MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_011978	AG	3	6	1529996	1530001	50 %	0 %	50 %	0 %	222100537
33502	NC_011978	TATC	2	8	1530003	1530010	25 %	50 %	0 %	25 %	222100537
33503	NC_011978	A	6	6	1530015	1530020	100 %	0 %	0 %	0 %	222100537
33504	NC_011978	TCA	2	6	1530049	1530054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100538
33505	NC_011978	AGT	2	6	1530104	1530109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100538
33506	NC_011978	TGA	2	6	1530141	1530146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100538
33507	NC_011978	ATC	2	6	1530175	1530180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100538
33508	NC_011978	CCG	2	6	1530269	1530274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100538
33509	NC_011978	GAA	2	6	1530291	1530296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100538
33510	NC_011978	CAT	2	6	1530330	1530335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100538
33511	NC_011978	CAG	2	6	1530342	1530347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100538
33512	NC_011978	AG	4	8	1530346	1530353	50 %	0 %	50 %	0 %	222100538
33513	NC_011978	CT	3	6	1530354	1530359	0 %	50 %	0 %	50 %	222100538
33514	NC_011978	CCA	2	6	1530411	1530416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100538
33515	NC_011978	TTC	2	6	1530419	1530424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100538
33516	NC_011978	TCT	2	6	1530544	1530549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100538
33517	NC_011978	GAC	2	6	1530579	1530584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100538
33518	NC_011978	AGA	2	6	1530586	1530591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100538
33519	NC_011978	AGC	2	6	1530598	1530603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100538
33520	NC_011978	CTT	2	6	1530618	1530623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100538
33521	NC_011978	TTCT	2	8	1530664	1530671	0 %	75 %	0 %	25 %	222100538
33522	NC_011978	CTT	2	6	1530741	1530746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100538
33523	NC_011978	TCC	2	6	1530777	1530782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100538
33524	NC_011978	TC	3	6	1530800	1530805	0 %	50 %	0 %	50 %	222100538
33525	NC_011978	CAT	2	6	1530918	1530923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100538
33526	NC_011978	TCC	2	6	1530980	1530985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100538
33527	NC_011978	TTTC	2	8	1531112	1531119	0 %	75 %	0 %	25 %	222100538
33528	NC_011978	TCG	2	6	1531175	1531180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100538
33529	NC_011978	CAA	2	6	1531200	1531205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100538
33530	NC_011978	GCC	2	6	1531220	1531225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100538
33531	NC_011978	CTG	2	6	1531231	1531236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100538
33532	NC_011978	ATC	2	6	1531286	1531291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100538
33533	NC_011978	TCC	2	6	1531321	1531326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100538
33534	NC_011978	CCA	2	6	1531359	1531364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100538
33535	NC_011978	TCCT	2	8	1531462	1531469	0 %	50 %	0 %	50 %	222100538
33536	NC_011978	CT	4	8	1531479	1531486	0 %	50 %	0 %	50 %	222100538
33537	NC_011978	GTC	2	6	1531582	1531587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100538
33538	NC_011978	TTC	2	6	1531601	1531606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100538
33539	NC_011978	GAG	2	6	1531633	1531638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100538
33540	NC_011978	TCC	2	6	1531742	1531747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100538
33541	NC_011978	CTT	2	6	1531786	1531791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100538
33542	NC_011978	CCT	2	6	1531833	1531838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100538
33543	NC_011978	TCT	2	6	1531849	1531854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33544	NC_011978	GGA	2	6	1531946	1531951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100539
33545	NC_011978	CTC	2	6	1532045	1532050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100539
33546	NC_011978	GAA	2	6	1532107	1532112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100539
33547	NC_011978	CGT	2	6	1532167	1532172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100539
33548	NC_011978	TCC	2	6	1532181	1532186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100539
33549	NC_011978	GTC	2	6	1532297	1532302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100539
33550	NC_011978	CAG	2	6	1532345	1532350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100539
33551	NC_011978	TGT	2	6	1532380	1532385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100539
33552	NC_011978	GT	3	6	1532458	1532463	0 %	50 %	50 %	0 %	222100539
33553	NC_011978	AGA	2	6	1532519	1532524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100539
33554	NC_011978	ATTG	2	8	1532578	1532585	25 %	50 %	25 %	0 %	222100539
33555	NC_011978	GTT	2	6	1532630	1532635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100539
33556	NC_011978	CT	3	6	1532753	1532758	0 %	50 %	0 %	50 %	222100539
33557	NC_011978	TCT	2	6	1532760	1532765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100539
33558	NC_011978	ACC	2	6	1532796	1532801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100539
33559	NC_011978	GTA	2	6	1532873	1532878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100539
33560	NC_011978	ATTTC	2	10	1532880	1532889	20 %	60 %	0 %	20 %	222100539
33561	NC_011978	TTCT	2	8	1532939	1532946	0 %	75 %	0 %	25 %	222100539
33562	NC_011978	GTA	2	6	1532957	1532962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100539
33563	NC_011978	ATT	2	6	1533000	1533005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100539
33564	NC_011978	GTTCA	2	10	1533050	1533059	20 %	40 %	20 %	20 %	222100539
33565	NC_011978	GTTT	2	8	1533074	1533081	0 %	75 %	25 %	0 %	222100539
33566	NC_011978	TTC	2	6	1533099	1533104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100539
33567	NC_011978	CAA	2	6	1533118	1533123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100539
33568	NC_011978	TCG	2	6	1533156	1533161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100539
33569	NC_011978	CGTGA	2	10	1533164	1533173	20 %	20 %	40 %	20 %	222100539
33570	NC_011978	GTT	2	6	1533192	1533197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100539
33571	NC_011978	TCGTA	2	10	1533208	1533217	20 %	40 %	20 %	20 %	222100539
33572	NC_011978	TTC	2	6	1533329	1533334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100539
33573	NC_011978	AG	3	6	1533338	1533343	50 %	0 %	50 %	0 %	222100539
33574	NC_011978	TCT	2	6	1533352	1533357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100539
33575	NC_011978	CTT	2	6	1533406	1533411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100539
33576	NC_011978	T	6	6	1533443	1533448	0 %	100 %	0 %	0 %	222100539
33577	NC_011978	GATC	2	8	1533514	1533521	25 %	25 %	25 %	25 %	222100539
33578	NC_011978	T	6	6	1533537	1533542	0 %	100 %	0 %	0 %	222100539
33579	NC_011978	GA	3	6	1533584	1533589	50 %	0 %	50 %	0 %	222100539
33580	NC_011978	CG	3	6	1533616	1533621	0 %	0 %	50 %	50 %	222100539
33581	NC_011978	GTA	2	6	1533767	1533772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100539
33582	NC_011978	GTC	2	6	1533791	1533796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100539
33583	NC_011978	AGT	2	6	1533844	1533849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100539
33584	NC_011978	A	6	6	1533867	1533872	100 %	0 %	0 %	0 %	222100539
33585	NC_011978	CCA	2	6	1533934	1533939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100539
33586	NC_011978	GA	3	6	1534070	1534075	50 %	0 %	50 %	0 %	222100539
33587	NC_011978	GAAAG	2	10	1534081	1534090	60 %	0 %	40 %	0 %	222100539
33588	NC_011978	GAAA	2	8	1534132	1534139	75 %	0 %	25 %	0 %	222100539
33589	NC_011978	CAA	2	6	1534255	1534260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100539
33590	NC_011978	ACA	2	6	1534293	1534298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100539
33591	NC_011978	CAA	2	6	1534339	1534344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100539
33592	NC_011978	ACG	2	6	1534353	1534358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100539
33593	NC_011978	A	6	6	1534361	1534366	100 %	0 %	0 %	0 %	222100539
33594	NC_011978	CCTT	2	8	1534391	1534398	0 %	50 %	0 %	50 %	222100540
33595	NC_011978	TAAT	2	8	1534610	1534617	50 %	50 %	0 %	0 %	222100540
33596	NC_011978	T	6	6	1534637	1534642	0 %	100 %	0 %	0 %	222100540
33597	NC_011978	GAA	2	6	1534648	1534653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100540
33598	NC_011978	CTT	2	6	1534709	1534714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100540
33599	NC_011978	GTCG	2	8	1534814	1534821	0 %	25 %	50 %	25 %	222100540
33600	NC_011978	GAA	2	6	1534832	1534837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100540
33601	NC_011978	ATC	2	6	1534858	1534863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100540
33602	NC_011978	TGATA	2	10	1534989	1534998	40 %	40 %	20 %	0 %	222100541
33603	NC_011978	AGAGAA	2	12	1535065	1535076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100541
33604	NC_011978	TCC	2	6	1535149	1535154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100541
33605	NC_011978	TCT	2	6	1535184	1535189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100541
33606	NC_011978	GAA	2	6	1535207	1535212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100541
33607	NC_011978	G	6	6	1535229	1535234	0 %	0 %	100 %	0 %	222100541
33608	NC_011978	CAT	2	6	1535248	1535253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100541
33609	NC_011978	GAG	2	6	1535272	1535277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100541
33610	NC_011978	AGTG	2	8	1535340	1535347	25 %	25 %	50 %	0 %	222100541
33611	NC_011978	TCT	2	6	1535391	1535396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100541
33612	NC_011978	GAA	2	6	1535427	1535432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100541
33613	NC_011978	TCT	2	6	1535444	1535449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100541
33614	NC_011978	TAC	2	6	1535473	1535478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100541
33615	NC_011978	TCT	2	6	1535499	1535504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100541
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33617	NC_011978	TTC	2	6	1535576	1535581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100541
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33975	NC_011978	CTT	2	6	1553088	1553093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100560
33976	NC_011978	CT	3	6	1553099	1553104	0 %	50 %	0 %	50 %	222100560
33977	NC_011978	TACTC	2	10	1553123	1553132	20 %	40 %	0 %	40 %	222100560
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33979	NC_011978	CCT	2	6	1553317	1553322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100560
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33983	NC_011978	GAA	2	6	1553514	1553519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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