MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 41200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011978	GGT	2	6	568728	568733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099545
12502	NC_011978	TCTTGG	2	12	568782	568793	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222099545
12503	NC_011978	TCT	2	6	568805	568810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12504	NC_011978	ACG	2	6	568816	568821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099545
12505	NC_011978	CGTT	2	8	568916	568923	0 %	50 %	25 %	25 %	222099545
12506	NC_011978	CGT	2	6	568952	568957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099545
12507	NC_011978	TGT	3	9	568997	569005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099545
12508	NC_011978	CAA	3	9	569066	569074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099545
12509	NC_011978	TCT	2	6	569087	569092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12510	NC_011978	CTTC	2	8	569222	569229	0 %	50 %	0 %	50 %	222099545
12511	NC_011978	AAG	2	6	569250	569255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099545
12512	NC_011978	AGG	2	6	569276	569281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099545
12513	NC_011978	TCT	2	6	569337	569342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12514	NC_011978	CT	3	6	569346	569351	0 %	50 %	0 %	50 %	222099545
12515	NC_011978	CT	3	6	569367	569372	0 %	50 %	0 %	50 %	222099545
12516	NC_011978	TCG	2	6	569380	569385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099545
12517	NC_011978	AGC	2	6	569449	569454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099545
12518	NC_011978	AGA	2	6	569581	569586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099545
12519	NC_011978	ATT	2	6	569599	569604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099545
12520	NC_011978	TCT	2	6	569616	569621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12521	NC_011978	GTT	2	6	569742	569747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099545
12522	NC_011978	TCGA	2	8	569764	569771	25 %	25 %	25 %	25 %	222099545
12523	NC_011978	TC	3	6	569807	569812	0 %	50 %	0 %	50 %	222099545
12524	NC_011978	TGG	2	6	569822	569827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099545
12525	NC_011978	CAC	2	6	569897	569902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099545
12526	NC_011978	CT	3	6	569951	569956	0 %	50 %	0 %	50 %	222099545
12527	NC_011978	CTT	2	6	569968	569973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12528	NC_011978	TCT	2	6	569998	570003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12529	NC_011978	AG	3	6	570048	570053	50 %	0 %	50 %	0 %	222099545
12530	NC_011978	GAA	2	6	570057	570062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099545
12531	NC_011978	TC	4	8	570086	570093	0 %	50 %	0 %	50 %	222099545
12532	NC_011978	TTC	2	6	570108	570113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12533	NC_011978	GGT	2	6	570122	570127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099545
12534	NC_011978	TCT	2	6	570159	570164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12535	NC_011978	GT	3	6	570237	570242	0 %	50 %	50 %	0 %	222099545
12536	NC_011978	TCT	2	6	570346	570351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099545
12537	NC_011978	ACA	2	6	570370	570375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099545
12538	NC_011978	AG	3	6	570384	570389	50 %	0 %	50 %	0 %	222099545
12539	NC_011978	GAT	2	6	570398	570403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099545
12540	NC_011978	GCCTT	2	10	570524	570533	0 %	40 %	20 %	40 %	222099545
12541	NC_011978	GAA	2	6	570543	570548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099545
12542	NC_011978	TCC	2	6	570553	570558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099545
12543	NC_011978	T	6	6	570588	570593	0 %	100 %	0 %	0 %	222099545
12544	NC_011978	CGG	2	6	570614	570619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099545
12545	NC_011978	CCA	2	6	570623	570628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099545
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12547	NC_011978	TCCA	2	8	570678	570685	25 %	25 %	0 %	50 %	222099545
12548	NC_011978	TC	3	6	570688	570693	0 %	50 %	0 %	50 %	222099545
12549	NC_011978	CCT	2	6	570786	570791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099545
12550	NC_011978	AAC	2	6	570799	570804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099545
12551	NC_011978	TG	3	6	570809	570814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_011978	TGG	2	6	570838	570843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099546
12553	NC_011978	TTC	2	6	570868	570873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099546
12554	NC_011978	TGAGAG	2	12	570945	570956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222099546
12555	NC_011978	A	6	6	570995	571000	100 %	0 %	0 %	0 %	222099546
12556	NC_011978	ACG	2	6	571069	571074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099546
12557	NC_011978	ATC	2	6	571103	571108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099546
12558	NC_011978	GAA	3	9	571111	571119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099546
12559	NC_011978	ATC	2	6	571145	571150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099546
12560	NC_011978	AGAA	2	8	571151	571158	75 %	0 %	25 %	0 %	222099546
12561	NC_011978	TG	3	6	571185	571190	0 %	50 %	50 %	0 %	222099546
12562	NC_011978	CGATGA	2	12	571369	571380	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222099546
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12566	NC_011978	TG	3	6	571541	571546	0 %	50 %	50 %	0 %	222099546
12567	NC_011978	GAT	2	6	571553	571558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099546
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12569	NC_011978	TGAG	2	8	571713	571720	25 %	25 %	50 %	0 %	222099548
12570	NC_011978	T	6	6	571729	571734	0 %	100 %	0 %	0 %	222099548
12571	NC_011978	TCT	2	6	571832	571837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099548
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12574	NC_011978	ACG	2	6	571892	571897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099548
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12578	NC_011978	GGTGT	2	10	572127	572136	0 %	40 %	60 %	0 %	222099548
12579	NC_011978	AAGG	2	8	572154	572161	50 %	0 %	50 %	0 %	222099548
12580	NC_011978	AG	3	6	572269	572274	50 %	0 %	50 %	0 %	222099548
12581	NC_011978	GGC	2	6	572434	572439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099548
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12584	NC_011978	TTCTC	2	10	572810	572819	0 %	60 %	0 %	40 %	222099548
12585	NC_011978	TG	3	6	572831	572836	0 %	50 %	50 %	0 %	222099548
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12589	NC_011978	GA	3	6	573026	573031	50 %	0 %	50 %	0 %	222099548
12590	NC_011978	CAGG	2	8	573047	573054	25 %	0 %	50 %	25 %	222099548
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12593	NC_011978	TCT	2	6	573192	573197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099549
12594	NC_011978	TG	3	6	573229	573234	0 %	50 %	50 %	0 %	222099549
12595	NC_011978	T	6	6	573237	573242	0 %	100 %	0 %	0 %	222099549
12596	NC_011978	CT	3	6	573243	573248	0 %	50 %	0 %	50 %	222099549
12597	NC_011978	GAG	2	6	573328	573333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099549
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12600	NC_011978	CGTT	2	8	573446	573453	0 %	50 %	25 %	25 %	222099549
12601	NC_011978	ACC	2	6	573472	573477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099549
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12603	NC_011978	ATGG	2	8	573520	573527	25 %	25 %	50 %	0 %	222099549
12604	NC_011978	TCT	2	6	573571	573576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099549
12605	NC_011978	CT	3	6	573575	573580	0 %	50 %	0 %	50 %	222099549
12606	NC_011978	GAA	2	6	573626	573631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099549
12607	NC_011978	TGT	2	6	573635	573640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099549
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12609	NC_011978	T	6	6	573877	573882	0 %	100 %	0 %	0 %	222099549
12610	NC_011978	CTTCC	2	10	573965	573974	0 %	40 %	0 %	60 %	222099549
12611	NC_011978	CT	3	6	574031	574036	0 %	50 %	0 %	50 %	222099549
12612	NC_011978	TC	3	6	574042	574047	0 %	50 %	0 %	50 %	222099549
12613	NC_011978	TG	3	6	574091	574096	0 %	50 %	50 %	0 %	222099549
12614	NC_011978	TTC	2	6	574123	574128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099549
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12620	NC_011978	GGA	2	6	574285	574290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099549
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12622	NC_011978	CA	3	6	574430	574435	50 %	0 %	0 %	50 %	222099549
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