MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_011978	GATC	2	8	1143917	1143924	25 %	25 %	25 %	25 %	222100150
25002	NC_011978	CTGG	2	8	1143990	1143997	0 %	25 %	50 %	25 %	222100150
25003	NC_011978	A	6	6	1144041	1144046	100 %	0 %	0 %	0 %	222100150
25004	NC_011978	AC	3	6	1144087	1144092	50 %	0 %	0 %	50 %	222100150
25005	NC_011978	CT	3	6	1144120	1144125	0 %	50 %	0 %	50 %	222100150
25006	NC_011978	GA	3	6	1144152	1144157	50 %	0 %	50 %	0 %	222100150
25007	NC_011978	TGGT	2	8	1144262	1144269	0 %	50 %	50 %	0 %	222100150
25008	NC_011978	TCT	2	6	1144374	1144379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100150
25009	NC_011978	A	6	6	1144420	1144425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25010	NC_011978	GCGAA	2	10	1144426	1144435	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25011	NC_011978	TA	5	10	1144482	1144491	50 %	50 %	0 %	0 %	222100151
25012	NC_011978	TAC	2	6	1144515	1144520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100151
25013	NC_011978	TGG	2	6	1144568	1144573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100151
25014	NC_011978	GAA	2	6	1144593	1144598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100151
25015	NC_011978	TGA	2	6	1144606	1144611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100151
25016	NC_011978	AGAA	2	8	1144612	1144619	75 %	0 %	25 %	0 %	222100151
25017	NC_011978	GAA	4	12	1144617	1144628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100151
25018	NC_011978	GAAG	2	8	1144634	1144641	50 %	0 %	50 %	0 %	222100151
25019	NC_011978	AGAA	2	8	1144644	1144651	75 %	0 %	25 %	0 %	222100151
25020	NC_011978	GAGG	2	8	1144654	1144661	25 %	0 %	75 %	0 %	222100151
25021	NC_011978	GGA	2	6	1144745	1144750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100152
25022	NC_011978	GTT	2	6	1144765	1144770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100152
25023	NC_011978	CCGG	2	8	1144772	1144779	0 %	0 %	50 %	50 %	222100152
25024	NC_011978	ATC	2	6	1144853	1144858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100153
25025	NC_011978	TTTC	2	8	1144896	1144903	0 %	75 %	0 %	25 %	222100153
25026	NC_011978	CCTTC	2	10	1144930	1144939	0 %	40 %	0 %	60 %	222100153
25027	NC_011978	CCTT	2	8	1144961	1144968	0 %	50 %	0 %	50 %	222100153
25028	NC_011978	TCA	2	6	1144980	1144985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100153
25029	NC_011978	CCG	2	6	1145018	1145023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100153
25030	NC_011978	GTG	2	6	1145027	1145032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100153
25031	NC_011978	TTC	2	6	1145173	1145178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100153
25032	NC_011978	CA	3	6	1145227	1145232	50 %	0 %	0 %	50 %	222100153
25033	NC_011978	TCT	2	6	1145234	1145239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100153
25034	NC_011978	CTT	2	6	1145242	1145247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100153
25035	NC_011978	AAGA	2	8	1145300	1145307	75 %	0 %	25 %	0 %	222100153
25036	NC_011978	T	6	6	1145331	1145336	0 %	100 %	0 %	0 %	222100153
25037	NC_011978	TGT	2	6	1145350	1145355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100153
25038	NC_011978	AGT	2	6	1145365	1145370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100153
25039	NC_011978	GA	3	6	1145429	1145434	50 %	0 %	50 %	0 %	222100153
25040	NC_011978	TTC	2	6	1145443	1145448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100153
25041	NC_011978	CTT	2	6	1145483	1145488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100153
25042	NC_011978	TTCG	2	8	1145534	1145541	0 %	50 %	25 %	25 %	222100153
25043	NC_011978	GAG	2	6	1145594	1145599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100153
25044	NC_011978	TGT	2	6	1145806	1145811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100153
25045	NC_011978	CAAG	2	8	1145886	1145893	50 %	0 %	25 %	25 %	222100154
25046	NC_011978	CCG	2	6	1145909	1145914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100154
25047	NC_011978	ATG	2	6	1145918	1145923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100154
25048	NC_011978	CT	3	6	1145941	1145946	0 %	50 %	0 %	50 %	222100154
25049	NC_011978	CAG	2	6	1145949	1145954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100154
25050	NC_011978	ATC	2	6	1145978	1145983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100154
25051	NC_011978	CCT	2	6	1146021	1146026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100154
25052	NC_011978	AAG	2	6	1146043	1146048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100154
25053	NC_011978	GAG	2	6	1146082	1146087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100154
25054	NC_011978	TGT	2	6	1146147	1146152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100154
25055	NC_011978	TCT	2	6	1146164	1146169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100154
25056	NC_011978	CGA	2	6	1146255	1146260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100154
25057	NC_011978	TCC	2	6	1146337	1146342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100154
25058	NC_011978	TCA	2	6	1146471	1146476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100154
25059	NC_011978	GA	3	6	1146480	1146485	50 %	0 %	50 %	0 %	222100154
25060	NC_011978	T	7	7	1146562	1146568	0 %	100 %	0 %	0 %	222100154
25061	NC_011978	CTTC	2	8	1146576	1146583	0 %	50 %	0 %	50 %	222100154
25062	NC_011978	AACG	2	8	1146607	1146614	50 %	0 %	25 %	25 %	222100154
25063	NC_011978	AAG	2	6	1146652	1146657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100154
25064	NC_011978	TCAG	2	8	1146715	1146722	25 %	25 %	25 %	25 %	222100155
25065	NC_011978	GAT	2	6	1146771	1146776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100155
25066	NC_011978	CTT	2	6	1146783	1146788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100155
25067	NC_011978	TCT	2	6	1146800	1146805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100155
25068	NC_011978	GAA	2	6	1146876	1146881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100155
25069	NC_011978	GCT	2	6	1146928	1146933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100155
25070	NC_011978	CACTTC	2	12	1147044	1147055	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222100155
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25072	NC_011978	T	6	6	1147091	1147096	0 %	100 %	0 %	0 %	222100155
25073	NC_011978	TCC	2	6	1147156	1147161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100155
25074	NC_011978	TGT	2	6	1147244	1147249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100155
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25077	NC_011978	AG	3	6	1147323	1147328	50 %	0 %	50 %	0 %	222100155
25078	NC_011978	TCG	2	6	1147331	1147336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100155
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25087	NC_011978	CTT	2	6	1147871	1147876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100155
25088	NC_011978	ATG	2	6	1147940	1147945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100156
25089	NC_011978	TCA	2	6	1148001	1148006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100156
25090	NC_011978	TC	3	6	1148023	1148028	0 %	50 %	0 %	50 %	222100156
25091	NC_011978	CAC	2	6	1148069	1148074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100156
25092	NC_011978	TCG	2	6	1148076	1148081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100156
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25099	NC_011978	GTC	2	6	1148602	1148607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100156
25100	NC_011978	GAT	2	6	1148632	1148637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100156
25101	NC_011978	CAT	2	6	1148779	1148784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100156
25102	NC_011978	CTT	2	6	1148785	1148790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100156
25103	NC_011978	GGA	2	6	1148806	1148811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100156
25104	NC_011978	T	6	6	1148839	1148844	0 %	100 %	0 %	0 %	222100156
25105	NC_011978	TCCC	2	8	1148914	1148921	0 %	25 %	0 %	75 %	222100157
25106	NC_011978	CCA	2	6	1148933	1148938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100157
25107	NC_011978	ACGGA	2	10	1148952	1148961	40 %	0 %	40 %	20 %	222100157
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25113	NC_011978	ATG	2	6	1149256	1149261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100157
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25118	NC_011978	CT	3	6	1149468	1149473	0 %	50 %	0 %	50 %	222100157
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25122	NC_011978	TG	3	6	1149783	1149788	0 %	50 %	50 %	0 %	222100157
25123	NC_011978	T	6	6	1149793	1149798	0 %	100 %	0 %	0 %	222100157
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25219	NC_011978	GATA	2	8	1154290	1154297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25220	NC_011978	AT	3	6	1154327	1154332	50 %	50 %	0 %	0 %	222100163
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25232	NC_011978	TCC	2	6	1154746	1154751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100164
25233	NC_011978	TAT	2	6	1154767	1154772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100164
25234	NC_011978	TCGAT	2	10	1154823	1154832	20 %	40 %	20 %	20 %	222100164
25235	NC_011978	CT	3	6	1154861	1154866	0 %	50 %	0 %	50 %	222100164
25236	NC_011978	GT	3	6	1154874	1154879	0 %	50 %	50 %	0 %	222100164
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25472	NC_011978	GTT	2	6	1166551	1166556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100174
25473	NC_011978	TCTG	2	8	1166604	1166611	0 %	50 %	25 %	25 %	222100174
25474	NC_011978	TCA	2	6	1166637	1166642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100174
25475	NC_011978	CCT	2	6	1166693	1166698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25476	NC_011978	A	7	7	1166700	1166706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25477	NC_011978	GT	3	6	1166716	1166721	0 %	50 %	50 %	0 %	222100175
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25480	NC_011978	CTT	2	6	1166943	1166948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100175
25481	NC_011978	TGC	2	6	1167020	1167025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100175
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25492	NC_011978	CAT	2	6	1167428	1167433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100175
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25496	NC_011978	TTC	2	6	1167681	1167686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100175
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25499	NC_011978	ATC	2	6	1167714	1167719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100175
25500	NC_011978	A	7	7	1167740	1167746	100 %	0 %	0 %	0 %	222100175

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