MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_011978	GA	3	6	1554718	1554723	50 %	0 %	50 %	0 %	222100561
34003	NC_011978	TCC	2	6	1554765	1554770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100561
34004	NC_011978	AG	3	6	1554781	1554786	50 %	0 %	50 %	0 %	222100561
34005	NC_011978	TCT	2	6	1554939	1554944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100561
34006	NC_011978	GAA	2	6	1554987	1554992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100561
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34008	NC_011978	AGT	2	6	1555145	1555150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100561
34009	NC_011978	TTC	2	6	1555189	1555194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100561
34010	NC_011978	AT	3	6	1555221	1555226	50 %	50 %	0 %	0 %	222100561
34011	NC_011978	CTT	2	6	1555251	1555256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100561
34012	NC_011978	GAG	2	6	1555261	1555266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100561
34013	NC_011978	GT	3	6	1555296	1555301	0 %	50 %	50 %	0 %	222100561
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34016	NC_011978	TAT	2	6	1555477	1555482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100561
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34018	NC_011978	TGATC	2	10	1555557	1555566	20 %	40 %	20 %	20 %	222100561
34019	NC_011978	TGA	2	6	1555608	1555613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100561
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34021	NC_011978	AAG	2	6	1555678	1555683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100561
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34024	NC_011978	T	6	6	1555841	1555846	0 %	100 %	0 %	0 %	222100561
34025	NC_011978	CGA	2	6	1555850	1555855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100561
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34028	NC_011978	GA	3	6	1555988	1555993	50 %	0 %	50 %	0 %	222100561
34029	NC_011978	TG	3	6	1556054	1556059	0 %	50 %	50 %	0 %	222100561
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34032	NC_011978	TTA	2	6	1556180	1556185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100561
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34035	NC_011978	TCT	2	6	1556257	1556262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100561
34036	NC_011978	CT	3	6	1556281	1556286	0 %	50 %	0 %	50 %	222100561
34037	NC_011978	T	6	6	1556315	1556320	0 %	100 %	0 %	0 %	222100561
34038	NC_011978	GCATG	2	10	1556421	1556430	20 %	20 %	40 %	20 %	222100561
34039	NC_011978	AG	3	6	1556505	1556510	50 %	0 %	50 %	0 %	222100561
34040	NC_011978	TTC	2	6	1556718	1556723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100562
34041	NC_011978	ATC	2	6	1556748	1556753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100562
34042	NC_011978	GATC	2	8	1556802	1556809	25 %	25 %	25 %	25 %	222100562
34043	NC_011978	T	6	6	1556858	1556863	0 %	100 %	0 %	0 %	222100562
34044	NC_011978	CTT	2	6	1556929	1556934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100562
34045	NC_011978	T	6	6	1556940	1556945	0 %	100 %	0 %	0 %	222100562
34046	NC_011978	GAAC	2	8	1556962	1556969	50 %	0 %	25 %	25 %	222100562
34047	NC_011978	CTTT	2	8	1557066	1557073	0 %	75 %	0 %	25 %	222100563
34048	NC_011978	GAAT	2	8	1557075	1557082	50 %	25 %	25 %	0 %	222100563
34049	NC_011978	ATC	2	6	1557131	1557136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100563
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34053	NC_011978	TCT	2	6	1557483	1557488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
34054	NC_011978	CT	3	6	1557532	1557537	0 %	50 %	0 %	50 %	222100563
34055	NC_011978	TCG	2	6	1557658	1557663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100563
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34058	NC_011978	T	7	7	1557710	1557716	0 %	100 %	0 %	0 %	222100563
34059	NC_011978	CTT	2	6	1557741	1557746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
34060	NC_011978	TTC	2	6	1557788	1557793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
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34068	NC_011978	GTA	2	6	1558144	1558149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100563
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34099	NC_011978	CGA	2	6	1559901	1559906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100563
34100	NC_011978	CCCTT	2	10	1559997	1560006	0 %	40 %	0 %	60 %	222100563
34101	NC_011978	CT	3	6	1560053	1560058	0 %	50 %	0 %	50 %	222100563
34102	NC_011978	T	6	6	1560081	1560086	0 %	100 %	0 %	0 %	222100563
34103	NC_011978	GAG	2	6	1560157	1560162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100563
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34105	NC_011978	AG	4	8	1560186	1560193	50 %	0 %	50 %	0 %	222100563
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34115	NC_011978	AGT	2	6	1560677	1560682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100564
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34237	NC_011978	TCT	2	6	1567363	1567368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100568
34238	NC_011978	GGGA	2	8	1567374	1567381	25 %	0 %	75 %	0 %	222100568
34239	NC_011978	GTTT	2	8	1567387	1567394	0 %	75 %	25 %	0 %	222100568
34240	NC_011978	TCC	2	6	1567439	1567444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100568
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34245	NC_011978	TGG	2	6	1567627	1567632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100568
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34274	NC_011978	AGA	2	6	1569496	1569501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34275	NC_011978	ATT	2	6	1569547	1569552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34276	NC_011978	ATT	3	9	1569576	1569584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34277	NC_011978	T	7	7	1569601	1569607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34278	NC_011978	GAGAG	2	10	1569671	1569680	40 %	0 %	60 %	0 %	222100569
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34338	NC_011978	TTTC	2	8	1573051	1573058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34339	NC_011978	ATT	2	6	1573143	1573148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34341	NC_011978	ATC	2	6	1573202	1573207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34343	NC_011978	AATGAG	2	12	1573460	1573471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222100576
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34345	NC_011978	GAA	2	6	1573509	1573514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100576
34346	NC_011978	TCG	2	6	1573515	1573520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100576
34347	NC_011978	TAC	2	6	1573535	1573540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100576
34348	NC_011978	A	6	6	1573543	1573548	100 %	0 %	0 %	0 %	222100576
34349	NC_011978	AGA	2	6	1573595	1573600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100576
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34351	NC_011978	TGC	2	6	1573726	1573731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100576
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