MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011978	T	6	6	661075	661080	0 %	100 %	0 %	0 %	222099632
14502	NC_011978	TCT	2	6	661113	661118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099632
14503	NC_011978	GA	3	6	661123	661128	50 %	0 %	50 %	0 %	222099632
14504	NC_011978	TTC	2	6	661291	661296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099632
14505	NC_011978	GTT	2	6	661323	661328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099632
14506	NC_011978	GT	3	6	661411	661416	0 %	50 %	50 %	0 %	222099632
14507	NC_011978	GCA	2	6	661448	661453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099632
14508	NC_011978	CTT	2	6	661464	661469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099632
14509	NC_011978	GAT	2	6	661587	661592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099632
14510	NC_011978	GT	3	6	661623	661628	0 %	50 %	50 %	0 %	222099632
14511	NC_011978	TGA	2	6	661701	661706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099632
14512	NC_011978	GAT	2	6	661765	661770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099632
14513	NC_011978	CTT	2	6	661786	661791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099632
14514	NC_011978	CATGTT	2	12	661816	661827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222099632
14515	NC_011978	GTC	2	6	661835	661840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099632
14516	NC_011978	CTT	2	6	661881	661886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099632
14517	NC_011978	AG	3	6	661899	661904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_011978	CT	3	6	661915	661920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14519	NC_011978	AAC	2	6	661970	661975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099633
14520	NC_011978	T	6	6	662098	662103	0 %	100 %	0 %	0 %	222099633
14521	NC_011978	TCC	2	6	662203	662208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099633
14522	NC_011978	ATA	2	6	662252	662257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099633
14523	NC_011978	TCC	2	6	662275	662280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099633
14524	NC_011978	TGT	2	6	662319	662324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099633
14525	NC_011978	GAG	2	6	662332	662337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099633
14526	NC_011978	TGA	2	6	662343	662348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099633
14527	NC_011978	AAG	2	6	662362	662367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099633
14528	NC_011978	GCT	2	6	662419	662424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099633
14529	NC_011978	GGA	2	6	662429	662434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099633
14530	NC_011978	CAC	2	6	662499	662504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099633
14531	NC_011978	CT	3	6	662538	662543	0 %	50 %	0 %	50 %	222099633
14532	NC_011978	CTGT	2	8	662582	662589	0 %	50 %	25 %	25 %	222099633
14533	NC_011978	AG	3	6	662656	662661	50 %	0 %	50 %	0 %	222099633
14534	NC_011978	GAT	2	6	662671	662676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099633
14535	NC_011978	TCTGC	2	10	662694	662703	0 %	40 %	20 %	40 %	222099633
14536	NC_011978	TGT	2	6	662901	662906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099633
14537	NC_011978	TGA	2	6	663060	663065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099633
14538	NC_011978	GA	3	6	663064	663069	50 %	0 %	50 %	0 %	222099633
14539	NC_011978	ATC	2	6	663080	663085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099633
14540	NC_011978	CCT	2	6	663086	663091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14541	NC_011978	ATC	2	6	663108	663113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_011978	AAT	2	6	663185	663190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_011978	TTC	2	6	663314	663319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099634
14544	NC_011978	TTC	2	6	663354	663359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099634
14545	NC_011978	TC	3	6	663358	663363	0 %	50 %	0 %	50 %	222099634
14546	NC_011978	TGG	2	6	663401	663406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099634
14547	NC_011978	TGG	2	6	663412	663417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099634
14548	NC_011978	CAA	2	6	663454	663459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099634
14549	NC_011978	TGG	2	6	663547	663552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099634
14550	NC_011978	TCC	2	6	663556	663561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099634
14551	NC_011978	TTCC	2	8	663565	663572	0 %	50 %	0 %	50 %	222099634
14552	NC_011978	A	7	7	663764	663770	100 %	0 %	0 %	0 %	222099634
14553	NC_011978	AGA	2	6	663775	663780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099634
14554	NC_011978	ATGA	2	8	663788	663795	50 %	25 %	25 %	0 %	222099634
14555	NC_011978	ACC	2	6	663796	663801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099634
14556	NC_011978	TCA	2	6	663819	663824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099634
14557	NC_011978	CTT	2	6	663917	663922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099634
14558	NC_011978	TTTC	2	8	663969	663976	0 %	75 %	0 %	25 %	222099634
14559	NC_011978	AAG	2	6	663991	663996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099634
14560	NC_011978	AAT	2	6	664006	664011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099634
14561	NC_011978	GTTG	2	8	664142	664149	0 %	50 %	50 %	0 %	222099634
14562	NC_011978	GTT	2	6	664208	664213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099634
14563	NC_011978	AGTA	2	8	664355	664362	50 %	25 %	25 %	0 %	222099634
14564	NC_011978	CTG	2	6	664434	664439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099634
14565	NC_011978	TAC	2	6	664456	664461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099634
14566	NC_011978	CAT	2	6	664471	664476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099634
14567	NC_011978	CAA	2	6	664491	664496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099634
14568	NC_011978	GAA	2	6	664517	664522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099634
14569	NC_011978	CTT	2	6	664523	664528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099634
14570	NC_011978	TTG	2	6	664554	664559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099634
14571	NC_011978	ATCCAC	2	12	664595	664606	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222099635
14572	NC_011978	ACA	2	6	664619	664624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099635
14573	NC_011978	AGG	2	6	664625	664630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099635
14574	NC_011978	AGA	2	6	664646	664651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099635
14575	NC_011978	TAGCAA	2	12	664691	664702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222099635
14576	NC_011978	TCG	2	6	664793	664798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099635
14577	NC_011978	TTA	2	6	664838	664843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099635
14578	NC_011978	TCT	2	6	664857	664862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099635
14579	NC_011978	T	6	6	664864	664869	0 %	100 %	0 %	0 %	222099635
14580	NC_011978	TCATGT	2	12	664874	664885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222099635
14581	NC_011978	GGAT	2	8	665014	665021	25 %	25 %	50 %	0 %	222099635
14582	NC_011978	AAT	2	6	665034	665039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099635
14583	NC_011978	CTG	2	6	665051	665056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099635
14584	NC_011978	GCT	2	6	665167	665172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099635
14585	NC_011978	GCA	2	6	665248	665253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099635
14586	NC_011978	TCC	2	6	665269	665274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099635
14587	NC_011978	AT	3	6	665348	665353	50 %	50 %	0 %	0 %	222099635
14588	NC_011978	AAC	2	6	665401	665406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099635
14589	NC_011978	ATCGA	2	10	665451	665460	40 %	20 %	20 %	20 %	222099635
14590	NC_011978	TTGC	2	8	665494	665501	0 %	50 %	25 %	25 %	222099635
14591	NC_011978	TCA	2	6	665513	665518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099635
14592	NC_011978	GAA	2	6	665552	665557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099635
14593	NC_011978	ATA	2	6	665581	665586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099636
14594	NC_011978	CTAT	2	8	665633	665640	25 %	50 %	0 %	25 %	222099636
14595	NC_011978	CAA	2	6	665687	665692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099636
14596	NC_011978	GAA	2	6	665763	665768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099636
14597	NC_011978	TTG	2	6	665776	665781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099636
14598	NC_011978	TCT	2	6	665803	665808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099636
14599	NC_011978	T	6	6	665808	665813	0 %	100 %	0 %	0 %	222099636
14600	NC_011978	T	6	6	665834	665839	0 %	100 %	0 %	0 %	222099636
14601	NC_011978	CAT	2	6	665877	665882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099636
14602	NC_011978	TTC	2	6	665936	665941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099636
14603	NC_011978	CA	3	6	665982	665987	50 %	0 %	0 %	50 %	222099636
14604	NC_011978	TA	3	6	665991	665996	50 %	50 %	0 %	0 %	222099636
14605	NC_011978	CAC	2	6	666009	666014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099636
14606	NC_011978	TAC	2	6	666031	666036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099636
14607	NC_011978	TTG	2	6	666056	666061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099636
14608	NC_011978	GCA	2	6	666064	666069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099636
14609	NC_011978	TTG	2	6	666112	666117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099636
14610	NC_011978	GTT	3	9	666142	666150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099636
14611	NC_011978	AGC	2	6	666218	666223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099636
14612	NC_011978	CTGG	2	8	666247	666254	0 %	25 %	50 %	25 %	222099636
14613	NC_011978	ACT	2	6	666357	666362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099636
14614	NC_011978	ATGA	2	8	666381	666388	50 %	25 %	25 %	0 %	222099636
14615	NC_011978	AGG	2	6	666390	666395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099637
14616	NC_011978	A	6	6	666411	666416	100 %	0 %	0 %	0 %	222099637
14617	NC_011978	CA	3	6	666484	666489	50 %	0 %	0 %	50 %	222099637
14618	NC_011978	A	6	6	666506	666511	100 %	0 %	0 %	0 %	222099637
14619	NC_011978	GAG	2	6	666549	666554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099637
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14985	NC_011978	T	6	6	682298	682303	0 %	100 %	0 %	0 %	222099652
14986	NC_011978	ATCC	2	8	682323	682330	25 %	25 %	0 %	50 %	222099652
14987	NC_011978	AC	3	6	682340	682345	50 %	0 %	0 %	50 %	222099652
14988	NC_011978	CAA	2	6	682396	682401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099652
14989	NC_011978	ATC	2	6	682497	682502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099652
14990	NC_011978	TCT	2	6	682503	682508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099652
14991	NC_011978	GA	3	6	682574	682579	50 %	0 %	50 %	0 %	222099652
14992	NC_011978	GGC	2	6	682610	682615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099652
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14997	NC_011978	CGTC	2	8	682696	682703	0 %	25 %	25 %	50 %	222099652
14998	NC_011978	TCTCT	2	10	682741	682750	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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