MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_011978	CGTA	2	8	1234445	1234452	25 %	25 %	25 %	25 %	222100249
27003	NC_011978	AAG	2	6	1234482	1234487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100249
27004	NC_011978	TC	3	6	1234537	1234542	0 %	50 %	0 %	50 %	222100249
27005	NC_011978	AAG	2	6	1234545	1234550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100249
27006	NC_011978	GAA	2	6	1234557	1234562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100249
27007	NC_011978	AG	3	6	1234633	1234638	50 %	0 %	50 %	0 %	222100249
27008	NC_011978	GAA	2	6	1234646	1234651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100249
27009	NC_011978	TCCC	2	8	1234682	1234689	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27010	NC_011978	TGC	2	6	1234769	1234774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100250
27011	NC_011978	TCAA	2	8	1234779	1234786	50 %	25 %	0 %	25 %	222100250
27012	NC_011978	TAT	2	6	1234886	1234891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100250
27013	NC_011978	AAG	2	6	1235009	1235014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100250
27014	NC_011978	TC	3	6	1235025	1235030	0 %	50 %	0 %	50 %	222100250
27015	NC_011978	CAG	2	6	1235033	1235038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100250
27016	NC_011978	T	6	6	1235205	1235210	0 %	100 %	0 %	0 %	222100250
27017	NC_011978	GAA	2	6	1235246	1235251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100250
27018	NC_011978	TAT	2	6	1235339	1235344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100250
27019	NC_011978	AAG	2	6	1235384	1235389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100250
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27021	NC_011978	TGA	2	6	1235422	1235427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100250
27022	NC_011978	AGC	2	6	1235499	1235504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100250
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27027	NC_011978	GGAA	2	8	1235679	1235686	50 %	0 %	50 %	0 %	222100251
27028	NC_011978	GAA	2	6	1235713	1235718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100251
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27034	NC_011978	ACC	2	6	1236044	1236049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27035	NC_011978	CCA	2	6	1236057	1236062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27036	NC_011978	ACC	2	6	1236064	1236069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27037	NC_011978	ATC	2	6	1236161	1236166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100252
27038	NC_011978	TCCT	2	8	1236188	1236195	0 %	50 %	0 %	50 %	222100252
27039	NC_011978	GAT	2	6	1236261	1236266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100252
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27041	NC_011978	TGTT	2	8	1236293	1236300	0 %	75 %	25 %	0 %	222100252
27042	NC_011978	GAA	2	6	1236377	1236382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100252
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27047	NC_011978	AAGAC	2	10	1236487	1236496	60 %	0 %	20 %	20 %	222100252
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27050	NC_011978	TCA	2	6	1236563	1236568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100252
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27052	NC_011978	ATG	2	6	1236673	1236678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100252
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27054	NC_011978	GTA	2	6	1236708	1236713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100252
27055	NC_011978	CAAAG	2	10	1236717	1236726	60 %	0 %	20 %	20 %	222100252
27056	NC_011978	AGG	2	6	1236775	1236780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100252
27057	NC_011978	GAT	2	6	1236786	1236791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100252
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27099	NC_011978	GGTA	2	8	1238782	1238789	25 %	25 %	50 %	0 %	222100255
27100	NC_011978	TC	3	6	1238954	1238959	0 %	50 %	0 %	50 %	222100255
27101	NC_011978	ATC	2	6	1239000	1239005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100255
27102	NC_011978	ATTC	2	8	1239026	1239033	25 %	50 %	0 %	25 %	222100255
27103	NC_011978	TTA	2	6	1239072	1239077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100255
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27105	NC_011978	CGT	2	6	1239118	1239123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100255
27106	NC_011978	CTT	2	6	1239138	1239143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100255
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27108	NC_011978	TTA	2	6	1239247	1239252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100255
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27110	NC_011978	AG	3	6	1239322	1239327	50 %	0 %	50 %	0 %	222100255
27111	NC_011978	CCA	2	6	1239336	1239341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100255
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27113	NC_011978	GAG	2	6	1239412	1239417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100255
27114	NC_011978	TTTC	2	8	1239429	1239436	0 %	75 %	0 %	25 %	222100255
27115	NC_011978	TAT	2	6	1239439	1239444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100255
27116	NC_011978	TGC	2	6	1239459	1239464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100255
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27358	NC_011978	CGG	2	6	1250674	1250679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100266
27359	NC_011978	AG	3	6	1250732	1250737	50 %	0 %	50 %	0 %	222100266
27360	NC_011978	CCT	2	6	1250739	1250744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100266
27361	NC_011978	GTC	2	6	1250816	1250821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100266
27362	NC_011978	TTC	2	6	1250845	1250850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100266
27363	NC_011978	CGT	2	6	1250851	1250856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100266
27364	NC_011978	GTCGAA	2	12	1250858	1250869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222100266
27365	NC_011978	GAA	2	6	1250945	1250950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100266
27366	NC_011978	TCT	2	6	1250974	1250979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100266
27367	NC_011978	CCA	2	6	1251126	1251131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27368	NC_011978	AAGA	2	8	1251143	1251150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27369	NC_011978	CAT	2	6	1251167	1251172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27373	NC_011978	TCGA	2	8	1251271	1251278	25 %	25 %	25 %	25 %	222100267
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27375	NC_011978	CTT	2	6	1251450	1251455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100267
27376	NC_011978	TTC	2	6	1251469	1251474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100267
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27404	NC_011978	CT	3	6	1252761	1252766	0 %	50 %	0 %	50 %	222100268
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27446	NC_011978	CTG	2	6	1254576	1254581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100269
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27470	NC_011978	GTC	3	9	1255449	1255457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100269
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27474	NC_011978	GAA	2	6	1255530	1255535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100269
27475	NC_011978	TGG	2	6	1255561	1255566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100269
27476	NC_011978	A	6	6	1255574	1255579	100 %	0 %	0 %	0 %	222100269
27477	NC_011978	CAGT	2	8	1255615	1255622	25 %	25 %	25 %	25 %	222100269
27478	NC_011978	ATC	2	6	1255656	1255661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100269
27479	NC_011978	TCT	2	6	1255715	1255720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100269
27480	NC_011978	A	6	6	1255773	1255778	100 %	0 %	0 %	0 %	222100269
27481	NC_011978	A	6	6	1255829	1255834	100 %	0 %	0 %	0 %	222100269
27482	NC_011978	GGCC	2	8	1255842	1255849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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27487	NC_011978	CGA	2	6	1256029	1256034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100270
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27490	NC_011978	TGA	2	6	1256227	1256232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100270
27491	NC_011978	GGA	2	6	1256241	1256246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100270
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27500	NC_011978	TCG	2	6	1256478	1256483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100270

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