MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33003	NC_011978	TGG	2	6	1506492	1506497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100520
33004	NC_011978	AG	3	6	1506659	1506664	50 %	0 %	50 %	0 %	222100520
33005	NC_011978	GTT	2	6	1506743	1506748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100520
33006	NC_011978	AG	3	6	1506760	1506765	50 %	0 %	50 %	0 %	222100520
33007	NC_011978	AG	3	6	1506849	1506854	50 %	0 %	50 %	0 %	222100520
33008	NC_011978	AAG	2	6	1506855	1506860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100520
33009	NC_011978	TCT	2	6	1506925	1506930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100520
33010	NC_011978	A	6	6	1507005	1507010	100 %	0 %	0 %	0 %	222100520
33011	NC_011978	AGAT	2	8	1507023	1507030	50 %	25 %	25 %	0 %	222100520
33012	NC_011978	GAA	2	6	1507049	1507054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100520
33013	NC_011978	TCC	2	6	1507088	1507093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100520
33014	NC_011978	GCA	2	6	1507124	1507129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100520
33015	NC_011978	TGT	2	6	1507192	1507197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100520
33016	NC_011978	TCGATG	2	12	1507245	1507256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222100520
33017	NC_011978	GCT	2	6	1507295	1507300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100520
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33020	NC_011978	ATAAA	2	10	1507523	1507532	80 %	20 %	0 %	0 %	222100521
33021	NC_011978	AAG	2	6	1507673	1507678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100521
33022	NC_011978	TA	3	6	1507774	1507779	50 %	50 %	0 %	0 %	222100521
33023	NC_011978	AAC	2	6	1507780	1507785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100521
33024	NC_011978	CA	3	6	1507819	1507824	50 %	0 %	0 %	50 %	222100521
33025	NC_011978	GAA	2	6	1507897	1507902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100521
33026	NC_011978	AG	3	6	1508000	1508005	50 %	0 %	50 %	0 %	222100521
33027	NC_011978	GAA	2	6	1508041	1508046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100521
33028	NC_011978	TCT	2	6	1508079	1508084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100521
33029	NC_011978	A	6	6	1508107	1508112	100 %	0 %	0 %	0 %	222100521
33030	NC_011978	GTA	2	6	1508221	1508226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100521
33031	NC_011978	TGG	2	6	1508232	1508237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100521
33032	NC_011978	GA	3	6	1508380	1508385	50 %	0 %	50 %	0 %	222100521
33033	NC_011978	AGA	2	6	1508397	1508402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100521
33034	NC_011978	T	6	6	1508454	1508459	0 %	100 %	0 %	0 %	222100521
33035	NC_011978	TCA	2	6	1508474	1508479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100521
33036	NC_011978	CTG	2	6	1508510	1508515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100521
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33039	NC_011978	ATG	2	6	1508716	1508721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100522
33040	NC_011978	AGA	2	6	1508765	1508770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100522
33041	NC_011978	TTC	2	6	1508890	1508895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100522
33042	NC_011978	AGAAGC	2	12	1508924	1508935	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222100522
33043	NC_011978	CTG	2	6	1508950	1508955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100522
33044	NC_011978	GAA	2	6	1508976	1508981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100522
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33046	NC_011978	GA	3	6	1509056	1509061	50 %	0 %	50 %	0 %	222100522
33047	NC_011978	AGC	2	6	1509140	1509145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100522
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33051	NC_011978	TTG	2	6	1509535	1509540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100522
33052	NC_011978	AGG	2	6	1509553	1509558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100522
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33060	NC_011978	CTTCA	2	10	1509866	1509875	20 %	40 %	0 %	40 %	222100522
33061	NC_011978	AGAT	2	8	1509877	1509884	50 %	25 %	25 %	0 %	222100522
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33067	NC_011978	GAAG	2	8	1510127	1510134	50 %	0 %	50 %	0 %	222100523
33068	NC_011978	GAA	2	6	1510148	1510153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100523
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33073	NC_011978	A	7	7	1510453	1510459	100 %	0 %	0 %	0 %	222100523
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33088	NC_011978	AATG	2	8	1511192	1511199	50 %	25 %	25 %	0 %	222100523
33089	NC_011978	CA	3	6	1511231	1511236	50 %	0 %	0 %	50 %	222100523
33090	NC_011978	TGT	2	6	1511329	1511334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100523
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33092	NC_011978	TGA	2	6	1511404	1511409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100523
33093	NC_011978	AT	3	6	1511479	1511484	50 %	50 %	0 %	0 %	222100524
33094	NC_011978	AAGGA	2	10	1511499	1511508	60 %	0 %	40 %	0 %	222100524
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33099	NC_011978	A	6	6	1511796	1511801	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
33100	NC_011978	ACTT	2	8	1511823	1511830	25 %	50 %	0 %	25 %	222100524
33101	NC_011978	T	7	7	1511842	1511848	0 %	100 %	0 %	0 %	222100524
33102	NC_011978	GGTAT	2	10	1511860	1511869	20 %	40 %	40 %	0 %	222100524
33103	NC_011978	A	6	6	1511909	1511914	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
33104	NC_011978	GA	3	6	1512101	1512106	50 %	0 %	50 %	0 %	222100524
33105	NC_011978	AGA	2	6	1512206	1512211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100524
33106	NC_011978	TAA	2	6	1512290	1512295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100524
33107	NC_011978	AAG	2	6	1512313	1512318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100524
33108	NC_011978	A	8	8	1512342	1512349	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
33109	NC_011978	TAG	2	6	1512370	1512375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100524
33110	NC_011978	AAT	2	6	1512440	1512445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100524
33111	NC_011978	ACA	2	6	1512451	1512456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100524
33112	NC_011978	ATGG	4	16	1512471	1512486	25 %	25 %	50 %	0 %	222100524
33113	NC_011978	CAA	2	6	1512551	1512556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100524
33114	NC_011978	A	6	6	1512608	1512613	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
33115	NC_011978	GGT	2	6	1512614	1512619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100524
33116	NC_011978	GC	3	6	1512629	1512634	0 %	0 %	50 %	50 %	222100524
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33118	NC_011978	AGC	2	6	1512848	1512853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100524
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33120	NC_011978	A	6	6	1512996	1513001	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
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33142	NC_011978	CA	3	6	1513877	1513882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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33232	NC_011978	GTT	2	6	1517929	1517934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100528
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33237	NC_011978	GAT	2	6	1518207	1518212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100528
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33338	NC_011978	TCAA	2	8	1523004	1523011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33339	NC_011978	CTT	2	6	1523056	1523061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100533
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33342	NC_011978	GAG	2	6	1523161	1523166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100533
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33345	NC_011978	A	6	6	1523444	1523449	100 %	0 %	0 %	0 %	222100533
33346	NC_011978	CGCT	2	8	1523465	1523472	0 %	25 %	25 %	50 %	222100533
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33349	NC_011978	CA	3	6	1523709	1523714	50 %	0 %	0 %	50 %	222100533
33350	NC_011978	A	7	7	1523763	1523769	100 %	0 %	0 %	0 %	222100533
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33470	NC_011978	TA	3	6	1528635	1528640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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