MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_011978	GGC	2	6	1369744	1369749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100373
30003	NC_011978	TTCGT	2	10	1369764	1369773	0 %	60 %	20 %	20 %	222100373
30004	NC_011978	AGA	2	6	1369781	1369786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100373
30005	NC_011978	A	6	6	1369790	1369795	100 %	0 %	0 %	0 %	222100373
30006	NC_011978	TTC	2	6	1369811	1369816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100373
30007	NC_011978	GTTC	2	8	1369819	1369826	0 %	50 %	25 %	25 %	222100373
30008	NC_011978	GAA	2	6	1369835	1369840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100373
30009	NC_011978	TCT	2	6	1369869	1369874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100373
30010	NC_011978	A	6	6	1369901	1369906	100 %	0 %	0 %	0 %	222100373
30011	NC_011978	GCGA	2	8	1369937	1369944	25 %	0 %	50 %	25 %	222100373
30012	NC_011978	TTCTC	2	10	1369980	1369989	0 %	60 %	0 %	40 %	222100373
30013	NC_011978	GAA	2	6	1370036	1370041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100373
30014	NC_011978	GA	3	6	1370044	1370049	50 %	0 %	50 %	0 %	222100373
30015	NC_011978	CA	3	6	1370074	1370079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30016	NC_011978	TAT	2	6	1370114	1370119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30017	NC_011978	AAGG	2	8	1370133	1370140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30018	NC_011978	GAG	2	6	1370157	1370162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100374
30019	NC_011978	TG	3	6	1370233	1370238	0 %	50 %	50 %	0 %	222100374
30020	NC_011978	AG	3	6	1370299	1370304	50 %	0 %	50 %	0 %	222100374
30021	NC_011978	TGG	2	6	1370311	1370316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100374
30022	NC_011978	CG	3	6	1370362	1370367	0 %	0 %	50 %	50 %	222100374
30023	NC_011978	GAA	2	6	1370426	1370431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100375
30024	NC_011978	TG	3	6	1370478	1370483	0 %	50 %	50 %	0 %	222100375
30025	NC_011978	GT	3	6	1370549	1370554	0 %	50 %	50 %	0 %	222100375
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30030	NC_011978	TG	3	6	1370648	1370653	0 %	50 %	50 %	0 %	222100376
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30032	NC_011978	GAG	2	6	1370715	1370720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100376
30033	NC_011978	TCTT	2	8	1370780	1370787	0 %	75 %	0 %	25 %	222100376
30034	NC_011978	CTC	2	6	1370794	1370799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100376
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30036	NC_011978	GAA	2	6	1370938	1370943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100376
30037	NC_011978	AGG	2	6	1370960	1370965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100376
30038	NC_011978	GCG	2	6	1370990	1370995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30039	NC_011978	GTG	2	6	1371064	1371069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100377
30040	NC_011978	AAG	2	6	1371144	1371149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100377
30041	NC_011978	TCCA	2	8	1371178	1371185	25 %	25 %	0 %	50 %	222100377
30042	NC_011978	AGATCG	2	12	1371325	1371336	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222100377
30043	NC_011978	AAC	2	6	1371369	1371374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100377
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30047	NC_011978	CA	3	6	1371696	1371701	50 %	0 %	0 %	50 %	222100377
30048	NC_011978	GAGT	2	8	1371835	1371842	25 %	25 %	50 %	0 %	222100377
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30051	NC_011978	TTC	2	6	1371991	1371996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100377
30052	NC_011978	ATTC	2	8	1372017	1372024	25 %	50 %	0 %	25 %	222100377
30053	NC_011978	GTA	2	6	1372152	1372157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100377
30054	NC_011978	CTC	2	6	1372304	1372309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100377
30055	NC_011978	TAA	2	6	1372345	1372350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30056	NC_011978	TCT	2	6	1372398	1372403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100378
30057	NC_011978	GAT	2	6	1372468	1372473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100378
30058	NC_011978	CTT	2	6	1372483	1372488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100378
30059	NC_011978	CT	3	6	1372494	1372499	0 %	50 %	0 %	50 %	222100378
30060	NC_011978	GAACA	2	10	1372502	1372511	60 %	0 %	20 %	20 %	222100378
30061	NC_011978	CGATA	2	10	1372542	1372551	40 %	20 %	20 %	20 %	222100378
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30066	NC_011978	CTT	2	6	1372752	1372757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100378
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30068	NC_011978	TCA	2	6	1372803	1372808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100378
30069	NC_011978	GAA	2	6	1372849	1372854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100378
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30071	NC_011978	GA	4	8	1372912	1372919	50 %	0 %	50 %	0 %	222100378
30072	NC_011978	GAA	2	6	1372940	1372945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100378
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30076	NC_011978	T	6	6	1373025	1373030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30077	NC_011978	TCTG	2	8	1373040	1373047	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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30082	NC_011978	TGAGA	2	10	1373313	1373322	40 %	20 %	40 %	0 %	222100379
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30089	NC_011978	ATG	2	6	1373476	1373481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100379
30090	NC_011978	GAC	2	6	1373521	1373526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100379
30091	NC_011978	GTT	2	6	1373527	1373532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100379
30092	NC_011978	CTT	2	6	1373560	1373565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100379
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30104	NC_011978	GA	3	6	1374122	1374127	50 %	0 %	50 %	0 %	222100379
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30107	NC_011978	ATT	2	6	1374326	1374331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100379
30108	NC_011978	TGGA	2	8	1374395	1374402	25 %	25 %	50 %	0 %	222100379
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30110	NC_011978	GAGT	2	8	1374501	1374508	25 %	25 %	50 %	0 %	222100379
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30112	NC_011978	GATGG	2	10	1374608	1374617	20 %	20 %	60 %	0 %	222100379
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30115	NC_011978	A	6	6	1374799	1374804	100 %	0 %	0 %	0 %	222100379
30116	NC_011978	TCG	2	6	1374806	1374811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100379
30117	NC_011978	G	6	6	1374825	1374830	0 %	0 %	100 %	0 %	222100379
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30119	NC_011978	GAA	2	6	1374967	1374972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100380
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30238	NC_011978	T	6	6	1379868	1379873	0 %	100 %	0 %	0 %	222100384
30239	NC_011978	CTCGTA	2	12	1379910	1379921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222100384
30240	NC_011978	GTG	2	6	1379924	1379929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100384
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30316	NC_011978	GAAA	2	8	1383676	1383683	75 %	0 %	25 %	0 %	222100386
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30330	NC_011978	TGA	2	6	1384150	1384155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100387
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30334	NC_011978	GCATG	2	10	1384273	1384282	20 %	20 %	40 %	20 %	222100387
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30337	NC_011978	GAT	2	6	1384475	1384480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100387
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30341	NC_011978	T	6	6	1384567	1384572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30342	NC_011978	TTTTC	2	10	1384605	1384614	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30343	NC_011978	T	6	6	1384627	1384632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30344	NC_011978	TCC	2	6	1384703	1384708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30345	NC_011978	TGA	2	6	1384713	1384718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30355	NC_011978	GAA	2	6	1385051	1385056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100388
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30477	NC_011978	AAG	2	6	1390548	1390553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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