MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31003	NC_011978	AT	3	6	1414739	1414744	50 %	50 %	0 %	0 %	222100418
31004	NC_011978	A	6	6	1414748	1414753	100 %	0 %	0 %	0 %	222100418
31005	NC_011978	AGT	2	6	1414799	1414804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100418
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31010	NC_011978	ACA	2	6	1415127	1415132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100418
31011	NC_011978	TA	4	8	1415133	1415140	50 %	50 %	0 %	0 %	222100418
31012	NC_011978	CAT	2	6	1415149	1415154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100418
31013	NC_011978	A	6	6	1415199	1415204	100 %	0 %	0 %	0 %	222100418
31014	NC_011978	AGA	2	6	1415223	1415228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100418
31015	NC_011978	GAA	2	6	1415273	1415278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100418
31016	NC_011978	TA	3	6	1415389	1415394	50 %	50 %	0 %	0 %	222100418
31017	NC_011978	GAG	2	6	1415499	1415504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100418
31018	NC_011978	GA	3	6	1415653	1415658	50 %	0 %	50 %	0 %	222100418
31019	NC_011978	GTTT	2	8	1415707	1415714	0 %	75 %	25 %	0 %	222100419
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31025	NC_011978	TTTC	2	8	1415829	1415836	0 %	75 %	0 %	25 %	222100419
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31035	NC_011978	CAG	2	6	1416248	1416253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100420
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31056	NC_011978	CTG	2	6	1417057	1417062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100421
31057	NC_011978	GGA	2	6	1417200	1417205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100421
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31083	NC_011978	TC	3	6	1418284	1418289	0 %	50 %	0 %	50 %	222100421
31084	NC_011978	TAA	3	9	1418303	1418311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100421
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31088	NC_011978	ATT	2	6	1418466	1418471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31098	NC_011978	A	7	7	1419010	1419016	100 %	0 %	0 %	0 %	222100422
31099	NC_011978	ACG	2	6	1419021	1419026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100422
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31101	NC_011978	ACG	2	6	1419069	1419074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100422
31102	NC_011978	TAC	2	6	1419083	1419088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100422
31103	NC_011978	GAT	2	6	1419200	1419205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100422
31104	NC_011978	TC	3	6	1419208	1419213	0 %	50 %	0 %	50 %	222100422
31105	NC_011978	GTG	2	6	1419254	1419259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100422
31106	NC_011978	TGA	2	6	1419262	1419267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100422
31107	NC_011978	GA	3	6	1419307	1419312	50 %	0 %	50 %	0 %	222100422
31108	NC_011978	TCG	2	6	1419327	1419332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100422
31109	NC_011978	TGA	2	6	1419342	1419347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100422
31110	NC_011978	CATCT	2	10	1419387	1419396	20 %	40 %	0 %	40 %	222100422
31111	NC_011978	TGA	2	6	1419411	1419416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100422
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31114	NC_011978	GAA	2	6	1419517	1419522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100422
31115	NC_011978	A	6	6	1419556	1419561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31116	NC_011978	AGC	2	6	1419585	1419590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31117	NC_011978	AATG	2	8	1419612	1419619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31118	NC_011978	ATG	2	6	1419698	1419703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100423
31119	NC_011978	GAAA	2	8	1419795	1419802	75 %	0 %	25 %	0 %	222100423
31120	NC_011978	CTG	2	6	1419817	1419822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100423
31121	NC_011978	CCA	2	6	1419843	1419848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100423
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31123	NC_011978	TGAAAG	2	12	1419897	1419908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222100423
31124	NC_011978	TTC	2	6	1419984	1419989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100423
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31128	NC_011978	TCT	3	9	1420120	1420128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100423
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31132	NC_011978	TTTG	2	8	1420352	1420359	0 %	75 %	25 %	0 %	222100423
31133	NC_011978	CTG	2	6	1420365	1420370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100423
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31143	NC_011978	T	6	6	1420811	1420816	0 %	100 %	0 %	0 %	222100424
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31151	NC_011978	TCT	2	6	1421217	1421222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100424
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31231	NC_011978	GTT	2	6	1425035	1425040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100428
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31233	NC_011978	AG	3	6	1425117	1425122	50 %	0 %	50 %	0 %	222100428
31234	NC_011978	TCT	2	6	1425129	1425134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100428
31235	NC_011978	GTC	2	6	1425146	1425151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100428
31236	NC_011978	GT	4	8	1425248	1425255	0 %	50 %	50 %	0 %	222100428
31237	NC_011978	TTC	2	6	1425297	1425302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100428
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31241	NC_011978	CTG	2	6	1425387	1425392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100428
31242	NC_011978	TGT	2	6	1425427	1425432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100428
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31251	NC_011978	GTA	3	9	1425734	1425742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100428
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31261	NC_011978	AGGAA	2	10	1425996	1426005	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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31266	NC_011978	AAC	2	6	1426220	1426225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100429
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31343	NC_011978	CTT	2	6	1430130	1430135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100436
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31347	NC_011978	GAAAA	2	10	1430418	1430427	80 %	0 %	20 %	0 %	222100436
31348	NC_011978	CTTTT	2	10	1430453	1430462	0 %	80 %	0 %	20 %	222100436
31349	NC_011978	AAAG	2	8	1430464	1430471	75 %	0 %	25 %	0 %	222100436
31350	NC_011978	AAGA	2	8	1430493	1430500	75 %	0 %	25 %	0 %	222100436
31351	NC_011978	AGGAA	2	10	1430507	1430516	60 %	0 %	40 %	0 %	222100436
31352	NC_011978	AGA	2	6	1430567	1430572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100437
31353	NC_011978	TGA	2	6	1430644	1430649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100437
31354	NC_011978	GAA	2	6	1430732	1430737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100437
31355	NC_011978	ATG	2	6	1430757	1430762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100437
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31357	NC_011978	TCT	2	6	1430776	1430781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100437
31358	NC_011978	TGA	2	6	1430782	1430787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100437
31359	NC_011978	AGA	2	6	1430811	1430816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100437
31360	NC_011978	ACC	2	6	1430826	1430831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100437
31361	NC_011978	AG	3	6	1430837	1430842	50 %	0 %	50 %	0 %	222100437
31362	NC_011978	TCG	2	6	1430906	1430911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100438
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31364	NC_011978	CTT	2	6	1431010	1431015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100438
31365	NC_011978	CCA	2	6	1431066	1431071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100438
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31369	NC_011978	AC	3	6	1431142	1431147	50 %	0 %	0 %	50 %	222100438
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31374	NC_011978	CCA	2	6	1431333	1431338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100438
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31380	NC_011978	TCA	2	6	1431686	1431691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100438
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31474	NC_011978	TCT	3	9	1435557	1435565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100444
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31482	NC_011978	CTGT	2	8	1435940	1435947	0 %	50 %	25 %	25 %	222100444
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31499	NC_011978	TCG	2	6	1436698	1436703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100445
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