MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_011978	AAGA	2	8	1278901	1278908	75 %	0 %	25 %	0 %	222100291
28003	NC_011978	TGA	2	6	1278930	1278935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100291
28004	NC_011978	AC	3	6	1278945	1278950	50 %	0 %	0 %	50 %	222100291
28005	NC_011978	TTC	2	6	1279000	1279005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100291
28006	NC_011978	TCC	2	6	1279025	1279030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100291
28007	NC_011978	AACG	2	8	1279097	1279104	50 %	0 %	25 %	25 %	222100291
28008	NC_011978	CCT	2	6	1279120	1279125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100291
28009	NC_011978	GAA	2	6	1279164	1279169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100291
28010	NC_011978	ATG	2	6	1279244	1279249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100291
28011	NC_011978	CTC	2	6	1279289	1279294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100291
28012	NC_011978	GAA	2	6	1279351	1279356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100291
28013	NC_011978	AGG	2	6	1279406	1279411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100291
28014	NC_011978	GCC	2	6	1279478	1279483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100291
28015	NC_011978	CGA	2	6	1279545	1279550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100291
28016	NC_011978	AGA	2	6	1279748	1279753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100293
28017	NC_011978	T	7	7	1279773	1279779	0 %	100 %	0 %	0 %	222100293
28018	NC_011978	AAG	2	6	1279784	1279789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100293
28019	NC_011978	GAA	2	6	1279826	1279831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100293
28020	NC_011978	CCA	2	6	1279888	1279893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100293
28021	NC_011978	TC	3	6	1279904	1279909	0 %	50 %	0 %	50 %	222100293
28022	NC_011978	AGG	2	6	1279987	1279992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100293
28023	NC_011978	ACC	2	6	1280103	1280108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100293
28024	NC_011978	AG	3	6	1280163	1280168	50 %	0 %	50 %	0 %	222100293
28025	NC_011978	CTG	2	6	1280241	1280246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100293
28026	NC_011978	GAC	2	6	1280249	1280254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100293
28027	NC_011978	TGA	2	6	1280278	1280283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100293
28028	NC_011978	CAA	2	6	1280302	1280307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100293
28029	NC_011978	TTC	2	6	1280346	1280351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100293
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28032	NC_011978	GA	3	6	1280422	1280427	50 %	0 %	50 %	0 %	222100293
28033	NC_011978	ACC	2	6	1280505	1280510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100293
28034	NC_011978	TTTCC	2	10	1280524	1280533	0 %	60 %	0 %	40 %	222100293
28035	NC_011978	CTT	2	6	1280549	1280554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100293
28036	NC_011978	CT	3	6	1280564	1280569	0 %	50 %	0 %	50 %	222100293
28037	NC_011978	CTG	2	6	1280674	1280679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100293
28038	NC_011978	T	6	6	1280702	1280707	0 %	100 %	0 %	0 %	222100293
28039	NC_011978	ATC	2	6	1280778	1280783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100293
28040	NC_011978	CCT	2	6	1280790	1280795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28041	NC_011978	TAAT	2	8	1280809	1280816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28042	NC_011978	AGG	2	6	1280866	1280871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100294
28043	NC_011978	ATGG	2	8	1280900	1280907	25 %	25 %	50 %	0 %	222100294
28044	NC_011978	GAG	2	6	1280984	1280989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100294
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28046	NC_011978	CT	3	6	1281064	1281069	0 %	50 %	0 %	50 %	222100294
28047	NC_011978	A	6	6	1281082	1281087	100 %	0 %	0 %	0 %	222100294
28048	NC_011978	GAG	2	6	1281095	1281100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100294
28049	NC_011978	GAA	2	6	1281166	1281171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100294
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28051	NC_011978	ATCT	2	8	1281311	1281318	25 %	50 %	0 %	25 %	222100294
28052	NC_011978	CT	3	6	1281436	1281441	0 %	50 %	0 %	50 %	222100294
28053	NC_011978	CTT	2	6	1281458	1281463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100294
28054	NC_011978	AG	3	6	1281515	1281520	50 %	0 %	50 %	0 %	222100294
28055	NC_011978	TCC	2	6	1281548	1281553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100295
28056	NC_011978	GGC	2	6	1281594	1281599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100295
28057	NC_011978	CTTT	2	8	1281603	1281610	0 %	75 %	0 %	25 %	222100295
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28062	NC_011978	TCCCT	2	10	1281823	1281832	0 %	40 %	0 %	60 %	222100295
28063	NC_011978	CGTC	2	8	1281866	1281873	0 %	25 %	25 %	50 %	222100295
28064	NC_011978	AGCC	2	8	1281973	1281980	25 %	0 %	25 %	50 %	222100295
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28067	NC_011978	ATG	2	6	1282117	1282122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100295
28068	NC_011978	CAA	2	6	1282250	1282255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100295
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28070	NC_011978	GGAT	2	8	1282375	1282382	25 %	25 %	50 %	0 %	222100295
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28085	NC_011978	TCG	2	6	1282969	1282974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100295
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28092	NC_011978	CGATG	2	10	1283302	1283311	20 %	20 %	40 %	20 %	222100296
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28100	NC_011978	GAG	2	6	1283548	1283553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100296
28101	NC_011978	CT	3	6	1283564	1283569	0 %	50 %	0 %	50 %	222100296
28102	NC_011978	TTC	2	6	1283617	1283622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100296
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28106	NC_011978	AC	3	6	1283784	1283789	50 %	0 %	0 %	50 %	222100296
28107	NC_011978	C	7	7	1283794	1283800	0 %	0 %	0 %	100 %	222100297
28108	NC_011978	TCC	2	6	1283815	1283820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100297
28109	NC_011978	GCCA	2	8	1283837	1283844	25 %	0 %	25 %	50 %	222100297
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28112	NC_011978	TGA	2	6	1284034	1284039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100297
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28114	NC_011978	TCT	2	6	1284151	1284156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100297
28115	NC_011978	TC	3	6	1284159	1284164	0 %	50 %	0 %	50 %	222100297
28116	NC_011978	TCC	2	6	1284169	1284174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100297
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28118	NC_011978	TCCT	2	8	1284233	1284240	0 %	50 %	0 %	50 %	222100297
28119	NC_011978	CCG	2	6	1284339	1284344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100297
28120	NC_011978	TTC	2	6	1284404	1284409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100297
28121	NC_011978	CGA	2	6	1284490	1284495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100297
28122	NC_011978	CGG	2	6	1284502	1284507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100297
28123	NC_011978	GGA	2	6	1284535	1284540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100297
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28224	NC_011978	GGA	2	6	1288674	1288679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100301
28225	NC_011978	CTCA	2	8	1288744	1288751	25 %	25 %	0 %	50 %	222100301
28226	NC_011978	GAAG	2	8	1288764	1288771	50 %	0 %	50 %	0 %	222100301
28227	NC_011978	AG	3	6	1288916	1288921	50 %	0 %	50 %	0 %	222100301
28228	NC_011978	CGA	2	6	1289031	1289036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100301
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28230	NC_011978	T	6	6	1289196	1289201	0 %	100 %	0 %	0 %	222100302
28231	NC_011978	ATC	2	6	1289216	1289221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100302
28232	NC_011978	TTCT	2	8	1289368	1289375	0 %	75 %	0 %	25 %	222100302
28233	NC_011978	GCCA	2	8	1289397	1289404	25 %	0 %	25 %	50 %	222100302
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28473	NC_011978	TAC	2	6	1300145	1300150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100313
28474	NC_011978	ATC	2	6	1300188	1300193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100313
28475	NC_011978	GGT	2	6	1300220	1300225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100313
28476	NC_011978	TCT	2	6	1300279	1300284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100313
28477	NC_011978	TGGCAC	2	12	1300446	1300457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222100313
28478	NC_011978	GAT	2	6	1300465	1300470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100313
28479	NC_011978	TGT	2	6	1300480	1300485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100313
28480	NC_011978	TCA	2	6	1300488	1300493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100313
28481	NC_011978	GT	3	6	1300500	1300505	0 %	50 %	50 %	0 %	222100313
28482	NC_011978	GAG	2	6	1300529	1300534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100313
28483	NC_011978	T	6	6	1300570	1300575	0 %	100 %	0 %	0 %	222100313
28484	NC_011978	CGC	2	6	1300609	1300614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100313
28485	NC_011978	CA	3	6	1300698	1300703	50 %	0 %	0 %	50 %	222100313
28486	NC_011978	TTC	2	6	1300787	1300792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100313
28487	NC_011978	CTG	2	6	1300950	1300955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100314
28488	NC_011978	ACC	2	6	1300977	1300982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100314
28489	NC_011978	GAA	2	6	1301023	1301028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100314
28490	NC_011978	TCT	2	6	1301029	1301034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100314
28491	NC_011978	GA	3	6	1301126	1301131	50 %	0 %	50 %	0 %	222100314
28492	NC_011978	AAG	2	6	1301157	1301162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100314
28493	NC_011978	AGG	2	6	1301184	1301189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100314
28494	NC_011978	GGC	2	6	1301198	1301203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100314
28495	NC_011978	TCT	2	6	1301207	1301212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100314
28496	NC_011978	GTTGCC	2	12	1301274	1301285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100314
28497	NC_011978	CG	3	6	1301286	1301291	0 %	0 %	50 %	50 %	222100314
28498	NC_011978	GATG	2	8	1301318	1301325	25 %	25 %	50 %	0 %	222100314
28499	NC_011978	A	6	6	1301379	1301384	100 %	0 %	0 %	0 %	222100314
28500	NC_011978	ACA	2	6	1301406	1301411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100314

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