3033	NC_011978	GAT	2	6	136611	136616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099117
3034	NC_011978	CT	3	6	136693	136698	0 %	50 %	0 %	50 %	222099117
3035	NC_011978	GTGA	2	8	136699	136706	25 %	25 %	50 %	0 %	222099117
3036	NC_011978	TCT	2	6	136763	136768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3037	NC_011978	TCTT	2	8	136797	136804	0 %	75 %	0 %	25 %	222099117
3038	NC_011978	TCT	2	6	136857	136862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3039	NC_011978	ACC	3	9	136905	136913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099117
3040	NC_011978	CTC	2	6	136926	136931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099117
3041	NC_011978	CCAA	2	8	136939	136946	50 %	0 %	0 %	50 %	222099117
3042	NC_011978	CTT	2	6	136994	136999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3043	NC_011978	CT	3	6	137070	137075	0 %	50 %	0 %	50 %	222099117
3044	NC_011978	CCA	2	6	137111	137116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099117
3045	NC_011978	AGGT	2	8	137179	137186	25 %	25 %	50 %	0 %	222099117
3046	NC_011978	CAA	2	6	137225	137230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099117
3047	NC_011978	TTC	2	6	137265	137270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3048	NC_011978	TCT	2	6	137285	137290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099117
3049	NC_011978	CAA	2	6	137309	137314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099117
3050	NC_011978	TCC	2	6	137360	137365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099117
3051	NC_011978	ATG	2	6	137414	137419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099118
3052	NC_011978	TGA	2	6	137496	137501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099118
3053	NC_011978	TTG	2	6	137549	137554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099118
3054	NC_011978	GGT	2	6	137562	137567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099118
3055	NC_011978	C	6	6	137613	137618	0 %	0 %	0 %	100 %	222099118
3056	NC_011978	TTC	2	6	137655	137660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099119
3057	NC_011978	TCT	2	6	137680	137685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099119
3058	NC_011978	CTC	2	6	137690	137695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099119
3059	NC_011978	TCT	2	6	137759	137764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099119
3060	NC_011978	TTCC	2	8	137821	137828	0 %	50 %	0 %	50 %	222099119
3061	NC_011978	CTT	2	6	137842	137847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099119
3062	NC_011978	TAT	2	6	137996	138001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099119
3063	NC_011978	GAA	2	6	138002	138007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099119
3064	NC_011978	GTC	2	6	138011	138016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099119
3065	NC_011978	TCC	2	6	138046	138051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099119
3066	NC_011978	GCC	2	6	138120	138125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099119
3067	NC_011978	TTC	2	6	138137	138142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099119
3068	NC_011978	CTT	2	6	138171	138176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099119
3069	NC_011978	TC	3	6	138183	138188	0 %	50 %	0 %	50 %	222099119
3070	NC_011978	CCAC	2	8	138267	138274	25 %	0 %	0 %	75 %	222099119
3071	NC_011978	TCC	2	6	138306	138311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099119
3072	NC_011978	AAAG	2	8	138337	138344	75 %	0 %	25 %	0 %	222099119
3073	NC_011978	CCA	2	6	138502	138507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099119
3074	NC_011978	CGG	2	6	138526	138531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099119
3075	NC_011978	CTT	2	6	138667	138672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099120
3076	NC_011978	CGT	2	6	138699	138704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099120
3077	NC_011978	CAC	2	6	138925	138930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099120
3078	NC_011978	TA	3	6	138935	138940	50 %	50 %	0 %	0 %	222099120
3079	NC_011978	GAAG	2	8	138978	138985	50 %	0 %	50 %	0 %	222099120
3080	NC_011978	CTGG	2	8	139050	139057	0 %	25 %	50 %	25 %	222099120
3081	NC_011978	GAA	2	6	139107	139112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099120
3082	NC_011978	AGA	2	6	139117	139122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099120
3083	NC_011978	AGA	2	6	139131	139136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099120
3084	NC_011978	CCA	2	6	139142	139147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099120
3085	NC_011978	CCA	2	6	139176	139181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099120
3086	NC_011978	ATA	2	6	139183	139188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099120
3087	NC_011978	CTTC	2	8	139203	139210	0 %	50 %	0 %	50 %	222099120
3088	NC_011978	TCA	2	6	139266	139271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099120
3089	NC_011978	CT	3	6	139320	139325	0 %	50 %	0 %	50 %	222099121
3090	NC_011978	TCT	2	6	139369	139374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099121
3091	NC_011978	AGA	2	6	139450	139455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099121
3092	NC_011978	CT	3	6	139507	139512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3093	NC_011978	TTC	3	9	139513	139521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_011978	TCCC	2	8	139555	139562	0 %	25 %	0 %	75 %	222099122
3095	NC_011978	CTC	2	6	139563	139568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099122
3096	NC_011978	GA	3	6	139575	139580	50 %	0 %	50 %	0 %	222099122
3097	NC_011978	TCG	2	6	139591	139596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099122
3098	NC_011978	AGA	2	6	139640	139645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099122
3099	NC_011978	CTTC	2	8	139708	139715	0 %	50 %	0 %	50 %	222099122
3100	NC_011978	TCC	2	6	139725	139730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099122
3101	NC_011978	TCAAGA	2	12	139774	139785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222099122
3102	NC_011978	AGA	3	9	139783	139791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099122
3103	NC_011978	TCA	2	6	139801	139806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099122
3104	NC_011978	AGA	2	6	139921	139926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099122
3105	NC_011978	GGT	2	6	139953	139958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099122
3106	NC_011978	TTC	2	6	140001	140006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099122
3107	NC_011978	CTTT	2	8	140026	140033	0 %	75 %	0 %	25 %	222099122
3108	NC_011978	CAT	2	6	140048	140053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099122
3109	NC_011978	GCA	2	6	140122	140127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099122
3110	NC_011978	AGA	2	6	140128	140133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099122
3111	NC_011978	GA	3	6	140143	140148	50 %	0 %	50 %	0 %	222099122
3112	NC_011978	A	6	6	140148	140153	100 %	0 %	0 %	0 %	222099122
3113	NC_011978	CTC	2	6	140170	140175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099122
3114	NC_011978	GTAT	2	8	140179	140186	25 %	50 %	25 %	0 %	222099123
3115	NC_011978	CAC	2	6	140249	140254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099123
3116	NC_011978	TTTCT	2	10	140255	140264	0 %	80 %	0 %	20 %	222099123
3117	NC_011978	TCT	2	6	140324	140329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099123
3118	NC_011978	GC	3	6	140372	140377	0 %	0 %	50 %	50 %	222099123
3119	NC_011978	TC	3	6	140380	140385	0 %	50 %	0 %	50 %	222099123
3120	NC_011978	AGC	2	6	140430	140435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099123
3121	NC_011978	TCT	2	6	140490	140495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099123
3122	NC_011978	GTG	2	6	140503	140508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099123
3123	NC_011978	GTCC	2	8	140606	140613	0 %	25 %	25 %	50 %	222099123
3124	NC_011978	GTG	2	6	140640	140645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099123
3125	NC_011978	TC	3	6	140667	140672	0 %	50 %	0 %	50 %	222099123
3126	NC_011978	CCTG	2	8	140680	140687	0 %	25 %	25 %	50 %	222099123
3127	NC_011978	TTCC	2	8	140711	140718	0 %	50 %	0 %	50 %	222099123
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3161	NC_011978	GTCC	2	8	142038	142045	0 %	25 %	25 %	50 %	222099124
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3213	NC_011978	TGA	2	6	143769	143774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099126
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3233	NC_011978	ATG	2	6	144541	144546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099128
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3237	NC_011978	ACC	2	6	144649	144654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099128
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3239	NC_011978	GAAAG	2	10	144689	144698	60 %	0 %	40 %	0 %	222099128
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3245	NC_011978	CAG	2	6	144936	144941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099128
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3491	NC_011978	ATC	2	6	156085	156090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099138
3492	NC_011978	CCGTTG	2	12	156104	156115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099138
3493	NC_011978	TCGT	2	8	156136	156143	0 %	50 %	25 %	25 %	222099138
3494	NC_011978	CCT	2	6	156155	156160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099138
3495	NC_011978	CGT	2	6	156227	156232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099138
3496	NC_011978	TTC	2	6	156275	156280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099138
3497	NC_011978	CTT	2	6	156342	156347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_011978	CCTC	2	8	156389	156396	0 %	25 %	0 %	75 %	222099139
3499	NC_011978	GAT	3	9	156431	156439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099139
3500	NC_011978	TCA	2	6	156447	156452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099139

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