MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_011978	GATC	2	8	1121866	1121873	25 %	25 %	25 %	25 %	222100130
24502	NC_011978	ACC	2	6	1121918	1121923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100130
24503	NC_011978	GT	3	6	1121928	1121933	0 %	50 %	50 %	0 %	222100130
24504	NC_011978	ATG	2	6	1121951	1121956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100130
24505	NC_011978	GTTCT	2	10	1121960	1121969	0 %	60 %	20 %	20 %	222100130
24506	NC_011978	AGA	2	6	1121971	1121976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100130
24507	NC_011978	GAA	2	6	1122031	1122036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100130
24508	NC_011978	CGA	2	6	1122069	1122074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100130
24509	NC_011978	AG	3	6	1122078	1122083	50 %	0 %	50 %	0 %	222100130
24510	NC_011978	CTTT	2	8	1122112	1122119	0 %	75 %	0 %	25 %	222100130
24511	NC_011978	ACA	2	6	1122140	1122145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100130
24512	NC_011978	CT	3	6	1122175	1122180	0 %	50 %	0 %	50 %	222100130
24513	NC_011978	CAG	2	6	1122298	1122303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100130
24514	NC_011978	TCT	2	6	1122309	1122314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100130
24515	NC_011978	GA	3	6	1122320	1122325	50 %	0 %	50 %	0 %	222100130
24516	NC_011978	AGG	2	6	1122329	1122334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100130
24517	NC_011978	T	6	6	1122335	1122340	0 %	100 %	0 %	0 %	222100130
24518	NC_011978	TCC	2	6	1122356	1122361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100130
24519	NC_011978	TCTCT	2	10	1122387	1122396	0 %	60 %	0 %	40 %	222100130
24520	NC_011978	TTTG	2	8	1122442	1122449	0 %	75 %	25 %	0 %	222100130
24521	NC_011978	TGGA	2	8	1122563	1122570	25 %	25 %	50 %	0 %	222100130
24522	NC_011978	GAAA	2	8	1122571	1122578	75 %	0 %	25 %	0 %	222100130
24523	NC_011978	TCG	2	6	1122715	1122720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100131
24524	NC_011978	ACG	2	6	1122724	1122729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100131
24525	NC_011978	CTT	2	6	1122737	1122742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100131
24526	NC_011978	GGC	2	6	1122833	1122838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100131
24527	NC_011978	GGA	2	6	1122914	1122919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100131
24528	NC_011978	GAT	2	6	1122951	1122956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100131
24529	NC_011978	GAA	2	6	1122965	1122970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100131
24530	NC_011978	TCCA	2	8	1122994	1123001	25 %	25 %	0 %	50 %	222100131
24531	NC_011978	A	7	7	1123014	1123020	100 %	0 %	0 %	0 %	222100131
24532	NC_011978	AC	3	6	1123040	1123045	50 %	0 %	0 %	50 %	222100131
24533	NC_011978	A	7	7	1123054	1123060	100 %	0 %	0 %	0 %	222100131
24534	NC_011978	TGG	2	6	1123083	1123088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100131
24535	NC_011978	GGAA	2	8	1123139	1123146	50 %	0 %	50 %	0 %	222100131
24536	NC_011978	CGA	2	6	1123178	1123183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100131
24537	NC_011978	GA	4	8	1123182	1123189	50 %	0 %	50 %	0 %	222100131
24538	NC_011978	CAGGAT	2	12	1123208	1123219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222100131
24539	NC_011978	TCA	2	6	1123246	1123251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100131
24540	NC_011978	TCCT	2	8	1123266	1123273	0 %	50 %	0 %	50 %	222100131
24541	NC_011978	AGG	2	6	1123348	1123353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100131
24542	NC_011978	AGA	2	6	1123456	1123461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100132
24543	NC_011978	GGT	2	6	1123543	1123548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100132
24544	NC_011978	ACG	2	6	1123560	1123565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100132
24545	NC_011978	CCT	2	6	1123597	1123602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100132
24546	NC_011978	AGA	2	6	1123663	1123668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100132
24547	NC_011978	TTG	2	6	1123671	1123676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100132
24548	NC_011978	AG	3	6	1123757	1123762	50 %	0 %	50 %	0 %	222100132
24549	NC_011978	AGA	2	6	1123842	1123847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100132
24550	NC_011978	GAAA	2	8	1123872	1123879	75 %	0 %	25 %	0 %	222100132
24551	NC_011978	TG	3	6	1123900	1123905	0 %	50 %	50 %	0 %	222100132
24552	NC_011978	TA	3	6	1123984	1123989	50 %	50 %	0 %	0 %	222100132
24553	NC_011978	TGGA	2	8	1124055	1124062	25 %	25 %	50 %	0 %	222100132
24554	NC_011978	GA	3	6	1124061	1124066	50 %	0 %	50 %	0 %	222100132
24555	NC_011978	GTC	2	6	1124138	1124143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100132
24556	NC_011978	TTTTC	2	10	1124297	1124306	0 %	80 %	0 %	20 %	222100132
24557	NC_011978	AAGAC	2	10	1124363	1124372	60 %	0 %	20 %	20 %	222100132
24558	NC_011978	CCT	2	6	1124374	1124379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100132
24559	NC_011978	GA	3	6	1124384	1124389	50 %	0 %	50 %	0 %	222100132
24560	NC_011978	GTG	2	6	1124456	1124461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100132
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24562	NC_011978	GA	3	6	1124481	1124486	50 %	0 %	50 %	0 %	222100132
24563	NC_011978	TCA	2	6	1124589	1124594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100132
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24565	NC_011978	GTTCT	2	10	1124633	1124642	0 %	60 %	20 %	20 %	222100132
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24567	NC_011978	AAGG	2	8	1124711	1124718	50 %	0 %	50 %	0 %	222100132
24568	NC_011978	AAG	2	6	1124737	1124742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100132
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24570	NC_011978	CGG	2	6	1125000	1125005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100133
24571	NC_011978	GTG	3	9	1125103	1125111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100133
24572	NC_011978	GAA	2	6	1125201	1125206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100133
24573	NC_011978	TCC	2	6	1125209	1125214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100133
24574	NC_011978	GAA	2	6	1125297	1125302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100133
24575	NC_011978	GATG	2	8	1125342	1125349	25 %	25 %	50 %	0 %	222100133
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24577	NC_011978	AG	3	6	1125482	1125487	50 %	0 %	50 %	0 %	222100133
24578	NC_011978	TGG	2	6	1125488	1125493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100133
24579	NC_011978	AGG	2	6	1125494	1125499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100133
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24582	NC_011978	TGA	3	9	1125547	1125555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100134
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24584	NC_011978	GATTAC	2	12	1125591	1125602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222100134
24585	NC_011978	CT	3	6	1125655	1125660	0 %	50 %	0 %	50 %	222100134
24586	NC_011978	GCAG	2	8	1125698	1125705	25 %	0 %	50 %	25 %	222100134
24587	NC_011978	T	6	6	1125747	1125752	0 %	100 %	0 %	0 %	222100134
24588	NC_011978	GGA	2	6	1125797	1125802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100134
24589	NC_011978	CAA	2	6	1125821	1125826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100134
24590	NC_011978	TCT	2	6	1125827	1125832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100134
24591	NC_011978	AAG	2	6	1125853	1125858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100134
24592	NC_011978	A	6	6	1125889	1125894	100 %	0 %	0 %	0 %	222100134
24593	NC_011978	TGC	2	6	1125920	1125925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100134
24594	NC_011978	ATG	2	6	1125940	1125945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100134
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24598	NC_011978	C	6	6	1126069	1126074	0 %	0 %	0 %	100 %	222100134
24599	NC_011978	GAA	2	6	1126088	1126093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100134
24600	NC_011978	CA	3	6	1126169	1126174	50 %	0 %	0 %	50 %	222100134
24601	NC_011978	CAT	2	6	1126343	1126348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100134
24602	NC_011978	GCTT	2	8	1126349	1126356	0 %	50 %	25 %	25 %	222100134
24603	NC_011978	TCT	2	6	1126487	1126492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100134
24604	NC_011978	GTC	2	6	1126521	1126526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100134
24605	NC_011978	TCT	2	6	1126527	1126532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100134
24606	NC_011978	GAA	2	6	1126535	1126540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100134
24607	NC_011978	CAA	2	6	1126562	1126567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100134
24608	NC_011978	CTC	2	6	1126671	1126676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100134
24609	NC_011978	TGT	2	6	1126760	1126765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100135
24610	NC_011978	T	6	6	1126765	1126770	0 %	100 %	0 %	0 %	222100135
24611	NC_011978	TCG	2	6	1126808	1126813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100135
24612	NC_011978	ATCA	2	8	1126819	1126826	50 %	25 %	0 %	25 %	222100135
24613	NC_011978	A	6	6	1126845	1126850	100 %	0 %	0 %	0 %	222100135
24614	NC_011978	TCT	2	6	1126876	1126881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100135
24615	NC_011978	AG	4	8	1126890	1126897	50 %	0 %	50 %	0 %	222100135
24616	NC_011978	CT	3	6	1126902	1126907	0 %	50 %	0 %	50 %	222100135
24617	NC_011978	GGA	2	6	1127005	1127010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100135
24618	NC_011978	CGC	2	6	1127067	1127072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100135
24619	NC_011978	AAG	2	6	1127145	1127150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100135
24620	NC_011978	AAGAA	2	10	1127382	1127391	80 %	0 %	20 %	0 %	222100135
24621	NC_011978	TG	3	6	1127399	1127404	0 %	50 %	50 %	0 %	222100135
24622	NC_011978	ACAA	2	8	1127419	1127426	75 %	0 %	0 %	25 %	222100135
24623	NC_011978	GA	3	6	1127448	1127453	50 %	0 %	50 %	0 %	222100135
24624	NC_011978	AG	3	6	1127486	1127491	50 %	0 %	50 %	0 %	222100135
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24627	NC_011978	AGA	2	6	1127596	1127601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100135
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24631	NC_011978	ACC	2	6	1127756	1127761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100135
24632	NC_011978	CGT	2	6	1127811	1127816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100135
24633	NC_011978	TCA	2	6	1127831	1127836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100135
24634	NC_011978	TCG	2	6	1127837	1127842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100135
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24638	NC_011978	GAT	2	6	1128103	1128108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100135
24639	NC_011978	GGA	2	6	1128150	1128155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100135
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24649	NC_011978	AGA	2	6	1128638	1128643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100135
24650	NC_011978	CT	3	6	1128726	1128731	0 %	50 %	0 %	50 %	222100135
24651	NC_011978	CT	3	6	1128858	1128863	0 %	50 %	0 %	50 %	222100135
24652	NC_011978	TTCC	2	8	1128868	1128875	0 %	50 %	0 %	50 %	222100135
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24684	NC_011978	GCA	2	6	1130208	1130213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100137
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24702	NC_011978	CGT	2	6	1130973	1130978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100138
24703	NC_011978	TGCT	2	8	1130991	1130998	0 %	50 %	25 %	25 %	222100138
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24705	NC_011978	TCTT	2	8	1131224	1131231	0 %	75 %	0 %	25 %	222100138
24706	NC_011978	ACG	2	6	1131236	1131241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100138
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24708	NC_011978	GAAC	2	8	1131276	1131283	50 %	0 %	25 %	25 %	222100138
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24716	NC_011978	GTT	2	6	1131700	1131705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100139
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24720	NC_011978	C	6	6	1131839	1131844	0 %	0 %	0 %	100 %	222100139
24721	NC_011978	CTC	2	6	1131917	1131922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100139
24722	NC_011978	TCTT	3	12	1132000	1132011	0 %	75 %	0 %	25 %	222100139
24723	NC_011978	GAGCA	2	10	1132061	1132070	40 %	0 %	40 %	20 %	222100139
24724	NC_011978	CA	3	6	1132178	1132183	50 %	0 %	0 %	50 %	222100139
24725	NC_011978	GAAG	2	8	1132239	1132246	50 %	0 %	50 %	0 %	222100139
24726	NC_011978	TCA	2	6	1132250	1132255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100139
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24728	NC_011978	GTG	2	6	1132332	1132337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100139
24729	NC_011978	TGA	2	6	1132355	1132360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100139
24730	NC_011978	CCT	2	6	1132375	1132380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100139
24731	NC_011978	GAT	2	6	1132395	1132400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100139
24732	NC_011978	AGAA	2	8	1132417	1132424	75 %	0 %	25 %	0 %	222100139
24733	NC_011978	TTTC	2	8	1132574	1132581	0 %	75 %	0 %	25 %	222100139
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