MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_011978	CTTC	2	8	1099457	1099464	0 %	50 %	0 %	50 %	222100103
24002	NC_011978	CAG	2	6	1099509	1099514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100103
24003	NC_011978	T	6	6	1099515	1099520	0 %	100 %	0 %	0 %	222100103
24004	NC_011978	T	6	6	1099530	1099535	0 %	100 %	0 %	0 %	222100103
24005	NC_011978	AGA	2	6	1099537	1099542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100103
24006	NC_011978	CTT	2	6	1099550	1099555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24007	NC_011978	GTA	2	6	1099599	1099604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100103
24008	NC_011978	GAC	2	6	1099635	1099640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100103
24009	NC_011978	TTG	2	6	1099652	1099657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100103
24010	NC_011978	GA	3	6	1099687	1099692	50 %	0 %	50 %	0 %	222100103
24011	NC_011978	TGT	2	6	1099760	1099765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100103
24012	NC_011978	GAA	2	6	1099773	1099778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100103
24013	NC_011978	TCT	2	6	1099784	1099789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24014	NC_011978	CGT	2	6	1099883	1099888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100103
24015	NC_011978	CCA	2	6	1099907	1099912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100103
24016	NC_011978	GGAG	2	8	1099985	1099992	25 %	0 %	75 %	0 %	222100103
24017	NC_011978	GCA	2	6	1099999	1100004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100103
24018	NC_011978	GAA	2	6	1100005	1100010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100103
24019	NC_011978	TCC	2	6	1100013	1100018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100103
24020	NC_011978	CTT	2	6	1100083	1100088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24021	NC_011978	GA	4	8	1100115	1100122	50 %	0 %	50 %	0 %	222100103
24022	NC_011978	TGC	2	6	1100160	1100165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100103
24023	NC_011978	ATG	2	6	1100212	1100217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100103
24024	NC_011978	TCT	2	6	1100246	1100251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24025	NC_011978	TTC	2	6	1100282	1100287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24026	NC_011978	CGTT	2	8	1100290	1100297	0 %	50 %	25 %	25 %	222100103
24027	NC_011978	CAG	2	6	1100355	1100360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100103
24028	NC_011978	G	6	6	1100408	1100413	0 %	0 %	100 %	0 %	222100103
24029	NC_011978	CTT	2	6	1100445	1100450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24030	NC_011978	T	6	6	1100472	1100477	0 %	100 %	0 %	0 %	222100103
24031	NC_011978	GAG	2	6	1100502	1100507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100103
24032	NC_011978	GA	3	6	1100547	1100552	50 %	0 %	50 %	0 %	222100103
24033	NC_011978	CCA	2	6	1100579	1100584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100103
24034	NC_011978	TCT	2	6	1100686	1100691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24035	NC_011978	GAAA	2	8	1100859	1100866	75 %	0 %	25 %	0 %	222100103
24036	NC_011978	CTT	2	6	1100894	1100899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100103
24037	NC_011978	ACG	2	6	1100962	1100967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100103
24038	NC_011978	GAAC	2	8	1101025	1101032	50 %	0 %	25 %	25 %	222100103
24039	NC_011978	AGG	2	6	1101037	1101042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100103
24040	NC_011978	TCA	2	6	1101214	1101219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100103
24041	NC_011978	TCC	2	6	1101245	1101250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100103
24042	NC_011978	CTTTT	2	10	1101259	1101268	0 %	80 %	0 %	20 %	222100103
24043	NC_011978	T	6	6	1101265	1101270	0 %	100 %	0 %	0 %	222100103
24044	NC_011978	AAT	2	6	1101271	1101276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100103
24045	NC_011978	GGT	3	9	1101314	1101322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100104
24046	NC_011978	AAG	2	6	1101333	1101338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100104
24047	NC_011978	AT	3	6	1101366	1101371	50 %	50 %	0 %	0 %	222100104
24048	NC_011978	GTT	2	6	1101408	1101413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100104
24049	NC_011978	CGA	2	6	1101448	1101453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100104
24050	NC_011978	TA	3	6	1101518	1101523	50 %	50 %	0 %	0 %	222100104
24051	NC_011978	CGA	2	6	1101539	1101544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100104
24052	NC_011978	CGA	2	6	1101620	1101625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100104
24053	NC_011978	GGA	2	6	1101701	1101706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100104
24054	NC_011978	ACA	2	6	1101721	1101726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100104
24055	NC_011978	GAG	2	6	1101795	1101800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100104
24056	NC_011978	G	6	6	1101841	1101846	0 %	0 %	100 %	0 %	222100104
24057	NC_011978	CAGA	2	8	1101895	1101902	50 %	0 %	25 %	25 %	222100104
24058	NC_011978	GCG	2	6	1101934	1101939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100104
24059	NC_011978	GGAAA	2	10	1102005	1102014	60 %	0 %	40 %	0 %	222100104
24060	NC_011978	GTG	2	6	1102035	1102040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100104
24061	NC_011978	ACA	2	6	1102042	1102047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100104
24062	NC_011978	CAG	2	6	1102064	1102069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100104
24063	NC_011978	ATG	2	6	1102074	1102079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100104
24064	NC_011978	A	6	6	1102260	1102265	100 %	0 %	0 %	0 %	222100104
24065	NC_011978	TGG	2	6	1102303	1102308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100104
24066	NC_011978	CTGAG	2	10	1102345	1102354	20 %	20 %	40 %	20 %	222100104
24067	NC_011978	CGG	2	6	1102360	1102365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100104
24068	NC_011978	A	7	7	1102440	1102446	100 %	0 %	0 %	0 %	222100104
24069	NC_011978	AC	3	6	1102492	1102497	50 %	0 %	0 %	50 %	222100104
24070	NC_011978	AAC	2	6	1102539	1102544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100104
24071	NC_011978	GAA	2	6	1102598	1102603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100104
24072	NC_011978	GGA	2	6	1102664	1102669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100104
24073	NC_011978	GA	3	6	1102675	1102680	50 %	0 %	50 %	0 %	222100104
24074	NC_011978	GTACAG	2	12	1102685	1102696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222100104
24075	NC_011978	GGA	2	6	1102706	1102711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100104
24076	NC_011978	GAA	2	6	1102714	1102719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100104
24077	NC_011978	TCT	2	6	1102762	1102767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100105
24078	NC_011978	GTG	2	6	1102796	1102801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100105
24079	NC_011978	TGC	2	6	1102839	1102844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100105
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24082	NC_011978	TG	3	6	1102918	1102923	0 %	50 %	50 %	0 %	222100105
24083	NC_011978	TCT	2	6	1102948	1102953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100105
24084	NC_011978	T	6	6	1102996	1103001	0 %	100 %	0 %	0 %	222100105
24085	NC_011978	TTC	2	6	1103022	1103027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100105
24086	NC_011978	CCTT	2	8	1103049	1103056	0 %	50 %	0 %	50 %	222100105
24087	NC_011978	GAC	2	6	1103121	1103126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100105
24088	NC_011978	GATCAT	2	12	1103140	1103151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222100105
24089	NC_011978	CAC	2	6	1103238	1103243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100105
24090	NC_011978	GAA	2	6	1103253	1103258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100105
24091	NC_011978	CAG	2	6	1103363	1103368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100105
24092	NC_011978	A	6	6	1103399	1103404	100 %	0 %	0 %	0 %	222100105
24093	NC_011978	AG	3	6	1103432	1103437	50 %	0 %	50 %	0 %	222100105
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24096	NC_011978	TCT	2	6	1103491	1103496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100105
24097	NC_011978	GAAGA	2	10	1103499	1103508	60 %	0 %	40 %	0 %	222100105
24098	NC_011978	CGTG	2	8	1103521	1103528	0 %	25 %	50 %	25 %	222100105
24099	NC_011978	GAAAG	2	10	1103545	1103554	60 %	0 %	40 %	0 %	222100105
24100	NC_011978	G	6	6	1103576	1103581	0 %	0 %	100 %	0 %	222100105
24101	NC_011978	GAA	2	6	1103627	1103632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100105
24102	NC_011978	TCC	2	6	1103637	1103642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100105
24103	NC_011978	GAA	2	6	1103707	1103712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100105
24104	NC_011978	A	7	7	1103711	1103717	100 %	0 %	0 %	0 %	222100105
24105	NC_011978	GGA	2	6	1103824	1103829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100105
24106	NC_011978	TGG	2	6	1103877	1103882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100105
24107	NC_011978	GGC	2	6	1104081	1104086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100105
24108	NC_011978	TCC	2	6	1104171	1104176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100105
24109	NC_011978	TC	3	6	1104179	1104184	0 %	50 %	0 %	50 %	222100105
24110	NC_011978	GAT	2	6	1104259	1104264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100105
24111	NC_011978	GA	3	6	1104327	1104332	50 %	0 %	50 %	0 %	222100105
24112	NC_011978	GAA	2	6	1104341	1104346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100105
24113	NC_011978	GAAA	2	8	1104362	1104369	75 %	0 %	25 %	0 %	222100105
24114	NC_011978	GAAA	2	8	1104470	1104477	75 %	0 %	25 %	0 %	222100105
24115	NC_011978	CCT	2	6	1104490	1104495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100105
24116	NC_011978	GAT	2	6	1104502	1104507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100105
24117	NC_011978	A	6	6	1104587	1104592	100 %	0 %	0 %	0 %	222100106
24118	NC_011978	CTT	2	6	1104613	1104618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100106
24119	NC_011978	TCC	2	6	1104644	1104649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100106
24120	NC_011978	GGA	2	6	1104654	1104659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100106
24121	NC_011978	CT	3	6	1104664	1104669	0 %	50 %	0 %	50 %	222100106
24122	NC_011978	TGA	2	6	1104746	1104751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100106
24123	NC_011978	TCT	2	6	1104869	1104874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100106
24124	NC_011978	ATG	2	6	1104891	1104896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100106
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24140	NC_011978	CTG	2	6	1105296	1105301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100106
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24147	NC_011978	TGG	2	6	1105667	1105672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100107
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24232	NC_011978	CGT	2	6	1109441	1109446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24234	NC_011978	GGTTTG	2	12	1109464	1109475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24464	NC_011978	GCT	2	6	1119927	1119932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100129
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24467	NC_011978	T	6	6	1120160	1120165	0 %	100 %	0 %	0 %	222100129
24468	NC_011978	TAC	2	6	1120294	1120299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100129
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24470	NC_011978	GAG	2	6	1120456	1120461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100129
24471	NC_011978	TCC	2	6	1120484	1120489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100129
24472	NC_011978	TAC	2	6	1120525	1120530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100129
24473	NC_011978	CTA	2	6	1120548	1120553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100129
24474	NC_011978	GAG	2	6	1120585	1120590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100129
24475	NC_011978	AGA	2	6	1120632	1120637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100129
24476	NC_011978	ACA	2	6	1120688	1120693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100129
24477	NC_011978	AG	3	6	1120698	1120703	50 %	0 %	50 %	0 %	222100129
24478	NC_011978	CAT	2	6	1120743	1120748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100129
24479	NC_011978	GAA	2	6	1120828	1120833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100130
24480	NC_011978	CGA	2	6	1120860	1120865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100130
24481	NC_011978	TTC	2	6	1120873	1120878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100130
24482	NC_011978	TGGC	2	8	1120884	1120891	0 %	25 %	50 %	25 %	222100130
24483	NC_011978	TTTC	2	8	1120913	1120920	0 %	75 %	0 %	25 %	222100130
24484	NC_011978	TCT	2	6	1120926	1120931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100130
24485	NC_011978	AG	3	6	1120953	1120958	50 %	0 %	50 %	0 %	222100130
24486	NC_011978	GAA	2	6	1120972	1120977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100130
24487	NC_011978	CCTT	2	8	1120985	1120992	0 %	50 %	0 %	50 %	222100130
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24489	NC_011978	AGA	2	6	1121090	1121095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100130
24490	NC_011978	AG	3	6	1121107	1121112	50 %	0 %	50 %	0 %	222100130
24491	NC_011978	CTT	2	6	1121140	1121145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100130
24492	NC_011978	CAA	3	9	1121220	1121228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100130
24493	NC_011978	GTC	2	6	1121237	1121242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100130
24494	NC_011978	GTCTTC	2	12	1121255	1121266	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222100130
24495	NC_011978	AG	4	8	1121289	1121296	50 %	0 %	50 %	0 %	222100130
24496	NC_011978	TCA	2	6	1121336	1121341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100130
24497	NC_011978	GATC	2	8	1121403	1121410	25 %	25 %	25 %	25 %	222100130
24498	NC_011978	TCC	2	6	1121422	1121427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100130
24499	NC_011978	CCAGA	2	10	1121500	1121509	40 %	0 %	20 %	40 %	222100130
24500	NC_011978	CT	3	6	1121760	1121765	0 %	50 %	0 %	50 %	222100130

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