MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_011978	ATC	2	6	1325829	1325834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100334
29003	NC_011978	GCG	2	6	1325904	1325909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100334
29004	NC_011978	CCAG	2	8	1325916	1325923	25 %	0 %	25 %	50 %	222100334
29005	NC_011978	CTCCG	2	10	1325954	1325963	0 %	20 %	20 %	60 %	222100334
29006	NC_011978	TGC	2	6	1326008	1326013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100334
29007	NC_011978	ACC	2	6	1326036	1326041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100334
29008	NC_011978	CCA	2	6	1326166	1326171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100334
29009	NC_011978	ACC	2	6	1326251	1326256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100334
29010	NC_011978	TC	3	6	1326291	1326296	0 %	50 %	0 %	50 %	222100334
29011	NC_011978	ATT	2	6	1326327	1326332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100334
29012	NC_011978	AAAC	2	8	1326340	1326347	75 %	0 %	0 %	25 %	222100334
29013	NC_011978	GTC	2	6	1326429	1326434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100334
29014	NC_011978	A	6	6	1326455	1326460	100 %	0 %	0 %	0 %	222100334
29015	NC_011978	TAT	2	6	1326470	1326475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100334
29016	NC_011978	AGAA	2	8	1326612	1326619	75 %	0 %	25 %	0 %	222100334
29017	NC_011978	TCT	2	6	1326634	1326639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100334
29018	NC_011978	GAG	2	6	1326665	1326670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100334
29019	NC_011978	AAG	2	6	1326757	1326762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100335
29020	NC_011978	GAAA	2	8	1326844	1326851	75 %	0 %	25 %	0 %	222100335
29021	NC_011978	GAT	2	6	1326907	1326912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100335
29022	NC_011978	GAT	2	6	1326934	1326939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100335
29023	NC_011978	TG	3	6	1326974	1326979	0 %	50 %	50 %	0 %	222100335
29024	NC_011978	TCCGA	2	10	1327082	1327091	20 %	20 %	20 %	40 %	222100336
29025	NC_011978	AAC	2	6	1327123	1327128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100336
29026	NC_011978	GA	3	6	1327163	1327168	50 %	0 %	50 %	0 %	222100336
29027	NC_011978	TTTC	2	8	1327263	1327270	0 %	75 %	0 %	25 %	222100336
29028	NC_011978	AGA	3	9	1327298	1327306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100336
29029	NC_011978	CTG	2	6	1327311	1327316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100336
29030	NC_011978	TCC	2	6	1327327	1327332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100336
29031	NC_011978	TCC	2	6	1327339	1327344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100336
29032	NC_011978	GA	3	6	1327352	1327357	50 %	0 %	50 %	0 %	222100336
29033	NC_011978	GAA	2	6	1327401	1327406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100336
29034	NC_011978	TTC	2	6	1327443	1327448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100336
29035	NC_011978	AAG	2	6	1327504	1327509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100336
29036	NC_011978	CGAT	2	8	1327554	1327561	25 %	25 %	25 %	25 %	222100336
29037	NC_011978	GA	3	6	1327706	1327711	50 %	0 %	50 %	0 %	222100336
29038	NC_011978	CAT	2	6	1327753	1327758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100336
29039	NC_011978	TTC	2	6	1327803	1327808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100336
29040	NC_011978	ATC	2	6	1327809	1327814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100337
29041	NC_011978	CTG	2	6	1327847	1327852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100337
29042	NC_011978	ACAG	2	8	1327924	1327931	50 %	0 %	25 %	25 %	222100337
29043	NC_011978	GA	3	6	1327938	1327943	50 %	0 %	50 %	0 %	222100337
29044	NC_011978	T	6	6	1327972	1327977	0 %	100 %	0 %	0 %	222100337
29045	NC_011978	A	6	6	1327989	1327994	100 %	0 %	0 %	0 %	222100337
29046	NC_011978	TGC	2	6	1327995	1328000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100337
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29050	NC_011978	TCG	2	6	1328064	1328069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100338
29051	NC_011978	CAGA	2	8	1328098	1328105	50 %	0 %	25 %	25 %	222100338
29052	NC_011978	A	7	7	1328157	1328163	100 %	0 %	0 %	0 %	222100338
29053	NC_011978	ACA	2	6	1328169	1328174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100338
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29055	NC_011978	CCTG	2	8	1328253	1328260	0 %	25 %	25 %	50 %	222100338
29056	NC_011978	TGT	2	6	1328266	1328271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100338
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29059	NC_011978	AGAT	2	8	1328438	1328445	50 %	25 %	25 %	0 %	222100339
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29062	NC_011978	AG	3	6	1328560	1328565	50 %	0 %	50 %	0 %	222100339
29063	NC_011978	GAA	2	6	1328590	1328595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100339
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29065	NC_011978	TCA	2	6	1328701	1328706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100340
29066	NC_011978	TTC	3	9	1328776	1328784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100340
29067	NC_011978	GAA	2	6	1328891	1328896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100340
29068	NC_011978	CGA	2	6	1328999	1329004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100340
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29070	NC_011978	TAG	2	6	1329164	1329169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29071	NC_011978	AG	3	6	1329185	1329190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29072	NC_011978	AAT	2	6	1329298	1329303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29073	NC_011978	GGT	2	6	1329405	1329410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29074	NC_011978	TTG	2	6	1329439	1329444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100341
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29086	NC_011978	CA	3	6	1330424	1330429	50 %	0 %	0 %	50 %	222100341
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29089	NC_011978	ACG	2	6	1330495	1330500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100341
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29091	NC_011978	GAA	2	6	1330536	1330541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100341
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29094	NC_011978	AGGG	2	8	1330634	1330641	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29095	NC_011978	GAA	2	6	1330650	1330655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100342
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29099	NC_011978	CTG	2	6	1330771	1330776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100342
29100	NC_011978	AATC	2	8	1330797	1330804	50 %	25 %	0 %	25 %	222100342
29101	NC_011978	TTGCT	2	10	1330841	1330850	0 %	60 %	20 %	20 %	222100342
29102	NC_011978	AGG	2	6	1330934	1330939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100342
29103	NC_011978	GTG	2	6	1330978	1330983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100342
29104	NC_011978	CT	3	6	1331029	1331034	0 %	50 %	0 %	50 %	222100342
29105	NC_011978	ATCT	2	8	1331077	1331084	25 %	50 %	0 %	25 %	222100342
29106	NC_011978	AGG	2	6	1331120	1331125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100342
29107	NC_011978	ACGAC	2	10	1331246	1331255	40 %	0 %	20 %	40 %	222100342
29108	NC_011978	GAC	2	6	1331278	1331283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100342
29109	NC_011978	A	7	7	1331370	1331376	100 %	0 %	0 %	0 %	222100342
29110	NC_011978	CATG	2	8	1331415	1331422	25 %	25 %	25 %	25 %	222100342
29111	NC_011978	GGCT	2	8	1331438	1331445	0 %	25 %	50 %	25 %	222100342
29112	NC_011978	ATG	2	6	1331459	1331464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100342
29113	NC_011978	ACC	2	6	1331485	1331490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100342
29114	NC_011978	GTG	2	6	1331491	1331496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100342
29115	NC_011978	AAG	2	6	1331528	1331533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100342
29116	NC_011978	GAA	2	6	1331604	1331609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100342
29117	NC_011978	T	6	6	1331610	1331615	0 %	100 %	0 %	0 %	222100342
29118	NC_011978	CTT	2	6	1331649	1331654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100342
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29231	NC_011978	ATCG	2	8	1337228	1337235	25 %	25 %	25 %	25 %	222100345
29232	NC_011978	GAA	3	9	1337238	1337246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100345
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29354	NC_011978	TGG	2	6	1342117	1342122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100349
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29372	NC_011978	GGA	2	6	1343060	1343065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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