MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_011978	CT	3	6	1188667	1188672	0 %	50 %	0 %	50 %	222100202
26003	NC_011978	TCC	2	6	1188715	1188720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100202
26004	NC_011978	CTT	2	6	1188759	1188764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100202
26005	NC_011978	TCT	2	6	1188815	1188820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100203
26006	NC_011978	CCT	3	9	1188826	1188834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100203
26007	NC_011978	TCT	2	6	1188858	1188863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100203
26008	NC_011978	AGC	2	6	1188884	1188889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100203
26009	NC_011978	TCG	2	6	1188903	1188908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100203
26010	NC_011978	CCTG	2	8	1188933	1188940	0 %	25 %	25 %	50 %	222100203
26011	NC_011978	CCA	2	6	1189003	1189008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100203
26012	NC_011978	TC	3	6	1189239	1189244	0 %	50 %	0 %	50 %	222100203
26013	NC_011978	TC	3	6	1189246	1189251	0 %	50 %	0 %	50 %	222100203
26014	NC_011978	CGA	2	6	1189252	1189257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100203
26015	NC_011978	TTG	2	6	1189353	1189358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100203
26016	NC_011978	TTA	2	6	1189390	1189395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100203
26017	NC_011978	GCA	2	6	1189434	1189439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100203
26018	NC_011978	AACG	2	8	1189502	1189509	50 %	0 %	25 %	25 %	222100203
26019	NC_011978	T	6	6	1189554	1189559	0 %	100 %	0 %	0 %	222100203
26020	NC_011978	GTA	2	6	1189598	1189603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100203
26021	NC_011978	CTT	2	6	1189654	1189659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100203
26022	NC_011978	TTTC	2	8	1189660	1189667	0 %	75 %	0 %	25 %	222100203
26023	NC_011978	GGA	2	6	1189668	1189673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100203
26024	NC_011978	TCA	2	6	1189714	1189719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100203
26025	NC_011978	TCT	2	6	1189722	1189727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100203
26026	NC_011978	AGG	2	6	1189784	1189789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100203
26027	NC_011978	TGA	2	6	1189840	1189845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100203
26028	NC_011978	TTC	2	6	1189929	1189934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
26029	NC_011978	TC	3	6	1189979	1189984	0 %	50 %	0 %	50 %	222100204
26030	NC_011978	CGA	2	6	1190009	1190014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100204
26031	NC_011978	TTC	2	6	1190073	1190078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
26032	NC_011978	CTG	2	6	1190172	1190177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100204
26033	NC_011978	TCT	2	6	1190206	1190211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
26034	NC_011978	TCC	2	6	1190236	1190241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100204
26035	NC_011978	CT	3	6	1190265	1190270	0 %	50 %	0 %	50 %	222100204
26036	NC_011978	TCC	2	6	1190341	1190346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100204
26037	NC_011978	ATG	2	6	1190359	1190364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100204
26038	NC_011978	AG	3	6	1190429	1190434	50 %	0 %	50 %	0 %	222100204
26039	NC_011978	TGT	2	6	1190496	1190501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100204
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26041	NC_011978	GTA	2	6	1190550	1190555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100204
26042	NC_011978	GC	3	6	1190563	1190568	0 %	0 %	50 %	50 %	222100204
26043	NC_011978	AAG	2	6	1190670	1190675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100204
26044	NC_011978	TCT	2	6	1190696	1190701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
26045	NC_011978	TGTT	2	8	1190712	1190719	0 %	75 %	25 %	0 %	222100204
26046	NC_011978	AGT	2	6	1190756	1190761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100204
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26048	NC_011978	ACG	2	6	1190827	1190832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100204
26049	NC_011978	GT	3	6	1190883	1190888	0 %	50 %	50 %	0 %	222100204
26050	NC_011978	CTT	2	6	1190894	1190899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
26051	NC_011978	GAA	2	6	1190941	1190946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100204
26052	NC_011978	CTTC	2	8	1190971	1190978	0 %	50 %	0 %	50 %	222100204
26053	NC_011978	GAT	2	6	1191002	1191007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100204
26054	NC_011978	AGA	2	6	1191033	1191038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100204
26055	NC_011978	CA	3	6	1191052	1191057	50 %	0 %	0 %	50 %	222100204
26056	NC_011978	GT	3	6	1191062	1191067	0 %	50 %	50 %	0 %	222100204
26057	NC_011978	TCT	2	6	1191074	1191079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
26058	NC_011978	GC	3	6	1191087	1191092	0 %	0 %	50 %	50 %	222100204
26059	NC_011978	ATC	2	6	1191114	1191119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100204
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26061	NC_011978	CGTT	2	8	1191155	1191162	0 %	50 %	25 %	25 %	222100204
26062	NC_011978	CTT	2	6	1191164	1191169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
26063	NC_011978	CCA	2	6	1191302	1191307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100204
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26067	NC_011978	TGG	2	6	1191476	1191481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100204
26068	NC_011978	TTTC	2	8	1191503	1191510	0 %	75 %	0 %	25 %	222100204
26069	NC_011978	TCCT	2	8	1191585	1191592	0 %	50 %	0 %	50 %	222100204
26070	NC_011978	GA	3	6	1191602	1191607	50 %	0 %	50 %	0 %	222100204
26071	NC_011978	TCT	2	6	1191646	1191651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100204
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26084	NC_011978	CCT	2	6	1192641	1192646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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26087	NC_011978	TTTC	2	8	1192673	1192680	0 %	75 %	0 %	25 %	222100205
26088	NC_011978	GAT	2	6	1192770	1192775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100205
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26095	NC_011978	TC	3	6	1193004	1193009	0 %	50 %	0 %	50 %	222100206
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26098	NC_011978	TGG	2	6	1193149	1193154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100206
26099	NC_011978	TCTTT	2	10	1193173	1193182	0 %	80 %	0 %	20 %	222100206
26100	NC_011978	TTC	2	6	1193186	1193191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100206
26101	NC_011978	AGG	2	6	1193198	1193203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100206
26102	NC_011978	CAGA	2	8	1193214	1193221	50 %	0 %	25 %	25 %	222100206
26103	NC_011978	TCC	2	6	1193244	1193249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100206
26104	NC_011978	A	6	6	1193372	1193377	100 %	0 %	0 %	0 %	222100206
26105	NC_011978	TTC	2	6	1193474	1193479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100206
26106	NC_011978	TGA	2	6	1193536	1193541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100206
26107	NC_011978	T	6	6	1193552	1193557	0 %	100 %	0 %	0 %	222100206
26108	NC_011978	ACC	2	6	1193603	1193608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100206
26109	NC_011978	TAT	2	6	1193609	1193614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100206
26110	NC_011978	TC	3	6	1193656	1193661	0 %	50 %	0 %	50 %	222100206
26111	NC_011978	CTTT	2	8	1193676	1193683	0 %	75 %	0 %	25 %	222100206
26112	NC_011978	TTTC	2	8	1193684	1193691	0 %	75 %	0 %	25 %	222100206
26113	NC_011978	TTC	3	9	1193693	1193701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100206
26114	NC_011978	TGA	2	6	1193734	1193739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100206
26115	NC_011978	GAG	2	6	1193750	1193755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100206
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26117	NC_011978	TTC	2	6	1193895	1193900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100206
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26350	NC_011978	AGAA	2	8	1203852	1203859	75 %	0 %	25 %	0 %	222100217
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