MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011978	GTA	2	6	637308	637313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099607
14002	NC_011978	CCT	2	6	637414	637419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099607
14003	NC_011978	GGA	2	6	637438	637443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_011978	AGAA	2	8	637451	637458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_011978	GAT	2	6	637461	637466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_011978	GAG	2	6	637504	637509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_011978	TCA	2	6	637568	637573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099608
14008	NC_011978	TCGTT	2	10	637580	637589	0 %	60 %	20 %	20 %	222099608
14009	NC_011978	CAT	3	9	637590	637598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099608
14010	NC_011978	TCC	2	6	637605	637610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099608
14011	NC_011978	CAC	2	6	637623	637628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099608
14012	NC_011978	GGC	2	6	637671	637676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099608
14013	NC_011978	GAA	2	6	637689	637694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099608
14014	NC_011978	GGT	2	6	637744	637749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099608
14015	NC_011978	GAG	2	6	637757	637762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099608
14016	NC_011978	TGG	2	6	637822	637827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099608
14017	NC_011978	TCC	2	6	637985	637990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099608
14018	NC_011978	GTG	2	6	637996	638001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099608
14019	NC_011978	ACA	2	6	638008	638013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099608
14020	NC_011978	CTG	2	6	638039	638044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099608
14021	NC_011978	TGT	3	9	638109	638117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099608
14022	NC_011978	TGC	2	6	638199	638204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099608
14023	NC_011978	GGT	2	6	638319	638324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099608
14024	NC_011978	GT	3	6	638426	638431	0 %	50 %	50 %	0 %	222099608
14025	NC_011978	GT	3	6	638511	638516	0 %	50 %	50 %	0 %	222099609
14026	NC_011978	GAA	2	6	638518	638523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099609
14027	NC_011978	GAA	2	6	638527	638532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099609
14028	NC_011978	GGA	2	6	638545	638550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099609
14029	NC_011978	TGG	2	6	638582	638587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099609
14030	NC_011978	ATC	2	6	638624	638629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099609
14031	NC_011978	TTC	2	6	638666	638671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099609
14032	NC_011978	CTC	3	9	638715	638723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099609
14033	NC_011978	CGTT	2	8	638763	638770	0 %	50 %	25 %	25 %	222099609
14034	NC_011978	AGA	2	6	638821	638826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099609
14035	NC_011978	AT	3	6	638837	638842	50 %	50 %	0 %	0 %	222099609
14036	NC_011978	TTC	2	6	638852	638857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099609
14037	NC_011978	TTC	2	6	638909	638914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099609
14038	NC_011978	CCA	2	6	639003	639008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099609
14039	NC_011978	TCA	2	6	639030	639035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099609
14040	NC_011978	TAC	2	6	639074	639079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099609
14041	NC_011978	TCA	3	9	639120	639128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099609
14042	NC_011978	CT	3	6	639144	639149	0 %	50 %	0 %	50 %	222099609
14043	NC_011978	GCT	3	9	639161	639169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099609
14044	NC_011978	TC	3	6	639220	639225	0 %	50 %	0 %	50 %	222099609
14045	NC_011978	CTGGA	2	10	639235	639244	20 %	20 %	40 %	20 %	222099609
14046	NC_011978	GAG	2	6	639259	639264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099609
14047	NC_011978	TC	5	10	639271	639280	0 %	50 %	0 %	50 %	222099609
14048	NC_011978	AGA	2	6	639283	639288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099609
14049	NC_011978	GTT	2	6	639296	639301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099609
14050	NC_011978	TGC	2	6	639351	639356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099609
14051	NC_011978	CGCT	2	8	639390	639397	0 %	25 %	25 %	50 %	222099609
14052	NC_011978	TCG	2	6	639576	639581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099609
14053	NC_011978	CGC	2	6	639598	639603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099609
14054	NC_011978	GAG	2	6	639626	639631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_011978	TCTACT	2	12	639670	639681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222099610
14056	NC_011978	GGAGA	2	10	639730	639739	40 %	0 %	60 %	0 %	222099610
14057	NC_011978	GTTG	2	8	639749	639756	0 %	50 %	50 %	0 %	222099610
14058	NC_011978	GA	3	6	639757	639762	50 %	0 %	50 %	0 %	222099610
14059	NC_011978	TTC	2	6	639805	639810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099610
14060	NC_011978	GAA	2	6	639897	639902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099610
14061	NC_011978	AT	3	6	639925	639930	50 %	50 %	0 %	0 %	222099610
14062	NC_011978	CGGT	2	8	639976	639983	0 %	25 %	50 %	25 %	222099610
14063	NC_011978	GAT	2	6	639989	639994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099610
14064	NC_011978	CTG	2	6	640005	640010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099610
14065	NC_011978	CGA	2	6	640038	640043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099610
14066	NC_011978	GTT	2	6	640047	640052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099610
14067	NC_011978	GGT	2	6	640091	640096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099610
14068	NC_011978	AGAA	2	8	640255	640262	75 %	0 %	25 %	0 %	222099610
14069	NC_011978	TCC	2	6	640269	640274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099610
14070	NC_011978	CTG	2	6	640413	640418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099610
14071	NC_011978	TG	3	6	640546	640551	0 %	50 %	50 %	0 %	222099610
14072	NC_011978	CCT	2	6	640563	640568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099610
14073	NC_011978	ACT	2	6	640633	640638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099611
14074	NC_011978	GAA	2	6	640654	640659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099611
14075	NC_011978	AAG	2	6	640688	640693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099611
14076	NC_011978	GAT	2	6	640718	640723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099611
14077	NC_011978	AAC	2	6	640786	640791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099611
14078	NC_011978	TCC	2	6	640842	640847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099611
14079	NC_011978	TGGA	2	8	640851	640858	25 %	25 %	50 %	0 %	222099611
14080	NC_011978	GAT	2	6	640921	640926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099611
14081	NC_011978	ATC	2	6	640976	640981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099611
14082	NC_011978	TGG	2	6	641104	641109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099611
14083	NC_011978	ACAGAG	2	12	641110	641121	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222099611
14084	NC_011978	GTC	2	6	641162	641167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099611
14085	NC_011978	CTCTG	2	10	641182	641191	0 %	40 %	20 %	40 %	222099611
14086	NC_011978	AC	3	6	641270	641275	50 %	0 %	0 %	50 %	222099611
14087	NC_011978	GTG	2	6	641285	641290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099611
14088	NC_011978	AGA	2	6	641353	641358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099611
14089	NC_011978	GAA	2	6	641435	641440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099611
14090	NC_011978	CCA	2	6	641480	641485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099611
14091	NC_011978	GCT	2	6	641490	641495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099611
14092	NC_011978	TCCA	2	8	641499	641506	25 %	25 %	0 %	50 %	222099611
14093	NC_011978	AGA	2	6	641536	641541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099611
14094	NC_011978	TTG	2	6	641676	641681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099612
14095	NC_011978	TTG	2	6	641695	641700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099612
14096	NC_011978	TGC	2	6	641711	641716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099612
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14098	NC_011978	CTA	2	6	641753	641758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099612
14099	NC_011978	GGAAG	2	10	641822	641831	40 %	0 %	60 %	0 %	222099612
14100	NC_011978	GGA	2	6	641858	641863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099612
14101	NC_011978	CGG	2	6	641903	641908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099612
14102	NC_011978	AGG	2	6	641996	642001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099612
14103	NC_011978	ATA	2	6	642141	642146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099612
14104	NC_011978	ACG	2	6	642151	642156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099612
14105	NC_011978	CGA	2	6	642212	642217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099612
14106	NC_011978	CTTC	2	8	642257	642264	0 %	50 %	0 %	50 %	222099612
14107	NC_011978	AC	3	6	642331	642336	50 %	0 %	0 %	50 %	222099612
14108	NC_011978	AGA	2	6	642355	642360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099612
14109	NC_011978	CGA	2	6	642398	642403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099612
14110	NC_011978	GA	3	6	642492	642497	50 %	0 %	50 %	0 %	222099612
14111	NC_011978	ACG	2	6	642577	642582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099612
14112	NC_011978	GGA	2	6	642639	642644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099612
14113	NC_011978	GGT	2	6	642651	642656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099612
14114	NC_011978	TC	3	6	642748	642753	0 %	50 %	0 %	50 %	222099612
14115	NC_011978	CAGG	2	8	642809	642816	25 %	0 %	50 %	25 %	222099612
14116	NC_011978	AGAGA	2	10	642837	642846	60 %	0 %	40 %	0 %	222099612
14117	NC_011978	TGA	2	6	642977	642982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099612
14118	NC_011978	GAC	2	6	642999	643004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099612
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14120	NC_011978	CGATG	2	10	643187	643196	20 %	20 %	40 %	20 %	222099612
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14486	NC_011978	GTA	2	6	660436	660441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099631
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14488	NC_011978	TCT	2	6	660630	660635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099631
14489	NC_011978	TGC	2	6	660650	660655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099631
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